STRUCTURE DES ACIDES NUCLEIQUES

I – Définition
Les acides nucléiques sont des macromolécules comportant des sous – unités
appelées nucléotides.
On distingue deux grands groupes d’acides nucléiques :
- Les acides ribonucléiques (ARN) ;
- Les acides désoxyribonucléiques (ADN). qui sont surtout localisés dans le
noyau.

II – Les Nucléotides

1- Définition
Ce sont des macromolécules formées de 03 composants qui sont les bases (T, A,
G, U, C), les oses (ribose, désoxyribose) et l’aide phosphorique.

a- Les bases
Elles sont classées selon la nature de leur noyau en bases puriques et
pyrimidiques.
- Les principales bases pyrimidiques c’est à dire issues d’un noyau pyrimidine
sont l’Uracile(U), la Cytosine(C) et la Thymine(T).

- Les principales bases puriques c’est à dire dérivées d’un noyau purine sont : la
Guanine(G) et l’Adénine(A).
 b- Les oses
Elles sont de deux sortes : le ribose et le désoxyribose. Ces deux sucres sont des
pentoses dont la structure de base se présente comme suit :

c- L’acide phosphorique
Il est caractérisé par trois fonctions acides. Deux de ces fonctions sont estérifiées
dans les ADN et les ARN. La troisième est libre.

2- Liaisons dans les nucléotides

a- Liaison base – ose
C’est une liaison glucosidique appelée b- osidique. L’association ose – base donne
un nucléoside.
QCM : 3 liaisons possibles, acid/base, acide ose, ose base ??? Rp F
L’ose est au centre des liaisons dans les acides nucleiq ? V

b- Liaison acide phosphorique – ose

Il s’agir d’une liaison ester. Il y a élimination d’une molécule d’eau entre un OH
de l’H3PO4 et un H de la fonction alcool de l’ose.

Fig.
 3- Nomenclature des acides nucléiques
a- Nucléotides à bases pyrimidiques
Le nom des nucléosides se termine par « idine » et celui des nucléotides se termine
par « idylique ».

b- Nucléotides à bases puriques

Le nom des nucléosides se termine par « ine » et celui des nucléotides par
« ylique ».

L’appellation est complétée, si l’ose est un désoxyribose, en faisant précéder

l’abréviation du nucléotide par la lettre « d » dans les deux cas.
Le tableau de la nomenclature des principaux nucléotides est le suivent

Nomenclature des principaux nucléotides

BASE NUCLEOSIDE NUCLEOTIDE ARN ADN

Monophosphate Monophosphate
Adénine Adénosine Acide AMP d- AMP
adenylique
Guanine Guanosine Acide GMP d- GMP
guanylique
Cytosine Cytidine Acide CMP d- CMP
cytidylique
Thymine Thymidine Acide - d- TMP
thymidylique
Uracile Uridine Acide UMP -
uridylique

QCM : tableau à remplir par V ou F (noms modifiés des nucleosides et nucleotide)

III- Les acides nucléiques
1- Liaisons entre les acides nucléiques
Dans un acide nucléique, les nucléotides sont rassemblés entre eux par des liaisons
esters. Une molécule d’eau est donc éliminée entre OH de l’H 3PO4 et H de la
fonction alcool située en position 3’ de l’ose. Quand l’H3PO4 présente ses deux
fonctions acides bloquées dans la formation de l’ester, on parle de liaison
phosphodiester. On peut indiquer les lettres a et b pour préciser les liaisons
concernées.
- La liaison phosphodiester « a » correspond à la liaison ester entre l’acide
H3PO4 et le OH en 3’ de l’ose.
- La liaison « b » correspond à la liaison ester entre l’acide H3PO4 et le OH
en 5’ de l’ose.

Fig.

2- Sens de lecture d’un acide nucléique

Par convention, l’acide nucléique est lu dans le sens de l’extrémité 5’, extrémité
comportant un groupement phosphate, vers l’extrémité 3’ qui possède un OH
libre.

