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Le métabolisme : généralités

1. Définition
Le métabolisme est l’ensemble des réactions cellulaires. Il assure quatre fonctions
principales :
1. Obtenir de l’énergie à partir de la dégradation d es nutriments ou par
conversion de l’énergie lumineuse
2. Convertir les molécules de nutriment en précurseurs de macromolécules
3. Assembler ses précurseurs en macromolécules
4. Former et dégrader les biomolécules qui sont nécessaires aux fonctions
spécialisées des cellules (médiateurs chimiques)

2. Notion de voies métaboliques et de systèmes multienzymatiques


Une voie enzymatique est une succession de réactions comportant plusieurs étapes,
chacune d’elles étant catalysée par une enzyme particulière. Les enzymes qui
participent au processus sont connues sous le nom de système multienzymatique.
Soit la voie métabolique suivante, les enzymes EA, EB, et EC forment un système
multienzymatique.

EA EB EC
A B C D

Dans une cellule donnée, il y a plusieurs voies métaboliques, certaines sont


caractéristiques du type cellulaire mais d’autres sont universelles. Une voie
métabolique peut prendre plusieurs formes (linéaire, circulaire, hélicoïdale et
ramifiée), dans tous les cas, les composés qui sont le siège des transformations sont
appelés intermédiaires métaboliques ou métabolites.
A B C D

Voie métabolique linéaire


C D
A B

E F

Voie métabolique ramifiée

B E

D
C

Voie métabolique circulaire

3. Notion de catabolisme et d’anabolisme


Le métabolisme est composé de deux parties
1. Le catabolisme, c’est la partie du métabolisme qui consiste à dégrader les
combustibles cellulaires (glucides, lipides et protéines provenant du milieu extérieur
(alimentation) ou du milieu intérieur (substances de réserve). L’énergie provenant
de cette dégradation n’est pas directement libérée mais stockée sous forme d’ATP,
de NADPH ou de NADH
2. L’anabolisme, c’est l’ensemble des réactions de biosynthèse ou de
construction. Ces réactions consomment l’énergie fournie par le catabolisme.

EC

EAB EBC EDE


A B C D E

ED
Les deux voies ne se font pas par réversibilité c'est-à-dire que les réactions de
synthèse d’un composé ne sont pas l’inverse des réactions de sa dégradation, bien que
certaines étapes puissent être communes. Des contraintes thermodynamiques ou des
nécessité de régulation sont à l’origine de la séparation des deux voies métaboliques.

4. Les intermédiaires chimiques entre les processus endergoniques et


processus exergoniques
Les voies de dégradation et de biosynthèses sont liées par un transporteur de liaison
phosphate (ATP) et un transporteur d’hydrogènes et d’électrons (NADH) riches en
énergie. L’excédent d’énergie provenant du catabolisme est mis en réserve sous forme
d’ATP.

C’est le plus courant parmi les réserves énergétiques de la cellule. Ses principales
fonctions sont :
- Le travail de biosynthèse
- Le travail mécanique (contraction musculaire)
- Le travail osmotique (transport actif)
Ces réactions sont consommatrices d’énergie. Leur accomplissement se traduit par
l’hydrolyse de l’ATP en ADP +Pi. La régénération du stock d’énergie passe par la
phosphorylation de l’ADP lors des réactions exergoniques
Cycle d’utilisation de l’ATP

Le deuxième intermédiaire chimique est représenté par les pyridines nucléotides


réduits que sont le NADH et le NADPH. Ces deux composés transportent les
hydrogènes et les électrons issus de la dégradation des métabolites.
O O
C H H
NH2 C
NH2
+ AH2
N
+
+ A + H+
N
R R
Métabolite
NADH
NAD+ réduit
Cycle du NAD+/NADH – NADP+/NADPH
A certaines étapes du processus oxydatif, les atomes d’hydrogène et les électrons
riches en énergie sont arrachés aux métabolites et transférés au NAD+ ou au NADP+
qui acquièrent ainsi un pouvoir réducteur. Le NAD+ cède ses électrons et ses
hydrogènes aux accepteurs terminaux quand il s’agit d’un processus qui génère de
l’énergie, tandis que le NADP+ les cèdent au cours des processus de biosynthèse.

5. Régulation des voies métaboliques


La cellule vivante dispose de plusieurs mécanismes pour réguler son activité selon le
principe de l’économie maximale. Il n’y aura pas de synthèse ou de dégradation
inutiles. La vitesse globale des réactions fournissant de l’énergie sera modulée par les
besoins de la cellule en ATP ou en NADPH. De même la vitesse de biosynthèse des
précurseurs et des biopolymères correspondants est fonction des besoins cellulaires du
moment. Trois principaux mécanismes régulent les voies métaboliques.
- La régulation allostérique
Le produit final de la voie inhibe l’enzyme d’initiation, c’est un contrôle à court terme

-
EA EB EB ED
A B C D E

- Le contrôle hormonal
Essentiellement rencontré chez les organismes supérieurs, ce type de contrôle
implique l’intervention des hormones qui interagissent avec des récepteurs
spécifiques pour provoquer une chaîne de réactions aboutissant soit à une stimulation
soit à une inhibition du système enzymatique.
- Le contrôle au niveau de la synthèse enzymatique par induction ou par
répression
C’est un contrôle au niveau de l’expression des gènes. Il se traduit par l’augmentation
ou la diminution de la synthèse des enzymes intervenant dans le métabolisme d’un
substrat particulier. C’est un contrôle à long terme.

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