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UNIVERSITE ABDELMALEK ESSAADI

Faculté des Sciences de Tétouan

Département de Biologie

Voies métaboliques et régulations


Module: Biochimie Approfondie
Sciences de la vie S6

Adnane LOUAJRI
alouajri@uae.ac.ma
INTRODUCTION GÉNÉRALE
Rappels :
- Métabolisme : du terme grec metabole ce qui signifie , changement ou transformation.
Ensemble de transformations chimiques dans une cellule ou ensembles de cellules.
Transformations des nutriments en produits finis et en énergie

- Le métabolisme comporte plusieurs centaines de réactions enzymatiques. Ces réactions


sont organisées en séquences ou voies.

• voie métabolique :

P (S) - ---- > M1----> M2 ------> M3 -----> Pr (s)

P ou S : Précurseur ou substrat initial

M1, M2: Intermédiaires métaboliques,métabolites

Pr (s) : Produit final

Le métabolisme cellulaire a deux principales objectifs:

- Production d’énergie nécessaire aux différentes fonctions cellulaires

- Synthèse de macromolécules

On distingue deux grands volets

- Catabolisme et Anabolisme

Il faut signaler que l'anabolisme et le catabolisme se déroulent simultanément dans une


même cellule. Pour une bonne organisation et afin d'assurer un fonctionnement normal et
continu la cellule utilise deux stratagèmes :

- Régulations séparées du catabolisme et anabolisme

- Compartimentation cellulaire: Séquences en compétition localisées dans compartiments


distincts

Exemple : Catabolisme acides gras dans mitochondrie et synthèse ou anabolisme des a-


gras dans cytosol
• Mécanismes généraux de régulation
La Régulation se fait à trois niveaux

- Enzymes allostériques: vitesse de réaction modulée par des effecteurs (inhibiteurs ou


activateurs)

- Hormones : Action sur activités enzymatiques via des protéines transductrices du signal

- Contrôle génétique du taux d’expression d’enzymes

Il faut signaler qu'il y a deux éléments majeurs participant à l'homéostasie cellulaire:

- Irréversibilité de certaines réactions dans des voies

- Compartimentation cellulaire.

Organite Fonction

Mitochondrie Cycle de Krebs, Phosphorylation oxydative, oxydation des a- gras,

Cytosol Glycolyse, voie des pentoses, biosynthèse des a-gras, néoglucogé

Réticulum endoplasmique lisse Biosynthèse des lipides et des stéroides

Réticulum rugueux Synthèse des protéines membranaires et sécrétées

Peroxysomes Réactions d’oxydation(aoxydases- catalases)

Lysosomes Digestion de constituants cellulaires


Métabolisme et échange d’énergie
Lors du catabolisme le contenu en énergie libre des nutriments est récupéré par couplage
avec une synthèse d’intermédiaires riches en énergie essentiellement en ATP. Ces
intermédiaires métaboliques sont utilisés potentiellement dans des réactions de
l’anabolisme (endergoniques).

Réaction hydrolyse ATP

ATP +H2O ------------------> ADP + Pi

- Sens 1(de gauche à droite) : Réaction exergonique -----------> énergie libérée

- Sens 2 (de droite à gauche) : Formation ATP à partir ADP . Nécessite de l’énergie.
Endergonique

- Utilisations de l’ATP

L'ATP formé peut servir pour:

- Dégradation préliminaires des oses impliquant une phosphorylation

- Processus physiologiques: Transport de molécules, pompes cellulaires, contraction


musculaires, transmission de signal……

- Hydrolyse de liaisons pyrophosphates lors de réactions très endergoniques

ATP------------> AMP + 2 Pi

- Formation d’ATP

Deux processus principaux assurent dans la cellule le renouvellement de l’ATP :

- Phosphorylation liée au substrat : A partir d’intermédiaires dont le contenu en


énergie libre est plus élevé que celui d’une liaison Phospho-anhydride

- Oxydations phosphorylantes mitochondriales

• Métabolisme et réactions d’oxydoréductions


Les nutriments sont des sources d’énergie chimique car leurs atomes de carbone
se trouvent initialement dans un état réduit

Le catabolisme est oxydatif : Atomes d’hydrogène produits lors des voies


cataboliques, sont transportés sous forme d’ions hydrures par un coenzyme NAD + .
Le NADH,H+ formé sera oxydé par oxydations phophorylantes (chaîne
mitochondriale)

Ainsi le système NAD+/NADH,H+ sert pour le transfert des électrons des substrats
aux mitochondries avec comme accepteur final L’O2.