Exemple : 5’ –AACTTGG-3’

IV- Les Acides Désoxyribonucléiques (ADN ou DNA)

1- Constituants
Ce sont les acides nucléiques faits de 02 chaînes de nucléotides. Les ADN
présentent quelques caractéristiques particulières notamment :
- l’ose : désoxyribose ;
- les bases : sont A, T, G, C soient 2 bases puriques et 2 bases pyrimidiques.

2 - Propriétés caractéristiques de l’ADN

Trois propriétés caractérisent l’ADN :
- la complémentarité ;
- l’antiparallélisme ;
 - la forme hélicoïdale ;

* Antiparallélisme
Les 2 brins de la molécule d’ADN sont disposés dans le sens opposé. L’un est
orienté dans le sens 5’-3’ et l’autre parallèle, s’oriente dans le sens 3’-5.

* Complémentarité
Les 2 brins composant l’ADN sont appariés par des bases. Cet appariement des
bases se fait selon une règle dite de complémentarité : A est appariée à T et C à
G. Cette complémentarité repose sur des raisons structurales et sur la formation
des liaisons hydrogènes. Ces liaisons hydrogènes sont au nombre de 2 entre A et
T, et de 3 entre C et G.

Fig.

* Forme hélicoïdale
Dans l’espace, les 2 chaînes d’une molécule de DNA, présentent une
conformation hélicoïdale. Elles s’enroulent autour d’un axe imaginaire pour
former une double hélice en rotation droite (la forme A et B) ou plus
exceptionnellement à rotation gauche (forme Z).

Fig.
 - Les formes d’ADN
Il existe plusieurs formes d’ADN dont les plus connues sont A, B et Z. La forme
B est la forme biologique la plus importante décrite par WATSON et CRICK. Les
caractéristiques de B sont les suivantes :
• Environ 10 paires de bases par tour de spire
• Le diamètre est de 2,4nm,

3- Propriétés physico-chimiques de l’ADN

a- Température de fusion
A une certaine température, les liaisons dites hydrogènes entre les 2 brins d’un
ADN se rompent et les 2 brins se séparent. On dit que l’ADN est dénaturé. C’est
la fusion ou dénaturation de l’ADN caractérisée par une température Tf dite
température de fusion. Cette dénaturation est cependant réversible. Les 2 brins
peuvent se réassocier suivant la règle de complémentarité.

QCM : A Tf, les 2 brins se réassocient selon la règle de complémentarité. V

b- Absorption dans l’ultraviolet

Dans l’UV, les bases pyrimidiques permettent de doser l’ADN grâce à leur
pouvoir d’absorption. Généralement l’ADN absorbe à 260 nm. Cette propriété
permet au laboratoire de détecter facilement la présence d’ADN dans un milieu.

Q : Dans l’UV, les bases pyrimidiques permettent de doser l’ADN grâce à leur
pouvoir d’absorption V
Q : l’ADN absorbe à 260 nm V

c- Hybridation des acides nucléiques et notion de sondes nucléiques

L’hybridation est l’une des propriétés fondamentales des acides nucléiques qui
reposent sur la règle de complémentarité. Il est possible d’apparier les brins
d’ADN avec les oligonucléotides ou les polynucléotides qui reconnaissent
spécifiquement des séquences sur les brins d’ADN de manière antiparallèle et
complémentaire. Ces oligos et polynucléotides sont appelés des sondes et l’ADN
obtenu, est dit hybride.
4 - Chromatine et Nucléosomes
Dans les cellules eucaryotes, la molécule d’ADN est fortement associée à des
protéines pour constituer la chromatine. Les nucléosomes sont constitués
d’environ 200 paires de bases associées à des protéines appelées Histones. Au
niveau des nucléosomes, l’ADN est associé à un octamère d’histones. Le
traitement doux de la chromatine par une endonucléase, libère des particules qui
sont l’ADN, les protéines d’histone et quelques protéines non histones (voir
purification).

