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m-PIMA™ HIV-1/2 DETECT

GUIDE DE LA CARTOUCHE

FR 0123
TABLE DES MATIÈRES
4 INTRODUCTION
4 Utilisation prévue
4 Indications
4 Utilisateur prévu
5 Informations pour la commande et pour la livraison
5 Matériel nécessaire non fourni
5 Articles optionnels
5 PRINCIPE DU TEST
5 Manipulation et traitement des échantillons
6 Extraction de l’ARN
6 Transcription inverse et amplification
7 Détection
8 CARACTÉRISTIQUES DE LA CARTOUCHE m-PIMA™ HIV-1/2 DETECT
8 Composantes de la cartouche
9 Caractéristiques du contrôle de qualité (CQ)
10 Réactifs
11 AVERTISSEMENTS ET MISES EN GARDE
14 PROCÉDURE DE TEST m-PIMA™ HIV-1/2 DETECT
14 Flux de travail de base
15 Comment jeter les cartouches de test usagées
16 Prélèvement d’un échantillon par piqûre au doigt
17 Prélèvement d’un échantillon par piqûre au talon
20 Prélèvement d’un échantillon de sang total veineux
20 Application de l’échantillon au moyen des capillaires de transfert
21 Rapport de test
23 LIMITES
23 Interprétation des résultats
23 Variants génétiques/ mutations
24 Effet de matrice
24 Stabilité des échantillons
24 Tests multiplexes
25 CARACTÉRISTIQUES DE PERFORMANCE
26 Sensibilité du diagnostic dans des échantillons frais et congelés de plasma et de sang total VIH-1
27 Sensibilité du diagnostic dans les échantillons de VIH-2
27 Sensibilité du diagnostic et spécificité dans les échantillons néonataux
27 Sensibilité du diagnostic dans les panels de séroconversion
28 Spécificité du diagnostic dans des échantillons congelés de sang total et de plasma
29 Sensibilité analytique/ limite de détection
31 Spécificité analytique
35 Test des génotypes/sous-types
35 Effets de matrice
38 Dosage multiplexe
38 Effet de report
39 Précision
39 SUPPORT TECHNIQUE
39 RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
42 EXPLICATION DES SYMBOLES
GUIDE DE LA CARTOUCHE 3
INTRODUCTION
Les tests virologiques utilisant des dosages de dépistage spécifique d’ADN ou d’ARN du VIH
jouent déjà un rôle important dans le diagnostic des infections par VIH chez les nouveau-
nés. (1) L’identification précoce d’une infection par le VIH chez des nourrissons exposés et
la prescription d’un traitement antirétroviral permettent d’améliorer le pronostic. Les tests
virologiques peuvent aussi jouer un rôle dans la confirmation d’une infection par VIH chez
des adultes qui ont été testés positifs avec d’autres méthodes (par ex. des tests antigène/
anticorps anti-VIH). Actuellement, les tests virologiques du VIH sont excessivement chers
et complexes étant donné qu’ils requièrent des techniciens compétents et un entretien
régulier de l’équipement. Le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect permet d’effectuer pour la
première fois des tests virologiques au point de soins par du personnel de santé non-
laboratoire en milieu de soins de santé primaires.(2) En dehors du type d’échantillon
classique, à savoir le plasma, la cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect est capable de traiter
le sang total, ne nécessitant que de faibles volumes (25 µL) qu’il est facile d’obtenir par
des techniques d’échantillonnage par piqûre du doigt ou du talon (chez les nouveau-nés).
Le fait d’utiliser du sang total au lieu du plasma présente aussi l’avantage de profiter du
fait que les particules du VIH adhèrent à divers types de cellules sanguines comme les
plaquettes (3-6) et les monocytes (7), mais aussi les lymphocytes T CD4-/CD8-, probablement
issus de lymphocytes T CD4+ infectés.(8) Il a aussi été démontré que l’ARN et des antigènes
du VIH étaient associés à des érythrocytes.(9-11) En outre, de l’ARN viral intracellulaire
est produit dans les lymphocytes infectés qui circulent dans le sang périphérique.(12-20)
En utilisant le sang total, les particules virales associées aux cellules sont incluses dans
l’analyse, augmentant la probabilité de détecter une infection par le VIH.(21)

Utilisation prévue
Le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect est un test qualitatif d’amplification des acides nucléiques
pour le dépistage de l‘ARN du virus de l’immunodéficience humaine (VIH) de type 1,
groupes M/N et O et de type 2 dans des échantillons de sang total et de plasma humains.
Le test peut être utilisé dans les environnements de laboratoire comme hors laboratoire.
Le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect est destiné au diagnostic in vitro. Il ne doit pas servir de
test de dépistage de donneurs pour le VIH.
Indications
Le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect peut être utilisé pour aider au diagnostic d’une infection
par VIH chez les adultes et les enfants ou en tant que dosage supplémentaire lorsque des
échantillons ont déjà été analysés avec d’autres méthodes (p. ex., tests sérologiques de
recherche d’une preuve d’infection par le VIH).
Utilisateur prévu
Le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect est conçu pour être utilisé par des professionnels
de la santé ou de laboratoire ou d’autres personnels de santé ayant reçu la formation
appropriée. Le test convient pour les environnements de laboratoire comme hors
laboratoire et pour le diagnostic au chevet du patient.
4 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
Informations pour la commande et pour la livraison
Kit de 50 cartouches m-PIMA™ HIV-1/2 Detect (réf. 27011R050):
• 50 cartouches de test conditionnées individuellement
• 1 Guide de la cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect

Kit de 10 cartouches m-PIMA™ HIV-1/2 Detect (réf. 27011R010):


• 10 cartouches de test conditionnées individuellement
• 1 Guide de la cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect

Conserver les cartouches m-PIMA™ HIV-1/2 Detect à 4-30 °C. Voir page 13 pour plus
d’informations.

Matériel nécessaire non fourni


m-PIMA™ Analyser (réf. 27030R001) avec le logiciel m-PIMA™ version 0.38.0 ou une
version plus haute.

Articles optionnels
Finger Stick Sample Collection Kit (100) (réf. 260400199)
Neonatal Sample Collection Kit (100) (réf. 270400200)
Plastic Capillaries plain (réf. 270400005)

Avant de réaliser le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect, consulter ces instructions pour
prendre connaissance des informations détaillées sur la procédure de test.

PRINCIPE DU TEST
Manipulation et traitement des échantillons
Un échantillon de sang peut être prélevé à l’aide de techniques d’échantillonnage de piqûre
du doigt ou du talon ou un prélèvement de sang veineux (effectué comme décrit aux pages
16-20). Le volume d’échantillon nécessaire pour faire un test est de 25 µL.
Le sang prélevé par piqûre au doigt ou au talon peut être directement et immédiatement
appliqué à la cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Si du sang veineux prélevé sur EDTA ou du
plasma est utilisé, le volume adéquat est transféré vers la cartouche à l’aide d’une pipette
volumétrique ou d’un capillaire de transfert (voir page 12 pour les anticoagulants autorisés).
Il convient d’appliquer les pratiques standard de prélèvement d’échantillons par phlébotomie
pour l’obtention des échantillons de sang capillaire ou veineux.
Après avoir appliqué l’échantillon, le capuchon de la cartouche est remis en place pour
éliminer tout risque d’écoulement de l’échantillon ou de contamination de l’instrument.
Après fermeture du capuchon, la cartouche est insérée dans le m-PIMA™ Analyser et le
test est automatiquement lancé. Les étapes décrites dans les paragraphes suivants sont
automatiquement effectuées par le m-PIMA™ Analyser au sein de la cartouche.
GUIDE DE LA CARTOUCHE 5
Extraction de l’ARN
L’extraction de l’ARN comprend les étapes suivantes:
a L yse complète de l’échantillon au moyen de sels chaotropiques afin de libérer tous
les acides nucléiques, notamment l’ARN du VIH associé aux cellules et l’ARN des VIH
plasmatiques.
b H
 ybridation des oligonucléotides complémentaires aux séquences spécifiques
du génome du VIH-1 et du VIH-2. Ces oligonucléotides de capture spécifiques
comportent un résidu de biotine en position 3’ terminale.
c T ous les oligonucléotides de capture biotinylés sont capturés à la surface de particules
de streptavidine-sépharose: de ce fait tout l’ARN du VIH lié à un oligonucléotide est
aussi capturé sur la sépharose.
d L avage des particules de streptavidine-sépharose afin d’éliminer tous les contaminants
qui se lient de manière non spécifique aux particules, comme les acides nucléiques
humains, les protéines cellulaires et extracellulaires, les fragments de membrane
cellulaire et les molécules de faible poids moléculaire.
Après le lavage, les molécules restantes d’ARN du VIH sont prêtes pour subir une
transcription inverse (TI), suivie d’une réaction en chaîne par polymérase (PCR).

Transcription inverse et amplification


L’ARN capturé à la surface des particules de streptavidine-sépharose ne peut pas
être détecté directement. Il est donc nécessaire de procéder à une amplification des
séquences d’acides nucléiques spécifiques du VIH. Cette opération est réalisée par la PCR
qui permet une amplification in vitro des séquences d’ADN.
Étant donné que la plupart des ADN polymérases ne synthétisent pas l’ADN
directement à partir de l’ARN, une étape de transcription inverse de l’ARN en ADNc
est indispensable. La transcription inverse est une réaction isotherme qui est effectuée
à une température donnée. Les mêmes amorces utilisées pour la TI seront utilisées
ultérieurement lors de l’étape d’amplification par PCR. Les amorces d’ADN s’hybrident
avec leur séquence complémentaire sur l’ARN pour former un hybride d’ADN-ARN.
La transcriptase inverse transcrit alors l’ARN vers son ADN complémentaire par une
extension de l’amorce oligonucléotidique. La transcription inverse est suivie d’une étape
de dénaturation à une température donnée afin de:
• désactiver la transcriptase inverse;
• activer l’ADN polymérase; et
• séparer l’hybride ARN-ADN et rendre l’ADNc accessible pour une liaison à
l’amorce oligonucléotidique et permettre l’extension cyclique de l’amorce par PCR.

