Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
A Création
Sommaire
I - Objet
II - Réactifs
III - Méthodologie
IV - Lecture des lames
V - Notation des résultats
VI - Annexes
Rédigé par: Vérifié par : Approuvé
Date: Date : par:
Signature Signature Pour
application
le
Signature
I - Objet
Ce document détaille les protocoles de coloration et d'examen microscopique des frottis colorés pour la
recherche et l'observation des mycobactéries.
II - Réactifs
Se reporter en annexes du document.
III - Méthodologie
A - Préparation des frottis
B - Fixation
C - Colorations
1 - Méthodes utilisant la fuchsine
2 - Méthodes utilisant l'auramine
3 - Méthode utilisant l'acridine orange
NB : Si le frottis est fait à partir du flacon Bactec 12B, 0,1 ml de culot est ajouté à 0,1 ml de sérum de
lapin.
B - Fixation
- Laisser sécher le frottis (à l'air ou sur une plaque chauffante à température moyenne).
- Fixer à l'alcool méthylique.
C - Colorations
Plusieurs techniques sont utilisées pour colorer les mycobactéries présentes dans les prélèvements :
1 - Méthodes utilisant la fuchsine
2 - Méthodes utilisant l'auramine
3 - Méthode utilisant l'acridine orange
Remarques :
Pour toutes les colorations , le rincage à l'eau se fait sous un filet d'eau de robinet.
Le séchage entre 2 épaisseurs de papier filtre est à éviter.
Remarques
* La coloration de Ziehl-Neelsen peut être faite à froid. Les lames sont immergées pendant au moins 3
heures dans la solution de fuchsine.
* On peut utiliser l'acide sulfurique dilué au 1/4 à la place de l'acide nitrique.
* On peut avantageusement remplacer les deux temps de la décoloration par l'utilisation d'un mélange
acide-alcool que l'on laissera agir pendant 2 minutes.
* Le réactif d'Armand qui contient l'acide, l'alcool, et le bleu de méthylène permet de réaliser en un seul
temps la décoloration et la recoloration des frottis préalablement colorés par la fuchsine.
Coloration de Degommier
Réactifs
Acide trichloracétique 1 %
Auramine 00
Décolorant
Rouge de thiazine
Technique
- Couvrir la lame d'acide trichloracétique à 1% pendant 30 mn.
- Rincer à l'eau.
- Couvrir la lame avec la solution d'auramine pendant 15 mn.
- Rincer à l'eau.
- Couvrir la lame avec la solution décolorante pendant 2 mn.
- Rincer à l'eau.
- Couvrir le frottis avec la solution de rouge thiazine pendant 1 mn 30.
- Rincer à l'eau.
- Décolorer avec la solution décolorante pendant 3 mn.
- Rincer à l'eau.
- Sécher à l'air.
Réactifs
Orange acridine
Décolorant
Bleu de méthylène
Technique
- Couvrir la lame avec la solution d'acridine orange à 1% pendant 15 mn.
- Rincer à l'eau.
- Couvrir la lame avec la solution de décoloration pendant 1 mn.
- Rincer à l'eau.
- Couvrir le frottis de bleu de méthylène pendant 1 mn.
- Rincer à l'eau.
- Décolorer avec la solution décolorante pendant 3 mn.
- Rincer à l'eau.
- Sécher à l'air.
VI - Annexes
Décolorant
Acide sulfurique...................................................................100 ml
Eau distillée........................................................................ 300 ml
Verser toujours l'acide très lentement dans l'eau.
Bleu de méthylène
Bleu de méthylène .............................................................. 1 g
Alcool à 95°...................................................................... 10 ml
Phénol................................................................................ 1 g
Eau distillée........................................................................ 100 ml
Même préparation que ci-dessus
Tous les réactifs se conservent à température ambiante pendant une longue durée.