L' anabolisme est un processus essentiellement réducteur . Le pouvoir réducteur


fourni par le NADPH,H+

Le NADPH, H+ est considéré comme une navette d’électrons entre les réactions
cataboliques et réactions anaboliques.

• Remarque :

Certaines voies centrales du métabolisme comme cycle de Krebs ont double rôle
(Anabolique et catabolique) Voies amphiboliques

Régulation des voies métaboliques : Principes généraux


Il faut prendre en considérations les rappels suivants:

→ Voie est une succession de réactions enzymatiques

→ Faut un contrôle fin et continu

→ Les différentes voies sont interconnectées.

De ce fait il faut une coordination générale, essentielle pour un fonctionnement normal

 Au niveau métabolique on a :

→ régulations propres à chaque voie

→ régulations entre les voies

→ régulations en fonction de l’état physiologigue


Il est important de souligner que le contrôle s’effectue au niveau des réactions irréversibles
catalysées par des enzymes allostériques

Différents éléments de régulation


Plusieurs élément et facteurs participent à la régulation des voies métaboliques sont:

1- Perméabilité membranaire

2- Disponibilité en substrats et coenzymes

3- Régulateurs “exogènes” du métabolisme

(hormones, facteurs de croissance, neuromédiateurs, cytokines…)

4- Régulation du nombre de molécules enzymatiques actives avec trois niveaux


d'intervention

→ contrôle transcriptionnel

→ contrôle traductionnel

→ contrôle post traductionnel

Régulateurs hormonaux de l’homéostasie glucidique

 L'insuline est une hormone hypoglycémiante.

 Glucagon, glucocorticoïdes, adrénaline et hormone de croissance sont


hyperglycémiantes.

 L'action de ces régulations à lieu principalement au niveau du foie, muscles et tissu


adipeux.
Schéma générale d'une régulation hormonale

 Remarque :

 Il s’agit d’un schéma général pour des hormones et médiateurs dont les récepteurs sont
membranaires

 Les stéroïdes par exemple n’ont que des récepteurs intracellulaires.

Action sur la transcription de gènes

Fixation ------------> passage au noyau----> activation d’expression de gènes


Contrôle transcriptionnel

 S’effectue sur la vitesse de la transcription de l’ADN et sur la stabilité de l’ARN

 Synthèse des isoenzymes

Isoenzymes:

→ Catalysent la même réaction (exemple hexokinase musculaire et glucokinase


hépatique)

→ Cinétiques différentes (Km différentes)

→ Affinités vis à vis du substrats différentes

→ Régulation différente

 Intérêt des isoenzymes :

→ Obtenir des profils métaboliques selon l’organe.

Exemple glycogène phosphorylase du muscle à des régulateurs différents de ceux


hépatiques

→ Assurer des localisations subcellulaires différentes avec différence du rôle


métabolique
Exemple: isocitrate deshydrogénase mitochondriale différente de celle cytosolique

→ Adapter les activités enzymatiques aux différentes étapes du développement

Exemple : Tissus embryonnaires et du foetus différents des adultes

Contrôle Traductionnel

 Se fait au niveau de la vitesse de traduction et sur la demi-vie de la protéine

→ Effet sur la quantité de protéines enzymes et sur leur stabilité

Contrôle post-traductionnel

 Deux types :

- régulation allostérique

- régulation par modification covalente

1- Régulation allostérique

Enzyme oscille entre 2 états conformationnels R et T

- Etat R ou relâché posséde une bonne affinité pour le substrat (Km faible)

- Etat T ou tendu faible affinité pour le substrat (Km élevé)

Le passage d’un état à l’autre : transition allostérique


2- Régulation par modification covalente

L’activité d’une enzyme peut être modifiée par liaison à une molécule. Cette
modification est en général réversible: phosphorylation ou acétylation, d'autres sont
irréversibles comme la modification lipidique membranaires--- ---> localisation enzyme

