Généralités sur les

bactéries anaérobies
Dr Yapi Jaures Cedric
Médecin microbiologiste - Institut Pasteur de Côte d’Ivoire

COURS DE BACTERIOLOGIE INFAS TBM 2e ANNEE

 Objectifs
• Enumérer les conditions de prélèvement pour l’identification
des bactéries anaérobies

• Citer trois milieux d’identification des anaérobies

• Décrire les caractères morphologiques des principales

bactéries anaérobies
 Introduction
• Les bactéries peuvent être classées de différentes manières.
• Une méthode se base sur leur besoin en oxygène, pour vivre
et se multiplier :
Aérobies : celles qui ont besoin d’oxygène
Anaérobies : celles qui ont du mal à vivre ou qui ne peuvent
pas se multiplier en présence d’oxygène
Bactéries aéro-anaérobies facultatives : celles qui peuvent
vivre et se multiplier avec ou sans oxygène
 Introduction
• Les bactéries anaérobies constituent une grande partie de la flore
résidente normale sur les muqueuses, en particulier dans la bouche,
la partie inférieure du système digestif et le vagin.
• Ces bactéries anaérobies peuvent provoquer une maladie lorsque
des muqueuses sont rompues.
• Les bactéries anaérobies depuis l’extérieur de l’organisme
provoquent parfois une maladie lorsqu’elles pénètrent dans la peau
ou sont consommées.
 Introduction

 Il s'agit d'un ensemble très complexe de bactéries ayant certaines

caractéristiques écologiques, biochimiques et pathologiques
 Ecologie
 Germes commensaux en particulier au sein de diverses flores dont celle
oropharyngée ou encore digestive comprenant de nombreuses espèces de
bacilles (Clostridium et Bacteroides)
 Germes telluriques
 Introduction

 Biochimie

 Ne peuvent utiliser et vivre au contact de l'air en raison de leur déficience en

certains transporteurs d'électrons (certains d'isolement difficile sont dits

EOS, car extremely oxygen-sensitive)

 Production de gaz accompagnée d'une odeur nauséabonde (H2S +....) lors

de la putréfaction
 Introduction

• Pathologie

production de nombreux facteurs de virulence, certains étant toxinogènes.

Une autre caractéristique est leur pouvoir très gazogène (crépitation au

niveau des tissus lors de multiplication)

Introduction
 Pouvoir pathogène
Epidémiologie
• Les anaérobies sont transmis à l'homme de trois façons :
 Effraction : tétanos ( C. tetani ), Clostridium des plaies souillées par de la
terre
 Origine endogène: Les bactéries qui colonisent une muqueuse vont se
retrouver dans des sites inhabituels. Ainsi, les Clostridium de l'intestin et les
Bacteroides du groupe fragilis vont migrer dans le péritoine du fait de
perforations de l'intestin soit à la suite de plaie par arme blanche
 Transmission nosocomiale est démontrée chez C. difficile , épidémies de
colites pseudomembraneuses
 Habitat
Epidémiologie
Clostridium tetani et tétanos
• Le bacille de Nicolaer est un commensal du tube digestif d'espèces
animales, mais peut être rencontré dans le sol (spore)
 Epidémiologie
Clostridium perfringens : gangrènes gazeuses

• Définition: affection grave consécutive le plus souvent à

l'introduction de terre ou de matières fécales souillées de spores de
Clostridium dans la plaie: C. perfringens
 Epidémiologie
Clostridium difficile : colite pseudomembraneuse
• La destruction d'une flore de barrière par une antibiothérapie
permettra sa multiplication et la sécrétion des toxines
• la clindamycine, les céphalosporines, le cotrimoxazole....., la
sélection dans les selles d'une espèce naturellement présente (C.
difficile) : colite pseudomembraneuse par prolifération dans le
colon et production de toxines (entérotoxine et cytotoxine)
 Epidémiologie
Clostridium botulinum et Botulisme
• Habitat : bactérie tellurique, rare (intestin des animaux) dont les
spores contaminent les légumes et les fruits
• Mauvaise stérilisation de conserves familiales ou autres
préparations: jambon, saucisson
• les intoxinations: C'est l'ingestion de la toxine préformée qui est
responsable de la maladie
 Epidémiologie
Autres infections liées aux anaérobies
• Angine fuso-spirochétienne de Vincent ou Angine ulcéro-nécrotique
Diagnostic bactériologique :présence d'une bactérie de type
Fusobacterium et d'une bactérie de type spirochète
 Epidémiologie
Autres infections liées aux anaérobies
• Suppurations bucco-dentaires: les abcès dentaires sont
douloureux, car polymicrobiens et distendus par la production de gaz.
 Analyse au laboratoire
Prélèvement
• Hémocultures :Flacons “anaérobies”
• Collections purulentes: Seringue capuchonnée
• Biopsies: Sachets “anaérobies”
• Ecouvillons: Milieu de transport
 Analyse au laboratoire
Caractères morphologiques
 Analyse au laboratoire
Caractères morphologiques

Bacilles à Gram Positif

Clostridium
 Analyse au laboratoire
Caractères morphologiques

Bacilles à Gram Négatifs

 Analyse au laboratoire
Caractères culturaux
Milieux liquides
Bouillon Schaedler
Milieu de Rosenow
cystéiné
Bouillon Brucella anaérobie
bouillon Schaedler-
vitamine K3
Milieux d'isolement non sélectifs
 Milieu Columbia au sang pour
anaérobies
Gélose Brucella anaérobie
d'isolement et pour l'antibiogramme
Milieu de Wilkins-Chalgren pour
antibiogramme
Analyse au laboratoire

Chambre spéciale (chambre dite de Freiter) avec mélange gazeux divers (C02, N2...)

Mini-chambre (jarre ou poche plastique)

 Analyse au laboratoire
Caractères culturaux

L'isolement et l'identification demandent un délai de quelques jours à quelques

semaines

Pigmentation noire
(Prevotella melanogenica)
 Analyse au laboratoire
Caractères biochimiques
- Etude de la fermentation des sucres
- Production d'indole et d'une gélatinase à l'aide d'une galerie miniaturisée
- Etude des caractères enzymatiques grâce à une galerie d'identification rapide
- Cette orientation présomptive permet la détermination du genre bactérien de la
grande majorité des anaérobies.

Rapid ID 32A
Galerie d’identification
 Conclusion
Les bactéries anaérobies strictes représentent un vaste groupe de micro-
organismes souvent négligés

En absence de techniques de culture et d’identification qui leur sont

spécifiques, leur mise en evidence s’avère difficile
Commensales pour la plupart, ces bactéries sont impliquées dans un grand
nombre d’infections qui se développent à la faveur de troubles circulatoires ou
de problèmes d’immunodépression et dont la prise en charge thérapeutique est
souvent complexe