Cours Bio-organique

Master1 PCMO

UHBC

Faculté des sciences

Départ Chimie

2014-2015 l’ADN ET L’ARN ET L’INFORMATION GENETIQUE

L'acide désoxyribonucléique (ADN) : est une biomolécule, présente dans toutes les cellules vivantes, qui renferme l'ensemble
des informations nécessaires au développement et au fonctionnement d'un organisme. C'est aussi le support de l'hérédité car il
est transmis lors de la reproduction, de manière intégrale ou non. Il porte donc l'information génétique et constitue.
La structure standard de l'ADN est une double-hélice droite, composée de deux brins complémentaires. Chaque brin d'ADN est
constitué d'un enchaînement de nucléotides, eux-mêmes composés de bases azotées, de sucres (désoxyribose) et de
groupements phosphate. On trouve quatre nucléotides différents dans l'ADN : A, G, C et T, du nom des bases correspondantes.
L'information génétique est inscrite dans l'ordre dans lequel s'enchaînent les quatre nucléotides. Ces nucléotides se regroupent
par paires spéciales :

 A avec T ;
 T avec A ;
 C avec G ;
 G avec C.
Aucune autre paire n'est possible.
L'ADN détermine la synthèse des protéines, par l'intermédiaire de l'acide ribonucléique (ARN).
Dans les cellules eucaryotes, l'ADN est contenu dans le noyau et une petite partie dans la matrice des mitochondries ainsi que
dans les chloroplastes. Dans les cellules procaryotes, l'ADN est contenu dans le cytoplasme.

Figure :Structure de L’ADN

2-Bases azotées : Les bases azotées sont les composés essentiels de l'ADN et de l'ARN, elles sont composées des bases puriques
et des bases pyrimidiques.

A-Les bases puriques : sont principalement l'adénine et la guanine, ce sont des dérivés de la purine.

Purine
 Adénine (A) ou 6-amino-purine

Guanine (G) ou 2-amino-6-oxy-purine

Les bases pyrimidiques : sont la cytosine et la thymine, dans l'ARN on trouve la cytosine, l'uracile et rarement la thymine transfert), ce
sont des dérivés de la pyrimidine.
 Pyrimidine

Cytosine (C) dans l'ADN et l'ARN,2-oxy-4-amino-

pyrimidine

Uracile (U) dans l'ARN,2,4-dioxy-pyrimidine

Thymine (T) dans l'ADN rarement dans l'ARN,2,4-dioxy-5-

méthyl-pyrimidine

Ce sont les quatre bases azotées qui assurent la variabilité de la molécule d'ADN, ainsi que la complémentarité des deux brins.
En effet, il n'existe que deux types complémentaires de bases : une base pyrimidique sera toujours en face d'une base purique.

 La thymine (T) et la cytosine (C) sont de la famille des pyrimidines.

 L'adénine (A) et la guanine (G) sont de la famille des purines.

La tautomérisation

Les figures ci-dessus sont sous la forme céto (ou lactame) qui est plus présente au pH physiologique que la forme énol (ou lactime).
Un nucléoside est une molécule formée soit d'un ribose soit d'un désoxy-ribose avec soit une base purique soit une base pyrimidique.

La liaison se fait entre le carbone c1' du pentose (ribose ou désoxy-ribose) et l'azote n9 de la base purique ou n1 de la base pyrimidique.

Le pentose est sous la forme furanose et la liaison osidique est sous la forme β.

