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UE1 : BIOCHIMIE
COURS 9 – Métabolisme
Chaîne respiratoire ,
Phosphorylation oxydative
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UE1 - Biochimie– 9 – Chaîne respiratoire, Phosphorylation oxydative – Pr Lesage – date – heure
I. La phosphorylation oxydative
A) Rappels d’énergétique cellulaire
a) Principe de la phosphorylation oxydative
b) Interconnexions métaboliques
B) Localisation et substrats
a) Organisation de la mitochondrie
b) Substrats de la chaîne respiratoire : les coenzymes
A TOI DE JOUER
ACC
ASTUCES, pour répondre rapidement et sans erreurs
Correction détaillée
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I. La phosphorylation oxydative
But de la
phosphorylation
oxydative
Les composés carbonés sont tous capables de fournir des précurseurs du cycle de
Krebs, qui produit des co-enzymes réduits.
La respiration
cellulaire
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Ensemble des
réactions de la
respiration
cellulaire
La respiration cellulaire se positionne dans un pénomène plus global qui est un
métabolisme complet du glucose.
Glycolyse :
o produit 2 pyruvate (3C) à partir de glucose (6C)
o il n’y a que 2 ATP produits
o 2 NADH,H+ dans le cytoplasme
o Cas des érythrocytes = globules rouges (pas de mitochondries).
Les voies métaboliques sont interconnectées entre elles, en particulier les voies
cataboliques.
Définition Aussi bien les protéines que les polysaccharides et les graisses vont être dégradés
en acétyl CoA qui est le substrat du cycle de Krebs.
Les e- produits par le cycle de Krebs sont couplés aux H+ portés par les coenzymes
Alimentation de la réduits.
chaîne respiratoire
par tous les Le cycle de Krebs fournit donc des coenzymes réduits à la chaîne respiratoire et
composés permet la phosphorylation oxydative qui génère de l’ATP.
carbonés
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B) Localisation et substrats
a) Organisation de la mitochondrie
Membrane externe : très poreuse, perméable aux petites molécules et aux ions.
Membrane interne :
o Des repliements sous forme de crêtes pour augmenter la surface
d’échange avec la matrice : surface totale des mitochondries humaines :
environ 14 000m2.
o Présence de tous les complexes de la chaîne respiratoire, lieu de la
phosphorylation oxydative.
Structure
Rôles o plus le nombre d’ATP synthase est élevé, plus la mitochondrie est active.
o ex : le muscle cardiaque au repos est 1000 fois plus producteur d’ATP qu’un
autre muscle.
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NAD = constitué d’un squelette d'AMP et d‘un Non mobile(forme réduite = FADH2), lié de façon
nicotinamide. covalente( = groupe prosthétique) aux
E'0= - 0,32 V = -320 mV très électronégatif : oxydoréductases.
c’est un composé réducteur qui peut donc donner
facilement ses électrons. E'0 = -0,219 mV << 0 mais >E’0 du NAD
Ré-oxydé par le complexe I de la chaine pouvoir réducteur < pouvoir du NADH
respiratoire. pouvoir de générer l’ATP < pouvoir du
NADH,H+
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Fonctionnement
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Fonctionnement
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Les éléments
mobiles
Gènes Les mitochondries ont leur propre génome, de petite taille (16 000 pb).
mitochondriaux 13/37 des gènes codent des protéines de la chaîne respiratoire ou des sous-
et chaîne unités fonctionnelles. argument en faveur de l’origine endosymbiotique de la
respiratoire mitochondrie.
B) Rôle des potentiels d’oxydoréduction
a) Notion de potentiel rédox
L’organisation des composés de la chaîne respiratoire optimise le transport dirigé
des e- depuis le composé le plus électronégatif (réducteur : NADH,H+ ou
FADH2) vers l’accepteur final (l’oxygène).
Capacité à
céder/accepter La capacité de céder ou d’accepter des e- dépend d’un potentiel rédox (noté E’0) :
des électrons réaction réalisable seulement dans le sens des potentiels croissants.
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Les complexes I à IV étant tous constitués d’AAs, leurs propriétés rédox leur sont
conférées par :
-soit les groupements prosthétiques de types cytochromes (b, c1, a, a3,…).
-soit des propriétés de coenzymes notamment liés à la flavine (FADH2 et FMN).
Potentiel rédox
des complexes I
à IV
b) Equation de Nernst
Le potentiel rédox peut ensuite être converti en énergie utilisable pour un travail
mécanique, selon l’équation de Nernst :
Lien entre le
potentiel rédox
et l’enthalpie
Bilan
réactionnel de
l’oxydation des
deux types de
coenzymes
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L’accepteur de ces e- est l’ubiquinone (Q, fonction cétone) qui va passer sous forme
d’ubiquinol (QH2 = coenzyme Q réduit, fonction alcool), en passant par un
intermédiaire semiquinone :
o La réduction de l’ubiquinone induit un changement de conformation du
bras membranaire du complexe I : permet à 4 H+ de se déplacer et de
passer dans l’EIM pompage de 4 protons.
o Le coenzyme Q = quinone ubiquitaire, est alors enchâssé dans la
membrane par la présence d’une chaîne isoprénique hydrophobe (10
unités isopréniques = coenzyme Q10) qui lui permet d’être libre.
o E’0 (CoE Q) légèrement >0 mais < E’0 (O2) donc contient une énergie
utilisable qui va pouvoir être transférée au reste de la chaîne respiratoire.
