Cours de Bactériologie Virologie

Chapitre I : Introduction à la microbiologie

INTRODUCTION
 Les organismes vivants contiennent des organes constitués de tissus faits de la
juxtaposition de cellules.
 La cellule est une structure physique qu’on retrouve chez tous les êtres vivants. Elle
possède un cytoplasme et un noyau limités l’un et l’autre par une membrane
cytoplasmique ou nucléaire.
 Des différences morphologiques importantes existent entre cellules des règnes végétal
et animal mais la place des bactéries restait mal précisée dans le régné animal et végétal
jusqu’à Haeckel qui, en 1866, proposa la création d’un troisième règne : Protistes.

A. Définition de la microbiologie

La microbiologie est la science qui étudie ……………………… (protistes=

microbes =germe). La microbiologie est divisée en plusieurs branches, en fonction du type
de microbe étudié. On appelle micro-organismes les organismes unicellulaires ou
pluricellulaires …………………. (Invisible à l’œil nu) et qui peuvent être observés qu’à
l’aide d’un microscope.

Les micro-organismes sont ubiquitaires (présents dans tous les écosystèmes).

 Dans le sol, ils jouent un rôle dans la décomposition de la matière organique, la

fourniture de l’azote assimilable aux plantes, la minéralisation de la matière
organique.
 Dans le corps humain (……………………).

B. Historique

 1676 : Antonie van Leeuwenhoek (1632-1723) observe et décrit des

microorganismes grâce à un microscope qu’il a lui-même construit. Il emploie le terme
« animalcules » pour qualifier les diverses formes présentes dans des échantillons d’eau,
des décoctions de foin ou dans la salive.

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 1857 : Louis Pasteur (1822-1895) démontre que la fermentation du sucre en acide

lactique est due à un microorganisme. Il participe à la remise en cause de la théorie de
la génération spontanée (apparition d’organismes vivants à partir de matière non
vivante).

 1876 : Robert Koch (1843-1910) démontre que le charbon est dû à Bacillus anthracis.
Il cultive des bactéries sur de la gélatine, puis découvre l’agent de la tuberculose (le
bacille de Koch : Mycobacterium tuberculosis).

 1892 : découverte des virus avec Dmitri Ivanovski

C. Relations des microorganismes avec les êtres vivants

De nombreux micro-organismes sont associés aux plantes ou aux animaux avec lesquels ils
peuvent entretenir des relations de symbiose, de commensalisme ou de parasitisme

La ………………….. est une association entre deux organismes différents qui leur permettent
de vivre avec des avantages mutuels (dont chacun tire bénéfice).

Le …………………………. est un type d’association naturelle entre deux êtres vivants dans
laquelle l'hôte fournit une partie de sa propre nourriture au commensal : il n’obtient en revanche
aucune contrepartie de ce dernier (relation à bénéfice non réciproque).

Le ……………………. : un mode de vie typique du parasite, c’est une être vivant incapable
de vivre par lui mémé .il a besoin d’exploiter un autre organisme appelé : hôte dont il tire sa
nourriture .l’hôte peut souffrir de la présence du parasite (maladie, affaiblissement).

D. Classification

Les protistes se composent : des bactéries, des protozoaires, des champignons

(Mycètes) microscopique, et des algues. Les virus sont considérés comme des micro-
organisme non vivants, acellulaires qui dépendent entièrement des cellules
………………………...

On distingue les protistes ………………. et les protistes ………………. sur la base

de la présence ou l’absence d’une ………………….. séparant le cytoplasme du matériel
génétique (ADN).

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I. Protistes procaryotes (unicellulaires)

 Protistes unicellulaires composés d’une cellule unique capable de toutes les

fonctions de la vie : nutrition, croissance et reproduction.

1. Les bactéries ont une taille comprise entre 0,5et 15 µm et une forme varie selon le
genre. Ils possèdent un seul chromosome circulaire d’ADN. Ils se reproduisent par
scissiparité.
2. Les archéobactéries : ils sont souvent appelés les archées ou archae, généralement
anaérobies. Ils forment un groupe de bactéries primitives qui n’ont aucun intérêt
médical. Ils ont la capacité à vivre dans des conditions ……………. colonisant les
sources thermales, abysses des océans, mer Morte, lacs acides.

On distingue 3 types généraux :

2.1. Méthanogènes :

 Les seuls organismes producteurs du méthane sur la terre.

