Microbiologie Générale

Pr. BOUGHRIBIL SAID

 Chap.3.
Classification des bactéries
 Classification des micro-organismes:
I- Les principaux groupes de µorganismes:

La classification avant la découverte des nouvelles formes

microscopiques vivantes:
♦ Mobile → rapproché des animaux;

♦ Immobile et photosynthétique → rapproché des

végétaux.
 Classification des micro-organismes:
I- Les principaux groupes de µorganismes:

Cependant, la découverte des microorganismes ayant à la

fois des caractéristiques animales et végétales ont posé des
problèmes:
• Champignons
(Botanistes);
les myxomycètes
• Protozoaires
(zoologistes).

• Algues (Botanistes);
les euglènes • Protozoaires
(zoologistes).
 a) Les Myxo mycètes

♦ myxo = gélatineux, mucilagineux, gluant ;

♦ mycète = champignon
► la comparaison des séquences d’acides nucléiques a
permis de montrer que les Myxomycètes n’ont pas de
parenté directe avec les champignons et qu’ils se
rapprochent plutôt des protistes (animaux unicellulaires).
 b) les euglènes

♦ Elles vivent principalement dans les eaux douces riches

en matières organiques;
♦ Elles sont également proches des protozoaires car
certaines espèces sont capables de se nourrir par
absorption de molécules organiques;
♦ Elles possèdent un ou deux flagelles insérés dans un
réservoir, invaginé dans la cellule;
♦ Les espèces photosynthétiques contiennent des
chlorophylles a et b, du bêta-carotène et des xanthophylles
II- Un troisième règne:
En 1866 un zoologiste allemand (Haeckel), a résolu le problème en
créant un 3ème règne, celui des Protistes, pour regrouper les algues,
les protozoaires, les champignons et les bactéries.
Végétaux Groupes Animaux
(Immobiles et contestés (Mobiles et non
=
photosynthétiques) photosynthétiques)
Protistes
♦ Algues ♦ Flagellés ♦ Petits métazoaires :
(photosynthétiques) : Photosynthéti- - Rotifères
- Formes immobiles ques - Certains nématodes
♦ Champignons : ♦ - Certains arthropodes
- Vrais champignons Myxomycètes ♦ Protozoaires :
-Flagellés non
photosynthétiques
- Ciliés
- Amibes
II-1- Les différences entre les trois règnes:
La majeure différence entre les trois règnes réside au
niveau de l’organisation biologique (Tableau 2).

Règnes Propriétés Exemples

Animaux Vertébrés et
Multicellulaires, Invertébrés
Végétaux différenciation cellulaire en Plantes
tissus et organes vasculaires et
Bryophytes
Unicellulaires, cœnocytiques - Algues
ou - Protozoaires
Protistes multicellulaires; avec très peu - Champignons
ou pas de différenciation - Bactéries
cellulaire.
II-2. Classification biologique actuelle (Contemporaine)
Eucaryotes Procaryotes Organismes
non
cellulaires
- Plantes vasculaires - Protistes -Virus
et Bryophytes inférieurs : -viroïdes;
- Animaux (métazoaires) + Bactéries - prions
- Protistes supérieurs : + Cyanobactéries
+ Algues (sauf
Cyanophycées =
cyanobactéries)
+ Protozoaires
+ Champignons
Les protistes sont des organismes simples, possédant
souvent des cellules pas ou très peu différenciées, du même
type et indépendantes.
Comparaison entre cellules eucaryote et procaryote
II.3.Comparaison entre cellules eucaryote et procaryote
Structure cellulaire Eucaryote Procaryote
Taille 2 - 20 mm 0,3 - 2,5 µm
Noyau Présence Absence
plusieurs un seul chromosome
chromosomes
Nucléole Présence Absence
Membrane nucléaire Présence Absence
Mitochondrie Présence Absence
Lysosome Présence Absence
Appareil de Golgi Présence Absence
Réticulum Présence Absence
endoplasmique
Ribosome Présence Présence
Ribosome 80S Ribosomes 70S
Peptidoglycane dans les Absence Présence
parois (chez les eubactéries
seulement)
III- Principales Caractéristiques du règne des protistes.