Décolorant
Acide chlorhydrique....................................................................... 3 ml
Alcool à 95 %................................................................................ 97 ml
Bleu de méthylène
Bleu de méthylène ......................................................................... 0,3 g
Eau distillée................................................................................... 100 ml
Tous ces réactifs se conservent à température ambiante pendant une longue durée
3 - Coloration à l'auramine
Acide trichloracétique à 1 %
Acide trichloracétique*........................................................ 10 g
Eau distillée............................................................................ 1000 ml
Dissoudre lentement l'acide dans l'eau.
Auramine
Auramine 00.......................................................................... 1 g
Phénol..................................................................................... 50 g
Chlorure de magnésium..................................................... 100 ml
Eau distillée (tiède)............................................................... qsp 1000 ml
Peser 1 g d'auramine, verser la poudre dans un ballon de 1 litre contenant 500 ml d'eau distillée, bien
mélangé,
Mettre à l'étuve pendant 24 heures.
Dissoudre 50 g de phénol dans 100 ml de la solution de chlorure de magnésium à 2 %.
Mélanger les 2 solutions. Compléter à 1000 ml avec de l'eau distillée.
Filtrer avec 2 filtres.
Conserver à l'obscurité et à + 4° pendant une durée maxima de 1 mois.
Décolorant
Alcool à 95 %...................................................................... 935 ml
Eau distillée........................................................................... 65 ml
Acide chlorhydrique pur.......................................................... 5 ml
Chlorure de sodium .................................................................5 g
Décolorant
Ethanol ................................................................................. 3700 ml
Eau distillée ........................................................................... 1300 ml
Bleu de méthylène
Eau distillée .............................................................................1300 ml
Bleu de méthylène .................................................................10 g
Ethanol à 95°........................................................................... 3700 ml
Transférer un barreau magnétique dans l'erlen. Boucher l'erlen avec du film recouvrant, mettre en route
l'agitation pendant une nuit.
Remarques
*Le phénol, l'acide chlorhydrique, l'acide sulfurique, et l'acide trichloracétique sont des produits
"corrosifs".
L'auramine et l'orange acidine étant des produits toxiques par inhalation et par contact, pour peser la
poudre d'auramine ou d'orange acridine, le manipulateur doit porter des gants et un masque à haute
filtration. Cette manipulation devrait se faire sous hotte à charbon actif.
L'évacuation des colorants doit s'effectuer selon une procédure particulière
Si les lames sont colorées dans des bacs, changer régulièrement les solutions (toutes les semaines) ou
plus selon le n
Coloration de Gram
Auteur: BIOLTROP
Editeur: Fondation Mérieux
Langue: Anglais, Français
Posté: 01/02/2012
Thème: Techniques bactériologiques
Principe
Par la coloration différentielle de Gram, les bactéries Gram positif (Gram+) sont colorées en violet, les
bactéries Gram négatif (Gram-) sont colorées en rose, ceci étant du à une différence de composition de
la paroi. Effectué à partir d'un frottis ou un étalement.
Matériel
Lames
Colorants
Mode opératoire
Lorsque l'on colore peu de lames, plutôt que d'immerger les préparations, on peut les recouvrir de
colorants. Les colorants doivent être changés chaque jour.
Risques d'erreurs
Faux Gram (+) :
Réaliser un frottis ou un étalement.
Fixer la préparation à la flamme sans dépasser 50 - 60° (brièvement supportable à la main), ce qui les
sèche puis laisser refroidir la lame.
Immerger (ou inonder) les lames dans la solution de Cristal Violet pendant 1mm.
Lavage à l'eau en transvasant les lames ou sous le robinet.
Immerger (ou inonder) les lames dans du Lugol pendant 1 mn en les agitant.
Laver à nouveau à l'eau.
Décolorer jusqu'à disparition de la couleur violette dans l'alcool en faisant couler goutte à goutte sur la
lame inclinée ou en immergeant les lames pendant une dizaine de secondes dans le décolorant.
