Rapport de Stage BTS

REALISATION DES EXAMENS CYTOBACTERIOLOGIQUE DES LIQUIDES D’EPANCHEMENT AU SEIN DU
LABORATOIRE DE BACTERIOLOGIE DE L’INSTITUT DE CARDIOLOGIE D’ABIDJAN
DEDICACE
Je dédie avant tout ce travail au bon Dieu pour la santé, la force et l’intelligence qu’il
m’a accordé dans la réalisation de ce travail.
A toute ma famille pour le soutien moral et leurs prières et plus particulièrement à mon
père KONAN YAO BLAISE pour son soutien financier et ses conseils.
A ma grande sœur KONAN EMILE DEBLEZE pour tout le soutien que tu m’as
apporté dans les moments difficiles.
A mon grand frère GERARD DEBLEZE et son épouse pour l’hospitalité et la

gentillesse que vous m’avez tout au long de ces deux années d’étude.
Que ce travail soit l’accomplissement de vos vœux et le fruit de votre soutient infaillible !
Merci d’être là pour moi.
KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

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STAGE
REMERCIEMENTS
Nous adressons nos sincères remerciements à :
• Notre maître de stage Monsieur KAKOU JEAN LUC, responsable du

laboratoire de bactériologie.
• Notre encadreur pédagogique Madame KOUAKOU Félicité épse KONE,

Auditeur Qualité/ Consultante en chimie et microbiologie à IAQT.
• Monsieur ATTEBE DONALD, Responsable de la Cellule Qualité à l’ICA.
• Tout le personnel du service biologie de l’ICA pour leurs contributions à la

rédaction de ce travail
Nous tenons également à remercier tout particulièrement et à témoigner toute notre

reconnaissance aux personnes suivantes :
• Monsieur ABY RAOUL, Président Fondateur du Groupe CSI POLE

POLYTECHNIQUE,
• Monsieur MOGNON VINCENT, Directeur de l’IAQT,
• Monsieur KACOU CONSTANT, Adjoint-Directeur de l’IAQT
• Dr KOUAME N’ZEBO, Consultant en microbiologie à l’IAQT
• Tout le personnel du Groupe CSI Pôle Polytechnique plus spécifiquement à

tous les consultants de l’IAQT pour la qualité de la formation reçue.

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STAGE
AVANT PROPOS
Le Groupe CSI-Pôle Polytechnique créé en 1998 avec l’autorisation N° 558/559
MESRS/DAH/CF du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique,
agréé par le FDFP est une grande école qui a pour le conseil et l’assistance aux entreprises
ainsi que l’enseignement supérieur. Groupe à vocation généraliste, son objectif est de
proposer une synergie d’activités au service de la compétence des hommes et de la
performance des entreprises. Il est composé de plusieurs écoles supérieures qui sont.
 ESM : Ecole Supérieure de Management
 IPEC : Institut Supérieur de Préparation à l’Expertise Comptable et Financière
 SUP-GRH : Institut Supérieur de Gestion des Ressources Humaines
 ESUP-BTS : Ecole Supérieure de Préparation BTS
 IDELCI : Institut de Développement de la Logistique et du Commerce

International
 CESDEC : Centre de Spécialisation et de Développement des Compétences
 IAQT : Institut Africain de la Qualité Totale.
Cette dernière école où nous avons été formés à en son sein, la filière Industrie
Agroalimentaires Chimiques option Contrôle. Pour apporter appui à l’action de L’Etat,
plusieurs entreprises mettent à la disposition des étudiants de stage pratiques.
C’est de ce cadre que l’Institut de Cardiologie d’Abidjan s'est portée garant pour nous
accueillir et nous permettre au mieux de parfaire notre formation.

