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CYTOMETRIE
EN
FLUX
BD FACSVerse
BD FACSAria III
Journée
de
Forma-on
et
Informa-on
6/11/2013
ImageUP
forma-on
2013
CYTOMETRIE
EN
FLUX
• Principe
• Applica4ons
• Tri
ImageUP
forma-on
2013
Qu’est que ce la cytométrie en flux?
• Individuelle
• Quan4ta4ve
• Qualita4ve
• Par4cules
en
suspension
• Flux
liquide
• Source
lumineuse
ImageUP
forma-on
2013
CYTOMETRIE EN FLUX: Principe
Fluidique Electronique
Optique
ImageUP
forma-on
2013
CYTOMETRIE
EN
FLUX:
Analyses
MulLparamétrique
Paramètres
SSC Fluorescence
LASER FSC
• FSC:
Forward
ScaDer—lumière
diffractée
Dépend
de
la
taille
et
de
la
surface
cellulaire
• SSC:
Side
ScaDer—lumière
réfléchie
et
réfractée
Dépend
de
la
granularité
et
de
la
complexité
cellulaire
• Fluorescence
ImageUP formation 2013
CYTOMETRIE EN FLUX:
Analyses Multiparamétrique
Paramètres
• Fluorescence
FITC FITC
FITC
FITC
FITC
FITC
Nombre d’évènements
FITC
FITC
FITC
Intensité de fluorescence
ImageUP
forma-on
2013
CYTOMETRIE EN FLUX: Fluidique
Vacuum
pump
Sheath
filter Laser intercept
Flow
cell
Loader
(plates or
tube racks)
Sample
Waste tank Sheath tank
injection
tube (SIT)
ImageUP formation 2013
Optique
Detector
Collection Optics arrays
Fiber optics
Collection lens
Laser Laser Laser
FSC diode
Lens Flow cell
665 LP 752 LP
700/54 783/56
PerCP-Cy5.5 PE-Cy7
560 LP
488/15
586/42
Side scatter
PE
ImageUP formation 2013
Fluorochromes
Configuration 4–2–2
http://www.bdbiosciences.com/external_files/media/spectrumviewer/index.jsp
ImageUP formation 2013
Système Electronique
Conversion signaux optiques en signaux digitaux
proportionnels
Analog to Digital
Conversion
Signal Digital data
Photon Out to memory
In
Voltage In
Système Electronique
Analyse digitale
Field Digital
Programmable Signal
Gate Arrays Processor
Digital data
Computer
in memory
Area
Height
PE
FITC
ImageUP
forma-on
2013
0 0
10 1024
2 450
0 0
10 1024
3 450
0 0
10 1024
900
4
0
0
10 1024
5 450
0
0
450 900
etc
ImageUP
forma-on
2013
Applica4ons
de
la
CMF
Analyse
morphologique
Immunophénotypage
anLgènes
membranaires
anLgènes
intracellulaires
Analyse
du
contenu
en
ADN
Cycle
cellulaire
Viabilité
ProliféraLon
cellulaire
Suivi
de
l’ac4vité
géné4que
par
l’expression
d’un
gène
rapporteur
(GFP)
Mesure
de
l’apoptose
Phagocytose
Stress
Oxyda4ve
Flux
calcique
Signalisa4on
cellulaire
…
ImageUP
forma-on
2013
Analyse morphologique
Forward ScaDer: taille
Granulocytes
Monocytes
Lymphocytes
Side
ScaDer:
granularité
ImageUP
forma-on
2013
Immunophénotypage
ACM anti-CD3 ACM anti-CD4 ACM anti-CD19 ACM anti-CD14
PE FITC
CD3 ?
CD19 ?
CD # : Cluster de différenciation
ImageUP
forma-on
2013
Immunophénotypage
CD19+ CD3‐ CD19+CD3+
CD19‐CD3‐ CD19‐ CD3+
Lymphocytes
ImageUP
forma-on
2013
Marquage intracellulaire
Perméabilisa4on des cellules
FITC
Leucocyte
• Sécré4on
• Signalisa4on
…
ImageUP formation 2013
Viabilité
Cellules
THP1
+
2.4 %
Thalidomide
(
#
conc.)
