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Matières organiques
• Protéines, protides, acides aminés
• Lipides, acides gras
• Glucides= sucre s oses, polyosides(polysaccharides)
• Acides nucléiques( ARN, ADN), nucléotides
• Vitamines ..
Matières organiques
ORGANIQUES: 29%
– Molécules à squelette carboné de 2 à 15 atomes diversifié
par les atomes d’hydrogène, d’azote(N), d’oxygène(O),
soufre(S), phosphore(P)
– MonomèresPolymèresMacromolécules
• Macromolécules: Protéines(18%); lipides:(5%); glucides
(2%); acides nucléiques (1%)
• Molécules simples organiques(Acides aminés, acides gras,
sucres, nucléotides): 3%
Matières organiques
PROTÉINES
• 18 % du poids total de la matière vivante et 50% du poids sec
• Chaines d’acides aminés(AA) reliés entre eux par des liaisons
peptidiques(NH2—CH —CO—NH—CH—COOH)
R1 R2
• le nombre AA varie d’une protéine à une autres
• Acides aminés sont des molécules carbonées
• Groupement carboxyle -------COOH
• Groupement aminés -----NH2
• Une chaine latérale R, variable et qui diffère entre les 20 acides
aminés connus
Matières organiques
PROTÉINES
– Deux type de protéines
• Protéines de structure: entrent de la structure cellulaires(
membrane, cytosquelette, acides nucléiques, collagène…..)
• Protéines de régulation qui entre dans la régulation de l’activité
métabolique cellulaires
– Enzymes(respiration, digestion…)
– Hormones protéiques
• régulation de la glycémie: insuline et glucagon
• croissances: somatotrophine(somatropine ou somathormone)
• Reproduction
• Signalisation/communication cellulaire et transport
moléculaire(aquaporine, canal ionique)
• Défense immunitaire(immunoglobulines)
Matières organiques
LES LIPIDES
- Choline
- Sérine
X - Inositol
-lecithine
-éthanolamine
Glycérophospholipide(Ex. Phosphatidylcholine)
Matières organiques
LES LIPIDES
CH3
CH3
CH3
CH3
CH3
CH2
Matières organiques
LES LIPIDES
STÉROLS(cholestérol)
– Rôles
• Constitution des biomembranes
• Source intense d’énergie( 1 gramme de graisse9 calories)
• Forme de réserve chez les végétaux et chez les animaux
• Formation des hormones stéroïdes lipophiles
Matières organiques
GLUCIDES
• On en distingue
– Monosaccharides: oses simples: glucoses, fructose, ribose…...
– Disaccharides: saccharose
– Polysaccharides: sont de polymères de monosaccharides
• Amidon, cellulose, glycogène(C6H10O2)n---
• Fonctions cellulaires
– Energie métabolique
– Identité cellulaire(reconnaissance, adhésion, tissu)
– Structurale(cellulose)
Matières organiques
GLUCIDES
Glycogène
Matières organiques
ACIDES NUCLÉIQUES
• Représentent 1% du poids total de la matière vivante
• Molécules biologiques isolées essentiellement dans le
noyau(ADN), mais aussi dans le cytoplasme(ARN)
• Deux types d’acides nucléiques
– Acides désoxyribonucléique( ADN ou DNA)
– Acide ribonucléique(ARN/RNA)
• Trois constituants entrent dans la formation des acides
nucléiques
– Bases azotées(puriques et pyrimidiques)
– Oses: ribose(D-ribose) et désoxyribose(2’-desoxy-D-ribose)
– Acide phosphorique, un triacide dont deux fonctions acides
seront estérifiées dans l’ADN et ARN
Matières organiques
ACIDES NUCLÉIQUES
• Nucléoside= Base+ sucre(pentose)
• Nucléotide= Base+sucre+phosphate
– Un nucléotide est une molécule organique qui est l'élément de
base d'un acide nucléique tel que l'ADN ou l'ARN.
• Il est composé
– d'une base nucléique ou base azotée
– d'un ose à cinq atomes de carbone, dit pentose,
– dont l'association forme un nucléoside,
– et enfin de un à trois groupes phosphate.
Nucléotide: Adénosine triphosphate (ATP)
– Complémentaires
• Appariement ou hybridation
entre bases puriques et
pyrimidiques par liaisons hydrogènes
A— T
G—C
C—G
T—A
Acides ribonucléiques(ARN)
• structures chimiquement proche de celle de l’ADN.
– Ce sont des polymères linéaires constitués d’un
enchaînement de nucléotides,
• un sucre ribose, et liés entre eux par une liaison phosphodiester.