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STAGE
TABLE DES MATIERES

DEDICACE................................................................................................................................1
REMERCIEMENTS...................................................................................................................2
AVANT PROPOS......................................................................................................................3
LISTE DES TABLEAUX...........................................................................................................6
LISTE DES FIGURES...............................................................................................................7
LISTE DE PHOTOGRAPHIES.................................................................................................8
LISTE DES ABREVIATIONS...................................................................................................9
INTRODUCTION...................................................................................................................10
I. PRESENTATION DE L’INSTITUT DE CARDIOLOGIE D’ABIDJAN (ICA).............12
I.1. Historique de l’ICA......................................................................................................................12
I.2. Mission, vision, ambition de l’ICA...............................................................................................12
I.3. Valeurs éthiques de l’ICA............................................................................................................13
I.4. Activités de l’ICA.........................................................................................................................13
II. PRESENTATION DU SERVICE BIOLOGIE DE L’ICA...........................................15
II.1. Localisation................................................................................................................................15
II.2. Rôle............................................................................................................................................15
II.3. Présentation de locaux..............................................................................................................15
III. PRÉSENTATION DU LABORATOIRE DE BACTÉRIOLOGIE DE SERVICE
BIOLOGIE D’ICA....................................................................................................................16
PREMIERE PARTIE :..............................................................................................................17
REVUE BIBLIOGRAPHIQUE.............................................................................................17
I. EXAMEN CYTOBACTERIOLOGIE..............................................................................18
I.1. Examen Cytologique...................................................................................................................18
I.2. Examen bactériologique.............................................................................................................18
II. LIQUIDE D’EPANCHEMENT....................................................................................18
II.1. Liquide Péricardique..................................................................................................................18
II.1.1. Généralités.........................................................................................................................18
II.1.2. Causes.................................................................................................................................19
II.2. Liquide Pleural...........................................................................................................................19

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STAGE
II.2.1. Généralités.........................................................................................................................19
II.2.2. Causes.................................................................................................................................20
II.3. Liquide d’ascite..........................................................................................................................20
II.3.1. Généralités.........................................................................................................................20
II.3.2. Causes.................................................................................................................................20
DEUXIEME PARTIE :..........................................................................................................21
MATERIELS ET METHODES...............................................................................................21
I. MATERIELS.....................................................................................................................22
I.1. Examen Macroscopique.............................................................................................................22
I.2. Examen Microscopique..............................................................................................................22
I.2.1 Etat frais...............................................................................................................................22
I.2.2 Coloration de GRAM.............................................................................................................22
I.2.3 Coloration GIEMSA...............................................................................................................22
I.3. Culture Bactérienne....................................................................................................................22
I.4. Identification API 20 E................................................................................................................23
I.5. Antibiogramme avec ATB 20 E....................................................................................................23
II. METHODE....................................................................................................................23
II.1. Examen Macroscopique............................................................................................................23
II.2. Examen Microscopique.............................................................................................................23
I.2.1 Etat frais...............................................................................................................................23
I.2.2 Coloration de GRAM.............................................................................................................24
I.2.3 Coloration GIEMSA...............................................................................................................24
II.3. Culture Bactérienne...................................................................................................................24
II.4. Identification.............................................................................................................................25
II.4.1. Préparation de la galerie API 20 E.......................................................................................26
II.4.2. Etapes De Réalisation.........................................................................................................26
II.5. Antibiogramme avec ATB 20 E...................................................................................................26
TROISIEME PARTIE :.........................................................................................................27
RESULTATS ET INTERPRETATION...................................................................................27
I.RESULTATS..........................................................................................................................28
II. INTERPRETATION............................................................................................................29
III. BILAN...........................................................................................................................29
CONCLUSION.......................................................................................................................30
RECOMMANDATIONS.........................................................................................................31

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STAGE
REFERENCE BIBLIOGRAPHIQUE ET WEBOGRAPHIQUE............................................32

ANNEXE..................................................................................................................................33
LISTE DES TABLEAUX
Tableau I: Sélection de la galerie

API………………………………………………………...24
Tableau II : Récapitulatif des examens réalisés………………………………………….……

27

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STAGE
LISTE DES FIGURES
Figure 1 : Organigramme de l’ICA………...…………………………………………………

13
Figure 2 : organigramme du service biologie de l’ICA………………...………...………….15
Figure 3 : Schéma du péricarde……………………………….………………………………

18
Figure 4 : Schéma d’un épanchement pleural droit………...…………...

…………………….18
Figure 5 : Schéma d’un épanchement de liquide d’ascite…………...…….

…………………..18

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STAGE
LISTE DE PHOTOGRAPHIES
Photo 1 : Galerie API
Photo 2 : Antibiogramme (ATB EU 08)
Photo 3 : Pipete + embout jaune + embout
Photo 4 : Pipette pasteur + tube à échantillon
Photo 5 : Milieu de culture
Photo 6 : Réactifs pour la coloration de GRAM
Photo 7 : Poste de travail

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STAGE
LISTE DES ABREVIATIONS
ICA : Institut de Cardiologie d’Abidjan
EMB : Eosine Méthylène Bleu
API : Analytical profile index
ATB : Antibiogramme
GO : Gélose ordinaire
mcf : McFarland standards
µL : Microlitre
ml : Millilitre