Incuba4on
48
HS
+
Iodure
de
Propidium
Intercalant
Imperméant
Induc4on:
Condensa4on
T2h
Fragmenta4on
T6h
T0
Chute
du
poten-el
membranaire
mitochondrial
(DiOC6)
Altéra-ons
de
la
membrane
plasmique
(Annexine
V)
Expression
des
caspases,
famille
Bcl‐2
Fragmenta-on
DNA
(TUNEL)
ImageUP
forma-on
2013
Apoptose: DiOC6
Détec4on
des
altéra4ons
de
poten4el
de
membrane
DiOC6: carbocyanines
La
fluorescence
est
modifiée
selon
l’environnement
électrique
Cellules
JURKAT
+
Camptothecin
(18
HS)
ImageUP
forma-on
2013
Apoptose:
Annexine
V
Détec4on
des
altéra4ons
de
la
membrane
plasmique
Extériorisa4on des phospha4dyl‐sérines (PS)
Annexine
V:
forte
affinité
pour
résidues
PS
Annexine
V
‐
APC
Cellules
JURKAT
+
Cellules
JURKAT
camptothecin
(4
HS)
ImageUP
forma-on
2013
Proliféra4on
cellulaire:
marquage
au
CFSE
CFSE:
CarboxyFluorescein
diacetate
Succinimidyl
Ester
Suivi
de
la
proliféra4on
lymphocytaire
dans
Charge
des
cellules
au
CFSE
le
sang
périphérique
Distribu4on
équivalente
de
la
fluorescence
entre
les
cellules
filles
J0:
cellules
arrêtes
en
généra4on
parentale
(mitomycin)
S-mula-on de la proliféra-on (PHA)
J7:
généra4ons
successives
ImageUP
forma-on
2013
Phagocytose
FITC-Labeled Bacteries
FITC
Neutrophile
ImageUP
forma-on
2013
Avantages de la CMF
Analyse quan4ta4ve
Sensibilité
de
détec4on
Rapidité
Analyse
mul4paramétrique
Tri
ImageUP
forma-on
2013
TRI
• Principe
• Introduc4on
au
système
BDFACSAria
III
• Quelques
exemples…….
ImageUP
forma-on
2013
TRI
:
Principe
ImageUP
forma-on
2013
ImageUP
forma-on
2013
TRI:
Principe
Déflec4on
électrosta4que
de
gouDes
chargées
‐
Les
cellules
sont
aspirées
de
l'échan4llon
‐
injectées
une
à
une
par
une
buse
dans
un
courant
con4nu
(forma4on
du
jet)
‐
Le
jet
se
rompre
pour
donner
des
gouDes
à
un
point
précis
appelé
«
break
of
point
»
‐
Chargement
de
goutes
‐
Les
goutes
sont
déviées
du
côté
de
la
plaque
de
polarité
opposée
et
collectée
En
appliquant
différent
niveau
de
charge
à
gauche
et
à
droite,
il
est
possible
de
trier
quatre
populaLons
simultanément
sur
le
BD
FACSAria
III.
ImageUP
forma-on
2013
TRI: PRINCIPE
1‐
les
signaux
sont
analysées
au
3‐Charge
du
jet
point
d’intercep4on
4‐«
break
of
point
»
2‐
Décision
de
tri
selon
les
critères
définis
par
l'u4lisateur
5‐
plaques
de
déflec4on
électrosta4que:
déflec4on
de
gouDes
chargées
6‐
Les
goutes
non
chargées
passent
à
la
poubelle
7‐
Les
goutes
chargées
(par4cules
d’intérêt)
sont
collectées
ImageUP
forma-on
2013
TRI:
Principe
Stabilité
du
jet
Pression
Liquide
de
gaine
Fréquence Taille de la buse
Amplitude
ImageUP
forma-on
2013
TRI:
Principe
Op4misa4on
de
paramètres
Pression
Taille
de
la
buse
Fréquence
Liquide
de
gaine
Viabilité
cellulaire
Taille
de
la
Pression
Fréquence
Type
cellulaire
buse
Liquide
de
gaine
(KHZ)
(µm)
(psi)
70
70
90
Lymphocytes
T
non
ac4vés,
Lymphocytes
B,
Bactéries,
Levures.