6 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


Les amorces sont des oligonucléotides courts et spécifiques qui s’hybrident facilement avec
leurs séquences complémentaires à une température d’hybridation adéquate et constituent
le point de départ pour l’extension par une ADN polymérase thermostable.
L’hybridation des amorces et l’amplification de l’ADN (élongation) par l’ADN polymérase
se déroulent à des températures données. Les trois étapes (dénaturation, hybridation
et élongation) décrivent un cycle de PCR qui est répété 45 fois. Une PCR multiplexe est
réalisée pour faciliter la détection simultanée de plusieurs séquences d’acides nucléiques
spécifiques. L’amplification ciblée des groupes M/N et O du VIH-1 et du VIH-2 est facilitée par
des paires d’amorces spécifiques. Pour le groupe M du VIH-1, deux réactions d’amplification
indépendantes ciblent la région gag en amont ou la région pol du génome viral (double cible).
Les paires d’amorces permettent aussi l’amplification des contrôles internes.

Détection
La détection du produit de PCR est fondée sur la technologie Competitive Reporter Monitored
Amplification qui utilise un réseau de sondes oligonucléotidiques immobilisées sur une puce
à ADN et des oligonucléotides rapporteurs fluorescent complémentaires en solution.(22)
Afin d’augmenter l’intensité initiale du signal, les rapporteurs utilisés dans cette réaction
comportent des marqueurs fluorescents aux extrémités 5’ et 3’. Dans des conditions adaptées,
le rapporteur s’hybride spécifiquement avec les sondes immobilisées. Les oligonucléotides
rapporteurs sont aussi complémentaires d’une séquence donnée d’un amplicon cible généré
pendant la PCR qui entre en compétition avec les sondes immobilisées pour la liaison avec
les oligonucléotides rapporteurs. Au début de la réaction d’amplification, aucune ou seules
quelques molécules cibles sont présentes, ce qui fait que le rapporteur peut se lier à sa sonde
complémentaire sur la puce à ADN. En présence de la matrice cible, d’autres amplicons cibles
dotés d’un site de liaison spécifique pour le rapporteur sont synthétisés tout au long de la
réaction d’amplification. Au fur et à mesure de l’accumulation des amplicons, la cinétique
d’hybridation devient plus dépendante de la concentration en amplicons. Plus le nombre
d’amplicons synthétisés augmente, plus les rapporteurs se lient à eux. De plus, le support
solide sur lequel la sonde oligonucléotidique est fixée introduit une barrière de diffusion qui
réduit sensiblement la vitesse d’hybridation. Ainsi, en général, les réactions dans la phase de
solution sont cinétiquement favorisées par rapport à celles ayant lieu dans la phase solide.(23)
Par conséquent, la quantité de rapporteurs hybridés à leur sonde complémentaire diminue
proportionnellement à la formation de nouveaux amplicons. Cette diminution est observée
jusqu’à ce que la réaction d’amplification atteigne un plateau. Il est possible de mesurer le
changement dans l’intensité du signal par imagerie du niveau de fluorescence sur la puce
à ADN pendant le processus d’amplification. Les images de la fluorescence sont recueillies
pendant la phase d’hybridation de chaque cycle d’amplification. Après avoir acquis le profil
d’hybridation, un algorithme est appliqué, capable d’identifier et d’éliminer les différents
signaux de bruit de fond des données obtenues par la PCR en temps réel sur la puce à ADN.
L’algorithme calcule alors les valeurs du cycle seuil à partir de la cinétique d’amplification
résultante déterminant la présence de l’analyte.
GUIDE DE LA CARTOUCHE 7
CARACTÉRISTIQUES DE LA CARTOUCHE
m-PIMA™ HIV-1/2 DETECT
Composantes de la cartouche
La cartouche de test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect est constituée d’une structure solide en plastique
noir, ainsi que d’un capuchon fixé remis en place après le prélèvement de l’échantillon.
Une fenêtre de contrôle permet à l’utilisateur de vérifier que le volume d’échantillon est
suffisant. La cartouche comporte aussi plusieurs compartiments internes contenant des réactifs
déshydratés et un réservoir de solution tampon intégré. Les compartiments de la cartouche sont
reliés au moyen d’un circuit microfluidique et le déplacement air/liquide au sein de la cartouche
est régulé par le m-PIMA™ Analyser au moyen de valves. La réaction de TI-PCR se déroule dans
la chambre réacteur de la cartouche. Tous les déchets liquides produits pendant le test sont
scellés à l’intérieur de la cartouche, qui est un système entièrement étanche après fermeture
du capuchon. Une pression pneumatique est appliquée au travers d’une membrane et permet
de déplacer les liquides d’un compartiment à l’autre. La membrane est percée par une aiguille
raccordée au module pneumatique du m-PIMA™ Analyser. Plusieurs dispositifs de sécurité
intégrés empêchent la contamination des matrices (filtre, réservoir étanche pour les déchets).
Les risques relatifs à la contamination par les matrices de PCR des échantillons, de l’appareil,
de la cartouche ou de l’environnement sont limités étant donné que le test est conçu pour
capturer de l’ARN non épissé, alors que les amplicons générés dans le processus de test
représentent des cibles courtes en aval des sites de liaison de capture.

m-PIMA™ HIV-1/2 Detect

Capillaire Canal d’arrivée Chambre réacteur


d’échantillon d’air
Réservoir de Fenêtre de Capuchon de la
solution tampon contrôle cartouche
8 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
Caractéristiques du contrôle de qualité (CQ)
Code de la matrice de données (DMC)
Le DMC imprimé sur l’étiquette de la cartouche contient des informations spécifiques,
notamment l’identifiant de la cartouche et du lot, la date de péremption et le protocole de
dosage. Lors de l’insertion de la cartouche de test, le m-PIMA™ Analyser lit automatiquement
le DMC. Après la lecture réussie du DMC, le test est lancé. Si la cartouche est périmée, le DMC est
illisible ou le logiciel correspondant pour la réalisation du dosage n’est pas trouvé, un message
d’erreur est affiché par le m-PIMA™ Analyser et le test n’est pas lancé.
Contrôle de la détection de l’échantillon
Le volume de l’échantillon traité pendant un test est défini par les dimensions du capillaire
d’échantillon. La capacité nominale du capillaire est de 25 (± 2) µL. La cartouche de test
contient aussi une fenêtre de contrôle de l’échantillon qui permet à l’utilisateur de contrôler
le chargement de l’échantillon. Au début de chaque test, le m-PIMA™ Analyser vérifie que
l’échantillon a bien été chargé dans la cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect au moyen de la
fenêtre de contrôle de l’échantillon. Si le volume d’échantillon chargé dans la cartouche de
test est insuffisant, l’analyse n’est pas lancée et un message d’erreur est affiché. Afin que
la présence d’un échantillon incolore (par ex., du plasma) puisse être détectée, un colorant
est appliqué sur la surface interne du capillaire d’échantillon. Le colorant se mélange avec
l’échantillon dès la mise en contact, ce qui permet la détection de l’échantillon.
Contrôles des procédés de dosage
Chaque cartouche dispose de contrôles de procédés intégrés garantissant le fonctionnement
correct du dosage.
• Des contrôles internes des procédés pour le VIH-1 et le VIH-2 ont été déposés dans la
chambre de lyse de la cartouche. Ces contrôles sont effectués en même temps que
l’échantillon du patient est traité tout au long des étapes de dosage et permettent de détecter
d’éventuelles défaillances pouvant survenir lors de la lyse, l’extraction de l’ARN, la capture,
la PCR et la détection. Les séquences de ces contrôles positifs s’hybrident avec les mêmes
oligonucléotides de capture et amorces que les cibles correspondantes et seront distinguées
pendant la détection par des rapporteurs et des sondes spécifiques sur la puce à ADN.
• Le contrôle d’hybridation positif est fait de sondes dans le réseau qui sont
complémentaires de rapporteurs spécifiques dans la solution. Le contrôle d’hybridation
positif n’interfère pas avec les amorces de PCR dans le mélange de TI-PCR et doit donc
générer un signal valide au-dessus d’un seuil donné, mais ne doit donc pas produire de
valeur ct (il détecte si les conditions d’hybridation sont hors plage).
• Le contrôle d’hybridation négatif est constitué de sondes sur la puce à ADN qui ne sont
complémentaires d’aucun rapporteur. Le signal d’hybridation de ce contrôle doit être
inférieur à un seuil donné (il détecte une hybridation non spécifique).
Le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect tient aussi compte de plusieurs paramètres de CQ afin de
garantir un fonctionnement correct du m-PIMA™ Analyser et la cohérence des données
brutes pour l’analyse des données.
GUIDE DE LA CARTOUCHE 9
Réactifs
% (p/p)

Capillaire échantillon (revêtu de)


K3EDTA*2H2O 65 %
Brilliant Black
Agents de lyse (comprimé, intégré dans la cartouche)
Guanidin-HCl 89,7 %
N-Lauroylsarcosine 0,92 %
Na4EDTA*4H2O 1,23 %
Na2EDTA*2H2O
Antifoam BC 2527
Proteinase K Tablet (comprimé, intégré dans la cartouche)
Proteinase K
Oligonucléotides de capture/contrôles internes (sur un support solide intégré dans la cartouche)
Oligonucleotides marqués à la biotine
Tris-HCl
Na2EDTA*2H2O
Tris
MgCl2
NaCl
BSA, acetylated
ARN viral artificiel
TI-PCR réactif 1 (pastille, intégrée dans la cartouche)
anti-Taq-antibody
Taq polymerase
Transcriptase Inverse
Tris-HCl
dNTP (dATP, dCTP, dGTP, dTTP) mix

TI-PCR réactif 2 (pastille, intégrée dans la cartouche)


Oligonucleotides
Oligonucleotides marqués avec Cy5
Tris-HCl
Na2EDTA*2H2O
Streptavidine-Sépharose (particules solides, intégrées dans la cartouche)
Streptavidine-Sépharose

Agents de lavage (comprimé, intégré dans la cartouche)


Guanidin-HCl 93,3 %
Na4EDTA*4H2O 1,2 %
Na2EDTA*2H2O

Tampon A (liquide, scellé dans la cartouche)


NaN3 0,04 %
Guanidin-HCl 0,32 %
Na4EDTA * 4H2O 0,005 %
Na2EDTA * 2H2O
Triton X-100
Tween 20
KCl
Tris
MgCl2
Eau ultrapure

10 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


AVERTISSEMENTS ET MISES EN GARDE
Usage diagnostique in vitro
Pour usage diagnostique in vitro.
L e test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect n’est pas destiné à être utilisé comme test de
dépistage du VIH pour des donneurs.
L es cartouches m-PIMA™ HIV-1/2 Detect sont destinées à être utilisées exclusivement
avec l’instrument m-PIMA™ Analyser.
L ’utilisation de la cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect est destinée aux personnes
ayant été formées pour effectuer le dosage.
Les cartouches m-PIMA™ HIV-1/2 Detect sont exclusivement à usage unique.