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STAGE
INTRODUCTION
L’analyse des liquides biologiques humains est un processus essentiel pour le

diagnostic et le Suivi des pathologies s’accompagnant d’épanchements. Les liquides
d'épanchement, dont font partie les liquides péricardiques, les liquides pleuraux et les liquides
d'ascite, sont des manifestations non spécifiques et pathologiques. Ils apparaissent chez des
patients atteints de pathologies diverses, et concernent de nombreuses spécialités médicales
(hépatologie, pneumologie, hématologie, bactériologie...). Le bilan diagnostique à la
recherche de l'origine d'un liquide d'épanchement repose sur la clinique, l'imagerie et la
biologie. Il comprend l'analyse du liquide au laboratoire d'analyses de biologie médicale, en
particulier de bactériologie, afin d'obtenir des informations sur la présence d’infection
d’origine bactérienne dans le prélèvement.
Ainsi notre mission serait de montrer comment se font les examens

cytobactériologiques au laboratoire de bactériologie du service de la biologie de l’ICA et
comment est-ce que ces analyses permettraient aux médecins de confirmer ou d’infirmer un
diagnostic, de traiter une maladie ou d’assurer un suivi thérapeutique.

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STAGE
Dans cette optique, nous avons eu pour thème : « REALISATION DES EXAMENS
CYTOBACTERIOLOGIQUE DES LIQUIDES D’EPANCHEMENT AU SEIN DU
LABORATOIRE DE BACTERIOLOGIE DE L’INSTITUT DE CARDIOLOGIE
D’ABIDJAN »
Dans ce présent rapport, nous aborderons d’abord la revue bibliographique dans une
première partie qui sera suivi par la partie des matériels et méthodes et nous terminerons par
les résultats et les interprétations.
PRESENTATION DE L’INSTITUT
DE CARDIOLOGIE D’ABIDJAN

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STAGE
I. PRESENTATION DE L’INSTITUT DE CARDIOLOGIE

D’ABIDJAN (ICA)
I.1. Historique de l’ICA
Etablissement Public National de Santé, l’Institut de Cardiologie d’Abidjan (ICA), fondé
en 1977, a été pendant deux décennies le fleuron de la médecine moderne de pointe en Côte
d’Ivoire et en Afrique.
Tombé en déclin avec la vétusté de son plateau technique, l’ICA a dû fermer ses portes en
1999 et une nouvelle direction a été installée en 2001. Un vaste projet de rénovation et de
renouvellement du plateau technique a été mis en œuvre.
Tirant les leçons du passé en matière de gestion, et dans sa politique constante de s’imposer
comme une structure de référence en Côte d’Ivoire et dans la sous-région par la qualité de ses
prestations, et ce, en respectant les prescriptions de la norme internationale ISO 9001 version
2015, pour renforcer et améliorer son organisation et son fonctionnement, l’ICA est
aujourd’hui certifiée ISO 9001 version 2015.
Après sa certification et malgré ses résultats forts encourageants, des contraintes et des
nouveaux défis s’imposent à l’Institut. Aussi, afin d’assurer l’amélioration de son système de
management de la qualité et de répondre aux exigences croissantes de sa clientèle, l’ICA doit
poursuivre ses efforts de modernisation de sa gestion et de sa production.

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STAGE
I.2. Mission, vision, ambition de l’ICA

L’ICA a une mission de service public général qui s’articule autour de trois (03) axes :
 Assurer des soins, (urgences 24 H/24) des examens de diagnostic, des consultations et
traitements ainsi que l’hospitalisation des malades cardiovasculaires ;
 Participer à l’enseignement universitaire médical, odontologique et pharmaceutique
ainsi qu’à la formation paramédicale et à la recherche ;
 Participer aux actions de médecine préventive en animant et assurant des opérations de
dépistage des affections cardiovasculaires.
La vision de l’ICA est d’être un établissement où la qualité des soins et des services est une
préoccupation constante.
I’ICA ambitionne d’être en Afrique, un pôle d’excellence et le leader des centres

cardiologiques.
I.3. Valeurs éthiques de l’ICA

L’ICA s’est doté de cinq (5) valeurs éthiques définies dans une charte en vue de
mobiliser et susciter l’engagement de son personnel. Ce sont :
 La responsabilité,
 L’excellence,
 L’équité,
 L’esprit d’équipe,
 Et l’intégrité.
I.4. Activités de l’ICA