Régulation par phosphorylation/ déphosphorylation

→ L’addition d’un groupement phosphoryle sur la fonction hydroxyle de résidus Ser-


Thr-ou Tyr provoque une modification d’activité de l’enzyme

→ Les phosphorylations sont catalysées par des protéines kinases soumises aussi à
régulation

→ Les phosphatases ( soumises à régulation) assurent les déphosphorylations

Remarque: La modification de l’activité enzymatique par phosphorylation n’est pas


forcément une activation . Elle peut entrainer une inactivation. Les mêmes considérations
pour les déphosphorylations

ENTRÉE DU GLUCOSE DANS LA CELLULE


Le passage membranaire du glucose se fait par des transporteurs dits GLUT. Ce
transport se fait dans le sens de la concentration. Les transporteurs : sont des
glycoprotéines de 500 acides aminés avec 12 régions hydrophobes avec insertion par
12 domaines transmembranaires

Il y a cinq types de GLUT (GLUT 1- ------GLUT 5)

 GLUT à faible Km (Ex GLUT 1) :

- forte affinité pour glucose,

- dans conditions pysiologiques presque saturation de ces transporteurs,

- En cas d’augmentation de glycémie pas de grande entrée du glucose

● GLUT à moyen Km (ex GLUT 4) ;

- Agit quand les GLUT 1 saturent,

- Le seul sous dépendance d’insuline au niveau cellules musculaires et adipocytes


 GLUT à fort Km (Ex GLUT 2) :

- Faible affinité

- Sert à faire entrer du glucose une fois les GLUT 1 sont saturés

- Entrée proportionnelle à la concentration du glucose


Métabolisme glucidique

I- Glycolyse
• Catabolisme du glucose

• Voie presque universelle

• Dans certains tissus et types cellulaires des mammifères, le glucose est la seule
source d’énergie

• Nombreux micro-organismes dépendent totalement de la glycolyse

• Glycolyse diffère d’un groupe d organismes à l’autre seulement dans les détails de la
régulation et le devenir du pyruvate

• 10 étapes ou réactions enzymatiques dont trois irréversibles.

• Deux phases de 5 réactions chacune.

• Préparatoire et de remboursement

Première phase

• Préparatoire ou d' investissement

• Cinq étapes ou réactions enzymatiques


Première étape

• Réaction irréversible

• Enzyme : Hexokinase. Dans le foie une Glucokinase

• Kinases enzymes catalysant le transfert d’un groupement phosphoryl terminal de


l’ATP à un accepteur (sous catégorie des transférases)

• Besoin de Mg2+

Deuxième étape

Glucose -6-P ⇌ Fructose-6-P

• Isomérisation réversible d’un aldose en cétose

• Conversion du glucose -6 -Phosphate en Fructose -6- Phosphate

• Modification faible d’énergie libre standard

• Besoin de Mg2+

Troisième étape
Fructose-6-P + ATP --------- Fructose-1,6-di phosphate +ADP

• Phosphorylation du F-6-P en F-1,6-biphosphate

• Enzyme : Phosphofructokinase-1
• (pyrophosphate) et non l’ATP

• Point majeur de la régulation de la glycolyse

Quatrième étape

Fructose-1,6-di P ⇋ G-3-P + DHAP

• L’enzyme : Fructose1,6-biphosphate aldolase.

• Réaction réversible

• Clivage du Fructose-1,6-biphosphate en deux trioses phosphates différents :

- Glycéraldéhyde -3-phosphate (G-3-P)

- Dihydroxyacétone phosphate (DHAP)

Cinquième étape

DHAP ⇌ G-3-P
• Inter conversion des trioses phosphates

• Dihydroxyacétone phosphate est rapidement et réversiblement converti ou transformé en G-


3-P

• Enzyme : Triose phosphate isomérase

Deuxième Phase

• Phase de remboursement

• Tout ce qui est fourni et ce qui est obtenu lors de cette phase doit être multiplié par
deux

• Important pour dresser le bilan de la glycolyse


Sixième étape

G-3-P + NAD+ + Pi ⇋ 1,3- biphosphoglycérate + NADH,H+


• Oxydation du G-3-P en 1,3-biphosphoglycérate

• Le groupement aldéhyde du G-3-P est déshydrogéné en anhydride d’acide


phosphorique (acylphosphate). Type avec énergie libre standard d’hydrolyse très
élevée.

