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Métabolisme cellulaire :

- Catabolisme oxydative
INTRODUCTION

Pour vivre ; exécuter les nombreuses tâches essentielles à la vie (synthèse de la matière organique, transport des
substances, se déplacer, se reproduire, etc.), les cellules ont besoin en permanence de matières organiques et
inorganiques ainsi que d’énergie chimique, qu’elles tirent essentiellement de l’ATP.

L’énergie emmagasinée dans les molécules organiques des


aliments vient, en fin de compte, du Soleil.
L’énergie entre dans l’écosystème sous forme de lumière
solaire et en sort sous forme de chaleur.
➢ En revanche, les substances chimiques essentielles à la vie
sont recyclées :

✓ La photosynthèse : génère de l’oxygène et des molécules


organiques, qui servent de combustible pour la respiration
cellulaire chez les Eucaryotes (y compris chez les
organismes photosynthétiques).
✓ La respiration cellulaire : décompose ces molécules pour
produire de l’ATP. Les déchets de la respiration, soit le
CO2 et l’eau, sont la matière première de la photosynthèse.
INTRODUCTION

- Selon la façon dont les besoins en matières organiques et inorganiques ainsi que d’énergie chimique, seront
couverts, on distingue :
- Les espèces autotrophes (végétaux et nombreux micro-organismes), peuvent synthétiser des molécules
organiques à partir de précurseurs inorganiques (CO2).
- Les espèces hétérotrophes (animaux et champignons), dépendent de l’apport de substances organiques par la
nourriture.
La plupart des substances nutritives (protéines, sucres, acides nucléiques et lipides) ne peuvent être utilisées
directement → doivent d’abord être dégradées en éléments plus petits par des voies cataboliques
Les métabolites ainsi formés (= compartiment métabolique) vont :
1) soit aboutir à la formation d’énergie après de nouvelles transformation cataboliques
2) soit être de nouveau intégrés dans des molécules complexes par des voies anaboliques
La respiration cellulaire
La respiration décompose les molécules organiques produites par la photosynthèse (elles servent de
combustibles), pour produire de lʼATP. Elle utilise de l'oxygène, autre produit de la photosynthèse.
Les « déchets » de la respiration sont H2O et CO2, qui sont les matières premières de la photosynthèse.
Dans les voies métaboliques de la respiration cellulaire, des transformations biochimiques ont lieu et libèrent de
l’énergie. Ce processus se déroule en partie dans les organites nommés mitochondries
Les étapes de la respiration aérobie
1. la glycolyse
2. le cycle de Krebs (ou cycle de l'acide citrique)
3. la phosphorylation oxydative : chaîne de transport des électrons et gradient de protons
Les voies cataboliques : respiration et fermentation

Les voies cataboliques génèrent de l'énergie en oxydant des molécules organiques : ces molécules contiennent
beaucoup d'énergie potentielle dans l'arrangement de leurs atomes.
Des enzymes dégradent ces molécules en produits plus simples (donc contenant moins d'énergie), l'énergie
récupérée sert pour faire du travail et est dissipée sous forme de chaleur.
Fermentation = dégradation partielle du glucose en absence d'oxygène (anaérobie)
Respiration = dégradation complète du glucose en présence d'oxygène (aérobie)

C6H12O6 + 6 O2 ---> 6 CO2 + 6 H2O + énergie (ATP et chaleur)


= réaction exergonique

Au cours de la respiration, les électrons sont transférés des


molécules organiques (glucose) à l'oxygène.

C6H12O6 + 6 O2 ---> 6 CO2 + 6 H2O + énergie


le glucose est oxydé : il perd des électrons
l’oxygène est réduit : il gagne des électrons
La glycolyse :

Une phase de l’investissement et


une phase de la libération d’énergie.

✓ La glycolyse libère de l'énergie en


oxydant partiellement le glucose, en
deux molécules de pyruvate.

✓ Elle se passe dans le cytosol et sans


oxygène.

✓ Elle se réalise en 10 étapes, chacune


catalysée par une enzyme spécifique.

NAD+ : Nicotinamide Adénine


Dinucléotide transporteur d’électrons
La glycolyse : première phase = investissement d'énergie

La glycolyse : deuxième phase = libération d'énergie


Le cycle de Krebs ou cycle de l'acide citrique

1 étape = conversion du pyruvate en acétyl-CoA.


Cela se passe dans un complexe multienzymatique qui catalyse 3
réactions:

1- Décarboxylation ---> libère du CO2

2- Le fragment restant est oxydé, les électrons sont


transférés sur le NAD+

3- Ce fragment oxydé (= acétate) est lié au coenzyme A


(CoA)

Conversion du pyruvate en acétyl-CoA

2 étape = Le cycle de Krebs ou cycle de l'acide citrique .

L'acétate porté par le coenzyme A entre dans le cycle et y


est dégradé par oxydation en deux molécules de CO2. Les
électrons sont récupérés sur le NAD+ et sur un autre
accepteur d’électrons, le FAD.
Phosphorylation au niveau du substrat
Près de 90 % de l’ATP engendrée par la respiration cellulaire provient de la phosphorylation oxydative.
Dans ce mode de synthèse de l’ATP, une enzyme transfère un groupement phosphate d’un substrat à de l’ADP au
lieu d’ajouter un phosphate inorganique à l’ADP comme lors de la phosphorylation oxydative.

La phosphorylation au niveau du substrat.