Les protistes sont définis par des propriétés communes et

spécifiques :

♦ Taille microscopique de l’ordre du micromètre (1 µm =

10-6 m);

♦ organisation simple;

♦ L’omniprésence et l’abondance.
III- Principales Caractéristiques du règne des protistes.

==► Organisation Biologique des protistes:

1) Protistes unicellulaires:
Une cellule unique qui constitue un organisme complet et
autonome, donc doué de toutes les fonctions de la vie :
nutrition, croissance et reproduction.

Bactérie Levures Protozoaire Algue unicellulaire

2) Protistes pluricellulaires:

Ce sont principalement des champignons (Fungi) et des

algues formés de plusieurs cellules identiques, sans aucune
différence structurale ou physiologique.

Pénicillium Pénicillium Algue

camembert notatum bleu
3) Protistes Coénocytiques : Exemple du Chytridiomycetes

Ces organismes qui peuvent être de grande taille, se

composent d’un cytoplasme important incluant de
nombreux noyaux sans cloisonnement (septum) entre eux.
● Ils sont généralement aquatiques, parasites ou
saprophytes.
● Ce sont les seuls membres des
Champignons possédant le caractère
de la mobilité.

Chytridiomycetes
IV- Principaux groupes des bactéries:
La classification de Bergey sépare les bactéries en 4
divisions:
♦ Selon la présence ou non d’une paroi;
♦ Selon la nature de cette paroi, que l’on peut déterminer
grâce à la coloration de GRAM. En 1970, grâce aux
séquençages de l’ADN, les
==˃ Les Archaebactéries; bactéries ont été divisées en
deux taxons :
==˃ Les bactéries à GRAM négatif;

==˃ Les bactéries à GRAM positif; les Eubactéries

= ( bactéries vraies)
==˃ Les mycoplasmes (bactéries sans paroi).
4- Principaux groupes des bactéries (suite) :

A) les Archéobactéries:

Les formes et les structures cellulaires des

Archéobatéries sont analogues à celles des

bactéries, mais elles sont différentes par de

nombreux caractères spécifiques:

A) les Archéobactéries:
Les principales ≠ces entre Archéobactéries et Eubactéries=
(bactéries vraies) :
Caractéristiques Eubactéries Archéobactéries
Présence d'acide muramique Oui Non
dans la paroi (si la paroi est
présente)
Peptidoglycane Oui Non
Chaines Quelques Chaines
Lipides membranaires carbonées carbonées
linéaires. ramifiées.
Présence d'introns dans les gènes
codant pour les ARNt Non Oui
Inhibition de la RNA polymérase Oui Non
DNA dépendante par la
rifampicine
Les Archéobactéries sont adaptés à vivre dans des
conditions extrêmes: Forte salinité, haute température,
faible pH, sans oxygène. On peut les classer en trois
groupes:
-les thermophiles extrêmes vivent à très hautes
températures (--> 90°C exp. les sources hydrothermales
sous-marines);
-les halophiles extrêmes vivent dans des milieux très salés
(exP. le Grand Lac Salé en Utah);
- les méthanogènes utilisent les CO2 pour oxyder le H2,
produisant du CH4. Elles sont anaérobies strictes.
B - Bactéries à GRAM négatif:
► Elles représentent plus de 66 % des bactéries
répertoriées dans la classification de Bergey.
► Elles possèdent une paroi qui donne à la cellule sa
forme.
► Cette paroi est formée d’une couche de peptidoglycane
comprise entre une couche externe et la membrane
plasmique.
► Sur une base morphologique, on distingue dans cette
division les groupes suivants :
B-Bactéries à GRAM négatif:

b.1) Les Cocci:

De forme sphérique, arrondie. Les plus importantes sont
les agents de deux maladies humaines graves.
Exp. Neisseria gonorrhoeae ou « gonocoque » responsable
de la gonorrhée, maladie sexuellement transmissible
(vénérienne).
B.2) Les Bacilles à Gram négatif
Ce sont des bactéries en forme de bâtonnet. La mieux
connue et la plus étudiée est Escherichia coli.