• Accepteur d’hydrogène (Hydrure) est le NAD+

• Enzyme Glycéraldéhyde-3-P déshydrogénase

Septième étape

1,3-biphosphoglycérate + ADP -------> 3- phosphoglycérate+ ATP

• Enzyme : Phosphoglycérate kinase

• Réaction avec la précédente (6ème étape) constitue un mécanisme de couplage


énergétique

• Formation ATP par transfert du groupement phosphate à partir du 1,3 BPG:


Phosphorylation au niveau du substrat ou liée au substrat.

Huitième étape

3- phosphoglycérate ⇌ 2-phosphoglycérate
• Transformation du 3-phosphoglycérate en 2-phosphoglycérate

• Enzyme : Phosphoglycérate mutase

• Cofacteur de la réaction est le 2,3 DPG

• Réaction réversible
Neuvième étape

2- phosphoglycérate ⇋ PEP + H2O

• Transformation du 2-phosphoglycérate en phosphoénolpyruvate (PEP)

• Réaction générant un composé avec un haut potentiel de transfert du Phosphate

• Enzyme : énolase élimination réversible d’H2O

• Contenu en énergie libre du PEP est 4 fois > à celui du 2-PG

Dixième étape

PEP + ADP---------------> Pyruvate + ATP


• Transfert du groupement phosphate du PEP à l’ADP: formation d’ATP

• Phosphorylation liée au substrat

• Réaction pratiquement irréversible

• Modification d’énergie libre standard fortement négative (-7,5Kcal/mole)

• Enzyme : Pyruvate Kinase (PK)

• Site important de régulation

II- Gluconéogénese ou néoglucogénese GNG


• Synthèse à novo du glucose
• A partir des lipides*, des acides aminés et du lactate

• Le lactate produit par fermentation du glucose dans le muscle est véhiculé jusqu’au
foie ou sert de précurseur à la GNG

• Dans le segment pyruvate -------> glucose la GNG décrit trois lacets où s’écarte de la
glycolyse (Différences au niveau de trois étapes)

• Premier lacet
• La conversion du pyruvate en PEP est presque impossible dans les conditions
cellulaires

• Contournement métabolique en deux étapes

- Première mitochondriale

- Deuxième cytosolique

• Pyruvate pénètre dans la matrice mitochondriale par système de transport spécifiqu

• Carboxylation au lieu d’une phosphorylation; un groupement d’anhydride d’acide


phosphorique est rompu . Le groupement Phosphoryle n’est pas fixé ---> apparition
sous forme Pi

• L’oxaloacétate est converti en malate par malate déshydrogénase mitochondriale

• Malate est transporté vers cytosol puis conversion en oxaloacétate par malate
deshydrogénase cytosolique
• Puis réaction oxaloacétate --------> PEP

• Deuxième lacet :
• Fructose -1,6-BiP + H2O -----> F-6-P + Pi

• Déphosphorylation

• Enzyme : Fructose-1,6-biphosphatase

• Régulation coordonnée et inverse du PFK-1

• Troisième lacet:
• Déphosphorylation du glucose -6-phosphate

• Glucose-6-P + H2O --------> Glucose + Pi

• Enzyme : Glucose 6-Phosphatase

• Le foie est le seul organe ou l’un des termes possibles de la GNG soit le glucose

• Dans la majorité des cellules pas de G-6-Ptase; Synthèse de polysaccharides à partir


du G-6-P

Cycle de Cori

• Au cours d’un effort musculaire débordement des capacités respiratoires


• Pyruvate --------> Lactate par lactate deshydrogénase

• Passage dans sang et véhiculé jusqu’au foie

• Lactate -------> pyruvate -------> synthèse glucose (GNG)

Régulations Glycolyse/Gluconéogénèse
Hexokinase musculaire
- KM= 0,1mM Forte affinité pour le glucose

- inhibition allostérique par le Glucose-6-phosphate. Rétroinhibition

- Augmentation du taux de Pi lève cette inhibition.

