2.

La cellule procaryote

2.1 Classification
2.2 Les bactéries
2.2.1 Formes et associations
2.2.2 Structure et composition de la cellule bactérienne
La paroi bactérienne
La capsule
Le cytoplasme
Le matériel génétique
Les flagelles
Les pili
Les spores
2.2.3 Le métabolisme bactérien
2.3 Les archées
1
2. La cellule procaryote

Définition procaryote

Noyau: caryon
Procaryote: espèce vivante dont la cellule ne possède pas
un noyau bien défini, entourée d'une membrane
(eubactérie, archée).

2
 Classification des procaryotes

Procaryotes Eucaryotes Procaryotes

Bactéries Archées

x50

Transferts horizontaux : transferts de gènes en

dehors des processus de reproduction, entre individus
de la même espèce ou non (fréquents chez les
bactéries)

x6000 x30000
"Biologie moléculaire de la cellule" Alberts et al. (1983)

Ces micrographies au microscope électronique donnent une idée de l'échelle de bactéries Escherichia
coli sur la pointe d'une épingle.
3
2.1 Caractéristiques générales de la cellule procaryote

Type cellulaire le plus abondant sur terre

Organisme unicellulaire
Structure simple, grandes variétés biochimiques
Dimension variée souvent de l'ordre du micron (m)
Souvent entouré d'une coque protectrice
Compartiment interne unique
Division par scissiparité
Très grande variété d'habitats et niches écologiques

Forme 2 grands groupes:

- les bactéries (forme courante: habitat, sol, eau..)

- les archées (dans des environnements très inhospitaliers : grands fonds

océaniques, sources chaudes, acides, marée...)

4
La division cellulaire bactérienne : par scissiparité ou fission binaire

5
2.2 Les bactéries

Procaryotes Eucaryotes Procaryotes

Bactéries Archées

6
2.2 Les bactéries
2.2.1 Forme et association bactérienne:

La forme des bactéries diffère en fonction des espèces :

- Coques ( forme sphérique )

Staphylococcus (amas) Streptococcus (chaînette)

- Bacilles ( forme allongée )

Escherichia coli
- Spirilles ( forme zigzag ), Spirochètes ( forme spiralée ) et Mycéliums

7
Streptomyces
2.2 Les bactéries
2.2.1 Forme et association bactérienne:

La forme des bactéries diffère en fonction des espèces :

8
 Micrographies illustrant la grande variété des bactéries
Elles peuvent être pathogènes ou non

MEB
9
dimension bactérienne:

- s'exprime le plus souvent en micromètre (m)

- variable au sein du monde bactérien

- diamètre moyen varie de 0,1 à 0,5 m

- longueur moyenne de 1 à 10 m.

Cas particuliers:

Certains spirochètes peuvent atteindre 500 micromètres alors que les

mycoplasmes ne dépassent guère 0.1 µm.

10
 2.2.2 Structure et composition de la cellule bactérienne:

La cellule bactérienne est entourée par une enveloppe rigide, la paroi qui lui garde
sa forme, lui donne sa résistance et entoure la membrane cytoplasmique.

A l'extérieur de la paroi, il peut exister la capsule chez certaines bactéries.

11
Le cytoplasme contient des ribosomes, des substances de réserve, des pigments,
des vacuoles à gaz, mais aucun des organites décrits dans la cellule eucaryote
(réticulum endoplasmique, chloroplastes, mitochondries, etc.).

Le matériel génétique est sous forme d’une molécule d'ADN non entouré par une
membrane et constitue une zone appelée nucléoïde.

Facultativement, la cellule bactérienne peut posséder une capsule, des flagelles,

12
un
pilus (ou fimbra). Certaines bactéries produisent des spores.
 Structure et composition de la cellule bactérienne:

La paroi bactérienne: paroi

capsule
Rôle de protection, résistance et défense (pression osmotique…)
Caractéristique de la cellule bactérienne
Composée de peptidoglycanes (muréine)
Contient de nombreux déterminants antigéniques

2 types de paroi:
- gram positif (violette) pseudomonas
- gram négatif (plus riche en lipides) ex: E. coli (rose)
Distinction par traitement chimique et coloration (perméabilité différente à
des solvants)
Violet gentiane, alcool puis safranine.

NB: synthèse de la paroi inhibée par certains antibiotiques comme la pénicilline

13
Coloration Gram:

14
 paroi bacterienne gram + et gram -
La carte d'identité antigénique d'un genre bactérien s'appelle sérotype.

périplasme

Très antigénique

15
 paroi bactérienne gram + et gram –

Les peptidoglycanes :

16
 paroi bactérienne gram –

Les lipopolysaccharides :
(LPS) : endotoxine

E. coli (escherichia coli), Shigelle, Salmonelle, Pseudomonas, Haemophilus

influenza, Neisseria et Vibrio cholerae (choléra).
17
La capsule : substance organique visqueuse excrétée qui entoure la paroi
(toutes les bactéries n'ont pas de capsule), sa synthèse est influencée par le
milieu, elle protège de la dessiccation, des prédateurs, des parasites et c'est

un support d'antigène.

pneumocoque

souvent polysaccharidique mais parfois polypeptidique

18
Le cytoplasme: compartiment délimité par la membrane cytoplasmique,

Dans lequel se trouvent des ribosomes 70S, des substances de réserves, des
sels minéraux...