Précautions de sécurité
S uivre les directives appropriées de lutte contre les risques infectieux pour la
manipulation de spécimens sanguins et éléments apparentés.
T oujours porter des gants non poudrés lors de la manipulation ou du prélèvement de
spécimens ou des cartouches de test et changer de gants après chaque prélèvement
d’échantillons et avant la manipulation d’une nouvelle cartouche (informations
détaillées aux pages 14 et 15).
NE PAS pipeter à la bouche.
 E PAS manger, boire, fumer, se maquiller ou manipuler des lentilles de contact dans
N
les zones où les échantillons sont manipulés.
E n cas de déversement d’échantillons, nettoyer et désinfecter en utilisant un
désinfectant comme de l’hypochlorite de sodium à 1,0 % ou un autre désinfectant
adapté.
 écontaminer et mettre au rebut tout matériel potentiellement infectieux
D
conformément aux règlementations locales, régionales et nationales en vigueur.
L a fiche de données de sécurité de ce produit est disponible sur demande auprès de
l’assistance technique.

GUIDE DE LA CARTOUCHE 11
Précautions de manipulation
 ‘utiliser les cartouches tests m-PIMA™ HIV-1/2 Detect qu’à température ambiante entre
N
10 et 40 °C et avec une humidité relative inférieure à 90 %.
 tiliser uniquement du sang total veineux prélevé sur EDTA, du plasma ou du sang total
U
capillaire (prélevé au bout du doigt ou au talon) avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect.
L’utilisation d’autres types d’échantillons n’a pas été évaluée et n’est PAS recommandée,
car elle peut entraîner des résultats imprécis ou non valides.
NE PAS utiliser des échantillons de sang coagulé, car ils peuvent conduire à un résultat
imprécis ou non valide.
L orsque des échantillons de sang prélevé par piqûre du talon sont utilisés, veiller à ce
que le site de prélèvement soit propre et non contaminé par le sang de la mère.
L es cartouches sont fournies avec le capuchon fixé à la cartouche.
NE PAS fermer le capuchon tant que la cartouche n’est pas entièrement remplie
d’échantillon pour éviter tout résultat non valide.
 E PAS tenter de rouvrir un capuchon fermé. Les capuchons abîmés peuvent
N
entraîner une mauvaise fermeture de la cartouche et un résultat non valide.
 E PAS toucher le film transparent recouvrant la chambre réacteur. Un film
N
endommagé ou souillé peut entraîner un résultat non valide.
 E PAS utiliser les cartouches endommagées, qui ont été mouillées ou dont
N
la pochette en aluminium est endommagée car l’intégrité du réactif peut être
compromise.

Contamination et inhibition
Les précautions suivantes doivent être prises afin de minimiser le risque de
contamination par RNase, de contamination croisée entre échantillons et d’inhibition:
T oujours porter des gants non poudrés lors de la manipulation ou du prélèvement de
spécimens ou des cartouches de test et changer de gants après chaque prélèvement
d’échantillons et avant la manipulation d’une nouvelle cartouche (informations
détaillées aux pages 14 et 15).
L orsqu’une pipette volumétrique est utilisée, toujours utiliser des cônes à filtre faisant
barrière aux aérosols pour éviter une contamination d’échantillon à échantillon. Si ce
type de cônes n’est pas disponible, utiliser des capillaires de transfert à usage unique.
NE JAMAIS réutiliser les cônes de pipette ni les capillaires de transfert.
L ors de la collecte, de la manipulation et de l’application des échantillons, il est
essentiel de respecter les bonnes pratiques de laboratoire afin de minimiser le risque
de contamination croisée entre les échantillons ainsi que l’introduction accidentelle
de ribonucléases (RNases) dans les échantillons.
12 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
 tiliser systématiquement une technique aseptique appropriée lors de la
U
manipulation d’ARN.
L es technologies d’amplification telles que la PCR sont sensibles à une introduction
accidentelle de produits issus de réactions d’amplifications antérieures.
L es résultats peuvent être incorrects si l’échantillon clinique ou le capillaire
d’échantillon de la cartouche sont contaminés par l’introduction accidentelle de
quelques molécules seulement de produit d’amplification.

Instructions de stockage
S tocker les cartouches à température ambiante (4 - 30 °C). La température extérieure
peut être en dehors de cette plage pour une durée limitée (à savoir jusqu’à 48 heures
à 2 °C et jusqu’à 72 heures à 40 °C). Une fois retiré de leur pochette de protection,
les cartouches sont stables jusqu‘à 10 minutes à 40 °C sous 90 % d‘humidité relative.
NE PAS congeler les cartouches de test.

Signes d’instabilité ou de dégradation


 ne valeur de contrôle positif ou négatif en dehors de la plage attendue peut indiquer
U
une détérioration des réactifs du test. Les résultats du test obtenus sont alors non
valides et les échantillons doivent être de nouveau testés.

GUIDE DE LA CARTOUCHE 13
PROCÉDURE DE TEST m-PIMA™ HIV-1/2 DETECT
Flux de travail de base
1.  ettre le m-PIMA™ Analyser sous tension et attendre que l’initialisation soit terminée.
M
L’affichage de l’écran «ACCUEIL» indique que l’analyseur est prêt à l’emploi.
2. Toujours porter une paire de gants neufs pour chaque cartouche!
Sortir une cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect de sa pochette et ouvrir complètement
le capuchon afin d’exposer le tube capillaire échantillon. Ouvrir la pochette en
aluminium uniquement au moment d’inoculer la cartouche avec l’échantillon.
3. Appliquer l’échantillon à la cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. La quantité
d’échantillon est suffisante lorsque la fenêtre de contrôle de l’échantillon est remplie
de sang.
4. Après avoir inoculer la cartouche, fermer celle-ci en bouchant le capillaire à l’aide du
capuchon de la cartouche, comme indiqué sur les images 11 à 14/ page 19.
Avant d’insérer la cartouche dans l’appareil, vérifier que le capuchon est bien fixé en place.
5. Les cartouches remplies doivent être traitées immédiatement après inoculation de
l’échantillon.
6. Appuyer sur «LANCER UN TEST» sur le m-PIMA™ Analyser et insérer la cartouche
de test dans le sens indiqué par la flèche sur l’étiquette de la cartouche. Suivre les
instructions affichées à l’écran ou consulter le guide de l’utilisateur du m-PIMA™
Analyser pour la réalisation de l’analyse.
7. Retirer la cartouche lorsque m-PIMA™ Analyser le demande (étape 1).
Toujours porter des gants lors du retrait d’une cartouche de l’instrument!
Le résultat du test s’affiche sur l’écran de l’appareil.
8. Pour mettre au rebus les cartouches de test utilisées, les sceller de préférence dans
les gants (l’exemple suivant s’applique aux utilisateurs droitiers):

• Tenir la cartouche de test dans la main gauche. Avec la main droite, pincer le
gant au niveau du poignet de la main gauche et le retirer tout en maintenant la
cartouche de manière à l’insérer dans le gant (étapes 2 et 3). Tenir le gant avec
la cartouche scellée à l’intérieur à l’aide du poing droit.
• Insérer un ou deux doigts de la main gauche sous le gant de la main droite côté
paume; pousser le gant de manière à le retirer emprisonnant ainsi à l’intérieur
le gant de la main gauche contenant la cartouche (étape 4).
• Saisir les gants, qui sont maintenant ensemble et à l’envers emprisonnant la
cartouche, avec la main gauche et les retirer de la main droite (étape 5).
• Les jeter avec les déchets contaminés (étape 6).

14 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


Comment jeter les cartouches de test usagées
(Une description détaillée est fournie à la page précédente.)