 Biodiversité extraordinaire : des sédiments marins, aux tourbières et dans les intestins
des animaux (mammifères).
 Modes de vie très variés: adaptation à la salinité, adaptation à toutes les températures
de 10°C à 100°C. Ces sont des organismes chimio-autotrophes et anaérobies strictes.

2.2. Thermoacidophiles :

 Ils préfèrent les milieux chaudes et acides et vivent dans les sources thermales, geysers,
volcans et cheminées marines. Ces organismes sont chimio-autotrophes.
 Croissance optimale au voisinage 60°C → thermophiles.
 Croissance. Optimal à plus de 80°C → hyperthermophiles.

2.3. Halophiles : Halobacteria ou Haloarchea (aime le sel)

C’est un organisme qui a un besoin absolu de fortes concentrations en sel pour vivre
(chlorure de sodium = NaCl = sel) et vivent dans les bassins de sel ou dans les eaux salées,
comme la mer Caspienne ou la mer morte. Il s'agit d'organismes chimio-autotrophes et
aérobiques obligatoires.

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II. Protistes eucaryotes (unicellulaires ou pluricellulaires)

1. Protistes eucaryotes unicellulaires : C’est le cas des, protozoaires, levures et de

nombreuses algues.

 Protozoaires : Ce sont les protistes de structure la plus rapprochée de celle des

cellules animales, ils ne possèdent pas de paroi, leur membrane la plus externe est la
membrane cytoplasmique. La plupart sont mobiles. Les protozoaires mesurent entre
2 µm et 1 mm. Ils ont les caractéristiques des cellules eucaryotes (un noyau et des
organites). Ils sont unicellulaires et se déplacent pour se nourrir d’autres organismes.
Les plus connus sont les euglènes, les amibes et les paramécies.
 Les levures : champignons microscopiques unicellulaires

Levures Protozoaire Algue unicellulaire

2. Protistes eucaryotes pluricellulaires : Ce sont principalement des champignons

(Fungi) et des algues, formés de plusieurs cellules identiques, sans aucune différence
structurale ou physiologique.

Les champignons est un groupe varié de microorganismes allant des

……………………………….. jusqu’aux moisissures et champignons multicellulaires.
Ces derniers produisent de fines structures filamenteuses appelées hyphes. Ils absorbent les
nutriments de leur environnement, y compris les molécules organiques qu’ils utilisent
comme source de carbone et d’énergie.

En raison de leurs capacités métaboliques, de nombreux champignons jouent un rôle

bénéfique, en intervenant par exemple dans la levée de la pâte à pain, et dans la
décomposition des organismes morts. D’autres champignons causent des maladies chez les
telles que la rouille, le charbon du blé.

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III. VIRUS :

Ils sont des entités ………………. qui doivent envahir une cellule ……….. pour se
répliquer (……………………….). Ils provoquent de nombreuses maladies végétales et
animales, et ont occasionné des épidémies qui ont pesé sur l’histoire de l’Humanité. Parmi
les maladies qu’ils provoquent, on peut citer la variole, la rage, la grippe, le sida, le rhume.

Quatre caractères fondamentaux permettent de définir les virus

1) Une grande diversité de type de génome, cependant chaque particule virale ne contient,
en général, qu’un type d’acide nucléique : soit de l’ADN soit de l’ARN
2) Les virus se reproduisent uniquement à partir de leur matériel génétique par réplication
: le génome viral programme la synthèse d’un très grand nombre de macromolécules
qui s’assemblent pour former les particules virales.
3) Les virus sont des parasites intracellulaires obligatoires. Ils ne possèdent pas de
ribosomes, mitochondries, : Ils sont entièrement dépendant de la cellule hôte pour la
synthèse de protéines et la production d’énergie (ATP)
4) Les virus ont une structure particulière (acellulaire)

LES VIRUS SONT-ILS VIVANTS ?

Un virus se résume à une information génétique protégée :
 Aucun virus ne peut fabriquer de ribosomes
 aucun virus ne peut générer de l'ATP 1°

a. Dans le milieu extérieur : les virus sont des particules inertes : les virions
b. A l’intérieur d'une cellule : le génome viral s’exprime : la cellule synthétise les
protéines de structure virales, génome et protéines virales s'assemblent ensuite pour
former de nouvelles particules virales qui sont libérées dans le milieu extracellulaire.

Ce n'est qu'à l'intérieur d'une cellule que l'information génétique des virus peut s'exprimer : à
ce moment-là seulement on peut considérer que les virus sont " vivants ". Toutefois, il ne
convient pas de considérer les virus comme des organismes vivants Ils s’apparentent aux
éléments génétiques mobiles