85
45
47
Lymphocytes
T
ac4vés,
cellules
plasma4ques,
NK,
NK‐T,
Monocytes,
mDC,
pDC,
cellules
souches.
100
20
20
Cellules
4ssulaires,
Neurones,
Macrophages,
130
10
12
ImageUP
forma-on
2013
TRI: Principe
Précisions
Pureté
Rendement
«
Single
Cell
»
ImageUP
forma-on
2013
BD
FACSAria
III
ImageUP
forma-on
2013
BD
FACSAria
III
Système
Op4que
Lasers
BD
FACSAria
III
Système
de
collec4on
Le
module
ACDU
(automated
cell
deposi4on
unit)
ImageUP
forma-on
2013
Le
BD
FACSAria
III
permet:
Trier
sur
des
microplaques
de
24,
96
puits
ou
384
puits,
des
lames
ou
des
tubes.
Trier
dans
des
condiLons
de
température
contrôlée
(4,
20,
37
et
42
°C)
et
dans
des
condiLons
asepLques.
Trier
à
différentes
pressions
(5
à
75
psi)
et
avec
quatre
tailles
de
buses
(70,
85,
100
et
130
µm)
pour
trier
divers
types
des
parLcules.
l’analyse
simultanée
de
18
paramètres
(FSC,
SSC
et
16
fluorescences).
l’acquisiLon
à
une
vitesse
maximale
de
70.000
évènements/sec.
Trier
avec
un
maximum
de
pureté
ou
un
maximum
de
rendement
(pour
une
peLte
et
précieuse
populaLon)
ou
un
maximum
de
précision
pour
un
clonage.
Récupérer
des
cellules
viables
ImageUP
forma-on
2013
Quelques
exemples…
Tri
des
lymphocytes
T
(CD3
+)
et
monocytes
(CD14
+)
à
par4r
de
CMN
de
sang
périphérique
Avant
Tri
Après
Tri
99.7
%
8.6 %
54.1 %
98.0
%
Après
Tri
ImageUP
forma-on
2013
Quelques
exemples…
Tri
des
cellules
GFP
+
à
par4r
de
lignée
transfectée
Avant
Tri
Après
Tri
97
%
31.7 %
67.9 %
Après Tri
99.3
%
ImageUP
forma-on
2013
Quelques exemples…
Am
J
Physiol
Cell
Physiol.
2010
June;
298(6):
C1326–C1342.
ImageUP
forma-on
2013
Stratégie
de
«
ga4ng
»:
Cellules
souches
de
sang
de
cordon
BV
421‐
CD38
SSC‐A
7‐AAD
Lineage
‐
viable
PBMC CD34+ CD38‐
CD45
RA
–
CD90
+
PBMC
BV
605‐
CD
90
BV 605‐ CD 90
Lineage
‐
viable
CD
49f+
CD90
+
CD34+
CD38‐
CD45 RA – CD90 +
CD 49f+ CD90 +
APC‐
H7
CD45
RA
PE
CD
49f
ImageUP
forma-on
2013
CYTOMETRIE EN FLUX
Informa4ons pra4ques…..
Responsables
et
contacts
Localisa4on
Matériel
PBS
Adriana
Delwail
secteur
α
Cytomètre
analyseur
Tél:
05
49
45
40
56
BD
FACSVerse
Mail:
Adriana.
Delwail@univ‐poi4ers.fr
Niveau
1
Salle
MS
Q24
Jean‐François
Jégou
Tél:
05
49
45
36
45
Cytomètre
trieur
Mail:
jean‐francois.jegou@univ‐poi4ers.fr
BD
FACSAria
III
ImageUP
forma-on
2013
Maintenant, c’est à vous…..
• Histogram
• Dot plot
• Contour plot
• 3D plots/isometric
• Dot plot with projection