1 2

3 4

m-PIMA

5 6

GUIDE DE LA CARTOUCHE 15
Prélèvement d’un échantillon par piqûre au doigt (26)
1. Toujours porter une paire de gants neufs pour chaque patient!
Préparer le patient pour le prélèvement d’un échantillon par piqûre au doigt.
Les doigts les plus indiqués pour une piqûre sont le majeur et l’annulaire. Ne pas
utiliser l’extrémité ni le milieu de la pulpe du doigt. Éviter le côté du doigt où les
tissus mous sont moins épais, où se trouvent les vaisseaux et les nerfs et où l’os est
plus près de la surface. La peau de l’index a tendance à être plus épaisse et calleuse.
L’auriculaire a tendance à présenter moins de tissus mous autour de l’os. Éviter de
ponctionner un doigt qui est froid, cyanosé, gonflé, qui comporte des cicatrices ou
présente une éruption cutanée. Éviter les doigts portant des bagues.
2. Réchauffer les doigts, si besoin. Demander au patient de placer la main vers le bas
pour augmenter l’afflux de sang dans le doigt.
Remarque: le patient doit toujours s’asseoir dans une position plus élevée que la
personne faisant la piqûre du doigt.
3. Essuyer l’extrémité du doigt sélectionné avec un tampon alcoolisé et laisser l’alcool
sécher à l’air.
4. Si la cartouche est directement remplie à partir du doigt piqué, passer à l’étape 5.
Si un capillaire de transfert est utilisé, consulter la section relative à l’application de
l’échantillon via un capillaire de transfert (page 20).
5. Sortir une cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect de sa pochette en aluminium et
ouvrir le capuchon de manière à entièrement exposer le capillaire d’échantillon.
6. Utiliser une lancette stérile pour perforer la peau à proximité du centre de la pulpe
du doigt. Il est indispensable d’obtenir un écoulement constant de l’échantillon
sanguin pour obtenir un échantillon représentatif. Si une lancette automatisée est
utilisée, il est important d’appuyer fermement sur le doigt avec la lancette et de
maintenir le contact lors de l’éjection de la lancette. Ne pas appuyer ou appliquer
une pression répétitive élevée (traite) sur le site, au risque de provoquer une
contamination de l’échantillon par du liquide interstitiel périphérique. Au besoin,
masser doucement le doigt pour assurer un écoulement constant de sang.
7. Essuyer les premières gouttes de sang à l’aide d’un tampon de gaze sec. Assurer un
écoulement de sang constant générant un nombre suffisant de gouttes de sang.
Si nécessaire, essuyer une autre goutte jusqu’à ce que le sang s’écoule librement.
8. Laisser le sang s’écouler librement depuis le doigt ponctionné jusqu’au capillaire
d’échantillon en tenant la cartouche à un angle de 45° pour la mise en place de
l’échantillon. Attendre que le capillaire d’échantillon soit entièrement rempli de sang.
La quantité d’échantillon est suffisante lorsque la fenêtre de contrôle de l’échantillon
est remplie de sang. Retirer ensuite la cartouche du doigt et laisser le patient
appliquer une pression directe sur la plaie avec un tampon de gaze sec.
9. Passer à l’étape 5 de la description du flux de travail de base (page 14).
10. Appliquer un pansement sur le doigt du patient.
16 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
Prélèvement d’un échantillon par piqûre au talon (24, 25)
Chez un patient pédiatrique, le choix du site d’échantillonnage capillaire est généralement
fonction de l’âge et du poids du patient. Si l’enfant marche, ses pieds risquent de
comporter des callosités qui empêcheront l´ écoulement adéquat du sang. Pour les enfants
de plus de 6 mois et de plus de 10 kg, il peut être préférable de réaliser une piqûre au doigt
pour le prélèvement de l’échantillon.
Consulter les procédures opérationnelles standard de l’établissement relatives à ce point.
1. Il est recommandé de réconforter le nourrisson. Demander de l’aide aux parents.
Veiller à ce que le nourrisson soit pelotonné et dans une position sûre pour le
prélèvement de l’échantillon.
2. S’assurer que le nourrisson est bien au chaud et confortable. Il n’est pas nécessaire de
réchauffer le pied.
3. Toujours porter une paire de gants neufs pour chaque patient! Nettoyer le site de piqûre
sur le talon. Celui-ci doit être entièrement sec avant le prélèvement de l’échantillon.
4. Si la cartouche est directement remplie à partir du talon piqué, passer à l’étape 5.
Si un capillaire de transfert est utilisé, consulter la section relative à l’application de
l’échantillon via un capillaire de transfert (page 20).
5. Sortir une cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect de sa pochette en aluminium et ouvrir le
capuchon de manière à entièrement exposer le capillaire d’échantillon.
6. Utiliser une lancette stérile adaptée aux nouveau-nés pour perforer la peau.
Les bords externes et internes du calcaneum sont les sites de piqûre préférés (régions
hachurées dans l’image 3/ page 18). Il est indispensable d’obtenir un écoulement
constant de l’échantillon sanguin pour obtenir un échantillon représentatif. Si une
lancette automatisée est utilisée, il est important d’appuyer fermement sur le talon
avec la lancette et de maintenir le contact lors de l’éjection de la lancette. Ne pas
appuyer ou appliquer une pression répétitive élevée (traite) sur le site, au risque de
provoquer une contamination de l´échantillon par du liquide interstitiel périphérique.
Au besoin, masser doucement le talon pour assurer un écoulement constant de sang.
7. Essuyer les premières gouttes de sang à l’aide d’un tampon de gaze sec. Assurer un
écoulement de sang constant générant un nombre suffisant de gouttes de sang.
Si nécessaire, essuyer une autre goutte jusqu’à ce que le sang s’écoule librement.
8. Laisser le sang s’écouler librement depuis le doigt ponctionné jusqu’au capillaire
d’échantillon en tenant la cartouche à un angle de 45° pour la mise en place de
l’échantillon. Attendre que le capillaire d’échantillon soit entièrement rempli de sang.
La quantité d’échantillon est suffisante lorsque la fenêtre de contrôle de l’échantillon est
remplie de sang. Retirer ensuite la cartouche du doigt et laisser le patient appliquer une
pression directe sur la plaie avec un tampon de gaze sec.
9. Passer à l’étape 5 de la description du flux de travail de base (page 14).
10. Appliquer un pansement sur le talon du nourrisson.

GUIDE DE LA CARTOUCHE 17
1 2

3 4

m-PIMA
LOT
REF

5 6

7 8

18 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


9 10

11 12

HIV-1/2 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect

m-PIMA™ HIV

13 14

15 16

GUIDE DE LA CARTOUCHE 19
Prélèvement d’un échantillon de sang total veineux (27)
1. Toujours porter une paire de gants neufs pour chaque patient ou chaque échantillon
manipulé! Prélever le sang de manière aseptique par ponction veineuse vers un tube
de prélèvement sanguin EDTA (acide éthylènediaminetétracétique) stérile.
2. Retourner le tube de prélèvement 8 à 10 fois.
3. Conserver à température ambiante (18 à 28 °C). L’échantillon doit être analysé dans
les 24 heures qui suivent le prélèvement. Si les échantillons doivent être conservés
pendant des périodes plus longues, consulter la section „Stabilité des échantillons“
(page 24) pour des informations détaillées.
4. Avant de prendre un échantillon pour le tester, retourner le tube de prélèvement
10 à 15 fois pour que l’échantillon soit correctement mélangé.
5. S’il est nécessaire de faire un test sur du plasma, les tubes de prélèvement doivent
être centrifugés de 800 à 1600 x g pendant 20 minutes à température ambiante.
6. Si la cartouche est directement remplie à partir d’une pipette volumétrique, passer
à l’étape 7. Si un capillaire de transfert est utilisé, consulter la section relative à
l’application de l’échantillon via un capillaire de transfert (voir ci-dessous).
7. Lorsqu’une pipette volumétrique est utilisée, toujours utiliser des cônes à filtre
faisant barrière aux aérosols pour éviter une contamination d’échantillon à
échantillon. En cas de non-disponibilité de ce type de cônes de pipette, utiliser des
capillaires de transfert à usage unique. NE JAMAIS réutiliser les pointes de pipettes.
8. Appliquer 25 µL dans le capillaire d’échantillon de la cartouche m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
et passer à l’étape 4 de la description du flux de travail de base (page 14).

Application de l’échantillon au moyen des capillaires de transfert


Il est possible d’utiliser des capillaires de transfert pour appliquer tous les types
d’échantillons compatibles avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Si les échantillons
contiennent de l’EDTA, utiliser des capillaires sans anticoagulant supplémentaire
(voir page 5 pour plus d’informations).
Pour le sang prélevé directement à partir d’une piqûre au doigt ou au talon, toujours
utiliser des capillaires contenant de l’EDTA. Toujours utiliser un nouveau capillaire
de transfert pour chaque patient!

1. Lorsque du sang total est prélevé directement à partir d’une piqûre au talon ou au
doigt, placer une extrémité du capillaire avec EDTA en contact avec la goutte de
sang. Tenir le capillaire quasiment à l’horizontale. Lorsque du sang total veineux/
plasma est prélevé, insérer un capillaire ordinaire dans le tube de prélèvement et les
maintenir tous les deux quasiment à l’horizontale, sans déverser l’échantillon.
2. Laisser le capillaire se remplir environ à moitié sans piéger de bulles d’air.
3. Obturer l’extrémité opposée du capillaire de transfert avec le doigt pour éviter toute
fuite non souhaitée de l’échantillon.
20 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
4. Placer l’extrémité ouverte du capillaire de transfert au contact du capillaire
d’échantillon de la cartouche de test et maintenir le capillaire de transfert
quasiment à la verticale. Retirer le doigt de l’extrémité opposée. Le capillaire
d’échantillon aspirera automatiquement le sang du capillaire de transfert. Observer
la diminution du niveau de remplissage du capillaire de transfert. Cette diminution
s’arrêtera lorsqu’un volume de sang suffisant aura été transféré vers la cartouche.
5. Mettre le capillaire de transfert au rebut avec les matériels potentiellement
infectieux conformément aux règlementations locales, régionales et nationales en
vigueur et passer à l’étape 4 de la description du flux de travail de base (page 14).

Rapport de test
Les rapports de test sont enregistrés dans l’archive intégrée du m-PIMA™ Analyser.
Les rapports comprennent les informations suivantes:
Nom du test, l’identification de l’échantillon, résultats qualitatifs du test pour les
groupes M/N et O du VIH-1 et le VIH-2, le nombre de résultats, la date et l’heure du test,
l’identification de la cartouche (y compris les informations du lot), l’identification de
l’utilisateur, le numéro de série de l’appareil, la version du logiciel, l’instrument,
le procédé de dosage et les informations de CQ de l’analyse de données.
Les résultats des tests peuvent être exportés, transmis à un serveur distant au moyen de
modem Connectivity Packs ou imprimés au moyen de l’imprimante USB printer.
Ces éléments sont disponibles en tant qu’accessoires du m-PIMA™ Analyser.