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Structure
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2) Structure
L’ATP synthase est de grande taille : hauteur ~200 Å.
Sa tête dépasse du côté matriciel de la mitochondrie d’environ 100 Å.
Elle est constituée de 2 parties :
o Partie FO = partie mobile (12 sous-unités C, cible de l’oligomycine).
Se dit F« O » comme Oligomycine et non F « zéro » . Expérimentalement :
filament d’actine fluorescent accroché pour démontrer qu’elle était mobile.
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3) Fonctionnement
L’ATP synthase génère l’ATP par un travail mécanique en utilisant le gradient de H+
généré par les complexes I, III et IV.
Travail La formation de 3 ATP nécessite le passage dans l’ATPase de 9 H+ ~ aux 10 H+
mécanique issus du transfert d’e- du NADH + H+ au niveau des complexes I, III et IV.
≠ pour le FADH2, seulement 6 H+ sont pompés, qui ne permettent de générer que 2
ATP.
La charge négative
portée par l’Asp61
de chaque sous-
unité C est
neutralisée par un
Rotation des H+ et se déplace
sous-unités alors.
L’Asp61 repasse
sous sa forme -COO-
et est alors attiré par
l’Arg210
mécanisme
d’attraction-répulsion qui fait tourner les s-u C autour de la s-u γ de la partie F1.
C’est une réaction endergonique donc il faut une énergie qui va permettre de faire
ce travail.
o Le retour d’un H+ dans la matrice = libération de – 20,4 kJ
o La formation d’un ATP nécessite une ΔG = 45 kJ il faut 3 H+ et fournir un
Formation travail de -61,2 kJ.
d’ATP Bilan final : 2 coenzymes réduits :
o 1 NADH + H+ pompage de 10 H+ synthèse de 3 ATP.
o 1 FADH2 pompage de 6 H+ formation de 2 ATP.
Le reste de l’énergie disponible n’est pas perdu mais converti en chaleur qui
contribue à l’homéostasie thermique de l’organisme (à 37°C).
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Régulation
Dès que l’on fournit de l’ADP càd le substrat de l’ATP synthase, on va avoir un état
(3) correspondant à une intensité respiratoire élevée, où il y a consommation d’O2.
Une fois que tout l’ADP a été transformé en ATP, on a une régulation et à nouveau la
chaîne respiratoire se met à fonctionner à l’état basal (4).
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Des molécules telles que le dinitrophénol (DNP) ou le FCCP peuvent capter les H+
et diffuser vers l’EIM.
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Anion
superoxyde
Peroxyde L’anion superoxyde peut être pris en charge par la superoxyde dismutase (SOD),
d’hydrogène lorsque la cellule fonctionne correctement, qui va générer du peroxyde
d’hydrogène (H2O2 = eau oxygénée).
Le peroxyde d’hydrogène est lui-même utilisé par le glutathion qui est important
pour le maintien du potentiel rédox de la cellule.
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A TOI DE JOUER
ACC : Phosphorylation oxydative
Décembre 2015
QUESTION N°61
A propos des coenzymes, une seule proposition est exacte, laquelle ?
A. Ce sont les substrats du complexe II de la chaîne respiratoire
B. Ils comportent un désoxyribose dans leur structure
C. Ils sont majoritairement produits par le cycle de Krebs
D. Ils utilisent la navette malate/aspartate
E. Aucune proposition n’est exacte
QUESTION N°62
A propos de la chaîne respiratoire, une seule proposition est exacte, laquelle ?
A. Elle comporte cinq complexes et un unique coenzyme libre
B. Elle permet le transport dirigé des protons via des centres fer-soufre
C. Environ la moitié de ses protéines sont codées par le génome mitochondrial
D. Elle fonctionne grâce à une différence totale de potentiel rédox supérieure à
600 mV
E. Aucune de ces propositions n’est exacte
QUESTION 63 :
A propos du complexe II de la chaîne respiratoire, une seule proposition est exacte,
laquelle ?
A. Il est aussi appelé Succinate Ubiquinone Oxydase
B. Il génère un produit de réaction utilisé dans le cycle de Krebs
C. Il comporte du FAD comme accepteur final des électrons
D. Il produit une énergie notée ΔG° suffisante pour pomper 3 protons
E. Aucune de ces propositions n’est exacte
QUESTION N°64 :
A propos de la théorie chimiosmotique, une seule proposition est exacte, laquelle ?
