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ET ACIDES NUCLÉIQUES
Biochimie générale
FSS-UL_LS1-LS2
Introduction
• Acides nucléiques
• macromolécules informationnelles
• Deux types
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Introduction
• Information génétique exprimée sous forme de protéines
diverses dont l’activité permet la vie
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NUCLÉOTIDES
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COMPOSITION DES NUCLÉOTIDES
• Nucléotide = condensation de 3 molécules simples :
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Oses
β-D-Ribose β-D-2-désoxy-Ribose
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Acide phosphorique
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Bases azotés
Bases pyrimidiques
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Bases azotés
Bases puriques
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FORMATION DES NUCLÉOTIDES
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Nucléosides
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Nucléotides
= nucléosides monophosphates
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FORMATION ET NOMENCLATURE
DES NUCLÉOTIDES
Acide
Molécules constitutives Nucléotide
nucléique
Pentose Phosphate Base azotée
AMP (adénosine
Adénine
monophosphate)
CMP (cytidine
Cytosine
monophosphate)
ARN Ribose Phosphate
GMP (guanosine
Guanine
monophosphate)
UMP (uridine
Uracile
monophosphate)
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FORMATION ET NOMENCLATURE
DES NUCLÉOTIDES
Acide
Molécules constitutives Nucléotide
nucléique
Pentose Phosphate Base azotée
dAMP (désoxy adénosine
Adénine
monophosphate)
dCMP (désoxy cytidine
Cytosine
Désoxy- monophosphate)
ADN Phosphate
ribose dGMP (désoxy guanosine
Guanine
monophosphate)
dTMP (désoxy thymidine
Thymine
monophosphate)
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POLYMÉRISATION DES NUCLÉOTIDES
nucléotide
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POLYMÉRISATION DES NUCLÉOTIDES
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POLYMÉRISATION DES NUCLÉOTIDES
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NOTION D’HYBRIDATION A – T ET G – C
• Lorsqu’un acide nucléique est en solution les molécules
forment des liaisons hydrogènes associant les nucléotides
2 par 2, de sorte que
− un nucléotide à adénine se lie avec un nucléotide à
thymine (ou à uracile dans un RNA) et
− un nucléotide à guanine avec un nucléotide à cytosine
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ACIDE DÉSOXYRIBONUCLÉIQUE
• Molécules d’ADN
• formées de deux chaînes avec nucléotides
hybridés deux à deux sur toute la longueur
• deux chaînes antiparallèles, c’est à dire que
l’extrémité 5’ de l’une est du côté de l’extrémité
3’ de l’autre
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ACIDE DÉSOXYRIBONUCLÉIQUE
• Pour que tous les nucléotides puissent s’hybrider, il faut que
l’ordre dans lequel ils sont liés ensemble soit
complémentaire de la chaîne opposée
• en face de chaque A sur une chaîne doit se trouver T sur
l’autre chaîne
• Idem pour C et la G
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LA COMPOSITION EN BASES DE L’ADN
• Les molécules d'ADN présentent la caractéristique suivante :
• Bien sûr les proportions ([A] + [T]) et ([G] + [C]) ne sont pas
égales et varient de 35 à 75% selon l'ADN étudié (espèce)
- longueur
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EFFET HYPERCHROME OU HYPERCHROMICITÉ
• ADN dénaturé : absorption à 260 nm plus élevée que l'ADN natif (d'un facteur 1,6)
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FACTEURS DONT DÉPEND LA TEMPÉRATURE DE FUSION
− 76 °C pour ADN de P.
aeruginosa (G+C = 68%)
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ACIDES RIBONUCLÉIQUES (ARN)
• Acide ribonucléique :
• nucléotides (GMP, AMP, UMP, CMP)
• condensés avec liaisons phosphodiesters en une seule
chaîne
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ACIDES RIBONUCLÉIQUES (ARN)
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DIFFÉRENCE DE STRUCTURE ARN AVEC ADN
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DIFFÉRENCE DE STRUCTURE ARN AVEC ADN
ADN ARN
Bicaténaire en
Structure Monocatenaire
double-hélice
Adénine Adénine
Guanine Guanine
Bases azotées
Cytosine Cytosine
Thymine Uracile
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FONCTIONS DES ACIDES NUCLÉIQUES :
BIOSYNTHÈSE DES MACROMOLÉCULES
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LA RÉPLICATION : DEFINITION
• Fixation de l’ADN-polymérase 39
LA RÉPLICATION : MECANISME
Élongation
• Synthèse d’un brin complémentaire par condensation de
désoxyribonucléotides à partir de l’extrémité 3’ des amorces d’ARN
et dans le sens 5’-3’
• Brin complémentaire continu sur le brin direct
• Brin complémentaire discontinue sur le brin indirect
• Progression jusqu’à la prochaine fourche de réplication grâce à
hélicase et top-isomérase I (qui déroule l’ADN surenroulé en aval par
l’action de l’hélicase)
• Hydrolyse des amorces (activité RNase) et remplacement par des
désoxyribonucléotides
• Soudure des fragments d’ADN par ADN-ligase
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LA RÉPLICATION : MECANISME
Terminaison
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LA RÉPLICATION : MECANISME
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LA TRANSCRIPTION
Notion de gène
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LA TRANSCRIPTION
Notion de gène
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STRUCTURE D’UN GÈNE
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LA TRANSCRIPTION
Notion de gène
• L’ensemble des mécanismes qui à partir de la séquence du
gène conduisent à la production d’un acide ribonucléique ou
d’une protéine est désigné sous le terme d’expression de ce
gène
• Après la transcription l’ARN produit de la ARN-polymérase
ou transcrit primaire contient encore les introns et les exons,
mais pas le promoteur
• Après l’épissage des exons, le messager ne contient plus
que les exons réunis en une seule séquence codante
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LA TRANSCRIPTION : MÉCANISME
1. Initiation
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LA TRANSCRIPTION : MÉCANISME
2. Elongation
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LA TRADUCTION
• C’est la lecture d’un ARN messager par des ribosomes qui
synthétisent des protéines dont la structure primaire est
déterminée par celle de l’ARN messager
• La traduction est faite dans le cytoplasme des cellules
• La « lecture » du mRNA se fait de 5’ vers 3’ et la synthèse de
la protéine se fait en même temps de l’extrémité NH2 terminale
vers l’extrémité COOH terminale
• Après des réactions de maturation, la protéine « mature » est
prête à remplir sa fonction dans la cellule
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LA TRADUCTION
Signifiants
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LA TRADUCTION
Signifiants
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LA TRADUCTION
1. Initiation de la traduction
• Petite sous-unité du ribosome reconnait ARNm et se
fixe sur le codon d’initiation (AUG)
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LA TRADUCTION
2. Elongation de la traduction
• Protéine s’allonge par addition successive des acides aminés qui sont
apportés à chaque fois que le codon à lire leur correspond
• Ainsi de suite
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LA TRADUCTION
3. Terminaison de la traduction
protéine synthétisée
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Synthèse des protéines
Synthèse des protéines
LA TRADUCTION
Modifications post-traductionnelles
• Protéolyse limitée
• Ponts disulfures
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