Résultats des tests


Un résultat qualitatif (détecté/non détecté) est indiqué pour les analytes VIH-1 (groupes
M/N et O) et VIH-2.
Si un ou plusieurs analytes mesurés simultanément (VIH-1 M/N, VIH-1 O et VIH-2) affichent
un résultat «VIH détecté (positif)», l’ARN du VIH est alors détecté et l’échantillon est
VIH-positif.
Si le rapport de test indique un résultat «VIH non détecté» pour les trois analytes mesurés
simultanément (VIH-1 M/N, VIH-1 O et VIH-2), aucun ARN du VIH n’est détecté dans
l’échantillon (voir des exemples de rapports de test imprimés à la page 22).
Pour les codes d’erreur qui s’affichent, consulter le guide de l’utilisateur du m-PIMA™
Analyser (chapitre 9).

GUIDE DE LA CARTOUCHE 21
Rapport sur les résultats de test (exemples)
Rapport de test pour les résultats Relevé du rapport de test si aucun VIH
VIH positifs n’est détecté

Rapport du Test Rapport du Test

m-PIMA HIV-1/2 Detect m-PIMA HIV-1/2 Detect

ID Echantillon ID Echantillon
23-07-2019-ABC 2347-SRT-2019

VIH détecté VIH


(positif) non détecté
VIH-1 M/N détecté VIH-1 M/N Non détecté
VIH-1 O Non détecté VIH-1 O Non détecté
VIH-2 Non détecté VIH-2 Non détecté
N° Résultat 107 N° Résultat 34
Date/Heure 2019-07-23 15:50 Date / Heure 2019-08-12 11:50
ID Cartouche 0123456789 ID Cartouche 0123456554
Opérateur SAM MILLER Opérateur OP-23
N° de série NAT-04000935 N° de série NAT-040001098
Logiciel 0.26.3 Logiciel 0.26.3
CQ CQ
Détection échantillon Réussi Détection échantillon Réussi
Dispositif Réussi Dispositif Réussi
Contrôle positif VIH-1 Réussi Contrôle positif VIH-1 Réussi
Contrôle positif VIH-2 Réussi Contrôle positif VIH-2 Réussi
Contrôle négatif Réussi Contrôle positif VIH-2 Réussi
Analyse Réussi Analyse Réussi

Signature Signature

Remarque: les lignes de résumé des résultats de test indiquant „VIH détecté (positif)“ et
„VIH non détecté“ ont été introduites avec le logiciel m-PIMA™ Analyser version 0.26.3.
Les versions antérieures du logiciel affichent uniquement les résultats des tests d’analytes
individuels.

Paramètres de CQ
Détection de l’échantillon: contrôle de la présence d’un échantillon
Dispositif: plusieurs paramètres de CQ pour la fonctionnalité
du m-PIMA™ Analyser.
Contrôle positif du VIH-1: contrôle interne des procédés pour le VIH-1
Contrôle positif du VIH-2: contrôle interne des procédés pour le VIH-2
Contrôle négatif: contrôle d’une hybridation non spécifique
Analyse: plusieurs paramètres de CQ pour le processus d’analyse,
notamment le contrôle positif d’hybridation
22 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
LIMITES
Interprétation des résultats
Les spécimens „Non détecté“ pour l’ARN du VIH-1 ou VIH-2 par le test m-PIMA™
HIV-1/2 Detect n’indiquent pas nécessairement l’absence d’une infection par VIH
du patient correspondant. Comme pour tout test de diagnostic, les résultats du test
m-PIMA™ HIV-1/2 Detect doivent être interprétés conjointement avec d’autres résultats
de laboratoire ou cliniques. La détection de l’ARN du VIH-1 et VIH-2 dépend du nombre
de particules virales présentes dans le spécimen et peut être influencée par les méthodes
de prélèvement des spécimens et les caractéristiques du patient (par ex., âge, présence
de symptômes, stade de l’infection et de la charge virale).
Les patients recevant un traitement antirétroviral (TAR) ou un traitement préventif (p. ex.,
PrPE, PEP, etc.) peuvent avoir des niveaux indétectables de l‘ARN viral malgré la présence
d‘une infection par le VIH. m-PIMA™ HIV-1/2 Detect n‘est pas prévu pour la confirmation
d‘une infection à VIH chez les patients recevant un TAR ou un traitement préventif.

Variants génétiques/ mutations


Le dosage m-PIMA™ HIV-1/2 Detect cible les parties conservées de l’UTR 5’ (région non
traduite) dans le génome du VIH-1 et de la région LTR 5’ (longue répétition terminale)
dans le génome du VIH-2, respectivement.
La détection des analytes du groupe M du VIH-1 est basée sur deux réactions
d’amplification ciblant la région gag en amont (UTR 5’) et la région pol du génome viral
(double cible) alors que la détection du groupe N du VIH-1 et du groupe O du VIH-1 est
basée uniquement sur la région gag en amont (cible unique).
La combinaison de plusieurs amorces permet la détection de polymorphismes.
Bien que rares, des variants génétiques/mutations dus, par exemple, à des changements
basiques, des suppressions ou des insertions dans les régions génomiques ciblées par
le dosage m-PIMA™ HIV-1/2 Detect peuvent affecter les sites de liaison de la sonde et/
ou de l’amorce provoquant une diminution de l’efficacité de détection du dosage et/
ou l’augmentation du taux d’erreur.(28, 29) Ces effets sont à prendre en compte pour
interpréter les résultats du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Des résultats de test négatifs
peuvent nécessiter des tests supplémentaires utilisant des technologies aux cibles
génomiques différentes si des résultats de clinique et de laboratoire indiquent une
infection au VIH.
Des résultats faux positifs au test du groupe M/N du VIH-1 peuvent se produire si le
groupe O du VIH-1 est présent dans l’échantillon à une concentration de 100 000 cp/mL
ou supérieure.

GUIDE DE LA CARTOUCHE 23
Effet de matrice
En raison de l‘inclusion de l‘ARN du VIH liée aux cellules dans l‘analyse, le nombre de
particules virales par volume d’échantillon est plus élevé dans des échantillons de sang total
que dans des échantillons de plasma. Les échantillons de 186 patients de la cohorte B (voir
ci-dessous) avec une charge virale plasmatique correspondant entre 0 et 2491 cp/mL (Roche
COBAS® AmpliPrep/COBAS® TaqMan® HIV-1 version 2.0) ont été analysés.
Alors que la sensibilité diagnostique (intervalle de confiance à 95 %) avec Roche Cobas®
en utilisant 1 mL de plasma a été de 48,4 % [41,0 %, 55,8 %], les sensibilités avec le test
m-PIMA™ HIV-1/2 Detect en utilisant un volume de 25 µL d‘échantillon a été 51,4 % [43,8 %,
59,0 %] pour le sang capillaire, 56,6 % [49,1 %, 63,9 %] pour le sang veineux, mais seulement
2,7 % [0,9 %, 6,2 %] pour les échantillons de plasma correspondant, indiquant une perte de
sensibilité pour les échantillons de faible charge virale lors de l‘utilisation de plasma au lieu
de sang total.

Stabilité des échantillons


Le sang total veineux, prélevé dans des tubes EDTA, peut être conservé à température
ambiante (18 à 28 °C) pendant 24 heures maximum après le prélèvement, avant d’être testé
avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Si le test ne peut pas intervenir dans les 24 heures, les
échantillons doivent être aliquotés et congelés au moins à -80 °C, soit sous forme de sang
total, soit sous forme de plasma dans les 24 heures suivant le prélèvement. Les échantillons
congelés doivent être décongelés à température ambiante avant d´être testés. Il est
recommandé de retourner les tubes d’échantillons décongelés environ 10 à 15 fois avant le
pipetage.
Remarque: La conservation de l’échantillon à température ambiante pendant plus de
24 heures, à des températures supérieures à 28 °C ou plus d’un cycle de congélation/
décongélation peuvent nuire à la performance du test, en particulier pour les
échantillons dont la charge virale est < 4000 cp/mL.

Tests multiplexes
Les tests multiplexes se réfèrent à la présence simultanée du VIH-1 M/N, du VIH-1 O
et/ou VIH-2 dans un même échantillon patient. Si la différence dans la charge virale est
grande, la capacité à détecter l’analyte présent en plus petite concentration peut être
diminuée (consulter aussi la section “Dosage multiplexe”, page 38).

24 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


CARACTÉRISTIQUES DE PERFORMANCE
Les caractéristiques de performance du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect ont été définies par des
tests dans les locaux d’Abbott Rapid Diagnostics Jena GmbH à Jena, en Allemagne et sur des
sites externes au Mozambique, en Uganda, aux États-Unis et en Allemagne. Des échantillons de
plusieurs cohortes africaines et européennes ont été testés. En raison de la disponibilité limitée
d’échantillons contenant le groupe O du VIH-1 et le VIH-2, la plupart des échantillons inclus
dans ces études étaient positifs pour le groupe M/N du VIH-1 uniquement.