Exo : différences : ADN, chromosome, chromatine ?

V - Les Acides Ribonucléiques : ARN ou RNA

1- Caractéristiques
Les ARN sont des acides nucléiques dont les caractéristiques générales sont les
suivantes :
- sucre : ribose
- bases : A, U, C, G.
- appariement : les règles d’appariement dans les bases complémentaires
peuvent s’observer aussi au niveau des ARN. En effet dans une même chaîne
d’ARN, des parties peuvent être bicaténaires avec des appariements tels que A=U
et C=G. Ceci donne au niveau de la portion appariée, des sortes de lignes alors
que les régions non appariées présentent des formes en boucle. Ainsi les ARN
peuvent prendre plusieurs formes.

2- Différents types d’ARN

Les cellules contiennent essentiellement 4 types d’ARN :
- les ARNr (ribosomique)
- les ARNt (transfert)
- les ARNm (messager)
- les ARN de petites tailles (sRNA).
a- Les ARNr
Ce sont les plus nombreux des ARN. Les ARNr jouent un rôle essentiel dans la
structure et le maintien de l’intégrité des ribosomes en association avec les
protéines ribosomales. Les ribosomes sont des organites situés dans le cytoplasme
et qui constitue l’usine de fabrication des protéines chez les procaryotes et les
eucaryotes. Chaque ribosome comporte 2 sous unités :
- Une grande sous-unité de 50 S (procaryote) ou de 60 S (eucaryote) ;
 - Une petite sous-unité de 30 S (procaryote) ou de 40 S (eucaryote).

b- Les ARNt
* Rôle
Leur rôle est essentiel dans la synthèse protéique. Ce sont des vecteurs qui vont
transférer les acides aminés jusqu’à l’usine ribosome où s’effectue la synthèse des
protéines.

* Structure des ARNt

En plus de la structure générale des ARN, les ARNt possèdent des particularités
propres :
- des bases inhabituelles comme l’hypoxanthine dont le nucléotide correspondant
est IMP (Inosine monophosphate), mais aussi la thiamine ou encore des bases
méthylées.
- structure spatiale : chaînes constituées d’une centaine de nucléotides avec des
zones d’appariement et des boucles non appariées. La forme générale est celle
d’une L qui prend la forme de trèfle en structure spatiale.
- des sites importants : on note plusieurs sites dont les plus importants sont :
* l’extrémité 3’-OH portant 3 nucléotides caractéristiques. C-C-A-3’-OH et qui
fixera l’acide aminé qui sera véhiculé par l’ARNt.
* l’anticodon qui correspond à un groupe de 3 nucléotides ou triplet situé sur une
boucle d’ARN. Ce triplet joue un rôle important lors de la synthèse protéique. En
effet, c’est ce triplet qui s’apparie à un autre triplet appelé codon présent sur
l’ARNm. Cet appariement se fait par des liaisons hydrogènes et selon les règles
de complémentarité. Le codon et l’anticodon sont disposés de façon antiparallèle.

Fig.
Il existe naturellement une vingtaine d’acides aminés, mais on dénombre 61
codons différents reconnus et transportés par plusieurs ARNt spécifiques.
- l’extrémité 5’ de l’ARNt comporte un groupement phosphate

e - ARNm
C’est le support essentiel de l’information génétique entre l’ADN et les ribosomes
du cytoplasme où s’effectue la synthèse protéique. Leur durée de vie est très
courte à la différence des ARNt.
Chez la bactérie, la durée de vie d’un ARNm est de quelques minutes.
Les ARNm sont très rapidement synthétisés. Ils sont formés d’une seule chaîne
de nucléotides avec des bases communes aux ARN (A,G,C et U). Cette chaîne
comporte une succession de triplets nucléotidiques et chaque triplet constitue un
codon spécifique d’un acide aminé.

d- Petits ARN nucléaires

Présents dans le noyau, ils sont impliqués dans certaines étapes de la transcription,
c'est-à-dire de la copie de l’ADN en ARNm.