Universit Cheikh Anta Diop de Dakar

Facult des Sciences et Techniques

LICENCE 3 SCIENCES DE LA VIE COURS DECOLOGIE LETRE VIVANT DANS SON ENVIRONNEMENT
Document ralis par Seydina Issa DIOP

Seydina Issa DIOP

Ltre vivant dans son Environnement

La notion de facteur cologique Facteurs cologiques Une espce particulire ne se rencontre pas nimporte o dans la biosphre Lorsquon sintresse cette espce, on va explorer sa niche cologique; qui est sous linfluence des facteurs cologiques Il faut donc alors tudier les facteurs cologiques qui influencent lespce Les facteurs abiotiques fixent le cadre des contraintes lintrieur duquel la distribution qualitative et quantitative de divers paramtres tels que la temprature, lhumidit, la composition des sols, contrle la prsence des espces et la structure des communauts vgtales et animales La dynamique dun cosystme, en fonction de sa localisation gographique, est sous le contrle de plusieurs paramtres abiotiques en interaction qui relvent la fois du climat et du contexte gologique. La connaissance de cette hirarchie de type bottom up est essentielle si lon veut comprendre comment fonctionne un cosystme.

Les Facteurs cologiques abiotiques

Seydina Issa DIOP

 Tout lment susceptible dagir directement sur les tres vivants constitue un facteur cologique Quelque soit le niveau dorganisation des tres vivants, un facteur cologique nagit jamais seul les tres vivants sont sous laction dun nombre important de facteurs, qui souvent, varient dans lespace et le temps Lcologie distingue les facteurs abiotiques, tels ceux lis au climat, au relief, des facteurs biotiques Parmi les facteurs abiotiques, on peut citer la lumire, les

prcipitations, la temprature, la pression, Parmi les facteurs biotiques, on distingue les relations entre espces (parasitisme, comptition,) et les facteurs anthropiques;
lis lactivit de lhomme

Seydina Issa DIOP

Les Facteurs cologiques varient selon des gradients larges Une Espce vivante prsente des limites de tolrance vis - vis dun facteur cologique donn ; dans ces limites se situe loptimum de dveloppement.

Pin sylvestre

Poisson Trematomus

Seydina Issa DIOP

Certaines espces ont des exigences trs strictes, alors que dautres peuvent supporter de trs grandes variations* Cette capacit des espces occuper des milieux caractriss par des variations grandes, est appele amplitude (ou valence) cologique. Dans les milieux o les facteurs cologiques prsentent de grandes variations dun facteur (eaux saumtres des estuaires p.ex.), seules subsistent les espces grande amplitude cologique* De manire gnrale, lamplitude des espce augmente avec lvolution ce petit jeu, lhomme est champion! Un facteur limitant tout facteur cologique qui vient manquer ou dpasser un des seuils de lespce (vis--vis de ce facteur) Cette limitation intervient, mme si tous les autres facteurs sont favorables Loi du minimum : si une espce prsente une amplitude troite vis-vis dun facteur, celui-ci risque fort dtre un facteur limitant pour cette espce Dans la nature, les autres facteurs cologiques interfrent sur un facteur Exemple : photosynthse plus efficace selon la lumire, mais aussi la temprature De plus, les exigences dune espce peuvent varier au cours de sa vie (stade de dveloppement) Facteurs abiotiques Processus de nature gologique Gomorphologie : tude de la configuration de la surface de la Terre Gochimie : tude de la distribution des flux dlments chimiques Deux disciplines pour comprendre la dynamique de la lithosphre. Le relief chelles de temps courtes : processus gologiques ayant une influence sur le fonctionnement des cosystmes = catastrophes*
Seydina Issa DIOP