Cohorte A: Au total, 254 paires appariées d’échantillons congelés de plasma et sang
total veineux prélevé sur EDTA de donneurs positifs pour le VIH-1 naïfs de
tout traitement après séroconversion ont été prélevées sur les sites cliniques
en Allemagne et testées dans les locaux d’Abbott Rapid Diagnostics Jena
GmbH (anciennement Alere Technologies GmbH). Pour chaque échantillon de
plasma, les données de la charge virale du VIH-1 de Roche COBAS® AmpliPrep/
COBAS® TaqMan® HIV-1 version 2.0 étaient disponibles.
Cohorte B:  u sang total frais veineux et obtenu par piqûre au doigt de 200 donneurs
D
positifs pour le VIH-1 après séroconversion (91,5 % sous TAR) a été testé sur des
sites cliniques en Allemagne. Les échantillons de plasma correspondants ont
été testés dans les locaux d’Abbott Rapid Diagnostics Jena GmbH. Pour chaque
échantillon de plasma, les données de la charge virale du VIH-1 de Roche
COBAS® AmpliPrep/COBAS® TaqMan® HIV-1 version 2.0 étaient disponibles.
Cohorte C:  es échantillons frais de sang capillaire obtenu au bout du doigt, prélevés
D
sur 200 donneurs positifs au VIH-1 après séroconversion (73,5 % sous TAR)
et testés sur un site clinique en Uganda. Des échantillons de sang veineux
correspondant ont été testés à l‘Uganda Virus Research Institute.
Pour chaque échantillon de plasma les données de charge virale du VIH-1
effectuées sur Roche COBAS® AmpliPrep/COBAS® TaqMan® HIV-1 version 2.0
étaient disponibles.
Cohorte D: Des échantillons congelés de plasma EDTA de 101 donneurs positifs pour le VIH-2
après séroconversion (72 % sous TAR) ont été recueillis sur des sites cliniques
dans plusieurs pays d’Afrique et testés à l’Université de Washington (UW),
aux États-Unis. Pour chaque échantillon de plasma, les données de la charge
virale du VIH-2 d’un dosage défini dans un laboratoire de VIH-2, développées
à l’UW en utilisant la plateforme Abbott m2000, étaient disponibles.(30)
Cohorte E:  es échantillons frais de sang total prélevés par piqûre au talon de 223
D
enfants (âge médian 1 mois; plage: 1-11) nés de mères infectées par le
VIH ont été testés sur des sites cliniques au Mozambique. Pour chaque
échantillon de sang total, la positivité pour le VIH-1 a été déterminée au
moyen du test qualitatif de Roche COBAS® AmpliPrep/COBAS® TaqMan®
HIV-1 Qualitative test.
GUIDE DE LA CARTOUCHE 25
Cohorte F:  es échantillons de plasma veineux EDTA ont été obtenus à partir
D
d’individus lors de la période de séroconversion au VIH-1.
Dix panels disponibles dans le commerce incluant 128 échantillons de
séroconversion précoce ont été achetés auprès de Helvetica Health Care,
Genève, Suisse et testés dans les locaux d’Abbott Rapid Diagnostics Jena
GmbH. Pour chaque échantillon de plasma, la positivité pour le VIH-1 a été
déterminée au moyen du Abbott ARCHITECT® HIV Ag/Ab Combo.
Cohorte G:  u total, 1203 échantillons congelés de plasma et de sang total veineux
A
EDTA de donneurs européens présumés sains (disponibles dans le
commerce auprès de BBI Solutions, Cardiff, R.-U.) ont été testés dans les
locaux d’Abbott Rapid Diagnostics Jena GmbH. Les échantillons cliniques ont
été testés négatifs pour les anticorps anti-VIH-1/2, le TAN du VIH-1, le TAN
du VHB, l’antigène de surface de l’hépatite B, le TAN du VHC, les anticorps
contre le virus de l’hépatite C et la syphilis.
Cohorte H: Des échantillons frais de plasma et de sang total veineux EDTA de
donneurs européens présumés sains (disponibles dans le commerce auprès
de l’Institut für Transfusionsmedizin der Friedrich Schiller Universität
Jena, Allemagne) ont été testés négatifs pour les anticorps anti-VIH-1/2,
les anticorps anti-VHC, l’antigène de surface de l’hépatite B, les anticorps
contre la protéine centrale du virus de l’hépatite B, la syphilis, des anticorps
irréguliers, le TAN du VHC et le TAN du VIH-1 (Roche COBAS® AmpliPrep/
COBAS® TaqMan® HIV-1 version 2.0).

Sensibilité du diagnostic dans des échantillons frais et congelés de plasma


et de sang total VIH-1
La sensibilité du diagnostic d’un test est définie comme la proportion de patients présentant
un état clinique d’intérêt dont le résultat du test est positif et est exprimé sous forme de
proportion ou de pourcentage. La sensibilité du diagnostic a été définie en utilisant au total
295 échantillons de sang total veineux, 235 échantillons de plasma et 74 échantillons de
sang capillaire des cohortes A, B et C avec les charges virales plasmatiques correspondantes
supérieures à la limite du détection du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect (≥ 2491 cp/mL et
déterminées par Roche Cobas®).
La sensibilité du diagnostic observée [intervalles de confiance de 95 %] pour le test
m-PIMA™ HIV-1/2 Detect pour le VIH-1 dans les échantillons de sang total veineux, de
plasma et de sang total capillaire était de 98,98 % (292/295) [97,06 %, 99,79 %], 99,57 %
(234/235) [97,65 %, 99,99 %] et 98,65 % (73/74) [92,70 %, 99,97%], respectivement.
Aucun échantillon réagissant pour le VIH-2 n’a été détecté dans ces cohortes.

26 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


Sensibilité du diagnostic dans les échantillons de VIH-2
La sensibilité du diagnostic a été définie en utilisant un total de 37 échantillons de plasma de
la cohorte D avec les charges virales plasmatiques correspondantes supérieures à la limite de
détection du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect (≥ 952 cp/mL, equivalent à ≥ 98 cp/mL determinées
sur Abbott m2000). La sensibilité du diagnostic observée [intervalles de confiance de 95 %]
pour le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect pour le VIH-2 dans les échantillons de plasma était
de 97,30 % (36/37) [85,84 %, 99,93 %]. Parmi les 101 patients de la cohorte D, 8 étaient
coinfectés par le VIH-1 et le VIH-2 selon les données des tests sérologiques historiques.
Parmi ceux-ci, 4 patients ont démontré une charge virale détectable pour un ou les deux types
de virus sur le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Aucun résultat incohérent n’a été observé pour
le VIH-2. L’un des patients ayant réagi pour le VIH-1 sur l’Abbott m2000 n’a pas été détecté
par le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect, mais la charge virale de cet échantillon était inférieure
à la limite de détection du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Les 4 autres patients présentaient
une charge virale indétectable, à la fois avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect et la méthode
de référence.

Sensibilité du diagnostic et spécificité dans les échantillons néonataux


La sensibilité du diagnostic et la spécificité dans les spécimens néonataux ont été déterminées
en utilisant un total de 223 échantillons de sang total prélevé par piqûre du talon dans la
cohorte E. La sensibilité du diagnostic et la spécificité observées [intervalles de confiance
de 95 %] pour le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect pour le VIH-1 dans les échantillons de sang
prélevé par piqûre du talon étaient de 100 % (18/18) [84,7 %, 100 %] et 100 % (205/205)
[98,5 %, 100 %], respectivement.
Aucun échantillon réagissant pour le VIH-2 n’a été détecté dans cette cohorte.

Sensibilité du diagnostic dans les panels de séroconversion


La sensibilité du diagnostic dans les panels de séroconversion a été déterminée en utilisant
10 panels de la cohorte F. Le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect a détecté le VIH-1 chez 46 des 128
membres du panel au total, comparé aux 42 détectés sur 128 par l’Abbott ARCHITECT® HIV
Ag/Ab Combo. Dans 4 des 10 panels, le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect a détecté le groupe
M/N du VIH-1 jusqu’à 4 jours plus tôt que la référence.
Le tableau 1 présente les résultats détaillés.

GUIDE DE LA CARTOUCHE 27
Tableau 1: Sensibilité de la séroconversion
Nombre de membres du Jours avant la première Différence
panel détectés détection du VIH entre le
nombre de
Nombre
jours avant
de
Abbott Abbott la première
Panel membres m-PIMA™ m-PIMA™
ARCHITECT® ARCHITECT® détection
du panel HIV-1/2 HIV-1/2
HIV Ag/Ab HIV Ag/Ab du VIH
testés Detect Detect
Combo Combo (m-PIMA™
minus
Abbott)
12007 9 6 6 117 117 0
6247 9 3 3 21 21 0
9016 10 3 2 27 30 -3
9018 11 3 3 28 28 0
9020 22 4 3 87 90 -3
9022* 9 3 2 23 25 -2
9024 12 2 1 49 53 -4
9025 12 2 2 85 85 0
9076 9 3 3 66 66 0
9079 25 17 17 40 40 0
Total 128 46 42 543 555
*Aucun résultat de l’Abbott ARCHITECT® HIV Ag/Ab Combo n’a été fourni pour les échantillons 9022-01 et
9022-07, mais ni l’Abbott PRISM HIV Ag/Ab Combo, ni l’Abbott Murex HIV-1 Ab/Ag Combo n’ont réagi.

Spécificité du diagnostic dans des échantillons congelés de sang total et de


plasma
La spécificité du diagnostic d’un test est définie comme la proportion de sujets non malades
dont le résultat du test est négatif et est exprimée sous forme de proportion ou
de pourcentage. La spécificité du diagnostic a été déterminée en utilisant un total de
600 échantillons de sang total veineux et 603 échantillons de plasma de la cohorte G.
La spécificité du diagnostic observée [intervalles de confiance de 95 %] pour le test
m-PIMA™ HIV-1/2 Detect pour les échantillons de sang total et de plasma de donneurs
présumés sains était de 100 % (600/600) [99,51 %, 100 %] et 100 % (603/603) [99,50 %,
100 %], respectivement.