Hexokinase D ou Glucokinase hépatique


- KM= 10mM Faible affinité

- Inhibée par le Fructose-6-phosphate par intervention du GRP (glucose regulatory


protein):

La GRP possède une affinité pour le fructose-1- phosphate

Le fructose-1-phosphate entre en compétition avec le F-6-P et lève son inhibition

F-1-P présent dans le foie quand fructose dans le sang

Phosphofructokinase-1 (PFK-1)
- Plusieurs sites régulateurs

- Taux d’ATP élevé------> inhibition PFK-1


- ADP et AMP agissent allostériquement pour éliminer cette inhibition par ATP

- Augmentation concentration du citrate-------> accentue l’effet inhibiteur de l’ATP

Le F-2,6-biphosphate (F-2,6-biP) activateur puissant de la PFK-1.

La concentration du F-2,6-biP est sous contrôle du glucagon

Sécrétion du glucagon -------> diminution de la concentration du F-2,6-biphosphate

• Explication:

Quand hypoglycémie:

Sécrétion glucagon-------> activation adénylate cyclase -------> AMPc-------->

activation protéine kinase---->Phosphorylation du système PFK-2/F-2,6-


biphosphatase-------> Activation phosphatase/ inhibition kinase----> diminution [ F-2,6-BiP]
-------> Inhibition glycolyse/ Activation GNG

• Hyperglycémie:
AMPc---------> déphophorylation PFK-2/F-2,6-biphosphatase----------> activation
kinase---------> [F-2,6-biP]

Conséquence : activation glycolyse et inhibition de GNG

Pyruvate carboxylase (PC)


- Acétyl CoA activateur allostérique.

Excés d’acétyl CoA mitochondrial par rapport besoins de la cellule---------> GNG possible

Pyruvate deshydrogénase (PDH)


- ATP, AcétylCoA, NADH (NAD réduit) ainsi que des acides gras à longues chaines sont
des inhibiteurs.

III- Glycogénolyse
Rappel :
Glycogène

- Macromolécule glucidique. Polysaccharide de réserve.

- Constitué de l’enchainement de molécules de glucose ou monomères.

- Les unités sont liées par des liaisons α (1—4) et présentant des ramifications α (1—6).
Glycogénolyse
Dégradation du glycogène

- Fait intervenir quatre enzymes:

- Glycogène phosphorylase

- Enzyme de débranchement

- Phosphoglucomutase

- Glucose-6-phosphatase (dans foie, reins, intestin)

Remarque: Régulation importante au niveau de la glycogène phosphorylase

Première réaction
- Phosphorolyse à partir de l’extrémité non réductrice du glycogène de la liaison α (1— 4)

- Action séquentielle répétitive avec production Glucose-1-phosphate

- La phosphorolyse ou action de la glycogène phosphorylase s’arrête à 4 résidus glycosyl


d’une ramification α (1—6).Dextrine limite.
Deuxième réaction
- Enzyme débranchant (α 1—6)/(α 1—4) glucane transférase

Deux activités :

→ Activité (α 1—4) transglycosylase; transfère de 3 unités de glucose

→ Activité glycosidasique ou (α 1--6) glucosidase; hydrolyse la liaison unique sur la


ramification
Troisième réaction
- Enzyme: Phosphoglucomutase

- Transformation du glucose-1-phosphate en glucose-6-phosphate

Glucose-1-P ⇌ Glucose-6-P

Remarque : Dans certains tissus ou organes (foie, reins, intestin) le glucose-6-phosphate


transformé en glucose par action d’une phosphatase Glycogénogénèse

IV- Glycogénogénèse
- Synthèse du glycogène

- Intervention des enzymes suivantes:

- Glucokinase

- Phosphoglucomutase

- UDP-glucose phosphorylase

- Glycogène synthase soumise à régulation

- Enzyme branchante

Première réaction (voir cours glycolyse)

Glucose+ ATP …………………> Glucose-6-P + ADP

Enzyme hexokinase

Deuxième réaction ( cours glycogénolyse)