Le cytosol: hydrogel colloïdal (70% d’eau) entre pH 7 et 7,2

Les inclusions cytoplasmiques: des granules de réserves ou des vacuoles à gaz

permettant le déplacement vertical des cyanobactéries

19
Le génome :est constitué:

- 1 chromosome bactérien : 1 seul chromosome circulaire, souvent condensé

formant une zone appelée nucléoïde (1).
(haploïde)

- 1 ou plusieurs plasmides (2): petits fragments d'ADN extrachromosomique qui

peuvent conférer des résistances à des antibiotiques... (avantage sélectif).

Le mésosome : invagination membranaire renfermant parfois les enzymes de la

chaîne respiratoire (rôle similaire à celui des mitochondries).

20
mésosome
Les flagelles: structure facultative complexe assurant la mobilité
de la cellule, ancrés dans le cytoplasme.

- 6 à 15 μm de long sur 12 à 30 nm d'épaisseur.

- composés de protéines appelées flagellines.
- Protéines antigéniques (provoquent la formation
d'anticorps permettant certains sérodiagnostics,
ex. fièvre typhoïde), elles sont différentes d'une
espèce bactérienne à une autre

flagellines

anneau

21
Les flagelles: structure complexe assurant la mobilité de la cellule.

Il existe différents types de formation flagellaires .

Insertion de flagelle
monotriche

lophotriche

amphitriche

péritriche
Listeria monocytogene (listériose)

Vibrio cholerae (choléra) Pseudomonas aeruginosa (maladie nosocomiale)

22
Les pili (un pilus): qq µm de long (ME)
appendices très courts et rigides surtout chez les gram-,
formés d’une protéine : la piline

- pili communs: (fimbriae) l'adhésion aux surfaces inertes

ou vivantes (autres cellules, pathogène).
Piline associés à l’adhésine
(pouvoir antigénique: Escherichia coli au cours de certaines
infections urinaires, Vibrio cholerae sur les entérocytes).

- pili sexuels: (plus long) échange d'ADN entre 2 bactéries lors de la conjugaison

23
Les pili (un pilus):

pili sexuels:

- Plus longs et moins nombreux (1 à 3)

- codés par des plasmides (facteur F)

- rôle essentiel dans la conjugaison bactérienne : transmission d’ADN codant

un caractère (pouvoir pathogène, résistance aux antibiotiques (facteur R)
virus, radiations, métaux lourds...) d'une bactérie donneuse à une bactérie
réceptrice.

Si les bactéries sont suffisamment compatibles, la transmission de plasmides peut

se faire entre bactéries d'espèces différentes.

Bacillus subtilis et
Bacillus subtilis et Echerichia coli
Staphylococcus aureus
24
La conjugaison bactérienne:

Chez les procaryotes (bactéries), la multiplication est asexuée par scissiparité (pas de
brassage génétique).

Pour assurer une diversité génétique:

- les mutations ponctuelles aléatoires (évolution induite lente).

- les transferts horizontaux (plus rapides) : mécanismes à l'origine d'une grande partie de la
diversité génétique.
Il existe trois mécanismes : La transduction, la transformation et la conjugaison.

Les conséquences de ces transferts, Ex :les gènes de résistance aux antibiotiques peuvent très
rapidement se propager dans la population mondiale de bactéries.

Ces mécanismes ont transformé Escherichia coli en Shigella flexneri, (dysenterie).

25
La conjugaison bactérienne:

Donneuse F+ Réceptrice F-

Facteur F
Fertilité

26
Les spores bactériens: petites unités sphériques très résistantes,
déshydratées, thermorésistantes et imperméables qui se forment chez
certaines bactéries (Bacillus, Clostridium et Sporosarcina), Gram+

Filaments de Bacillus anthracis libérant

des spores (grossissement x 2 500)

Une spore 27
Les spores bactériens: forme de résistance et de dissémination

28
 2.2.3 Métabolisme bactérien: grandes diversités

les bactéries ont besoin de matière (carbonée, azotée, minérale, etc...) et

d'énergie pour croître.