A. Elle a été formalisée bien après la découverte du fonctionnement du complexe V
B. Elle utilise une différence de pH entre la matrice mitochondriale et le
nucléoplasme
C. Elle permet de générer de l’ATP uniquement s’il existe un gradient de pH
suffisant
D. Elle propose que la synthèse d’ATP est couplée à la pression osmotique cellulaire
E. Aucune de ces propositions n’est exacte
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UE1 - Biochimie– 9 – Chaîne respiratoire, Phosphorylation oxydative – Pr Lesage – date – heure
Décembre 2014
QUESTION N°49
Parmi les couples oxydo-réducteurs suivants, lequel possède une valeur de potentiel E0’
inférieure au couple FAD/FADH2 ?
A. Cytochrome C1 oxydé / Cytochrome C1 réduit
B. Ubiquinone / Ubiquinol
C. FMN / FMNH2
D. Cytochrome A oxydé / Cytochrome A réduit
E. aucune de ces propositions n’est exacte
QUESTION N° 83
A propos de la chaîne respiratoire, indiquer la (les) proposition(s) exacte(s).
A. les complexes I et IV sont des pompes à protons
B. les complexes II et III sont des pompes à protons
C. la chaîne respiratoire permet de pomper 10 protons dans l’espace inter-membranaire
à chaque oxydation d’une molécule de NADH,H+
D. les protéines de la chaîne respiratoire sont codées pour moitié par le génome
mitochondrial
E. aucune de ces propositions n’est exacte
QUESTION N° 84
A propos de l’ATP synthase, indiquer la (les) proposition(s) exacte(s).
A. elle peut aussi être appelée complexe IV
B. sa structure est en partie dans l’espace inter-membranaire mitochondrial
C. elle est sensible à l’action de l’oligomycine et de la roténone
D. elle convertit une énergie protomotrice en énergie mécanique
E. elle comporte une sous-unité multimérique appelée F1
Décembre 2013
QUESTION N°47
A propos de la respiration cellulaire, quelle est la réponse exacte ?
A. Elle a lieu essentiellement dans le cytoplasme
B. Elle génère trois coenzymes sous forme oxydée
C. Elle utilise l’acide pyruvique comme intermédiaire réactionnel
D. Elle a lieu uniquement dans les érythrocytes
E. Elle permet, en aérobiose, la synthèse de 37 molécules d’ATP
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QUESTION N°48
A propos des propriétés de la mitochondrie, quelle est la réponse exacte ?
A. La cardiolipine représente 60 % de ses phospholipides membranaires
B. Les sous-unités F1 des ATPases sont situées dans l’espace matriciel
C. La perméabilité des deux membranes vis-à-vis des protons est identique
D. La composition biochimique mitochondriale est différente dans les cardiomyocytes
E. La membrane interne mitochondriale a une surface d’échange réduite
QUESTION N°49
A propos de la Flavine Adénine Dinucléotide (FAD), quelle est la réponse exacte ?
A. Elle est un dérivé de la vitamine B3
B. Elle est constituée d’un squelette de ribitol diphosphate
C. Elle possède un potentiel redox E’° de +0,045 mV
D. Elle est le groupement prosthétique de deux flavoprotéines mitochondriales
E. Elle possède, sous sa forme réduite, trois électrons ayant un fort potentiel de
transfert
QUESTION N°50
A propos des potentiels Redox E’° de la chaîne respiratoire, quelle est la réponse exacte
?
A. Ils varient de - 400 mV à + 150 mV
B. Ils sont dus aux propriétés chimiques de trois complexes distincts
C. Ils nécessitent la présence de cytochromes de types C, A3 et D
D. Ils permettent un transport séquentiel d’électrons par paire
E. Aucune de ces propositions
Décembre 2012
QUESTION N°55
A propos des coenzymes substrats de la chaîne respiratoire, quelle est la proposition
exacte ?
A. Le NADH + H+ est issu principalement de la glycolyse
B. Leur pouvoir oxydoréducteur E’° est très supérieur à 0
C. Ils comportent un désoxyribose dans leur structure
D. Ils sont majoritairement produits par le cycle de Krebs
E. Ils utilisent la navette malate aspartate
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QUESTION N°56
A propos de la chaîne respiratoire, quelle est la proposition exacte ?
A. Elle comporte cinq complexes et seul le coenzyme Q y est mobile
B. Elle permet le transport dirigé des protons via des centres fer-souffre
C. Ses protéines sont pour moitié codées par le génome mitochondrial
D. Elle utilise les propriétés de l’oxygène comme accepteur final des protons
E. Elle utilise une différence totale de potentiel redox supérieure à 600 mV
QUESTION N°57
A propos du complexe II de la chaîne respiratoire, quelle est la proposition exacte ?
A. Il est aussi appelé Succinate Ubiquinone Oxydase
B. Il génère du fumarate comme produit de réaction
C. Il comporte du FAD comme accepteur final des électrons
QUESTION N°58
A propos de la théorie chimiosmotique, quelle est la proposition exacte ?
A. Elle a été formalisée par Sir Francis Crick en 1953
B. Elle utilise une différence de pH entre l’espace intermembranaire et le cytoplasme
C. Elle permet la synthèse finale de l’ATP par le complexe IV
D. Elle permet de générer de l’ATP si un gradient de pH suffisant pré-existe, même sans
transporteurs
E. Elle formalise que la synthèse d’ATP est couplée à la pression osmotique cellulaire
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