Glucose-6-P ⇋ Glucose-1-P
Enzyme : phosphoglucomutase

Troisième réaction :
Remarque: la conversion du glucose-1-P en glycogène très endergonique donc
énergétiquement très défavorable, la cellule va utiliser le passage par des sucres nucléotides
avec réaction riche en énergie

- Enzyme UDP-glucose pyrophosphorylase

Glucose-1-P + UTP =======> UDP-glucose + PPi

La réaction est exergonique

Quatrième réaction
- Enzyme Glycogène synthase

- Transfert d’un glucose sur le C4 d’une extrémité non réductrice d’un fragment glycogène
existant ------> liaison (α 1—4)

Pour ce rallongement l’enzyme utilise la glycogénine protéine qui agit comme amorce.

Cinquième réaction
- Enzyme branchante ou amylo(α1—4)(α1-6)trans-glycosylase

Mécanisme : activité glycosyl (4—6) transférase catalyse le transfert d’un fragment de 6


glucoses sur le groupe hydroxyle en C6 d’un glucose de la même chaine ou une ramification
proche.

Effet de la ramification: augmenter la solubilité du glycogène et du nombre des


terminaisons non réductrices facilitant la sensibilté du glycogène pour la synthèse ou la
dégradation

Régulation métabolisme Glycogène


- Glycogène phosphorylase
Régulation allostérique directe:

Dans le muscle la GP est activée par AMP et Ca++ et inhibée par ATP et par G-6-P

- AMP -----> changement de l’état T inactif à R actif activation glycogénolyse


- ATP ----> vers forme T inactif-------> inhibition glycogénolyse

Régulation par phosporylation / déphosphorylation

Glycogène phosphorylase deux états de phosphorylation : forme <a> active et la forme<b>


inactive

Interconversion des formes <a> et<b> sous la dépendance de trois enzymes:

- phosphorylase b kinase

- protéine kinase AMPc dépendante----> phosphoryle GP ------> activation

- phosphoprotéine phosphatase---------> déphosphoryle GP -------> inactivation

En cas d’effort musculaire:

l’adrénaline provoque la phosphorylation de la forme<b> et la transforme en <a> dont


l’activité est indépendante du rapport ATP/AMP

Adrénaline --------> AMPc -------> activation PK A -----> phosphorylation de la phosphorylase


b kinase-------> Activation de la GP avec présence de Ca ++-------> Activation de la Glycogénolyse

Dans le foie la glycogénolyse est sous contrôle du glucagon et insuline. Régulation covalente
par phosphorylation/déphosphorylation:

→ Glucagon stimule la glycogénolyse

→ Insuline inhibe la glycogénolyse

En plus il y a régulation allostérique : rétrocontrôle par le glucose: augmentation de la


concentration du glucose inhibe la glycogène phosphorylase GP
Régulation de la Glycogène synthase
Glycogène synthase existe sous deux états:

- Forme <a> déphosphorylée active

- Forme <b> phosphorylée inactive

La glycogène synthase est régulée de manière opposée à la glycogène phosphorylase

Phosphorylation par PK A -AMPc dépendante ---------> inactivation de la glycogène synthase


Glycogénogénèse inhibée

Déphosphorylation par Protéine phosphatase----------> activation de la glycogène synthase


Glycogénogénèse stimulée

En période post prandiale (aprés repas)

- Régulation allostérique par ATP et glucose-6-P qui activent la glycogène synthase.

- Secrétion de l’insuline ------> activation de la GS par déphosphorylation------>


stimulation glycogénogénèse

V -Oxydation du pyruvate

 Le produit final de la glycolyse est le pyruvate

 Pyruvate pénétre dans la mitochondrie il est oxydé en présence de CoA-SH en


AcétylCoA.

 Enzyme catalysant la réaction est Pyruvate déshydrogénase PDH


Points essentiels:

▪ Il y a une décarboxylation, réduction du NAD+ en NADH,H+, formation AcétylCoA avec


une liaison riche en énergie.