- Source d'énergie:
- rayonnement lumineux (phototrophe)

- oxydation composés organiques ou minéraux (chimiotrophe)

- Source de carbone:
- CO2 (autotrophe)

- substances hydrocarbonées
(alcool, sucre, acide lactique...) (hétérotrophe)

- Source d'azote:
- N2 atmosphérique (ex: rhizobium, bactéries symbiotiques des légumineuses)

- dégradation composés azotés (désamination)

29
2.2.3 Métabolisme bactérien: grande diversité

- effet de l'oxygène:

- bactérie aérobie stricte: besoin absolu d'oxygène (air), effectue respiration

Sucre + O2 CO2 + H2O + énergie

- bactérie aéro-anaérobie facultative: se développe avec ou sans air

(bactéries pathogènes souvent) respiration ou fermentation

- bactérie anaérobie stricte: oxygène est toxique (bactéries intestinales)

fermentation
Sucre CO2 + éthanol + énergie

- effet de la température: ex: mésophile, 37°C, thermophile (45°C et 70°C)...

- effet du pH: ex: neutrophile pH7, acidophile...(Lactobacillus)

30
- effet de la pression osmotique
Les différentes bactéries:

Photosynthétique et aérobie, utilisent l'énergie lumineuse: cyanobactéries

Aérobie anaérobie facultative

Anaérobie (sans oxygène)

E. Coli x 10 000 31
Clostridium
La diversité de mode de vie des bactéries:

- Libre
- Parasite obligatoire dans des cellules (ex rickettsies parasite d'arthropodes,
poux ou puces transmises à l'homme par piqure donnant le typhus)

- Symbiose
L'intestin humain (+ de 200 espèces de bactéries comme Escherichia coli) (2 kilo
de biomasse), un rôle favorable dans la digestion, dans la régulation du système
immunitaire et empêchent la colonisation par des organismes pathogènes.
(bactéries commensales)
L’estomac des ruminants : bactéries symbiotiques capables de digérer la cellulose.

Les légumineuses: des symbioses avec des bactéries

de type Rhizobium N2 NH3
32
La phylogénie des bactéries:

33
 Structure hiérarchique en taxonimie:

E. coli

Pour nommer une bactérie : nom de Genre et ensuite d'espèce

ex: Escherichia coli.

La genre prend une Majuscule et l'espèce une minuscule.

34
Les bactéries peuvent être classées selon :

• la coloration de Gram

• la morphologie

• la mobilité

• la capacité à sporuler

• la température de croissance

• le mode respiratoire (aérobie, anaérobie, etc…)

• la capacité de photosynthèse

• l’utilisation des différentes sources de carbone (autotrophe, hétérotrophe)

35
Les bactéries peuvent aussi être classées selon leurs
caractères :

•biochimiques (classification en biotypes)

•antigéniques (classification en sérotypes)

•pathogéniques (classification en pathotypes)

•de sensibilité aux antibiotiques (classification en antibiotypes)

•moléculaires : identification de l’ADN par ribotypie, (séquençage de l’ARN

ribosomique 16S)

36
2.3 Les Archées

Procaryotes Eucaryotes Procaryotes

Bactéries Archées

Les archées se distinguent des bactéries par certains caractères :

- composition de la paroi
- de la membrane
- de la machinerie d’expression des gènes ( ex: ARN polymérases).

37
Généralités sur les Archées:

- les Archées sont des procaryotes unicellulaires.

- les Archées ne sont pas des bactéries.

- les Archées ont été divisées en plusieurs groupes (méthanogènes, halophiles et

thermophiles, pH extrême..), sur la base de critères métaboliques.

- Les archées occupent des niches écologiques qu’elles sont souvent seules à
occuper, environnements extrêmes (geyser, lac salé, glacier, fond des océans...).

- les Archées ne vivent pas que dans des conditions extrêmes.

-les Archées sont partout et représentent jusqu’à 20% des procaryotes en

biomasse.

- Non pathogène, existe des espèces commensales.

38
 Les archées ou les extrémophiles

Halophile (milieux riches en sels)

Méthanogène (produisent du méthane)

Le rumen est riche en méthanogènes

Xérophile (résiste à la dessiccation)

Hyperthermophile
Pyrolobus (hyperthermophile,113°C)

Sulfolobus acidocaldarius
(acidophile et hyperthermophile)

Radiorésistant

Deinococcus radiodurans (radiorésistant jusqu'à 3000 fois la résistance humaine) 39

 exemple les halophiles

- la majorité sont des aérobies

- certains sont photosynthétiques grâce à la bactériorhodopsine

(milieux riches en sels)

coloration pourpre d’une saline

provoquée par Halobacterium salinarum Halobacterium salinarum

40
 Comparaison des 3
domaines du vivant

41
Quelques chiffres :

1 à 2 kg de flore intestinale (bactéries, archées,…).

100 000 milliards dans l’intestin (10 x plus que le nombre de cellules
constituant l’homme)

1,25 milliard dans un yaourt

80 millions transmis dans un baiser de 10 secondes

10 millions sur les mains

La masse des procaryotes sur Terre est supérieure à celle de toutes les
plantes de la planète.

Moins de 1% des bactéries vivent dans les animaux ou humains.

92% à 94% vivent dans le sol.

42