 chelles de temps plus longues : variables gologiques et leurs interactions avec les processus hydrologiques, atmosphriques et biosphriques (agissant chelles spatiales et temporelles) ont model (et continuent) les reliefs et les paysages. Gomorphologie : description et explication des divers modes dvolution du relief terrestre, continental et sous-marin. Divers types de systmes morphogniques : systme glaciaire, systme olien, systme fluvial : correspondent des caractristiques drosion, de dpt et de sdimentation Systme trs tudi : bassin versant Gomorphologie climatique : tudie le relief dans ses rapports avec le climat. Cycle rosion-transport-sdimentation Contact lithosphre avec atmosphre et biosphre ; attaque des roches par divers agents (eau, biologiques) : assure transformation des roches et minraux de la surface terrestre en produits meubles Cette altration comporte une dgradation physique, suivie dune dgradation chimique et de processus de nature organiques deux rsultats : formation des sols + model du paysage Lvolution dans le temps de la morphologie des bassins versants est la rsultante des processus drosion, de transport et de dpt. Le cycle rosion-transport-sdimentation concerne lessentiel des terres merges : Eau = agent important drosion capacits drosion des cours deau considrables (Exemple : rivires rapides creusent des valles profondes comme celle du Verdon o les falaises peuvent atteindre 700m de haut) Les effets mcaniques dpendent des dbits et de la vitesse du courant. La taille des matriaux transports et le mode de transport des sdiments voluent de lamont laval (modification de la pente et de la nature des roches) La charge de matires en suspension transportes par les fleuves = fonction de la nature des sols et de leur occupation sur le bassin versant (exemples)

Seydina Issa DIOP

Les sols
Interaction des couches superficielles de la lithosphre avec latmosphre et la biosphre Pdogense = gense des sols partir dune roche-mre Deux processus : Altration de la roche-mre sous leffet dagents climatiques et organiques Apport de MO par tres vivants Ces deux processus se poursuivent au cours du temps mlange de matires minrale et organique = complexe organo-minral

Caractristiques physiques et chimiques des sols Texture = taille des particules (analyse ganulomtrique) Structure = mode dagencement des particules Particulaire (lments du sol restent indpendants) Agrgats (particules agglutines) Texture et structure conditionnent la porosit du sol : permet la
circulation des gaz et de leau (aration ncessaire lactivit des organismes du sol). La capacit de rtention en eau assure une fertilit.

Proprits des sols et rpartition de la vgtation Les proprits gochimiques des sols dterminent les quantits de minraux disponibles pour la vie des tres vivants
Cartes gologiques contiennent lments importants pour cologues Les lments majeurs pour la nutrition des organismes vivants sont galement ceux sur lesquels repose la classification des minraux (Al, Ca, Fe, K, Mg, Na, Si)

Composition vgtation dpend de la nature du sol /formation vgtale agit sur caractristiques sur sol.
Facteurs abiotiques Le macroclimat Temps quil fait = tat passager de latmosphre
Seydina Issa DIOP

caractris par des grandeurs physiques : temprature, prcipitations, vitesse et direction du vent, pression atmosphrique, humidit de lair Climat = succession des tats de latmosphre en un lieu donn (prs du sol)

Fischesser & Dupuis-Tate, 1996

Seydina Issa DIOP

Le climat est le principal facteur de contrle de la rpartition et de la dynamique des cosystmes

Linsolation
Principale source dnergie des cosystmes = rayonnement

solaire
Lnergie solaire sert rchauffer la surface du sol et les eaux, et permet la photosynthse. Cette nergie est transmise par la lumire Des 42% dnergie solaire que contient la partie visible du spectre solaire, la moiti seulement est utilisable pour la photosynthse Un des facteurs de la variabilit des climats sur la Terre est linclinaison des rayons du soleil en fonction de la latitude De manire trs schmatique, on peut dire que les types de climat correspondent des rgions qui forment des ceintures parallles lquateur.

Fischesser & Dupuis-Tate, 1996

Les vgtaux recherchent la lumire avec davidit, mais ont aussi tendance se protger de lardeur excessive de ses rayons
Seydina Issa DIOP

La lumire alimente les plantes et les faonne (paisseur des feuilles, couleur des fleurs,) Cest surtout la dure de lclairement et lalternance de la lumire et de lobscurit qui dterminent les rythmes biologiques et rglent lhorloge interne des organismes vivants Ce photopriodisme joue un rle essentiel pour les plantes, il contrle leur germination, leur croissance et leur floraison, mais aussi pour les animaux, il conditionne leur priode de reproduction, de migration ou dhibernation

La temprature
Paramtre mesur sous abri (par convention) On mesure la temprature moyenne dun milieu protg des radiations solaires La temprature agit sur les phnomnes mtaboliques Elle contrle directement la respiration, la croissance, la photosynthse, les dplacements et conditionne donc la rpartition des espces et des communauts La temprature est un rgulateur biologique Chaque espce a sa temprature prfrentielle, mais peut faire preuve de de plasticit.