Bacilles à Gram négatif

˃ Pathogènes: les agents responsables des maladies
infectieuses humaines :
♦ Yersinia pestis ============˃ La peste;
♦ Shigella dysenterea ========˃ La dysenterie ;
♦ Salmonella thyphimurium =====˃ La Typhoïde
B.2) Les Bacilles à Gram négatif:
˃ Non pathogènes saprophytes du tube digestif,
le genre Bactéroïdes.

D’autres bacilles GRAM négatif, sont des agents très

important de l’environnement:
˃ Symbiotiques:
♦ Rhizobium (fixation de l’azote atmosphérique);
B.2) Les Bacilles à Gram négatif (suite):

˃ Symbiotiques:
♦ Nitrobacter: joue un rôle important dans le cycle de
l'azote en oxydant le nitrite en nitrate dans le sol;
♦ Thiobacillus.
D’autres bactéries présentes dans le sol, l’eau douce ou
l’eau de mer, certaines sont pathogènes, forment la famille
des Pseudomonadaceae. On distingue:

♦ Pseudomamonas;
♦ Acetomonas;
♦ Xanthomonas.
 B.3- Les Spirochètes
• Unicellulaires: Bacilles Gram négatif;
• Structure hélicoïdale;
• déplacement grâce aux fibrilles axiales dans des
solutions très visqueuses ou sur des surfaces solides;
• Multiplication par scission binaire transversale;
• Paroi mince et flexible entourée d’un manteau;
• Vie aquatique (eau douce, eau marine, boue);
• Ils possèdent une gaine externe multicouche de
peptidoglycanes recouvrant la membrane plasmique.
 B.3- Les Spirochètes
Les spirochètes pathogènes de l’homme :
♦ Leptospira interrogans agent d’une jaunisse
infectieuse.

♦ Treponema pallidium agent de la syphilis chez

l’homme de 5 à 15 µm de longueur.
Cultivable uniquement chez les lapins.
 B.4- Les Rickettsies

• Parasites intracellulaires obligatoires: ils se développent

à l’intérieur de l’hôte;
• Ce sont les plus petites des bactéries polymorphes;
• Bactéries bacilliformes, coccoides ou pléomorphes avec
des parois Gram négatif, non mobiles;
• Les Rickettsies sont capables de produire une partie de
leur énergie par l’oxydation de quelques substrats :
Glucose et pyruvate;
 B.4- Les Rickettsies
• Transmission par l’intermédiaire d’arthropodes
succeurs de sang: poux, puces et tiques.

Elles entrainent des maladies graves chez l’Homme:

- Rickettsia typhi typhus

- Coxiella burnetii Fièvre Q
- Rickettsia prowazekii Typhus épidémique

N.B: Il est impossible de les cultiver avec des méthodes

classiques de cultures.
B.5) Les Chlamydies :

♦ Parasites intracellulaires obligatoires, comme les

Rickettsies;

♦ Incapables de produire seuls Rickettsies;

la moindre énergie

♦ Ils dépendent entièrement de la cellule hôte;

B.5) Les Chlamydies :

♦ Longtemps confondues avec les virus en raison de leur :

- Petite taille < 1 µm de long.

- Existence intracellulaire.

Inclusion de Chlamydia à
l’intérieur d’un lymphocyte
sanguin (voir flèche)
B.5) Les Chlamydies (suite) :

● L’agent infectieux le plus connu chez l’homme est:

Chlamydia trachomatis: responsable de la maladie

Trachome

● Trachome C’est une inflammation et infection des

conjonctives de l’œil.
B.5) Les Chlamydies (suite) :
● Il peut entrainer:
♣ une cécité partielle;

♣ ou totale.