Laver à l'eau.
Contre colorer avec la solution de safranine diluée ou de fuchsine diluée pendant 20 à 30 secondes.
Laver à l'eau et sécher à l'air ou en chauffant vers 50°. Les lames doivent être parfaitement sèches.
Observer à l'objectif x 100, en immersion avec de l'huile à immersion.
Étalement trop épais (mauvais décoloration) : examinez dans une zone ou l'etalement esr mince.
Dépôt de colorant dans le flacon de violet de gentiane : filtrer le colorant pour y remédier.
Solution iodée de Gram mal égouttée.
Décolorant laissé trop peu de temps (globalement, mieux vaut trop que pas assez).
Solution de fushine laissée très longtemps (plus d'une minute).
Avidité de certaines bactéries (Neisseria et Acinetobacter en particulier) pour la fuchsine donnant un
rouge très foncé, difficile à distinguer d'un violet.
Faux Gram (-) :
Solution iodée de Gram laissée trop peu de temps.
Décolorant laissé trop longtemps et mal rincé
Préparation des réactifs
Violet de gentiane – adaptation de Hucker
Solution A :
Violet de gentiane 2g
Alcool à 95° 20ml
Solution B :
Oxalate d'ammonium : 0,8g
Eau distillée 80ml
Mélanger les solutions A et B, Laisser reposer 24 heures avant l'emploi, Verser à travers un papier filtre
dans un flacon.
Solution iodée de gram
Iode 1g
Iodure de potassium 2g
Eau distillée 300ml
Dissoudre d'abord l'iodure de potassium dans environ 30 ml d'eau distillée, ajouter l'iode et mélanger
jusqu'à dissolution.
Ajouter le reste d'eau distillée, mélanger.
Conserver dans un flacon en verre brun ou en plastique opaque (à l'abri de la lumière).
Solution de safranine (préférer la safranine à la fuchsine)
Solution A :
Safranine O 2,5g
Alcool à 95° qsp 100ml
Solution A bis :
Solution A 10ml
Eau distillée 90ml
Décolorant
Mélanger à parties égale alcool à 95 ° et acétone (on peut utiliser seulement de l'alcool mais la
décoloration est plus longue : faire des essais).
Contrôle de qualité
Il est fortement conseillé de pratiquer régulièrement un contrôle de qualité de la coloration car sa qualité
est très dépendante de la qualité et de la composition des réactifs ainsi que de l’expérience de
l'opérateur, notamment à cause de l’étape de décoloration qui doit être appréciée « à l’œil ».
On peut ainsi préparer une série de lames de témoin Gram (-) riches en entérobactéries (gram d'une
CBU riche en Escherichia coli) et une autre série de lames de témoin Gram (+) riches en
Staphylococcus aureus (à partir d’une plaie ou autre).
OLORATIONS EN MICROBIOLOGIE
HISTORIQUE
Mises au point au 19e siècle. Durant le dernier siècle, l’utilisation des colorations a vraiment aidé au
développement technologique tant et si bien que maintenant, la coloration bactérienne est une technique de base
dans l’identification bactérienne.
2
COLORATIONS EN MICROBIOLOGIE
Les colorants existent sous forme de?
Préparation aqueuse ou organique
3
COLORATIONS EN MICROBIOLOGIE
Ils peuvent être utilisés pour :
Colorer du matériel biologique
Comme indicateur de pH dans les milieux de culture
Comme inhibiteur dans les milieux de culture(gram-/+Crystal violet)
Comme indicateur d’oxydoréduction
4
PRINCIPES DE LA COLORATION
Tous les colorants ont au moins deux propriétés en commun?
Présence de groupes chromophores.
Posséder un groupe auxochrome
5
PRINCIPES DE LA COLORATION
Ils sont colorés grâce à la présence de groupes chromophores
Qui ont pour origine la molécule de benzène ou une quinone. Ils peuvent se lier aux cellules par interaction
ionique, covalente ou hydrophobe.