Les vgtaux ont dploys toutes sortes de ruses pour sadapter et rsister soit au froid, soit la chaleur , ils rduisent leur priode de vgtation et passent la mauvaise saison dfolies ou sous forme de graines Les animaux aussi rglent leurs comportements pour mieux lutter contre les carts de temprature pokilothermes et homothermes Le lzard par exemple, saplatit et carte ses ctes pour sinstaller sur un rocher le matin, offrant une surface maxi aux rayons du soleil. A midi, il se cache sous la pierre rgles cologiques

Seydina Issa DIOP

Adaptation des vgtaux la mauvaise saison

Chez les animaux homothermes, divers systmes disolation vitent les pertes calorifiques : plumage des oiseaux, pelage des mammifres, couche de graisse des phoques et baleines, Cette homothermie ncessite une importante consommation de calories! Chez les petits animaux, le rapport lev de leur surface leur masse entrane des dperditions importantes de chaleur, besoin en nourriture dmesur et ncessit de brler lessentiel de cette nourriture pour survivre

Seydina Issa DIOP

Seydina Issa DIOP

Les prcipitations et lhumidit

Aux facteurs thermiques qui structurent la rpartition des climats, se superposent une rpartition des prcipitations (conditionne par la circulation des masses dair), modifient parfois sensiblement la

distribution des zones climatiques Prcipitations : condensation de la vapeur deau par le

refroidissement de lair humide Pluviomtrie = mesure des prcipitations Humidit de lair = quantit de vapeur deau contenue dans un certain volume dair

Rle structurant du climat : les biomes

La combinaison des prcipitations et de la temprature permet de diviser le globe en grands domaines morphoclimatiques une chelle macroscopique 4 zones coclimatiques : tropical chaud et humide; tempr humide; polaire; aride.
Seydina Issa DIOP

 une chelle plus grande, on observe que rgions du globe (avec conditions climatiques proches) sont occupes par des

cosystmes de nature comparable. Vgtation indicateur assez fiable pour traduire ( chelle
assez grande) le jeu de ces facteurs Les limites entre grandes formations vgtales concrtisent des discontinuits du milieu naturel et apportent des infos sur le climat probable dans des zones mal connues On appelle biomes ces grandes formations caractriss par le type de vgtation Les gammes de variations de ces facteurs sobservent aussi bien en allant de lquateur aux ples quen escaladant une montagne leve Le climat dune rgion est la rsultante de trois facteurs principaux : la quantit de rayonnement solaire incident, les mouvements de lair et de leau et les caractristiques principales de la surface terrestre. Le nombre de biomes identifis dpend du degr de rsolution souhaite selon les auteurs, on peut en distinguer de 10 100! Les plus importants sont :
La toundra La fort borale de conifres (taga) La fort tempre feuilles caduques Les cosystmes mditerranens La steppe tempre (+ grande prairie USA) Les dserts La savane tropicale La fort ombrophile tropicale

Seydina Issa DIOP

Krogh, 2005

Combinaison des effets de la temprature et des prcipitations

Seydina Issa DIOP

Il existe sept biomes terrestres principaux. Le climat peut empcher la survie dune espce dans une rgion de manire directe ou indirecte. Bien que le climat soit le facteur le plus important dans la slection de la localisation probable des biomes terrestres, leur emplacement rel est fortement influenc par les activits humaines.