L’ICA est un centre hospitalier et universitaire affilié à l’Unité de formation et de
Recherche (UFR) des Sciences Médicales de l’Université Félix Houphouët BOIGNY
d’Abidjan Cocody. L’institut exerce des activités médicales et des activités d’enseignement et
de recherche.
 Les activités médicales et médicotechniques sont assurées par les services suivants :
 Consultation ;
 Médicine ;
 Urgences ;

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STAGE
 Soins Intensifs Médicaux ;

 Cardio-pédiatrie ;
 Chirurgie cardiaque ;
 Chirurgie thoracique ;
 Explorations externes ;
 Anesthésie -Réanimation ;
 Radiologie ;
 Hémodynamique ;
 Biologie ;
 Pharmacie.

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STAGE
Figure 1 : Organigramme de l’ICA

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STAGE
I. PRESENTATION DU SERVICE BIOLOGIE DE L’ICA

II.1. Localisation
Le service de biologie médical de l’ICA se trouve dans l’enceinte dudit institut entre le
service de consultation exploration et celui de médecine et en dessous du bloc opératoire.
II.2. Rôle
Le rôle de ce service est de réaliser les examens biologiques, d‘une part des malades
hospitalisés à l’Institut de Cardiologie d’Abidjan et d’autre part ceux des malades externes.
II.3. Présentation de locaux

Le service de biologie de l’ICA comprend :
 Un secrétariat,
 Une salle d’attente ;
 Une salle de réunion ;
 Une salle de prélèvement ;
 Une salle de stickage ;
 Une salle de garde ;
 Une laverie ;
 Un bureau pour le chef de service ;
 Un bureau pour les assistants ;
 Un bureau pour le surveillant d’unité ;
 Une salle de stockage des réactifs du laboratoire ;
 Cinq unités de laboratoire.
- Laboratoire d’urgence (labo 1)
Utilisé pour effectuer les analyses d’urgences
- Laboratoire d’hématologie (labo 2)
Le laboratoire d’hématologie assure les analyses de numération, formule sanguine, QBC
(Quantitative Buffy Coat malaria test), électrophorèse d’hémoglobine, électrophorèse des
protéines, sérologie…etc.
- Laboratoire de biochimie (labo 3)
Les analyses de biochimie comprennent le dosage de molécules contenues dans différents
liquides physiologiques (sang, urines, liquides de ponction).
Le laboratoire de biochimie assure les analyses de glycémie, créatinine, urée…etc.
- Laboratoire d’hémostase et sérologie (labo 4)

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STAGE
Ce laboratoire assure le dosage des paramètres prescrits pour le diagnostic et le suivi

biologique.
- Laboratoire de bactériologie (labo 5)
Ce laboratoire assure les analyses microbiologiques.
CHEF DE SERVICE
SECRETARIAT
MAÎTRE ASSISTANT
ASSISTANT
INFIRMIER TECHNICIEN AIDE SOIGNANT
Figure 2 : organigramme du service biologie de l’ICA
II. PRÉSENTATION DU LABORATOIRE DE BACTÉRIOLOGIE DE

SERVICE BIOLOGIE D’ICA
Le laboratoire de bactériologie est un local spécial disposé pour mener à bien des diagnostics
et des traitements des infections bactériennes grâce à l’isolement, l’identification des
bactéries, l’analyse de l’antibiogramme et l’optimisation thérapeutique. Les techniciens du
laboratoire analysent les échantillons jusqu’à l’atteinte des résultats des patients.
Les différents examens réalisés dans ce laboratoire sont :
- L’examen cytobactériologique des urines,
- L’examen cytobactériologique des liquides (liquide de ponction) ;
- L’examen d’hémoculture ;
- L’examen cytobactériologique du pus ;
- L’examen cytobactériologique de liquide céphalo - rachidien.
Pour mener à bien ces examens, l’ICA a équipé le laboratoire avec du matériel adapté et des
techniciens compétents et qualifiés.
Nous avons effectué notre stage dans le laboratoire de bactériologie.