• La thymine(T) de l’ADN est remplacée par un uracile(U) dans l’ARN, et
• La substitution du désoxyribose par un ribose
• L’ARN est généralement sous forme de simple brin(monocaténaire)
dans la cellule
• L’ARN est une copie d’une région de l’un des brins de l’ADN, par le
mécanisme de la transcription réalisée par les ARN polymérases
• ARN polymérase
ADN(Bicaténaire)>>>>>>>>ARN(Monocaténaire)
Acides nucléiques: Bases et appariement
Acides ribonucléiques(ARN)
• Les ARN interviennent dans la synthèse des protéines et dans
de nombreuses réactions métaboliques cellulaires
Protéines 18
Lipides 5
Organiques Glucides 2
Molécules simples 3
Classification
plusieurs flagelles
permettant leur mobilité
– Métabolisme : aérobies ou
anaérobies ou les deux
– Division par scissiparité
Procaryotes
Eubactéries
– Echerichia .coli
– Mycobacterie
– Pneumoccoque
– Staphyloccoque
– Helicobacter pylori
….
Procaryotes
Archéobactéries
• (absence de noyau, de mitochondries, de système
endomembranaire, de peroxysomes)
• Microorganismes longtemps classés dans le groupes des bactéries
• vivent et se développent dans les conditions extrêmement
difficiles, incompatibles avec la vie de tous les autres organismes
d’où le qualificatif d’extrémophiles (milieu à PH=1, T°=100, très
salés, fortes pressions)
• Les archéobactéries et eucaryotes présentent des similitudes de
composition et de fonctionnement qui ne sont pas retrouvées chez
les bactéries
– Il est admis aujourd'hui que les 3 groupes ont un ancêtres
commun(Progenote Last Universal Common ancestor= LUCA)
Cellules eucaryotes
Organisation en différents la compartiments cellulaires par les
biomembranes cellulaires
– Noyau cellulaire ou caryon
• support de l’information génétique(ADN) et
• Commande et contrôle des fonctions cellulaires
– Cytoplasme= Hyaloplasme +Organites cellulaires
• Siège d’importantes activités métaboliques
– Membrane plasmique:
• Double couche lipidique+protéines+polysaccharides
• communication inter et intracellulaire
La cellule a une activité cyclique :
• Interphase : activité fonctionnelle de la cellule.
• Mitose : multiplication cellulaire= mitose
• Mort programmée (apoptose)
Cellules eucaryotes au microscope optique
Structure
• Double membrane Externe et internecrêtes
• Espace intermembranaire ou chambre externe entre les deux
• Matrice ou chambre interne: ADNmt+ribosomes+granules denses+ATP-
synthétase
A:Schéma d’une Ultrastructure d’un mitochondrie B: Ultrastructure cellulaire et mitochondrie au METx40 000 et
schéma d’interprétation
Peroxysomes
• Structure
– Grande sous unité
– Petite sous unite
• Fonction
– déchiffrer le code de l'ARN messager
– pour synthétiser les protéines.
Réticulum endoplasmique
Système endomembranaire (SEM)
le réticulum endoplasmique
Fonctions
• Synthèse des protéines et des glycoprotéines :
– le message génétique que contient l’ARNm va être lu par les
ribosomes et permettra la synthèse des protéines(assemblage
d’acides aminés). Chaque protéine est spécifique de la cellule qui l’a
synthétisée.
• Stockage.
• Transfert : les protéines synthétisées vont être transférées
dans les vésicules puis vers l’appareil de Golgi.
Système endomembranaire (SEM)
Appareil de Golgi
• ensemble de saccules (dictyosomes) ou citernes empilées les uns
sur les autres et reliés entre eux par des systèmes tubulo-
vésiculaires
– Face trans- golgienne = face d'envoi des vésicules golgiennes
– face cis golgienne= face de réception des vésicules
• Fonction :
– Réception, triage, modification( glycosylation, sulfatation,
phosphorylation…)
– stockage, emballage des molécules synthétisées par RE
– Transfert des substances élaborées par la cellule.
– Distributeurs des nouvelles membranes synthétisé par REFlux
membranaire
Appareil de Golgi
Système endomembranaire (SEM)
Les lysosomes.
• petites structures sphériques (une vésicule) délimitées par une
membrane lipidique située dans le cytoplasme des cellules
eucaryotes.
C’est un organite contenant des enzymes(hydrolases), qui existe
sous 2 formes :
– Lysosome primaire(phagosome), formé à partir de l’appareil de golgi.
– Lysosome secondaire(phagocytome ou phagolysosome), qui est un
primaire ayant fusionné avec d’autres vésicules et qui est impliqué dans
la digestion cellulaire
• Ce sont les agents de la défense cellulaire et de la phagocytose.