6
PRINCIPES DE LA COLORATION
Les groupes de colorants qui nous intéressent sont ionisables et ils sont
divisés en deux groupes :
Les colorants basiques ou cationiques et les colorants acides ou anioniques.
7
PRINCIPES DE LA COLORATION
un groupe auxochrome
Qui est un radical ionisant attaché à la partie du colorant possédant le chromophore. Ces radicaux possèdent des
charges. Ils sont soit cationiques (NH2) ou anioniques (COOH-, OH-, SO3 H-). Il permettra au colorant de
s’attacher au tissu ou à la cellule.
8
PRINCIPES DE LA COLORATION
Le tissu ou le micro-organisme basophile (charge négative, anionique,
acide) se colore par
Des colorants possédant une charge positive donc : basiques, cationiques.
ex: La surface des cellules bactériennes, l’ADN, l’ARN, le mucus, le cartilage, les acides nucléiques, les protéines
et la chromatine sont: basophile anionique, de charge négative, acide
9
PRINCIPES DE LA COLORATION
Le tissu ou la cellule acidophile (charge positive, cationique, basique)
se colore par
Des colorants possédant une charge négative donc : acide, anionique.
ex: Le collagène, les érythrocytes, les éosinophiles, les mucosubstances carboxyles et sulfatés sont : acidophiles,
cationiques, de charge positive, basique.
10
Les colorants basiques utilisés en microbiologie, ils sont généralement
vendus sous forme de chlorures :
bleu de méthylène
fuchsine basique
cristal violet
safranine
vert de malachite
carbolfuschine
11
Les colorants acides:
fuchsine acide
éosine
rose Bengale
12
ÉTAPES D’UNE COLORATION
On reconnaît deux types de fixation :
la fixation par la chaleur
la fixation chimique
13
LA FIXATION PAR LA CHALEUR
Il s’agit de chauffer doucement un film bactérien séché à l’air. Ce procédé permet de conserver correctement la
morphologie générale, mais pas les structures intracellulaires.
14
LA FIXATION CHIMIQUE
On utilise ce procédé pour protéger les structures cellulaires fines et la morphologie de microorganismes plus
grands et plus délicats.
Ces fixateurs pénètrent dans les cellules et réagissent avec les composantes cellulaires, le plus souvent des
protéines et des lipides afin de les rendre inactifs, insolubles et immobiles.
15
Les mélanges de fixateurs utilisés le plus souvent sont?
Fixateurs chimiques?
le méthanol
l’éthanol
l’acide acétique
le chlorure mercurique
le formaldéhyde
le glutaraldéhyde.
16
Ne sont pas des colorations différentielles.
Les colorations de spores, de flagelles, la coloration pour la mise en évidence des capsules.
17
La coloration à l’encre de Chine est?
Une coloration négative des bactéries puisque ce n’est pas la bactérie qui est colorée, mais les éléments qui
l’entourent.
18
LA COLORATION DE GRAM
Les techniques de coloration différentielle divisent les bactéries en groupes distincts basés sur les propriétés de
coloration. La coloration de Gram a été mise au point par Hans Christian Gram, il y a un peu plus de 100 ans.
19
UTILITÉ DE LA COLORATION DE GRAM
Permet aussi de sélectionner les milieux de culture appropriés pour la croissance et l’identification de la bactérie
soupçonnée. Elle est donc une coloration de routine. Fournir une identification provisoire des micro-organismes
contenus dans un échantillon en déterminant:
acides teichoïques
polyosides
protéine M
acide poly glutamique
24
Gram négatif
Portion élevée de lipides (11 à 22%)
Trois couches de composition chimique différente:
N.B.: Essuyer l'huile sur l'objectif entre chaque lame afin d'éviter le transfert de bactérie alcoolo acido-résistante
d'une lame à l'autre.