Une partie de l’ATP est produite grâce au transfert
enzymatique direct d’un groupement phosphate
provenant d’un substrat organique à de l’ADP

La phosphorylation oxydative
C’est la transmission des électrons portés par le NADH et le
FADH2 pour produire de lʼATP.
Elle se fait par décomposition en étapes successives qui
permettent de récupérer une grande partie de lʼénergie =
chaîne de transporteurs des électrons.
La chaîne de transporteurs des électrons
✓ La chimiosmose constitue le mécanisme de couplage entre lʼénergie venant de la chaîne de transporteurs
des électrons et l’énergie utilisée par l’ATP synthase pour produire l’ATP.

L’ATP synthase, une turbine moléculaire


Rendement en ATP de la respiration

Pour une molécule de glucose :


✓ Glycolyse : 2 pyruvate + 2 ATP + 2 NADH
✓ Décarboxylation de 2 pyruvate : 2 acétate + 2 NADH
✓ Cycle de Krebs (2 acétate) : 6 NADH + 2 FADH2 + 2 GTP
--------------------------------------------------------------------------------
Chaîne de transport dʼélectrons : 1 NADH expulse 10 H +
1 FADH2 expulse 3 à 4 H+
✓ ATP synthase utilise 3 ou 4 H+ pour faire 1 ATP
La fermentation lactique ou alcoolique

C’est la production dʼATP en absence d'oxygène en anaérobiose.


Rendement = 2 ATP/glucose/phosphorylation au niveau du substrat
Cʼest un prolongement de la glycolyse qui permet de régénérer le NADH : les
électrons du NADH sont transférés au pyruvate ou à un dérivé. Elle permet donc
de maintenir lʼoxydation du glucose au cours de la glycolyse.

bactéries levures
bactéries levures cellules musculaires
Glycolyse et cycle de Krebs

Sont reliés à de nombreuses


voies métaboliques. La
respiration produit de l’ATP
à partir du glucose mais aussi
à partir d’autres molécules,
comme les lipides ou les
protéines.
La régulation de la respiration cellulaire

Des mécanismes de rétro-

inhibition régulent la respiration

cellulaire afin de ne pas

gaspiller du glucose lorsqu'il y a

assez d'ATP.
Exercice 1

1. La source d’énergie qui alimente directement la synthèse de l’ATP par


l’intermédiaire de l’ATP synthase pendant la phosphorylation oxydative est :
a) l’oxydation du glucose et d’autres composés organiques.
b) le flux endergonique des électrons dans la chaîne de transport d’électrons.
c) l’affinité du dioxygène pour les électrons.
d) le gradient de concentration de H+ de part et d’autre de la membrane abritant
l’ATP synthase.
e) le transfert du phosphate à l’ADP.
2. Pour une molécule de glucose, quelle est la voie métabolique commune à la
fermentation et à la respiration cellulaire aérobie ?
a) Le cycle de l’acide citrique.
b) La chaîne de transport d’électrons.
c) La glycolyse.
d) La synthèse de l’acétyl-CoA à partir du pyruvate

3. Quel est le dernier accepteur d’électrons de la chaîne de transport


d’électrons dans la phosphorylation oxydative aérobie ?

a) L’oxygène. b) Le pyruvate. c) L’eau. d) L’ADP. d) Le NAD+

4. Quel est l’accepteur d’électrons durant la phase de glucolyse ?

a) L’oxygène. b) Le pyruvate. c) L’eau. d) L’ADP. d) Le NAD+


5. Lors du catabolisme aérobie, la plus grande partie du CO2 est libérée pendant :

a) la glycolyse.
b) le cycle de l’acide citrique.
c) la fermentation lactique.
d) le transport des électrons.
e) la phosphorylation oxydative.

6- Le graphique ci contre montre l’évolution de la différence de pH


de part et d’autre de la membrane mitochondriale interne dans une
cellule qui respire activement. Au moment indiqué par la flèche
verticale, on ajoute un poison métabolique qui inhibe
spécifiquement et totalement le fonctionnement de l’ATP synthase
mitochondriale. Expliquez ce qui va se passer en traçant le reste de
la ligne rouge.
Exercice 2
O2, Ethanol, CO2 Glucose (u.a ) Milieu réactionnel :
(mg/ml)
- Suspension de levures
40
- Eau
- Glucose
30 Glucose CO2 Conditions expérimentales :
- Absence d’oxygène (milieu fermé)
- Température : 37°C
20

Ethanol
10 Analyser les résultats
O2 présentés sur le graphique ci-
0
contre
100 300 500 700
Temps (sec.)
Exercice 3
Expliques pourquoi :
Fermentation = dégradation partielle du glucose
Respiration = dégradation complète du glucose

• Respiration cellulaire :
la dégradation de la molécule de glucose, donne comme résidus deux
molécules inorganiques (minérales) dépourvues d’énergie à savoir le CO2 et
l’H2O : c’est une dégradation complète du glucose ;

• Fermentation :
la dégradation de la molécule de glucose donne comme résidu l’acide
lactique ou l’alcool : deux molécules organiques encore riche en énergie ;
c’est une dégradation incomplète du glucose
Exercice 4 :

Comment on peut transformer la matière organique consommée, en


molécules reconnaissables (métabolites) par les cellules et pouvant être
utilisées comme source d'énergie ?
Exemples des Glucides

Matière organique Dégradation chimique


Molécules simples
consommées (Dégitions par
(Métabolites/ Glucose)
(Glucides) enzymes)

Dégradation au niveau
Transport par le sang
des cellules
Vers les cellules
(Catabolisme)

Assemblage dans les


cellules
(Anabolisme)

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