28 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


Sensibilité analytique/ limite de détection
Le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect a été conçu pour atteindre des sensibilités analytiques pour
les trois analytes de 4000 cp/mL. Lors d’une étude interne réalisée au sein d’Abbott Rapid
Diagnostics Jena GmbH, la sensibilité analytique du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect a été
déterminée en analysant la limite inférieure de détection (LOD) de chaque analyte (groupe
M/N VIH-1, groupe O VIH-1 et VIH-2). La limite de détection est le nombre de copies/mL
ou d’unités internationales/mL pour lequel le taux de détection réel est de 95 % et a été
calculée au moyen de la régression de Probit. Des cartouches de trois lots différents ont été
utilisées.
Le groupe M du VIH-1 et le groupe A du VIH-2 disponibles dans le commerce ont été utilisés.
Pour le groupe O du VIH-1, le virus a été purifié à partir d’un surnageant de culture cellulaire
dans les locaux d’Abbott Rapid Diagnostics Jena GmbH. Ces analytes ont été introduits à
différentes concentrations dans les échantillons de sang total veineux négatif pour le VIH de la
cohorte H aux concentrations décrites dans les tableaux 2, 3 et 4. Lors de l’évaluation du test
m-PIMA™ HIV-1/2 Detect par l’OMS pour son inscription à la liste de l’OMS de présélection
des produits de diagnostic in vitro, la limite de détection a été déterminée en utilisant le 3e
étalon international de l’OMS pour le VIH-1, ajouté à du sang total.(31)
Les facteurs de conversion entre les copies d’ARN du virus et les unités internationales sont
de 1/1,67 pour le groupe M/N du VIH-1 selon la première norme internationale sur le VIH-1
de l’OMS et de 1/0,55 pour le groupe A du VIH-2 selon la première norme internationale sur
le VIH-2 de l’OMS.
Remarque: En raison de l’absence de matériel de référence pour le groupe O du VIH-1,
aucune conversion en UI n’a été possible.
Les concentrations en cp/mL et UI/mL [intervalles de confiance de 95 %] de l’ARN viral qui
peuvent être détectées avec un taux de positivité supérieur à 95 %, comme déterminé par
l’analyse de Probit, sont les suivantes:*
Groupe M du VIH-1 (souche IIIB): 2491 cp/mL [2046 cp/mL, 3319 cp/mL] et
4160 IU/mL [3417 IU/mL, 5543 IU/mL]
Groupe M du VIH-1 (3e étalon int. de l’OMS): 1759 cp/mL [1286 cp/mL, 3640 cp/mL] et
2937 IU/mL [2147 IU/mL, 6079 IU/mL]
Groupe O du VIH-1 (souche MVP5180): 943 cp/mL [790 cp/mL, 1262 cp/mL]
Groupe A du VIH-2 (souche NIHZ): 952 cp/mL [794 cp/mL, 1239 cp/mL] et
524 IU/mL [437 IU/mL, 681 IU/mL]
*Données représentatives: les résultats des différents laboratoires peuvent différer de ces données.

GUIDE DE LA CARTOUCHE 29
Tableau 2: Groupe M du VIH-1 (souche IIIB)

Concentration (cp/mL) Nvalide Ndétecté Pourcentage détecté

640 83 44 53%
1080 79 52 66%
1920 82 74 90%
3320 80 79 99%
5760 82 82 100%
10000 85 85 100%

Tableau 3: Groupe O du VIH-1 (souche MVP5180)

Concentration (cp/mL) Nvalide Ndétecté Pourcentage détecté

400 74 48 65%
720 80 67 84%
1240 72 72 100%
2120 81 81 100%
3720 85 85 100%
6440 80 80 100%

Tableau 4: Groupe A du VIH-2 (souche NIHZ)


Concentration (cp/mL) Nvalide Ndétecté Pourcentage détecté

240 78 30 38%
400 83 56 67%
720 81 70 86%
1240 78 77 99%
2200 81 81 100%
3800 78 78 100%

30 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


Spécificité analytique
La spécificité analytique d’un test est définie comme la capacité à détecter uniquement la
cible prévue, à condition que la détection de la cible ne soit pas affectée par une réactivité
croisée ou des substances interférentes. La réactivité croisée concerne des organismes
potentiellement interférents, par exemple d’autres pathogènes. Les substances interférentes
sont des substances endogènes susceptibles d’être présentes dans des conditions relatives au
spécimen, par exemple des maladies non infectieuses, d´autres pathologies ou des substances
exogènes comme des médicaments. Ces substances ont été ajoutées aux échantillons ou
étaient déjà détectables dans des panels d’échantillons disponibles dans le commerce.
Des échantillons négatifs pour le VIH de la cohorte H ont été surchargés avec des quantités
données du sous-type B du groupe M du VIH-1 (souche IIIB), du groupe O du VIH-1 (souche
MVP5180) et du virus purifié du groupe A du VIH-2 (souche NIHZ) (un analyte par échantillon)
pour atteindre la concentration de 12000 cp/mL. L’interférence des médicaments a été testée
en ajoutant trois fois la concentration plasmatique maximale dans le sang total.

Réactivité croisée
La susceptibilité du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect à la réactivité croisée avec des organismes
pathogènes pertinents a été évaluée pour les échantillons de sang total, de plasma et de
sérum. Les éléments testés incluaient des pathogènes qui sont souvent présents dans des
coinfections avec le VIH, mais aussi dans la flore humaine normale et incluent des virus,
des champignons, des protozoaires et des bactéries (voir tableaux 5 et 6).

Tableau 5: Liste des pathogènes: échantillons non cliniques


Virus Bactéries
HTLV-1 Salmonella Enteritidis
HTLV-2 Salmonella Typhimurium
HBV Salmonella Paratyphi
HCV Staphylococcus epidermidis
HAdV Streptococcus pneumoniae
HSV-1 (HHV-1) Streptococcus mutans
HSV-2 (HHV-2) MSSA
VZV (HHV-3) MRSA
EBV (HHV-4) Chlamydia pneumoniae
HCMV (HHV-5) Escherichia coli
HHV-6 Propionibacterium acnes
Champignons Protozoaires
Candida albicans Toxoplasma gondii
Cryptococcus neoformans
Pneumocystis jirovecii

GUIDE DE LA CARTOUCHE 31
Tableau 6: Liste des pathogènes: échantillons cliniques
Nombre d’échantillons de
Organisme/ Agent
patients
Treponema pallidum
(Panel d’échantillons
10
comportant différents
titres en anticorps)*
HCV
(Positif sérologiquement 10
et en acide nucleiques)**
HBV
(Positif sérologiquement 10
et en acide nucleiques)**
HCMV 12
EBV
HSV-1
HSV-2
Rubella Virus
Toxoplasma gondii
(IgG pos)*
* Échantillons dont la présence d’anticorps est confirmée
** Échantillons dont la présence d’anticorps et d’acide nucléiques est confirmée

Au total, 26 pathogènes fournis en tant qu’échantillons non cliniques (pathogène purifié ou


ADN génomique purifié) ont été testés sur au moins 10 réplicats avec le test m-PIMA™
HIV-1/2 Detect. Dans un total de 304 séries de test avec des échantillons négatifs pour
le VIH et 306 séries de test avec des échantillons positifs pour le VIH surchargés, aucune
réactivité croisée avec les organismes testés n’a été observée. Aucun résultat faux positif
pour le VIH n’a été obtenu avec les échantillons négatifs pour le VIH et aucun résultat faux
négatif n’a été obtenu avec les échantillons positifs pour le VIH (pour les trois analytes).
De plus, 42 échantillons cliniques (9 pathogènes différents) ont été testés en termes de
réactivité croisée avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Aucun résultat faux positif pour le
VIH n’a été obtenu avec les échantillons négatifs pour le VIH et aucun résultat faux négatif
n’a été obtenu avec les échantillons positifs pour le VIH (pour les trois analytes). Aucun des
pathogènes n’a révélé de réaction croisée avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect.

Substances endogènes interférentes et pathologies


La susceptibilité du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect à l’interférence par des concentrations
élevées de substances endogènes et plusieurs pathologies a été évaluée pour des
échantillons de plasma et de sérum (voir le tableau 7).
32 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
Tableau 7: Liste des substances endogènes ou échantillons de donneurs souffrant de pathologies
Échantillon clinique Nombre de patients

ADN double brins 10


Anticorps anti-nucléaires (titre 1:320-1:10 000) 10
Bilirubine (5,1-13,4 mg/dL) 10
Cholestérol (99-220 mg/dL) 10
Pillule contraceptive 10
Cancer ovarien 10
Insuffisance rénale 10
Facteur rhumatoide (295-7 900 IU/mL) 10
Troisième trimestre de grossesse 10
Total T3 10
Diabète de type II 10
Toxicomane IV 10
Maladie hépatique non virale 10

Au total, 130 échantillons cliniques (représentant 13 différentes pathologies) ont été utilisés
pour tester l’interférence avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Sur les 130 passages de test
avec des échantillons négatifs pour le VIH, aucun résultat faux positif n’a été généré pour
les trois analytes. Sur les 130 passages de test avec des échantillons positifs pour le VIH
surchargés, aucun résultat faux négatif n’a été généré pour les trois analytes.
Aucune interférence des substances endogènes ou pathologies n’a été observée.

Interférence médicamenteuse
La susceptibilité du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect à l’interférence par des médicaments
couramment prescrits aux personnes infectées par le VIH a été évaluée pour des échantillons
de plasma (voir le tableau 8).

GUIDE DE LA CARTOUCHE 33
Tableau 8: Liste des médicaments
Médicaments anti-VIH
Inhibiteurs de protéase Nucléoside/Nucléotide Analogue
Lopinavir, LPV Inhibiteurs de Transcriptase Inverse
Ritonavir Abacavir sulfate, ABC
Emtricitabine, FTC
Stavudine, d4T
Tenofovir disoproxil fumarate, TDF
Lamivudine, 3TC
Zidovudine, AZT
Non-Nucléoside/Nucléotide Analogue Inhibiteurs d’intégrase
Inhibiteurs de Transcriptase Inverse Raltegravir, RAL
Efavirenz, EFV
Nevirapine, NVP
Médicaments anti-VHC/VHB Composés pour le traitement des virus
herpétiques
Modulateur Immunitaire Nucleoside Analogues
Ribavirin Acyclovir
Peginterferon alfa-2a Ganciclovir
Peginterferon alfa-2b
Composés pour le traitement/la prévention des infections opportunistes pour la
maladie du VIH
Anti-Fongique Anti-Fongique / Bacterien
Fluconazole Co-trimoxazole
Anti-mycobactériens
Isoniazid
Rifampicin
Pyrazinamide
Ethambutol
Streptomycin
Parmi les 284 passages de test avec des échantillons négatifs pour le VIH, aucun résultat
faux positif n’a été généré pour les trois analytes. Parmi les 280 passages de test avec des
échantillons positifs pour le VIH surchargés, aucun résultat faux négatif n’a été généré pour
les trois analytes. Aucune interférence avec les médicaments n’a été observée.