33
KINYOUN MODIFIÉ
Principe
Les Nocardia, Rhodococcus et certains Actinomyces possèdent de l'acide mucolique intermédiaire dans leur paroi
cellulaire.
La coloration de Kinyoun modifiée met en évidence une acido-résistance plus ou moins complète de ces germes.
Cette acido-résistance s'accroît en cultivant ces germes dans des milieux riches en lipides (ex.: Lowenstein, lait).
34
ÉTAPE KINYOUN MODIFIÉ
Eau courante 1000X
Fixer la lame à la chaleur
1. Kinyoun carbolfuschine ne pas chauffer (5min)
2. Éthanol 50%
3. Acide sulfurique 1% (1-2min)
4. Contre color bleu méthylène (1min)
35
COLORATION DE SPORES
3 méthodes pour la coloration des spores?
Méthode de Schaeffer-Fulton (vert de malachite et fuchsine)
Méthode de Dorner (fuchsine et nigrosine)
Méthode de Wirtz-Conklin
36
COLORATION DE WIRTZ-CONKLIN
Principe
L’enveloppe des endospores des bactéries est imperméable à la plupart des colorants usuels. Ce phénomène est dû
à leur composition chimique. Les bactéries sporulantes colorées au Gram, montreront un espace clair non coloré à
la place de l’endospore. Les techniques de coloration des spores ont toutes le même principe qui est de favoriser
par chauffage, l’entrée des colorants à travers l’enveloppe de la spore. Le refroidissement de la membrane
empêche le colorant de s'échapper de la spore. Le reste de la bactérie est ensuite contre colorée.
37
ÉTAPE COLORATION DE WIRTZ-CONKLIN
Eau courante
Résultats : Bacilles : rouges
Spores : vertes
1. Vert de malachite à 5% (3-6min ou 30min sans chauffage)
2. 0.5% safranine (30sec)
38
COLORATION DE FLAGELLES
Principe
Méthode de Leifson
Méthode de Rhode
Attention préparation du solution de colorant, ne pas prendre solution
réfrigérer avec précipité. Ne pas re-mélanger
Les flagelles ne peuvent être mis en évidence de façon précise à l’état frais ou par toute autre technique de
coloration habituelle. La coloration de flagelle permet une imprégnation par l’acide tannique laissant voir les
flagelles après être colorées à l’acide tannique. C'est une coloration qui demande beaucoup de minutie.
Pour le Cryptococcus neoformans, il s’agit d’un critère d’identification important. La coloration à l’encre
de Chine d’un spécimen de liquide céphalo-rachidien permet d’identifier avec confiance le Cryptococcus
neoformans chez un patient immunodéprimé.
41
COLORATION MAY-GRÜNWALD-GIEMSA
(FROTTIS SANGUINS, PARASITES)
PRINCIPE
Triton X-100
En hématologie pour l'identification des cellules sanguines. C'est aussi la coloration la plus sûre pour identifier les
parasites sanguins, en particulier pour les frottis minces. Il est très important que le pH de la solution colorante se
situe entre 7,0 et 7,2; qu'un contrôle de qualité soit utilisé pour la coloration. La coloration de Giemsa est une
coloration oxydative. L'oxygène contenu dans l'eau initie la réaction et par conséquent, après une journée, notre
solution de coloration doit être changée.
42
POUR LES GRANULATIONS MÉTACHROMATIQUES OU
CORPS DE BABES DE CERTAINES ESPÈCES DE
CORYNEBACTERIUM
3 Colorations?
COLORATION D’ERNST-NEISSER
COLORATION D’ALBERT
COLORATION DE LOEFFLER
43
ÉTAPË COLORATION D’ERNST-NEISSER
Les granulations forment une combinaison stable avec le bleu acétique
sous l’effet de la chaleur.