Nomenclature des principaux nucléosides:

Base Ribonucleoside Desoxyribonucleoside

Adénine Adénosine Désoxyadénosine

Guanine Guanosine Désoxyguanosine

Uracile Uridine Désoxyuridine

Cytosine Cytidine Désoxycytidine

Thymin
Thymine ribonucléoside (rare) Désoxythymidine ou thymidine
e

EXEMPLES DE NUCLEOSIDES
 ADENOSINE

THYMIDINE

-Nucléotide :
Un nucléotide est une molécule organique composée d'une nucléobase, d'un pentose (l'association des deux forme un nucléoside) et de 1 à 3 groupements
phosphates. (ou nucléoside-monophosphate) est un nucléoside avec un phosphate sur le carbone c5' du pentose, on parle aussi d'ester
phosphorique de nucléosides. Certains nucléotides forment la base de l'ADN et de l'ARN, d'autres sont des cofacteurs ou coenzymes.

Puisque les phosphates et les sucres sont toujours les mêmes dans un acide nucléique donné, la nature du nucléotide est déterminée par la base azotée qu’il
contient. La séquence d'un brin d'ADN ou d'ARN peut donc se résumer à la succession des bases azotées présentes. Les cinq principaux nucléotides sont
nommés selon leur base azotée.

Nomenclature des principaux nucléotides :

Ribonucléoside-5'- Désoxyribonucléoside-5'-
Base
monophosphate monophosphate

Adénosine-5'-monophosphate Désoxyadénosine-5'-
Adénine
= AMP monophosphate = dAMP

Guanosine-5'-monophosphate Désoxyguanosine-5'-
Guanine
= GMP monophosphate = dGMP

Uridine-5'-monophosphate = Désoxyuridine-5'-monophosphate
Uracile
UMP = dUMP

Cytidine-5'-monophosphate = Désoxycytidine-5'-monophosphate
Cytosine
CMP = dCMP

Thymine riboside-5'- Désoxythymidine-5'-

Thymine
monophosphate (rare) monophosphate = dTMP
 Figure : Nucléotides

-LA STRUCTURE DE L’ADN

I- Structure primaire :- Il est constitué par l’enchaînement linéaire de nucléotides qui forment un
filament non ramifié.

- Chaque nucléotide résulte de l’union d’un désoxyribose, un acide phosphorique et d’une base azotée

purique (A-G) ou pyrimidique (T-C).

Figure: structure primaire de l’ADN

II- Structure secondaire :

- 2 filaments de polynucléotides sont enroulés l’unsur l’autre en une double hélice.

- Chaque hélice est formée par les nucléotides unies par leur désoxyribose (entre C 3’ et 5’) au moyende

la molécule d’acide phosphorique.

- Les 2 hélices sont réunis par les liaisons hydrogènes qui forment entre les bases azotées une

complémentarité bien définie : A-T ; G-C.

- Le pas de l’hélice = 34A° ; le diamètre = 20A°

Figure: structure secondaire de L’ADN

• III- Structure tertiaire :

• - Dans le noyau l’ADN est associé à des protéines basiques = les histones.

• - La double hélice subit ainsi un enroulement hélicoïdal secondaire entouré d’un manchon
d’histone

-Fonctions :
L'ADN est une macromolécule, polymère de nucléotides (dAMP, TMP, dGMP, dCMP) dont la structure et les propriétés chimiques lui permettent de remplir les
fonctions suivantes :

1. Sa fonction principale est de stocker l'information génétique, information qui détermine le développement et le fonctionnement d'un organisme. Cette
information est contenue dans l'enchaînement non-aléatoire de nucléotides.
2. Une autre fonction essentielle de l'ADN est la transmission de cette information de génération en génération. Cela permet l'hérédité.
3. L'information portée par l'ADN peut se modifier au cours du temps. Cela aboutit à une diversité des individus et à une évolution possible des espèces.
Cela est dû à des mutations dues principalement à des erreurs lors de la réplication des séquences de l'ADN (ajout, délétion ou substitution
de nucléotides), ou bien à des recombinaisons génétiques.

