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Présentation du cours
Code : BIO2001
Niveau : L2S3-SV
Nombre d’heures : 24H
Travaux pratiques: 12H
Poids : 3 crédit
Présentation du cours
Prérequis :
Biologie cellulaire :
Organisation et fonctionnement de la cellule
Origine et évolution des cellules
Différences entre cellules eucaryote et procaryote
Présentation du cours
Objectif général :
Donner un aperçu de la diversité du monde vivant et de la place particulière
qu’occupent les protistes au regard de leur phylogénie, de leur organisation,
de leur fonctionnement et des interactions qu’ils entretiennent avec les autres
êtres vivants.
Présentation du cours
Objectifs spécifiques :
1. Situer les protistes dans le monde en fonction des
règles actuelles de la systématique
2. Connaitre l’organisation et le fonctionnement des
protistes
3. Connaitre quelques interactions entre protistes et
autres êtres vivants (symbiose, parasitisme,
commensalisme)
4. Connaître les représentants importants des principaux
groupes de Protistes
5. Connaitre l’utilité des Protistes
Présentation du cours
Matériel du cours
- Polycopie du cours
- Polycopies des schémas du cours
Présentation du cours
Livres à consulter
- Classification phylogénétique du vivant (Guillaume
Lecointre et Hervé Le Guyader)
- Atlas de phylogénie: La classification du vivant en
fiches et en images (Daniel Richard et col.)
Mini manuel de Biologie animale (Anne Marie Bautz,
Alain Bautz)
Protistes Eucaryotes (Philippe Silar)
Présentation du cours
Sites web:
http://www2.ac-lyon.fr/ressources/rhone/maths-scienc
es
http://www.ac-grenoble.fr/savoie/pedagogie/docs_ped
as/classification_phylogenetique
https://www.youtube.com/results?search_query=protis
tes
Parties du cours
I. Introduction à la protistologie
Quelques definitions
Caracteres generaux des protistes
Apercu systematique des protistes
II. Etude de quelques groupes de protistes (Anatomie, morphologie et
fonctionnement)
Les discicristes et groupes alliés (Trypanosomes et groupes amiboides)
Les alveeolobiontes (ciliés et sporozoaires)
Les amibozoaires (l’amibe)
III. Interactions entre protistes et autres êtres vivants
Cas du parasitisme
Cas de la symbiose
Cas de commensalisme
Apparition de la vie:
formation de la terre
• La Terre s'est formée, il y a vraisemblablement 4 500
millions d'années, par condensation d'un nuage de gaz
et de poussières.
Origine de la vie
Mycobacterium tuberculosis
Yersinia pestis
Staphylococcus aureus
Vibrio cholerae
Neisseria meningitidis
Bacteries utiles
Bacillus thuringiensis
Bacillus sphaericus
Escherichia coli
Les Eucaryotes
Caractères généraux des
protistes
Taille microscopique
Colonisent tous les milieux aquatiques (eau douce,
salée, saumâtres)
Etat Unicellulaire
Multiplication par voie asexuée dans la plupart des cas
Certains recourent à la reproduction sexuée
Protozoaires? Protophytes?
Protozoaire=Protophytes=Protiste
Arbre du vivant selon
Cicarelli et al 2006
Historique de la
classification
• Carl von Linné(1707-1778) médecin, naturaliste
suédois
⇒ Nomme et ordonne les animaux et plantes en
utilisant les ressemblances morphologiques et les
différences sans liens évolutifs (ouvrage Systema
naturae)
⇒ Il divise le monde en 3 règnes: minéral, animal,
végétal
⇒ Il introduit la Nomenclature binominale (binomiale):
ex. Homo sapiens (Genre espèce)
⇒ Il introduit la classification hiérarchique
Historique de la
classification
⇒ la classification hiérarchique
Regne<Embranchement<classe<Ordre<Famille<genre<es
pece
Historique de la
classification
• XVIIIsiècle
⇒ Il semble exister une classification naturelle (au sein d’une
classification artificielle) représentant un ordre intrinsèque à la Nature.
L’ordre étant à l’époque la création divine.
⇒ Le travail du scientifique = inventaire de l’oeuvre divine.