▪ PDH : système multienzymatique

- Trois enzymes E1, E2, E3

- Cinq coenzymes (Thiamine pyrophosphate TPP, acide lipoique, CoA-SH, FAD, NAD)

Bilan:

Pyr+ NAD++ CoA-SH+ H2O------------> AcétylCoA + NADH,H+ + CO2

Régulation de la pyruvate déshydrogénase PDH :


Deux types :

▪ Allostérique directe par des effecteurs


Régulation par phosphorylation/ déphosphorylation

PDH existe sous deux formes ;

▪ PDH déphosphorylé active

▪ PDH-P (phosphorylée) inactive

→ AcétylCoA et NADH activent une PDH kinase-----> Phosphorylation-------> PDH inactive.

→ Ca2+ et insuline activent PDH phosphatase--->-déphosphorylation du PDH-P----> PDH


active.
VI - Fermentation lactique

 Dans certaines cellules animales comme les musculaires le pyruvate n est pas oxydé
en acétate mais transformé en lactate

 Les globules rouges dépourvus de mitochondries : formation lactate à partir du


glucose

 Enzyme catalysant la réaction est lactate déshydrogénase LDH

 Réaction réversible.

 Oxydation du NADH en NAD+

 Lactate peut enclencher la gluconéogenèse GNG au niveau du foie (cycle de Cori).

Cycle de Cori voir cours Glycolyse/GNG

VII Cycle de Krebs

• Voie universellement rencontrée dans les cellules aérobies

• Voie mitochondriale

• Voie appelée également du citrate et aussi des acides tricarboxyliques

• Voie Amphibolique
• Plusieurs origines de l’Acétyl-CoA (glycolyse- β oxydation des a gras- dégradation de
plusieurs a-aminés)

• A part l’entrée par Acétyl-CoA , existent d’autres entrées (a-gras nombre impaire de
carbones, α-cétoglutarate, et oxaloacétate…..)

• Huit réactions enzymatiques (dont une subdivisée en deux)

• Trois réactions soumises à régulation

Première réaction
• Condensation de l’Acétyl-CoA avec oxaloacétate

• Enzyme Citrate Synthase soumise à régulation et dépend de la disponibilité ou


concentrations des deux substrats

• ΔG= - 12,8 Kcal/Mole

Deuxième réaction

• Isomérisation réversible du citrate en isocitrate

• Enzyme : Aconitase

• Se subdivise en deux étapes avec Cis –Aconitate comme intermédiaire (voir schéma
du cycle)

• ΔG= 0,2 Kcal/Mole

Troisième réaction
• Oxydation de l’isocitrate en α-cétoglutarate

• Enzyme isocitrate deshydrogénase

• Irréversible et soumise à régulation

• Décaboxylation oxydative avec réduction du NAD+ en NADH,H+

• ΔG= -4 Kcal/Mole

Quatrième réaction

• Enzyme α-cétoglutarate deshydrogénase soumise à régulation

• Oxydation de l’α- cétoglutarate en succinyl CoA

• Décarboxylation avec réduction du NAD+ en NADH,H+

• Succinyl-CoA contient liaison thioester riche en énergie

• ΔG= - 10 Kcal/Mole

Cinquième réaction
• Enzyme : Succinyl CoA synthétase

• Réaction réversible

• Enérgie de la liaison thioester utilisée pour la synthèse de GTP à partir de GDP

• GTP ⇌ ATP

• ΔG= 0 Kcal/ Mole

Sixième réaction

• Enzyme : Succinate deshydrogénase

• Réaction réversible

• Coenzyme FAD : réduction du FAD en FADH2

• ΔG = 0 Kcal/Mole

Septième réaction
• réaction réversible

• Enzyme Fumarase

• ΔG = 0 Kcal / Mole

Huitième réaction

• Réaction réversible

• Enzyme : malate deshydrogénase

• Oxydation du malate en oxaloacétate et réduction du NAD + en NADH,H+

ΔG = 0 Kcal/Mole

Rôle métabolique du cycle de Krebs

• Oxaloacétate participe dans néoglucogénèse (cf cours GNG)


• Biosynthèse des acides gras besoin d’acétylCoA

• Biosynthèse des acides aminés besoin α-cétoglutarate et oxaloacétate

• Succinyl CoA nécessaire biosynthèse des porphyrines (de l’hème)

Régulation du cycle de Krebs

• Enzyme Citrate Synthase CS

L’ augmentation des taux de l’ATP et du citrate entraine une inhibition de l’enzyme


Citrate synthase.