● Il existe aussi une forme transmissible sexuellement et

qui peut provoquer l’infertilité suite à l’infection.
B.6- Myxobactéries:

● Unicellulaires : Bacilles Gram négatif aérobies;

● non photosynthétiques;

● déplacement par glissement;

● Paroi fine et flexible;

● Un cycle de vie complexe;

● Ils se développent un peu partout: eau, sol, végétaux,

écorce d’arbres (omniprésence).
B.6- Myxobactéries (suite):

● Les myxobactéries forment

des agrégations appelées
fructifications
pluricellulaires:

● En conditions défavorables,
elles se transforment en
myxospores dormantes
enfermées dans des structures
appelées sporanges.
B-7: Les Cyanobactéries : Algues bleues.
● Les cyanobactéries sont les seuls procaryotes
photosynthétiques.

● Leur développement rapide peut s'expliquer par:

1) la photosynthèse oxygénique: production d’O2 au cours
de la photosynthèse en utilisant les pigments:
phycocyanines;
B-7: Les Cyanobactéries : Algues bleues.

● Leur développement rapide peut s'expliquer par:

2) l'emploi d'une source d'électrons toujours disponible:

l'eau. Contrairement aux Chlorobactéries et
Rhodobactéries, qui utilisent le soufre à la place de
l'eau;

3) l'élimination des bactéries concurrentes par les effets

toxiques de l'oxygène sur ces espèces principalement
anaérobies.
B-7: Les Cyanobactéries : Algues bleues (suite).

4) Ils se développent un peu partout, dans:

♣ l'océan;
♣ les eaux douces;
♣ mais aussi sur la terre ferme;

5) Grâce à leur activité photosynthétique, ils contribuent

au maintien d’un équilibre entre le gaz carbonique et
l'oxygène;
B-7: Les Cyanobactéries : Algues bleues (suite).
6) A la fin de leur vie, certaines espèces de cyanobactéries
libèrent des toxines dans l’eau qui peuvent affecter la santé
humaine et animale;

7) Grande diversité de forme et d’aspect : unicellulaire,

multicellulaire, sphérique, bâtonnet ou filamenteuse (les
filaments = trichome).

Nostoc commune
B-7: Les Cyanobactéries : Algues bleues (suite).

Elles possèdent la chlorophylle a ou des pigments appelés

phycobilines :
♣ Phycocyanine chez les Cyanobactéries bleues;
♣ Phycoérythrine chez les Cyanobactéries rouges-brunes;

♣ Peuvent se déplacer grâce aux vésicules gazeuses ou par

glissement;
♣ Possèdent un organite particulier,
« la vacuole à gaz »;
B-7: Les Cyanobactéries : Algues bleues (suite).

♣ Elles se reproduisent par :

♦ Scission binaire,
♦ Bourgeonnement,
♦ Fragmentation
♦ ou Scission multiple;
♣ Les filaments se fragmentent pour donner des petits
filaments appelés hormogonies;
♣ Par opposition aux bactéries, se sont les seules à
posséder des acides gras polyinsaturés.
C) Les Bactéries à Gram Positif :

♦ Moins nombreuses que les Gram négatif;

♦ Leur paroi est plus simple (aspect uniforme);

♦ Elles sont très variées sur le plan:

♣ Morphologique;

♣ Physiologique;

♣ et Ecologique.
C.1-Les Bacilles:
Il existe deux groupes principaux :
♣ Le groupe sporulant (formation des endospores), est
composé de deux genres:
● le genre Bacillus;
● le genres Clostridium.
N.B: L’endospore est une forme de résistance aux
conditions défavorables;
♦ Les genres Bacillus et Clostridium sont très répondus
dans le sol, l’eau et d’autres habitats.
♣ Le groupe non sporulant qui regroupe les Lactobacilles.
C.1.1- Les Bacillus:
♦ La plus part sont mobiles sauf Bacillus antharcis;

♦ Aérobies stricts ou Anaérobies facultatifs;

♦ La présence d’air n’inhibe pas

la formation d’endospore;

♦ Ils synthétisent la catalase (+);

♦ Toutes les espèces sont Chimioorganotrophe;

♦ Ils peuvent croitre à 65°C comme c’est le cas pour

Bacillus stearothermophilus .
C.1.2- Clostridium :
♦ Ils se développent un peu partout, dans le sol, dans la
vase, dans les intestins des animaux et des hommes;
♦ Ils sont très pathogènes;
♦ La plus part sont mobiles;
♦ La majorité sont anaérobies strictes, certains peuvent
tolérer une faible quantité d’oxygène;
♦ Ils ne synthétisent pas la Catalase (-); Les Bacillus
♦ La formation de spore est inhibée Les Bacillus
par l’oxygène;
 C.1.2- Clostridium:
♦: Les plus rencontrés en microbiologie médicale sont :