⇒ Problème à l’époque: des croyances (non fondées)
Génération spontanée: apparitions d’animaux de la même espèce, à
différents moments de l’histoire, par des événements de génération
spontanée
Métamorphose: transformation d’un organisme adulte en un autre
organisme adulte. Par ex., les anatifes (crustacés) pouvaient se
transformer en canards; des
arbres dont les feuilles se transformaient en poissons quand tombant
dans l’eau d’une rivière ou en chauvesouris quand entraînées par le vent.
Historique de la
classification
- Ranger
- Trier
- Classer
Exemples de collections :
Guêpe commune, Chat sauvage, Chimpanzé commun,
Pigeon Biset
a- RANGER
CLASSER
est la seule opération
qui nous « dit quelque
chose » sur l’évolution.
RANGER
Classification
Arbre du vivant selon Cicarelli et al
2006 d’àpres 31 genes universels
sequencés
Extrait fiche connaissances n°8 :
« de l’ordre dans le monde vivant »
IV- Quelques conséquences de la
rationalisation des méthodes de classements
Et les invertébrés?
Groupe
Paraphylétique
(ex: poissons)
groupe sans
valeur
phylogénétique
puisque constitué
par un ancêtre
mais pas de la
totalité de ses
descendants.
Classification des Protistes
Definition
Actinophrys
TAXON 4 - HETEROCONTES s.l. (ou
STRAMENOPILES) & TAXONS AFFINES
Labyrinthula
TAXON 4 - HETEROCONTES s.l. (ou
STRAMENOPILES) & TAXONS AFFINES
◊ Chlorophylle a et phycobiliprotéines :
- ALGUES ROUGES (=RHODOBIONTES)
◊ Chlorophylle a et b :
- CHLOROBIONTES (= CHLOROPHYTES s.l.)
TAXON 6 – RHIZARIA ( = CERCOZOAIRES
s.l., DONT FORAMINIFERES ET
CHLORARACHNIOPHYTES)
◊ A filopodes en réseau, souvent avec test : FORAMINIFERES (=
GRANULORETICULOSES) (Nummulites)
◊ A filopodes en réseau, souvent sans test : CERCOMONADES s.l. ou FILOSA
TAXON 6 – RHIZARIA ( = CERCOZOAIRES
s.l., DONT FORAMINIFERES ET
CHLORARACHNIOPHYTES)
◊ Avec axopodes : RADIOLAIRES (Hexacontium), HELIOZOAIRES
Desmothoracidés (Clathrulina),
TAXON 6 – RHIZARIA ( = CERCOZOAIRES
s.l., DONT FORAMINIFERES ET
CHLORARACHNIOPHYTES)
◊ Parasites : ENDOMYXA, dont entre autres :
◊◊ Parasites de végétaux : PLASMODIOPHORIDES (= PLASMODIOPHORALES)
(Plasmodiophora) et PHYTOMYXEA (Phagomyxa)
TAXON 6 – RHIZARIA ( = CERCOZOAIRES
s.l., DONT FORAMINIFERES ET
CHLORARACHNIOPHYTES)
◊◊ Parasites de bivalves : PARAMYXIDES et HAPLOSPORIDIES (Haplosporidium)
TAXON 7 – AMIBOZOAIRES (=
MYXOMYCETES POUR PARTIE,
ET GROUPE ALLIES)
◊ Amiboïdes formant des plasmodes
formant des sporophores aériens: MYCETOZOAIRES =
MYXOMYCETES s.l.(2)
TAXON 7 – AMIBOZOAIRES (=
MYXOMYCETES POUR PARTIE,
ET GROUPE ALLIES)
◊◊ Plasmodes vrais, sporophores avec
péridium, stade amibe flagellé : MYXOGASTRIDES (=
MYXOMYCETES s.s.) (Physarum)
TAXON 7 – AMIBOZOAIRES (=
MYXOMYCETES POUR PARTIE,
ET GROUPE ALLIES)
◊◊ Pseudoplasmodes, faits de cellules agrégées, stade
amibe non flagellé : DICTYOSTELIDES (Dictyostelium)
TAXON 7 – AMIBOZOAIRES (=
MYXOMYCETES POUR PARTIE,
ET GROUPE ALLIES)
◊◊ Petits plasmodes vrais, sporophores à 1-2 spores,
flagelle présent ou non : PROTOSTELIDES (Ceratiomyxa,
Protostelium)
TAXON 7 – AMIBOZOAIRES (=
MYXOMYCETES POUR PARTIE,
ET GROUPE ALLIES)