Le climat volue avec le temps

Leau
Dissous et distribue loxygne, le gaz carbonique et les sels minraux dont la vie ne peut se passer Volume annuel des prcipitations conditionne en grande partie la distribution des biomes
Seydina Issa DIOP

Entre pour plus de moiti dans le poids de la majorit des organismes Essentielle leur survie (fonctionnement des mcanismes fondamentaux, rgulation de la temprature, ect )

Fischesser & Dupuis-Tate, 1996

Les tres vivants peuvent tre classs selon leurs besoins en eau. Les groupes archaques ne peuvent supporter de sloigner dun milieu humide; Parmi les groupes plus volus, certains ont besoin dun certain degr dhumidit; Dautres, peuvent vivre en milieu sec (dficit en eau accentu et frquent) La plupart des tre vivants peuvent traverser des alternances de scheresse et dhumidit, notamment par le biais de dispositifs ou comportements adapts

Seydina Issa DIOP

Fischesser & Dupuis-Tate, 1996

La neige Dans les rgions froides, leau des prcipitations se transforme en neige ds que la T avoisine 0C. La couche de neige qui saccumule peut avoir divers effets : isolant, rserve deau, action mcanique Selon laptitude des espces vgtales subir une dure denneigement longue, on classe les associations vgtales alpines

Seydina Issa DIOP

 Le vent Outre les aspects lis lrosion, le vent intervient galement comme facteur limitant dans certains milieux (altitude, ctes, temptes,) Il agit aussi sur la dissmination des graines et comme facteur de pollinisation. Le feu Agent perturbateur fort, qui interrompt ou change lvolution des communauts vgtales Le feu peut avoir une origine naturelle (foudre, ruptions volcaniques) ou anthropique Le feu est lorigine de nombreux cosystmes connus actuellement Principal facteur de destruction des forts tropicales actuelles, des tagas, des formations mditerranennes; mais aussi facteur de gestion De la tolrance ladaptation Une espce peut vivre en dehors de ses stations cologiques habituelles pendant un certain temps Elle peut sadapter le temps de la perturbation, les variations morphologiques ne durent que le temps des contraintes du milieu; la transformation nest pas hrditaire, cest un simple accommodat Dautres variations vont tre soumises la pression de slection constitution dcotypes

Seydina Issa DIOP

Laction combine des facteurs climatiques (Essentiellement temprature-hygromtrie) conditionne la rpartition des tres vivants et lpanouissement de leurs populations ; ils peuvent tre la cause de dplacements despces animales :

Seydina Issa DIOP

la migration = phnomne de nature cyclique, comportant un

dpart et un retour, effectus sur un rythme quotidien ou saisonnier les exodes = phnomnes passagers, lis des conditions particulires (criquets migrateurs)

Les mouvements dmigrations ou immigrations = extensions daires de rpartition (ne pas confondre avec invasions) Macroclimat Prcise les conditions climatiques dune rgion (il est lchelle du biome) Msoclimat
Seydina Issa DIOP

Conditions prsentes lchelle dune fort, dun lac, du versant dune montagne chelle de la communaut ou de lcosystme Microclimat Le microclimat reflte les conditions prsentes lchelle de lorganisme cest en ville que le phnomne est le plus marqu Les relations entre espces

Les Facteurs cologiques biotiques

Toutes les espces exercent, des degrs divers, des actions les unes sur les autres* Ces actions vont de lantagonisme fort lentraide Les grands types de rapports entre tres vivants associs dans une communaut ont t tudis et classifis Labsence de relations Cette absence est souvent qualifie dindiffrence Elle se marque soit par une absence totale de relations entre espces; soit par une association, mais sans quaucune des espces ne trouve davantages ou dinconvnients cette association Les relations favorables Ces relations sont rparties en quatre groupes : Le commensalisme La synergie Laide mutuelle La symbiose

Seydina Issa DIOP

 De manire gnrale, si les deux espces dune interaction mutualiste profitent de ce rapport, chaque espre individuellement ne joue le jeu que par intrt personnel Il arrive rgulirement que cette interaction ait un cot pour lune des deux espces, mais ce cot reste infrieur au gain procur par la relation Le commensalisme Association qui ne profite qu lune des deux espces, lautre tant indiffrente Implique (ou non) un contact permanent Frontire avec parasitisme pas toujours vidente! La synergie Stimulation de lactivit ou du dveloppement dun organisme par la prsence dun autre Azote fix par lgumineuses enrichit le sol pour dautres espces Laide mutuelle Appele aussi coopration, permet de nombreux organismes de sassocier pour en tirer un bnfice rciproque (ils peuvent aussi se dvelopper lun sans lautre)
Seydina Issa DIOP