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STAGE
PREMIERE PARTIE :
REVUE BIBLIOGRAPHIQUE

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STAGE
I. EXAMEN CYTOBACTERIOLOGIE
L’examen cytobactériologique est fait en deux grandes phase : la phase cytologique et la
phase bactériologique.
I.1. Examen Cytologique

L’examen cytologique consiste à observer au microscope la lame afin de :
- Dénombrer des leucocytes et des hématies
- Observer la présence de bactérie et de levures
- Identifier des bactéries après de coloration de GRAM
I.2. Examen bactériologique

L’examen bactériologique permet de rechercher et d’identifier les bactéries en cause dans
une infection. Elle consiste à ensemencer l’inoculum sur un milieu de culture. C'est à partir de
ces cultures que se feront la recherche, l'isolement et l'identification des germes.
II. LIQUIDE D’EPANCHEMENT

Les liquides d’épanchement correspondent à une quantité anormale de liquide dans les
séreuses. Il s’agit des liquides pleuraux, des liquides d’ascite, des liquides péricardiques, des
liquides articulaires, des liquides de dialyse péritonéale, ou de tout autre liquide corporel
normalement stérile pouvant être prélevé par ponction.
Lors de notre étude, nous avons travaillé avec les liquides péricardiques, pleuraux et
d’ascites.
II.1. Liquide Péricardique

II.1.1. Généralités
Le péricarde est un sac fibreux dans lequel se trouvent le cœur et les racines des gros
vaisseaux sanguins. Lorsque le cœur se contracte, une partie du péricarde sécrète un liquide
(dont la quantité varie entre 30 et 50 ml), qui agit comme un lubrifiant. Lors d’une
inflammation du péricarde, ce liquide peut augmenter et empêcher les contractions du cœur ;
on parle alors de péricardite ou d'épanchement péricardique qui est une accumulation de
liquide dans le péricarde (considérée comme anormale à partir de 50 ml).

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STAGE
Figure 3 : Schéma du péricarde
II.1.2. Causes
Un épanchement péricardique peut être dû à plusieurs causes telles que :
- Agents pathogènes tels que virus ou bactéries
- Cancers (surtout ceux des poumons, de la glande mammaire et de la plèvre)
- Infection de tous genres telle que la tuberculose.
II.2. Liquide Pleural

L'épanchement pleural désigne la présence de liquide dans la cavité pleurale : on parle
également de pleurésie. La pleurésie correspond plus précisément à une inflammation de la
plèvre. Cette membrane tapisse l'intérieur de la paroi thoracique permettant ainsi d'envelopper
et de protéger les poumons. Une ponction pleurale permet de soulager le patient, et, après
analyse du liquide, d'en connaître l'origine.

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STAGE
Figure 4 : Schéma d’un épanchement pleural droit
II.2.2. Causes
Les différentes causes de pleurésie peuvent être dû à :
- Une insuffisance cardiaque ;
- Une inflammation des structures voisines, une tumeur cancéreuse ;
- Une inflammation d'origine infectieuse (principalement bactérienne, rarement viral).
II.3. Liquide d’ascite

Une ascite ou épanchement liquidien intraabdominal est un épanchement de liquide
(ou accumulation de liquide) dans la cavité péritonéale, c’est-à-dire à l’intérieur de la
membrane qui entoure les viscères abdominaux. Souvent causée par une cirrhose (une
maladie sévère entraînée par une fibrose hépatique), elle peut survenir chez des patients
souffrant d'insuffisance cardiaque ou de cancer.

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STAGE
Figure 5 : Schéma d’un épanchement de liquide d’ascite
II.3.2. Causes
Trois mécanismes peuvent entraîner l'apparition d'ascite :
- La rupture, à l’intérieur du péritoine, d'un canal liquidien ;
- Une anomalie de réabsorption du liquide péritonéal normalement présent ;
- Ou un surplus de production du liquide péritonéal.
KONAN AUGUSTIN DEBLEZE

DEUXIEME
RAPPORT DE
PARTIE :
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STAGE
MATERIELS ET METHODES
I. MATERIELS
I.1. Examen Macroscopique
- Echantillon de liquide (péricardique, pleural ou ascite)
I.2. Examen Microscopique

I.2.1 Etat frais
- Lame
- Lamelle
- L’échantillon
- Pipette
I.2.2 Coloration de GRAM
- Alcool de 90ᵒC
- Cristal violet ou violet de gentiane

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STAGE
- Lugol
- Safranine ou fuchsine
- Huile de paraffine
- Lame
- Flamme
- Pipete
I.2.3 Coloration GIEMSA
- Lame
- Pipete
- Echantillon
- Giemsa stain RR88
I.3. Culture Bactérienne
La culture bactérienne est faite sur quatre milieux de culture : Gélose ordinaire, milieu
Chapman, Gélose au Sang Cuit et le milieu Eosine Méthylène Bleu (EMB)
- Boite de Pétri avec milieux déjà coulé
- Pipette Pasteur
- un bec bunsen
I.4. Identification API 20 E