◊ Amiboïdes unicellulaires formant des pseudopodes en
lobes :
◊◊ Pas de mitochondries(4) : ARCHEAMIBES (=
ARCHAMOEBA)
TAXON 7 – AMIBOZOAIRES (=
MYXOMYCETES POUR PARTIE,
ET GROUPE ALLIES)
◊◊◊ : PELOBIONTES(4) (Mastigamoeba, Pelomyxa)
◊◊◊ : ENTAMIBES(4) (= ENTAMOEBA) (Entamoeba,
Archamoeba)
◊◊ Des mitochondries : LOBOSES(5) s.s. (Amoeba,
Acanthamoeba)
RELATION AVEC LE MILIEU
Cellule de chlamydomonas
Interêt des foraminiferes
Formes Libres
La grande majorité des Protistes rassemble des formes
libres dont le plus grand nombre sont marines
(Radiolaires, Foraminifères, Dinoflagellés ...).
Certains groupes sont toutefois typiquement dulcaquicoles
(Héliozoaires, Amibes testacées, Euglènes, nombreux
Ciliés ...).
Beaucoup d'espèces (Flagellés, Ciliés. Colpidiens,
Amibes, ...) vivent également dans le sol au niveau des
films d'eau localisés dans les interstices ménagés entre
les particules
FONCTION DE RELATION
Associations Animales Avec Des Métazoaires
Les Protistes peuvent établir selon les espèces des associations plus ou
moins lâches (Phorésie) ou au contraire très étroites (Symbiose,
Parasitisme) avec d'autres êtres vivants.
Phorésie
De nombreux Protistes vivent à la surface d'autres êtres vivants. Les
exemples sont nom- breux : Vorticelles, Zoothamnium, Acinétiens
symbiose : relation écologique obligatoire qu'entretiennent des organismes
d'espèce différente vivant en contact direct les uns avec les autres ;
mutualisme : association bénéfique entre deux espèces vivantes, soit
facultative (protocoopération) ou obligatoire, auquel cas on la dénomme
symbiose ;
commensalisme : association entre deux espèces dont une seule tire profit
sans pour autant nuire à l'autre.
parasitisme : association étroite entre deux espèces vivantes dont l'une
dénommée l'hôte héberge la seconde qui vit à ses dépens au plan trophique ;
concurrence : interaction indirecte, de type compétition pour une ressource
insuffisante pour deux espèces occupant une même niche écologique
neutralisme : absence d'interaction concurrentielles ou mutualiste entre
deux espèces ; ni le bénéfice, ni le détriment d'une espèce sur l'autre ne
sont mesurables.
Symbiose
De nombreux animaux phytophages parmi les Métazoaires ont des régimes
alimentaires riches en polymères glucidiques qui nécessitent des
équipements enzymatiques particuliers pour la dégradation de ces
substances complexes.
Symbiose
Ces animaux utilisent, dans bien des cas, le concours de microorganismes
variés (bactéries, levures, Flagellés, Ciliés, ...) en établissant des
symbioses parfois spectaculaires : cas des Termites chez les Insectes, des
Ruminants et des Equidés chez les Mammifères pour ne citer que les plus
classiques.
Interaction avec la santé de l’homme et des animaux
Parasitisme un des symbiotes porte atteinte ou vit aux dépens d'un autre
organisme (corps de l'animal = hôte)
Hôte final (reproduction) / Hôte intermédiaire (temporaire mais essentiel
au développement) / Hôte vecteur (non essentiel, véhicule)
Parasitisme
Un certain nombre de Protistes sont des parasites typiques dont certains sont
responsables de maladies très graves.