• Assure la digestion cellulaire
Centre cellulaire ou centrosome
• Un centrosome est un organite sans membrane, situé prés
du noyau, specifique de la cellule animale, qui est composé
d'une paire de centrioles, entourée par un nuage de matériel
amorphe appelé matériel péricentriolaire
• un édifice composé de deux fois neuf triplets de
microtubules (avec treize protofilaments entre chaque
microtubule), formant la paroi d'un cylindre.
• Fonction
– Le centrosome est un centre organisateur des microtubules (ou
MTOC).
– responsable de la formation du fuseau mitotique microtubulaire lors
de la division cellulaire, sur lequel se déplacent les chromosomes
– Division cellulaire(transport et répartition des chromosomes)
Centre cellulaire ou centrosome
Cytosquelette
NB: Les virus ne sont pas des êtres vivants, ni des cellules
Virus à la frontière du vivant
NB: Les virus ne sont pas des êtres vivants, ni des cellules
L’acide nucléique
• Sa nature et sa structure sont variables. On distingue :
– virus à ARN
• double brin (bicaténaire) ou
• simple brin (monocaténaire).
– virus à ADN
• double brin ou
• simple brin, linéaire ou circulaire.
Virus à la frontière du vivant
Structure des virus
La capside
• coque protéique rigide qui renferme et protège le génome.
• Elle permet de définir la forme du virus
– symétrie cubique (exemple du poliovirus)
– les virus à symétrie hélicoïdale(virus de la mosaïque du tabac ou
VMT).
• NB: l’ensemble acide nucléique + protéines
enzymatiques+capside virale = nucléocapside.
• On trouve des virus « nus », pour lesquels la nucléocapside
constitue le virus entier
• des virus enveloppés, pour lesquels la capside est entourée
d’une enveloppe lipidique.
Virus à la frontière du vivant
Structure des virus
L’enveloppe lipidique = bicouche lipidique.
• Elle entoure la nucléocapside.
• Elle est enchâssée des protéines ou glycoprotéines.
Exemples
• Virus de la grippe (Influenza virus)
– il est constitué de 8 fragments d’ARN inclus dans des capsides en
hélice flexiques (contrairement à celle du VMT), le tout entouré
d’une enveloppe.
Le VIH est aussi un virus à ARN, enveloppé.
Structure virus ARN et ADN
• Virus à ADN
• Avec une capside protéique
• Infection génitale (IST+++)
• Cause: cancer du col de
l’utérus et de la verge
• prévention
– Dépistage: frottis cervico-
utérin(FCU) ou cervico-
vaginal(FVC)
– Test immunologie
– Vaccination chez les
adolescentes
Virus à la frontière du vivant
Classification
trois critères permet de classer les virus, selon:
• La nature de l’acide nucléique
– virus à ADN
– virus ARN
• Le type de symétrie
– Forme cubique,
– Forme hélicoïdale
– Forme combinée
• L’ existence d’une enveloppe :
– virus nus
– Virus enveloppés.
Virus à la frontière du vivant
Classification
Ces trois critères définissent la famille.
N.B : on trouve aussi une classification utilisée par les
cliniciens qui tient compte
• de l’hôte,
• du mode de transmission,
• de la voie d’entrée du virus et
• de ses effets pathologiques (ex : virus entériques,
respiratoires, oncogènes…).
CONCLUSION
• Les êtres vivants sont composés de cellules et molécules
synthétisées, par ces dernières, sous l’influence de
l’environnement
• Le corps humain est composé de 100. 000 milliards de cellules
toutes organisées en 200 types de cellules, qui s’associent en
différents types de tissus, d’organes, d’appareils ou de systèmes,
travaillant en toutes synergie
• Toutes ces cellules proviennent d’une seule cellule, le zygote(œuf
fécondé)qui a évolué pour donner un être humain au cours du
développement intra-utérin
CONCLUSION
• La cellule est un être vivant en miniature dont la mission est
d’assurer
– des fonctions métaboliques(anabolismes+catabolisme),
– des fonctions de relation, de nutrition, d’épuration, et reproduction des
organismes vivants
• La cellule est une entité biologique dont la désorganisation ou le
dysfonctionnent peut se retentir sur les équilibres
fondamentaux des organismes vivant.
• L’étude de la cellule apporte de nombreuses et précieuses aides
au diagnostic en Médecine, et à la compréhension des
phénomènes de la vie.
– C’est ainsi que le Médecin est très souvent amené à explorer des cellules
ou leurs substances métaboliques, à travers des prélèvements pour
éclairer son diagnostic et conduire une bonne prise en charge