- Galerie d’API 20 E
- API suspension
- Le densimat
- Colonie bactérienne
- Ecouvillon
- Eau distillée
- Pipete plastique
- Pipete pasteur
I.5. Antibiogramme avec ATB 20 E
- API suspension
- ATB medium

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STAGE
- Colonie bactérienne
- Ecouvillon
- Galerie d’ATB 20 E
- Pipete pasteur
II. METHODE
Une fois l’échantillon arrivé au laboratoire, on met la moitié de celui-ci dans un autre
tube à hémolyse pour faire un enrichissement en y ajoutant quelques millilitres du bouillon
cœur cervelle. L’autre moitié servira à faire l’examen macroscopique et microscopique.
II.1. Examen Macroscopique

Elle consiste à observer l’échantillon contenu dans le tube à hémolyse et d’y relever
les paramètres suivants : la couleur, l’aspect (trouble ou limpide) et la viscosité.
II.2. Examen Microscopique

I.2.1 Etat frais
- Homogénéiser l’échantillon primaire
- Pipeter une goutte de l’échantillon et mettre sur une lame propre
- Poser la lamelle.
- Observer à l’objectif 40X à l’aide d’un microscope.
I.2.2 Coloration de GRAM

- Pipeter 15 µl de l’échantillon primaire
- Mettre sur une lame propre et laisse sécher.
- Faire la fixation bactérienne a la flamme avec de l’alcool.
- Faire la coloration avec cristal violet ou violet de gentiane pendant 1 minute et rincez à
l’eau.
- Faire le mordançage au Lugol pendant 1 minute puis rincez à l’eau.
- Faire la décoloration rapide à l’alcool puis rincer à l’eau.

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STAGE
- Faire la recoloration à la safranine ou à la fuchsine pendant 30 secondes
- Rincer à l’eau et laisse sécher.
- Mettre une goutte d’huile à immersion et observer à l’objectif 100X à l’aide d’un
microscope.
I.2.3 Coloration GIEMSA

- Pipeter une goutte de l’échantillon et mettre sur une lame propre.
- Etaler et laisse sécher.
- Faire la fixation bactérienne avec de l’alcool.
- Mettre le réactif Giemsa stain RR88 et laisse agi pendant 15 minutes.
- Rincer et laisse sécher.
- Mettre une goutte d’huile a immersion et observer à l’objectif *100 à l’aide d’un
microscope.
II.3. Culture Bactérienne

- Homogénéiser l’échantillon enrichi
- Introduire une pipette pasteur stérile dans le tube contenant l’échantillon et bien
homogénéiser
- Avec la pipette, faire des stries sur toute la surface de la gélose
- Refermé ensuite la boite de Petri et incuber la Gélose ordinaire, le milieu Chapman, et

le milieu Eosine Méthylène Bleu (EMB) à l’étuve pendant 24h à 37 °C
- Mettre la Gélose au Sang Cuit dans une boite à fermeture étanche, puis allumer une
bougie et refermé la boite afin de créer un anaérobie ; incuber à 37 °C pendant 24h.
II.4. Identification
Le laboratoire de bactériologie utilise trois différents types de galerie pour l’identification des
germes :
 API STAPH pour l’identification des staphylocoques

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STAGE
 API STREP pour l’identification des streptocoques
 API 20 E pour l’identification des entérobactéries
Le choix de la galerie se fait selon le milieu sur lequel la bactérie pousse, ce qui nous donne le
tableau suivant :
Milieu avec
présence de
bactéries
Eosine Méthylène
Bleu (EMB) et
API 20 E
Gélose au Sang
Cuit
Galerie Milieu Chapman,
utilisée API Gélose ordinaire,
STAPH Gélose au Sang
Cuit
API Gélose au Sang
STREP Cuit
Tableau I : Sélection de la galerie API
Tout au long de notre travail, nous avons manipulé seulement la galerie API 20 E ;
l’utilisation des autres galeries ne seront pas mentionner dans ce présent rapport.
II.4.1. Préparation de la galerie API 20 E

- Repartir l’eau distillée dans les alvéoles d’une boite d’incubation pour créer une
atmosphère humide.
- Placer la galerie dans la boite d’incubation.
II.4.2. Etapes De Réalisation

- Mettre 5 ml de suspension medium dans un densimat.
- A l’aide d’un écouvillon, mettre une colonie bactérienne avec une densité de 0.5 mcf
et homogénéiser.
- Pipeter le mélange et mettre dans les tubes de la galerie d’API 20 E en évitant la

présence de boules d’air.
- Remplir les tubes et cupules des paramètres encadrés avec la suspension bactérienne.
- Remplir les Tubes des paramètres surlignés avec l’huile de paraffine.