La Maladie du sommeil
L’agent causal de la Maladie du sommeil, Trypanosoma gambiense, est un
Flagellé polyxène (c'est-à-dire à plus d'un hôte). Il a besoin de 2 hôtes pour se
développer et se reproduire : la Mouche tsé-tsé, Glossinia palpalis et
l'Homme.
L'amibiase ou dysenterie amibienne
Le vecteur de l'Amibiase, Entamoeba histolica, est un Rhizopode à un seul
hôte (monoxène), l'Homme.
Trypanosoma sp. : Agent de la maladie du sommeil
Hommes porteurs
asymptomatiques en général
20% des femmes en sont
affectées dans leur vie
IMPORTANCE DES PROTISTES : PROTISTES ET POLLUTION
Vacuole
digestive
Vacuole
pulsatile
Dr Gnankiné - TP de BA - 2010-2011
Habitat
• An funestus: vecteur
secondaire assurant le relais de
la transmission
Espèces de pathogènes impliquées
en pathologie humaine
Trophozoïtes jeunes de P. ovale: anneau petit mais large, bleu foncé avec un gros
noyau rouge (plus gros que dans Plasmodium malariae). Apparition rapide de grosses
granulations orangées : les granulations de Schüffner.
Trophozoïtes âgés : forme allongée ou ovoïde, cytoplasme bleu foncé, non
amiboïde ; noyau rouge très net, gros et compact.
Trophozoites de Plasmodium
Rosaces : cytoplasme plus foncé. Pigment noir rassemblé en une masse compacte
au centre, entouré d'un petit nombre de mérozoïtes (8 à 12), ovales, bleus, avec un
noyau rouge régulièrement disposé à la périphérie qui donne l'aspect typique de
marguerite à ces rosaces.
Gamétocytes Plasmodium
falciparum
Gamétocytes : ils sont présents plus tardivement ou après traitement. Ils sont
très typiques dans cette espèce : forme de croissant ou de banane, mais toujours
intra-érythrocytaire ; ils remplissent l'hématie dont il est souvent difficile de voir
le contour. Microgamétocyte : cytoplasme lilas ou rose, forme trapue, extrémité
arrondie, forme de banane - noyau coloré en rouge allongé - présence de grains
de pigment noir assez dispersés dans le cytoplasme.
Macrogamétocyte : cytoplasme bleu intense, forme plus élancée, en croissant.
Noyau rouge condensé entouré de nombreux grains de pigment.
Gamétocytes Plasmodium
vivax
2. Les Protistes
3. Les Mycètes
4. Les animaux
5. Les végétaux
1. Les Monères Unicellulaires eucaryotes
2. Les Protistes
3. Les Mycètes
4. Les animaux
5. Les végétaux
Hypothèse endosymbiotique des Protistes
Plasmodium sp. : Agent de la malaria (paludisme)
Une partie du
cycle
reproducteur
dans le
moustique
Hommes porteurs
asymptomatiques en général
20% des femmes en sont
affectées dans leur vie
Classification des Prostistes
Caractéristiques des
protistes
Que sont les protistes?
Les protistes sont des eucaryotes, ce qui signifie que
leurs cellules ont un noyau et des organites
membranaires. La plupart des protistes sont
unicellulaires. Ils ont tous besoin d'un environnement à
base d'eau - ce qui peut être de l'eau douce ou marine,
dans la neige, le sol humide... ou les poils d'un ours
polaires ! En dehors de ces caractéristiques, ils ont très
peu en commun.
Caractéristiques des protistes
2) La forme ciliée.
Plusieurs protistes possèdent des cils qui sont plus petits
que les flagelles
Exemple la paramécie :
Unicellulaire aquatique.
Possède un grand nombre de cils fins pour le mouvement
et la digestion (bouche cystotome pour phagocytée).
Plusieurs noyaux dont un macronoyau.
Caractéristiques des protistes
3) La forme amibe.
La forme amibe est une forme non définie et variable
Capable de produire des extensions
cytoplasmiquespseudopodes.
Peuvent être parasitaires.
Capable de symbiose avec des dinophytes.
Eukaryotes unicellulaires.
Marins, dulçaquicoles, ou vivant en milieu terrestre
humide.
Libres, fixés, ou symbiotes : leurs relations avec leurs
hôtes
vont du mutualisme au parasitisme