L'ADN est donc le support de l'information génétique mais aussi le support de ses variations. En subissant les effets de la sélection naturelle, l'ADN permet
l'évolution biologique des espèces.
-Expression de l'information portée par l'ADN :

ARN
1-Introduction
L'acide ribonucléique (ARN) est une molécule biologique trouvée dans pratiquement tous les organismes vivants, y compris certains virus. L'ARN est une
molécule très proche chimiquement de l'ADN et il est d'ailleurs en général synthétisé dans les cellules à partir d'une matrice d'ADN dont il est une copie. Les
cellules vivantes utilisent en particulier l'ARN comme un support intermédiaire des gènes pour fabriquer les protéines dont elles ont besoin. L'ARN peut remplir de
nombreuses autres fonctions et en particulier intervenir dans des réactions chimiques de la cellule.

Chimiquement, l'ARN est un polymère linéaire constitué d'un enchaînement de nucléotides. Chaque nucléotide contient un groupement phosphate, un sucre,
le ribose et une base azotée. Les nucléotides sont liés les uns aux autres par des liaisons phosphodiester. On trouve quatre bases azotées dans l'ARN, l'adénine,
la guanine, la cytosine et l'uracile. L'ARN a de nombreuses similarités avec l'ADN, avec cependant quelques différences importantes : sur le plan de la structure,
l'ARN contient un ribose à la place du désoxyribose de l'ADN, ce qui rend l'ARN chimiquement plus instable et la thymine de l'ADN y est remplacée par l'uracile,
qui possède les mêmes propriétés d'appariement de base avec l'adénine. Sur le plan fonctionnel, l'ARN est le plus souvent trouvé dans les cellules sous forme de
simple brin, tandis que l'ADN est présent sous forme de deux brins complémentaires, formant une double hélice. Enfin les molécules d'ARN trouvées dans les
cellules sont plus courtes (de quelques dizaines à quelques milliers de nucléotides) que l'ADN du génome (de quelques millions à quelques milliards de
nucléotides).

Figure: sequence de L’ARN

2-types de ARN
Trois types principaux

1-ARN messenger (mARN) –transferts code de l'ADN aux ribosomes pour la traduction.
2-ARN de transfert(tARN) –apporte les acides aminés aux ribosomes pour la synthèse des protéines.

3-ARN ribosomique(rARN) – Les ribosomes sont des ARNr et de protéines.

Les biologistes attribuent à l'ADN deux rôles fondamentaux : il est le support de l'information génétique,
et permet la transmission des informations génétiques de cellule en cellule et de génération en génération.

Support de l'information génétique

C'est l'assemblage des bases les unes par rapport aux autres qui détermine le contenu de cette information,
notamment au travers des gènes. Ainsi, selon l'ordre de succession des bases, l'information que l'ADN
contient ne sera pas la même par exemple, l'ordre AAAGATCGA est différent de ATAGAAGCA. Ce code
génétique permet en particulier la synthèse de protéines celleci passe d'abord par la traduction de l'ADN en
ARN messager, qui passe dans le cytoplasme où il est transcrit en protéines.

Transmission de l'information : la réplication

Le maintien de l'information génétique dans l'organisme et sa transmission sont assurés par la capacité qu'a
une cellule de former deux molécules d'ADN ayant la même séquence, à partir d'une seule. Ce processus
biochimique, appelé réplication, est fondé sur la propriété de complémentarité des bases AT et GC. Il fait
intervenir un brin d'ADN chromosomique, des bases A, G, T et C libres, et plusieurs enzymes catalysant cette
réaction, les ADN polymérases.

Pour que la réplication puisse avoir lieu, les deux brins de la molécule d'ADN s'ouvrent, un peu comme une
fermeture à glissière. Chaque brin est alors parcouru par une molécule d'une enzyme spécifique, l'ADN
polymérase. Cette dernière synthétise un nouveau brin, complémentaire du premier, en accolant bout à bout
des bases libres. à la fin du processus, au lieu d'une, il y a désormais deux molécules d'ADN : chacune est
constituée d'un brin nouvellement formé et d'un brin ancien la réplication est dite semiconservative.