Exemples : oiseaux qui se regroupent : une espce donne lalerte pour les autres*; nettoyage; rapports insectes plantes (pollinisation*, dispersion); La symbiose Les deux protagonistes y bnficient davantages rciproques et ne pourraient pas subsister (ou trs mal) lun sans lautre Association mycorhiziennes : plante champignons Les lichens : forme vgtale rsultant de la symbiose dun champignon et dune algue Chez les animaux : symbioses frquentes pour espces dont le rgime se compose dune seule sorte de nourriture (cellulose chez le termite p.ex.) Les mutualismes voluent quand les avantages de linteraction sont suprieurs aux cots pour les deux associs. Les mutualismes participent la dtermination de la distribution et de labondance des espces mutualistes ainsi que des autres espces qui dpendent directement ou indirectement des espces mutualistes. Les interactions consommateur-victime Lammensalisme La prdation + herbivores Le parasitisme + agents pathognes
Fischesser & Dupuis-Tate, 1996

Lammensalisme Utilisation de substances toxiques inhibitrices ou mortelles pour lutter distance contre la concurrence spatiale dautres espces La prdation
Seydina Issa DIOP

Utilisation dune espce par une autre pour sen nourrir = processus essentiel pour le contrle des populations tape essentielle de la chane alimentaire On peut classer les prdateurs en fonction de leur degr de spcialisation - ceux qui mangent de tout (polyphages - mais ont des prfrences) souvent les animaux suprieurs - ceux qui ne se nourrissent que de qqs espces (oligophages) - ceux qui ne se nourrissent que dune espce (monophages) Chaque prdateur a ajust sa technique de chasse infinit de spcialisations anatomiques et comportementales

Seydina Issa DIOP

Les consommateurs peuvent exercer une puissante force de slection, conduisant leurs victimes voluer pour acqurir divers types de dfense pour viter dtre consommes. Les consommateurs peuvent imiter la distribution et labondance de leurs victimes, et dans certains, cas, provoquer leur propre extinction. Le parasitisme Utilisation dun hte par une espce pour se nourrir et se reproduire (sans entraner ncessairement la mort) Certains parasites sont eux-mmes parasits par dautres

hyperparasitisme
Lhomme peut utiliser ce type de mcanisme pour lutter contre des parasites lutte biologique Chez les plantes on distingue les parasites et les hemiparasites Chez les animaux, on distingue les ectoparasites et les

endoparasites La lutte biologique

Constats sur les produits phytosanitaires : Dsquilibrent les cosystmes Apparition de souches rsistantes Solution : lutte biologique Mthodes : utilisation de prdateurs naturels; lutte intgre; hyperpararistisme; microorganismes pathognes; diminution de la natalit Lutte contre insectes nuisibles essentielle pour survie Homme (1/3 des rcoltes dtruites chaque anne; 400 millions de personnes atteintes) La comptition Correspond une lutte pour des ressources, la lumire, leau, un territoire, Comptition dautant + intense que les exigences sont proches, et que la densit est leve

Seydina Issa DIOP

Chez les vgtaux : lutte pour la lumire (stratification); lutte pour les ressources du sol (eau, sels minraux) Chez les animaux : exemples nombreux de piraterie Quand deux espces sont en comptition, chacune a un effet ngatif sur lautre utilisent les mmes ressources On reconnat deux types de comptition : Comptition par interfrence : un organisme exclut directement les autres organismes de lutilisation dune ressource Concurrence par exploitation : espces saffrontent indirectement pour le partage dune ressource alimentaire

Cain et al., 2006

Dans la comptition par interfrence, une espce exclut directement les autres pour lutilisation des ressources. Dans la comptition par exploitation, les espces se font concurrence indirectement, chacune rduisant la quantit de ressources disponibles pour lautre. La comptition peut affecter la distribution et labondance des espces et faire voluer des diffrences phnotypiques entre les concurrents au cours du temps.