1. Fixer la lame à la chaleur
2. Recouvrir la lame de bleu acétique 10 minutes
3. Laver à l’eau courante
4. Recouvrir de vésuvine 1 minute
5. Laver à l’eau, sécher et observer à l’immersion
Les bacilles apparaissent en brun pâle, les granulations métachromatiques se détachent en bleu foncé.
44
ÉTAPE COLORATION D’ALBERT
Les granulations métachromatiques du Corynebacterium diphteriae
sont colorées facilement par le bleu de méthylène et apparaissent en
bleu foncé.
1.Recouvrir la lame de la Solution 1 pour 5 minutes
2.Égoutter la lame sans la rincer
3.Recouvrir la lame de la Solution2 pour 1 minute
4.Rincer à l'eau courante, sécher+observer à l’immersion
Note : Certaines bactéries comme les Actinomycetes, certaines espèces de streptocoques et d’autres bactéries
peuvent morphologiquement ressembler aux Corynebacteries et doivent être différenciées par des cultures et des
tests biochimiques.
46
ORANGE D’ACRIDINE
Cette méthode de coloration est principalement utilisée aux
hémocultures lorsque l’appareil nous signale une bouteille positive et
que le Gram ne démontre aucune bactérie. Il s’agit d’une coloration
fluorescente qui pourrait aussi être utilisée pour observer des
Trichomonas vaginalis.
1.Laisser sécher la lame à l’air
2.Placer la lame sur un support à coloration
3.Fixer la lame au méthanol 50-100% (1-2min)
4.Laisser sécher la lame à l’air après vous être débarrassé de l’excédent de fixatif
5.Ajouter l’orange d’acridine sur la lame 2 minutes
6.Rincer à l’eau courante et permettre de sécher avant d’observer
7.le spécimen au microscope à fluorescence.
47
CALCOFLUOR
(cherche la présence des hyphes/long chemin)
En mycologie pour l'observation directe des spécimens clinique. Il s'agit d'une coloration non spécifique au
fluorochrome, pour la détection rapide des éléments fongiques. Les éléments fongiques apparaîtront vert pomme
brillant fluorescent. Les débris ou le tissu peut apparaître jaune vert brillant. La morphologie des cellules
tissulaires et des éléments fongiques vont aider à les distinguer les uns des autres.
48
CALCOFLUOR
(cherche la présence des hyphes/long chemin)
Contrôle positif: Suspension de Candida albicans dans une goutte d'eau distillée +une goutte de calcofluor white
Contrôle négatif:goutte de (KOH 10% + calcofluor white)
Présence ou absence d'hyphes (MCFP, MCFN)
49
FUNGI-FLUOR
Cherche des hyphes et levures de champignon. Rare positif.
RT Normalement infection pulmonaire
En mycologie pour l'observation directe des spécimens clinique provenant du système respiratoire. Les chaines
polysaccharides B présentes dans la cellulose et la chitine retrouvée dans les parois de la cellule fongique sont
colorés par le colorant fluorescent et fungi-fluor. Lorsqu’examinés au microscope à fluorescence, les éléments
fongiques seront.
50
ÉTAPE FUNGI-FLUOR
1.Laisser sécher les lames à l'air
2.fixer la lame avec du méthanol absolu pendant 5 minutes, ou jusqu'à évaporation complète du méthanol
3.ajouter une goutte de Fungi-Fluor, attendre une minute
4.rincer délicatement avec de l'eau distillée
5.mettre le contre-colorant solution B
6.rincer délicatement à l'eau
7.mettre une lamelle sur la lame mouillée et examiner au microscope à fluorescence avec le filtre "G". S'il y a un
délai entre le montage de la lame et la lecture de celle-ci, ajouter de l'eau sous la lamelle avant de lire la lame.
8. Utiliser l'objectif 20x ou 40x.
Résultat: Le matériel fongique apparaitra comme une coloration périphérique avec une morphologie
caractéristique