La réplication permet, de former, à partir d'une cellule " mère", deux cellules filles possédant les mêmes
chromosomes (dans lesquels un brin provient de la cellule mère, et l'autre est nouvellement synthétisé), par
ailleurs identiques à ceux de la cellule mère.

C'est ce mécanisme, qui explique comment l'information génétique est conservée dans toutes les cellules de
l'organisme, , lesquelles vont permettre la transmission de cette information à la descendance (c'est
l'hérédité). La réplication est, de la même façon, à l'origine de la permanence des caractéristiques globales de
chaque espèce animale, végétale, virale ou bactérienne.

Transcription
Même si, pour les procaryotes et les eucaryotes, l'ADN ne se trouve pas sous la même forme, il renferme dans les deux cas l'information génétique, c'est-à-dire
que des zones de l'ADN appelées “gènes” codent les protéines. Mais comment une séquence d'acides nucléiques peut-elle coder une séquence d'acides
aminés ? En fait, lorsque la cellule aura besoin de protéines (par exemple, des protéines de structure lors de sa division, ou des enzymes pour fabriquer les
molécules dont elle a besoin pour fonctionner), elle va transcrire, c'est-à-dire recopier une partie de ses gènes (c'est-à-dire les gènes codant les protéines
d'intérêt) sous forme d'ARN grâce à une enzyme nommée “ARN polymérase ADN dépendante de type II”. Cette enzyme va produire un ARN messager (ARNm)
identique à la séquence d'ADN (par exemple : AUGUCUUUAUGU…UAG) du gène. L'existence de l'ARNm a été démontrée par Jacques Monod et ses
collaborateurs, ce qui lui valut leprix Nobel de Médecine en 1965. À l'inverse de l'ADN, l'ARNm n'est pas sous forme de double hélice et il adopte des structures
secondaires complexes. Il est moins stable que l'ADN, c'est-à-dire qu'il est dégradé plus facilement, de par la présence d'un ribose à la place d'un désoxyribose.
Le ribose est très sensible à l'hydrolyse alcaline, tandis que le désoxyribose y est totalement insensible.
La transcription est un processus complexe et l'élucidation de ses mécanismes fut l'une des grandes avancées de la biologie de la seconde moitié du XXe siècle.
C'est un processus hautement régulé, notamment grâce à des protéines appelées facteurs de transcription qui, en réponse à des hormones par exemple, vont
permettre la transcription de gènes cibles (par exemple les gènes exprimés quand la cellule reçoit des œstrogènes, ou de la progestérone, des hormones dites
sexuelles). Une dérégulation des mécanismes de contrôle et la machinerie s'emballe, les ARN sont transcrits de manière désordonnée, les protéines sont
présentes en excès, entraînant un fonctionnement aberrant des cellules, un fonctionnement cancéreux. En effet, dans un grand nombre decancers, la
transcription de certains gènes est altérée, ce qui entraîne un dérèglement total de la cellule qui se divise activement et de façon désordonnée.

Molécules d'ARN sont produits en copiant une partie de la séquence nucléotidique de l'ADN dans une séquence complémentaire à l'ARN, un processus appelé
transcription.
Au cours de la transcription, l'ARN polymérase se lie à l'ADN et de séparation des brins d'ADN. ARN polymérase utilise ensuite un brin d'ADN comme matrice à
partir de laquelle les nucléotides sont assemblés en un brin d'ARNm

Figure : La transcription de L’ARN

Conclusion
On va conclure avec une différence entre L’ADN et L’ARN
-Présence d’un groupement 2’-OH sur le sucre

(au lieu du 2’-H): plus polaire

- Remplacement de la thymine par l’uracile

= suppression du groupement -CH 3

ARN = molécule linéaire «courte»

ADN long et ARN court

La plupart des ARN sont monocaténaires

ADN double brin et ARN simple brin

Petites modifications => grands effets