Seydina Issa DIOP

La notion de niche cologique

Chaque espce vivante sinsre dans les mcanismes dun cosystme comme dans les rouages complexes de la machinerie des horloges La niche cologique se dcrit par lhabitat de lespce, mais aussi ce quelle mange, o elle se place dans la chane alimentaire, les conditions ncessaires sa reproduction

La niche cologique traduit la relation fonctionnelle qui lie un organisme a son systme
La coexistence est impossible entre deux espces ayant une niche cologique identique, une espce liminera lautre (principe dexclusion comptitive) Deux espces nont jamais des structures, des besoins et des comportements identiques
Seydina Issa DIOP

Il existe une tonnante diversit de niches cologiques permettant lensemble des tres vivants dexploiter au mieux un milieu et ses ressources Les niches cologiques ne sont pas spcifiques dune rgion. On peut, par exemple, retrouver sur deux continents des animaux (volutivement) dissemblables qui occupent des niches cologiques similaires et remplissent des fonctions identiques (ex. taupes des forts europennes et taupes marsupiales dAustralie)

cest lobservation de cette convergence qui a conduit Darwin a percevoir lvolution des espces
Les cosystmes voluent et se compliquent, permettant lmergence de nouvelles niches cologiques.

Un cosystme mur, ou chaque niche est occupee, exploite au mieux les possibilits de son environnement grande stabilit

Seydina Issa DIOP

Certains auteurs ont critiqu la notion de nichemais si ce mot rassemble des phnomnes apparemment trs diffrents, ceux-ci traduisent des fonctions similaires. Lapproche systmique consiste caractriser la niche cologique des espces par rapport trois axes fondamentaux : axe spatial (variables climatiques et physico-chimiques); axe trophique (types de proies potentielles); axe temporel (mode dutilisation dans le temps de lespace et la nourriture) Effets des facteurs cologiques sur les tres vivants partant de cette connaissance, en retour, on pourrait utiliser les organismes vivants pour juger de ltat de lenvironnement Certaines espces se comportent comme des sentinelles, capables de ragir de trs faibles taux de contamination de polluants; certaines disparaissent ou se rarfient, dautres au contraire, se mettent pulluler. Une dernire catgorie accumule des quantits normes de polluants dans ses tissus Les sentinelles Les lichens absorbent toute leau de pluie, y compris les polluants quelle contient activit continue et pouvoir daccumulation En connaissant une cinquantaine despces (donc, leur sensibilit aux polluants), on peut dresser des cartes de pollutions Le lichen est un bio indicateur: il est capable de traduire de manire directe et vidente des modifications qualitatives ou quantitatives de son cosystme Dautres groupes faunistiques, comme les diatomes, poissons, les mollusques ou les insectes remplissent galement ce rle

Seydina Issa DIOP

Seydina Issa DIOP

Lavifaune (les oiseaux), est galement un bon groupe dindicateurs. Les oiseaux sont faciles observer et dnombrer dans leur milieu naturel (vision et coute). En tudiant lvolution des populations de diverses espces, on peut mesurer les effets de diverses activits ou politiques sur le milieu
Seydina Issa DIOP

 Les associations vgtales La science qui sintresse aux associations vgtales est la phytosociologie. Elle permet dutiliser la vgtation comme indicateur biologique, car elle intgre un grand nombre de paramtres cologiques Lidentification des associations passe un reprage des ensembles homognes, puis par ltablissement de relevs et lutilisation dindices, tels que celui dabondance-dominance de Braun-Blanquet (chelle mixte 6 valeurs)

Seydina Issa DIOP

Bibliographie
Cain, M., Damman, H., Lue, R. & Yoon, C.; 2006; Dcouvrir la biologie ; De Boeck. Duvigneaud, P.; 1980; la synthse cologique ; Doin d. Fischesser B. et Dupuis-Tate, MF.; 1996; le guide illustr de lcologie , d. de la Martinire Krogh, D.; 2005; Biology a Guide to the Natural World ; Pearson Prentice Hall, 3th ed. Lvque, C. 2001; cologie de lcosystme la biosphre ; Dunod.

Seydina Issa DIOP