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STAGE
- Fermer et mettre à l’étuve de 37 °C pendant 24h.
 LECTURE
Apres les 24 heures d’incubation, ajouter les réactifs suivants :
- Test TDA – Ajouter une goutte de réactif TDA
- Test IND – Ajouter une goutte de réactif JAMES
- Test VP – Ajouter une goutte des réactifs VP 1 et VP 2
- Faire la lecture après 10 minutes en se référant au tableau de lecture.
II.5. Antibiogramme avec ATB 20 E

- Placer 2 ml de la suspension medium sur le desimat.
- Mettre une colonie bactérienne avec une densité de 0.5 mcf à l’aide d’un écouvillon et
homogénéiser.
- Transférer 10 µl de la suspension bactérienne dans ATB medium à l’aide d’une pipete.
- Mettre 135µl du mélange dans chaque cupule.
- Fermer et mètre à l’étuve de 37 ᵒC pendant 24h.
TROISIEME PARTIE :
RESULTATS ET
KONAN AUGUSTIN DEBLEZE
INTERPRETATION
RAPPORT DE
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STAGE
I.RESULTATS
Notre travail nous a permis d’analyser 12 échantillons de liquide, soit :
- 5 examens de liquide péricardique ;
- 4 examens de liquide pleural ;
- 3 examens de liquide d’ascite.
Nous notons 2 échantillons positifs (échantillons avec présence de bactérie) sur 12. Les
résultats sont consignés dans le tableau ci-dessous.
Nombre
Nombre
d'échantillo %
d'échantillon
n positif d'échantillo
n positifs
Liquide Péricardique 5 1 20%
Liquide Pleural 4 1 25%

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STAGE
Liquide d'Ascite 3 0 0%
TOTAL 12 2 17%
Tableau II : Récapitulatif des examens réalisés
5 Liquide
Péri-
cardique
Liquide Pleural
Liquide d'Ascite
Figure 6 : Diagramme de répartition des différents examens réalisés
Nombre d'échantillon Nombre d'échantillon positif

6
0
Liquide Péricardique Liquide Pleural Liquide d'Ascite
Figure 7 : histogramme des examens positifs selon les types de liquides

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STAGE
II. INTERPRETATION
Selon le tableau II, on note un total de 2 examens positifs, soit 17% sur 12 examens réalisés.
- Les examens positifs permettent aux médecins confirmer leur hypothèse et de

prescrire un traitement adapté aux patients.
- Quant aux examens négatifs, ils viennent écarter l’hypothèse d’une infection
bactérienne dans le diagnostic des médecins.
CONCLUSION
Notre travail nous a permis d’acquérir des connaissances et des aptitudes nécessaires
pour la réalisation d’un examen cytobactériologique d’un liquide d’épanchement en
particulier et de façon général les pratiques en laboratoire médicale.
La présence d’un liquide d’épanchement est un indicateur de disfonctionnement dans

l’organisme, alors les résultats de laboratoire doivent être aussi précis que possible.
Ainsi l’analyse bactériologique des liquides péricardique, pleuraux et ascites doit

occuper une place importante dans la démarche clinique et biologique puisqu’elle permet aux
médecins de confirmer ou d’infirmer un diagnostic afin d’assurer un suivi thérapeutique.

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STAGE
RECOMMANDATIONS
Au terme de notre stage effectué au laboratoire de bactériologie du service biologie de
l’Institut de Cardiologie d’Abidjan, nous recommandons au laboratoire de bactériologie, pour
un fonctionnement optimal :
 Installez un poste de travail (ordinateur) pour la saisie des résultats d’analyse dans le
laboratoire de bactériologie
 Sensibiliser régulièrement le personnel sur l’importance du respect et du suivi des

procédures et instructions de travail.
 Suivie et contrôler des informations documentées.