˃ Clostridium botulinum (anaérobie strict)==˃ Agent du

botulisme;

˃ Clostridium perfringens ==˃ Agent d’intoxications

alimentaires, immobiles, tolère une faible quantité
d’oxygène et forment rarement des endospores;

˃ Clostridium tetani (mobiles) =====˃ Tétanos.

Lorsqu’il sporule, la spore est à l’extrémité

du bacille,
C.2. Les Cocci :
Les deux principaux genres sont:

♦ le genre Staphylococcus;

♦ le genre Streptococcus

De nombreuses espèces sont pathogènes.

Exp. Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus

● Présent sur la peau et les
muqueuses de l’homme et des
animaux.
●Responsables, d’intoxication
alimentaire et d’infections.
C.2) Les Cocci :

Exp. Streptocoques:

Streptococcus sp
♦ Certains peuvent provoquer des infections qui touchent
tous les organes humains;

♦ Mais d’autres sont utilisés dans l’industrie laitières «

Streptococcus thermophilus » dans la fabrication du
yaourt;
C.2) Les Cocci :

♦ Certains sont dits inhibiteurs, car ils produisent des

antibiotiques:
► Streptococcus lactis =======˃ la nisine ;
Un peptide antibactérien polycyclique de 34 acides
aminés.
► Streptococcus.cremoris =====˃ la diplococcine
(antibiotique proche de la nisine).
C.3) Les Actinomycètes :
♦ Se sont des organismes Gram+ à Gram variables;
♦ Ils forment des hyphes ou filaments comme des
champignons, à un moment au moins de leur croissance;

♦ Mais ils ont les caractéristiques des procaryotes;

♦ Se sont des chimioorganotrophes qui se développent le
mieux en anaérobioses;
♦ Les actinomycètes forment la plupart des antibiotiques
naturels. Ils sont à l'origine des 2/3 des quelques
6 000 antibiotiques qui ont été isolés.
C.3) Les Actinomycètes :
► Les Actinomycètes les plus pathogènes pour l’homme
sont de la famille des Mycobacteriaceae :

• Mycobacterium Tuberculosis =====˃ la tuberculose

• Mycobcterium leprae =====˃ la lèpre

C.3) Les Actinomycètes :
► Les Actinomycètes utiles sont de la famille des
Streptomycetaceae.
♦ Ils forment des hyphes stables qui ne se fragmentent pas;
♦ En forme de chainettes de spores.
Cette famille contient 4 genres. Le plus important c’est le
genre: Streptomyces.
♦ Streptomyces est aérobie, se rencontre dans le sol, bien
que certains soient pathogènes. Ils forment d’hyphes avec
des septums (cloisons) espacés, très colorés.
♦ Streptomyces:
˃ S. griseus ==˃ produit deux antibiotiques importants. La
streptomycine et la cycloheximide qui a une action
antifongique.
˃ S. Scabies ==˃ espèce du sol, responsable de la gale de la
pomme de terre.

La gale de la pomme de terre

D) Les Mycoplasmes :
♦ Cette classe regroupe des bactéries sans paroi;

♦ Certaines espèces sont parasites et pathogènes;

♦ Taille de 0,15 à 0,3µm de diamètre;

♦ Forme variable;

♦ certaines souches se déplacent par glissement;

D) Les Mycoplasmes :

♦ Leur membrane plasmique contient des stérols qu’elles

puisent des cellules parasitées;
♦ Ils sont très sensibles aux chocs osmotiques et aux
tensioactifs;
♦ ADN est très petit par rapport aux autres bactéries. 1/4 à
1/5 d’E. coli. Ce qui explique leur mode de vie parasite
intracellulaire obligatoire.
Exp. Mycoplasma pneumoniae ==˃ la pneumonie chez
l’homme.
Merci de votre attention