Le succinyl CoA inhibe la CS ; il entre en compétition avec l’Acétyl-CoA (analogie de


structure) au niveau de l’enzyme.

• Isocitrate deshydrogénase

Augmentation du NADH et ATP entraine une inhibition de l’isocitrate


deshydrogénase

• α-cétoglutarate deshydrogénase

Augmentation du NADH et succinyl-CoA inhibent l’enzyme

VIII -Voie des pentoses phosphates VPP

 La voie principale de dégradation du glucose est la glycolyse


 Une partie du glucose est catabolisée par une voie secondaire: voie des pentoses
phosphates VPP. Appelée aussi voie du phosphogluconate

 Elle se déroule au niveau du cytosol

Intérêt de la voie :
Production du NADPH et du ribose -5-phosphate

->NADPH transporteur d’électrons équivalent réducteur . Nécessaire pour la


biosynthèse des acides gras et des stéroïdes (glande mammaire , cortex surrénalien, tissu
adipeux, foie).

->Ribose ------>synthèse acides nucléiques

 On distingue deux parties :

→ Partie oxydative avec 4 réactions

→ Partie non oxydative en cas de besoin important du NADPH,H+; dans certains tissus.
Réarangement des squelettes carbonés pour reproduire des sucres à 6 carbones (6C)

PARTIE OXYDATIVE
Première réaction

 Réaction irreversible

 Enzyme Glucose-6-phosphate déshydrogénase

 Réduction du NADP+ en NADPH,H+


 Point de régulation de la voie

Deuxième réaction

 Enzyme lactonase

 Réaction réversible

 Addition d’une molécule d’H2O

Troisième réaction

 Enzyme : 6- phosphogluconate déshydrogénase

 Réaction irréversible

 Réduction du NADP+ en NADPH,H+

 Décarboxylation C 6--------> C 5

Quatrième réaction
 Enzyme: Phosphopentose isomérase

 Réaction réversible

 Ribose-5- phosphate produit sert pour synthèse des nucléotides

 Dans nombreux tissus : dernière réaction de la VPP.

 Dans d’autres il y a une deuxième partie non oxydative

PARTIE NON OXYDATIVE

Dans les tissus avec besoin important en NADPH

Les pentoses-5-phosphates sont recyclés en hexoses-6-phosphates

Réarrangements des squelettes carbonés: sucres phosphate à 5 C sont transformés en


sucres à 6 C

Epimérisation du ribulose
 Le xylulose-5-phosphate et le ribulose -5-phosphate vont paticiper à la série de
réarangement des squelettes carbonés; partie non oxydative de la VPP

 Trois enzymes vont catalysé ses réactions :

→ transcétolase

→ transaldolase

→ trancétolase

Trancétolase : catalyse le transfert de trois atomes de carbone 2C

Transaldolase : catalyse le transfert de deux atomes de carbones 3C

Première étape :
Xylulose-5-P Sédohéptulose-7-P

+ ⇋ +
Ribulose-5-P Glycéraldéhyde-3-P

Transfert de 2 C du xylulose-5-P sur Ribulose-5-P catalysé par transcétolase

Coenzyme est le thiamine pyrophosphate

Deuxième étape

Sédoheptulose-7-P Fructose-6-P

+ ⇌ +
Glycéraldéhyde-3-P Erythrose-4-P

Transfert de 3 C du sédoheptulose au glycéraldéhyde catalysé par transaldolase

Troisième étape
Xylulose-5-P Fructose-6-P

+ ⇌ +
Erythrose -4-P Glycéraldéhyde-3-P

Transfert de 2 C catalysé par une deuxième trancétolase

 Bilan :
- Deux Fructose-6-phosphate s’isomérisent en deux glucose-6-phosphate
- Deux glycéraldéhyde-3-P peuvent donner du fructose-6-phosphate -------> glucose
-6-phosphate

Le glucose-6-phosphate est précurseur de la VPP.

Cétolase-aldolase-cétolase

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