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STAGE
REFERENCE BIBLIOGRAPHIQUE ET WEBOGRAPHIQUE

 BIBLIOGRAPHIQUE
1- Manuel de procédures du service biologie de l’ICA
2- Instruction de travail du laboratoire de bactériologie
3- Support de cours technique de rédaction de rapport de stage
 WEBOGRAPHIQUE
https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89panchement_p
%C3%A9ricardique#Description_et_sympt%C3%B4mes

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STAGE
https://www.chuv.ch/fr/cardiologie/car-home/patients-et-famille/maladies-traitees/affections-
du-myocarde-et-du-pericarde/pericardite
https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89panchement_pleural#Causes
https://sante.journaldesfemmes.fr/fiches-maladies/2632261-epanchement-pleural-pleuresie-
symptomes-causes-complications-et-ponction/
https://fr.wikipedia.org/wiki/Ascite#Causes
https://www.passeportsante.net/fr/Maux/Symptomes/Fiche.aspx?doc=ascite
ANNEXE
Photo 1 : Galerie API

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STAGE
Photo 2 : Antibiogramme (ATB EU 08)
Photo 3: Pipette + embout jaune + embout 1

PAGE 35
STAGE
Photo 4 : Pipette pasteur + tube à échantillon +

écouvillon
Photo 5 : Milieu de culture
Photo 6 : Réactifs pour la coloration de GRAM
Photo 7 : Poste de travail

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STAGE

Rapport de Stage BTS

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REALISATION DES EXAMENS CYTOBACTERIOLOGIQUE DES LIQUIDES D’EPANCHEMENT AU SEIN DU

LABORATOIRE DE BACTERIOLOGIE DE L’INSTITUT DE CARDIOLOGIE D’ABIDJAN

A mon grand frère GERARD DEBLEZE et son épouse pour l’hospitalité et la

Merci d’être là pour moi.

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

• Notre maître de stage Monsieur KAKOU JEAN LUC, responsable du

• Notre encadreur pédagogique Madame KOUAKOU Félicité épse KONE,

• Monsieur ATTEBE DONALD, Responsable de la Cellule Qualité à l’ICA.

• Tout le personnel du service biologie de l’ICA pour leurs contributions à la

Nous tenons également à remercier tout particulièrement et à témoigner toute notre

• Monsieur ABY RAOUL, Président Fondateur du Groupe CSI POLE

• Monsieur MOGNON VINCENT, Directeur de l’IAQT,

• Monsieur KACOU CONSTANT, Adjoint-Directeur de l’IAQT

• Dr KOUAME N’ZEBO, Consultant en microbiologie à l’IAQT

• Tout le personnel du Groupe CSI Pôle Polytechnique plus spécifiquement à

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

 ESM : Ecole Supérieure de Management

 IPEC : Institut Supérieur de Préparation à l’Expertise Comptable et Financière

 SUP-GRH : Institut Supérieur de Gestion des Ressources Humaines

 ESUP-BTS : Ecole Supérieure de Préparation BTS

 IDELCI : Institut de Développement de la Logistique et du Commerce

 CESDEC : Centre de Spécialisation et de Développement des Compétences

 IAQT : Institut Africain de la Qualité Totale.

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

TABLE DES MATIERES

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

REFERENCE BIBLIOGRAPHIQUE ET WEBOGRAPHIQUE............................................32

LISTE DES TABLEAUX

Tableau I: Sélection de la galerie

Tableau II : Récapitulatif des examens réalisés………………………………………….……

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

LISTE DES FIGURES

Figure 1 : Organigramme de l’ICA………...…………………………………………………

Figure 2 : organigramme du service biologie de l’ICA………………...………...………….15

Figure 3 : Schéma du péricarde……………………………….………………………………

Figure 4 : Schéma d’un épanchement pleural droit………...…………...

Figure 5 : Schéma d’un épanchement de liquide d’ascite…………...…….

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

Photo 1 : Galerie API

Photo 2 : Antibiogramme (ATB EU 08)

Photo 3 : Pipete + embout jaune + embout

Photo 4 : Pipette pasteur + tube à échantillon

Photo 5 : Milieu de culture

Photo 6 : Réactifs pour la coloration de GRAM

Photo 7 : Poste de travail

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

LISTE DES ABREVIATIONS

ICA : Institut de Cardiologie d’Abidjan

EMB : Eosine Méthylène Bleu

API : Analytical profile index

mcf : McFarland standards

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

L’analyse des liquides biologiques humains est un processus essentiel pour le

Ainsi notre mission serait de montrer comment se font les examens

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

I. PRESENTATION DE L’INSTITUT DE CARDIOLOGIE

KONAN AUGUSTIN DEBLEZE RAPPORT DE

I.2. Mission, vision, ambition de l’ICA

I’ICA ambitionne d’être en Afrique, un pôle d’excellence et le leader des centres

I.3. Valeurs éthiques de l’ICA

I.4. Activités de l’ICA