34 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


Test des génotypes/sous-types
La performance analytique du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect avec les sous-types du VIH-1 et
VIH-2 a été évaluée en testant 20 isolats du VIH-1 (sous-types A à H du groupe M, groupe N,
groupe O et formes recombinantes circulantes) et 5 isolats du VIH-2 (groupes A, B, A/B du
VIH-2). Tous les isolats utilisés dans cette étude étaient des membres des panels de sous-
types fournis par le Centre national de référence allemand pour les rétrovirus (German
National Reference Center for Retroviruses ou GNRCR) de Munich, en Allemagne, l’ancien
GNRCR d’Erlangen, en Allemagne, et l’Institut national pour les normes et contrôles
biologiques (National Institute for Biological Standards and Control ou NIBSC), au Royaume-
Uni. Les virus ont été cultivés sur des cellules et les surnageants ont été dilués dans du
plasma négatif pour le VIH et quantifiés au moyen de différents dosages de PCR en temps
réel au GNRCR de Munich et d’Erlangen. Les virus fournis par le NIBSC ont été cultivés sur des
cellules et les surnageants ont été dilués dans du plasma négatif pour le VIH et lyophilisés.
Les spécimens ont été utilisés dans les locaux d’Abbott Rapid Diagnostics Jena GmbH pour
générer différents niveaux de dilution. Les sous-types ont été testés à 0,5 fois, 1 fois et 3 fois
la limite de détection. Tous les sous-types ont pu être détectés par le test m-PIMA™
HIV-1/2 Detect. Aucun résultat faux positif à toutes les concentrations ou faux négatif à 3 fois
la LOD pour le groupe M/N et le groupe O du VIH-1, ou pour le VIH-2 n’a été observé.
Pour des informations détaillées sur les isolats testés, voir les tableaux 9 et 10:

Tableau 9: Détection des groupes du VIH-2 par le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect

m-PIMA™ HIV-1/2 Detect (Ndétecté / Nvalidé)


Groupes Isolats 0.5x LOD 1x LOD 3x LOD
Groupe A CDC77618 10/10 10/10 10/10
Groupe A 7924A 10/10 10/10 10/10
Groupe A 60415K 10/10 10/10 10/10
Groupe A/B 7312A 10/10 10/10 10/10
Groupe B CDC310319 10/10 10/10 10/10

GUIDE DE LA CARTOUCHE 35
Tableau 10: Détection des groupes et sous-types du VIH-1 par le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect

m-PIMA™ HIV-1/2 Detect (Ndétecté/Nvalidé)


Groupes/Sous-types Isolats 0.5x LOD 1x LOD 3x LOD
Groupe M/Subtype A 92UG029 8/10 10/10 10/10
Groupe M/Subtype B 92TH026 10/10 10/10 10/10
Groupe M/Subtype C 92BR025 10/10 9/10 10/10
Groupe M/Subtype D 92UG021 8/10 10/10 10/10
Groupe M/Subtype F 93BR029 7/10 8/10 10/10
Groupe M/Subtype F 93BR020 9/10 10/10 10/10
Groupe M/Subtype G RU570 6/10 10/10 10/10
Groupe M/Subtype G P962 8/10 10/10 10/10
Groupe M/Subtype H VI557 10/10 10/10 10/10
Groupe M/Subtype J SE9173 8/10 10/10 10/10
Groupe M/Subtype CRF01
92TH022 8/10 10/10 10/10
(AE)
Groupe M/Subtype CRF02
01CM.0005BBY 6/10 10/10 10/10
(AG)
Groupe M/Subtype CRF02
01CM.0008BBY 9/10 10/10 10/10
(AG)
Groupe M/ Subtype AG-GH VI525 9/10 10/10 10/10
Groupe M/
96CM1849 8/10 10/10 10/10
Subtype CRF01 A, G, J, U
Groupe N YBF30 10/10 10/10 10/10
Groupe O MVP5180 8/10 10/10 10/10
Groupe O CA-9 4/10 10/10 10/10
Groupe O 13740 8/10 10/10 10/10
Groupe O 2549-95 5/10 10/10 10/10

36 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect


Effets de matrice
Pour évaluer les possibles effets de la matrice d’échantillons sur la performance du test
m-PIMA™ HIV-1/2 Detect, des échantillons artificiellement positifs pour le VIH et des
échantillons de cohortes positives pour le VIH ont été testés.

Effet de matrice sur les échantillons surchargés


Des échantillons frais appariés de plasma et de sang total de la cohorte H ont été surchargés
avec des préparations virales du sous-type B du groupe M du VIH-1 (souche IIIB) à une
concentration de 12000 cp/mL. Les échantillons ont été analysés avec le test m-PIMA™
HIV-1/2 Detect à 3 jours avec deux passages par jour sur 20 analyseurs. Des tests valides (sang
total veineux: n=56; plasma: n=59) ont été utilisés pour analyser l’effet de matrice. Pour tous
les tests sur le sang total veineux et le plasma surchargé correspondant avec 12000 cp/mL du
sous-type B du groupe M du VIH-1 (souche IIIB), le groupe M/N du VIH-1 a pu être détecté à
100 % avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Aucune influence des cellules sanguines et de
leurs composants n’a été observée sur le taux de détection. Aucun résultat faux positif pour le
groupe O du VIH-1 et pour le VIH-2 n’a été observé. Les résultats sont considérés comme étant
représentatifs pour tous les analytes du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect (groupe M/N du VIH 1,
groupe O du VIH-1 et VIH-2).
Effet de matrice dans des échantillons de patients dont les charges virales
sont ≥ 2491 cp/mL
L’effet de matrice a été déterminé au moyen de 235 paires appariées d’échantillons
de plasma et de sang total veineux et 74 échantillons de sang capillaire et sang total
veineux appariés provenant des cohortes A, B et C dont les charges virales plasmatiques
correspondantes étaient supérieures à la limite de détection du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
(≥ 2491 cp/mL déterminée sur Roche Cobas®).
Pour toutes les paires échantillons de sang veineux total et plasma, les résultats du test
m-PIMA™ HIV-1/2 Detect correspondaient à 100 % (intervalle de confiance pour différence
de sensibilité -1,8 %; +1,8 %). Pour toutes les paires échantillons de sang veineux total et sang
capillaire, les résultats du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect correspondaient à 98,65 % (intervalle
de confiance pour la différence de sensibilité -7,7 %; +4,2 %). Merci de consulter également la
section limitation, page 23.
Alors que seulement le groupe M/N du VIH-1 était détecté dans les échantillons de ces
cohortes, les résultats sont considérés comme étant représentatifs pour tous les analytes du
test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect (groupe M/N du VIH-1, groupe O du VIH-1 et VIH-2).

GUIDE DE LA CARTOUCHE 37
Dosage multiplexe
Afin d’évaluer la sensibilité dans les doubles infections au VIH-1/VIH-2, les deux types de virus
ont été testés à différentes concentrations (élevée/faible) dans le même échantillon sur le
test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Des concentrations données de préparations virales du VIH,
du groupe O du VIH-1 et du VIH-2 ont été ajoutées à des échantillons de sang total négatif
pour le VIH de donneurs européens présumés sains de la cohorte H conformément au tableau
ci-dessous.
Tableau 11: Résultats de test pour des échantillons duplexes surchargés avec le VIH-1/VIH-2

Concentration testée (Ndétecté/Nvalide)


Échantillon
VIH-1 groupe M/N VIH-1 groupe O VIH-2 groupe A

3x LOD _* 100,000 IU/mL


1
(58/59) (0/59) (59/59)
_* 3x LOD 100,000 IU/mL
2
(0/58) (53/58) (58/58)

1,000,000 IU/mL _* 3x LOD


3
(59/59) (0/59) (59/59)
_* 1,000,000 IU/mL 3x LOD
4
(1/57) (57/57) (57/57)

* Négative pour l’analyte

Pour l’ensemble des échantillons, des analytes de concentration supérieures ont toujours été
détectées avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect. Comme décrit dans “Limitations”, section
“Variants génétiques/ mutations”, page 23, des concentrations élevées du groupe O du
VIH-1 peuvent provoquer des résultats faux positifs pour le groupe M/N du VIH-1. Dans
cette étude, un résultat faux positif a été observé pour le groupe M/N du VIH-1 en présence
de concentrations élevées du groupe O du VIH-1. Aucun analyte de faible concentration
n’a été détecté pour le groupe M du VIH-1 et le groupe O du VIH-1 dans un cas et cinq cas,
respectivement. Cependant, il a été prouvé que la limite de détection (intervalle de confiance
à 95 % compris) dans les échantillons multiplexes avec des concentrations élevées de VIH-2
était inférieure à 4000 cp/mL pour le groupe M du VIH-1 et le groupe O du VIH-1.

Effet de report
Un possible effet de report des échantillons dans le m-PIMA™ Analyser, lorsqu’utilisé avec le
test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect, a été évalué en testant les échantillons de VIH-1 (souche IIIB)
à titre élevé (à une concentration cible de 3x107 cp/mL) entrecoupés avec des échantillons
négatifs (n=144).
38 m-PIMA™ HIV-1/2 Detect
Le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect n’a pas démontré d’effet de report détectable à partir des
échantillons hautement positifs vers les échantillons négatifs.

Précision
Afin d’évaluer la précision du test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect, trois utilisateurs ont réalisé des
doubles essais à l’aide de trois lots de production de cartouches sur trois m-PIMA™ Analyser
pendant six jours. L’ensemble des expériences ont été réalisées à l’aide d’échantillons de sang
total veineux EDTA surchargés avec des préparations virales du groupe M du VIH-1 (souche
IIIB), du groupe O du VIH-1 (souche MVP5180) et du groupe A du VIH-2 (souche NIHZ) à deux
concentrations différentes, représentant 3 fois et 7 fois la limite de détection. Pour l’ensemble
des tests, chaque analyte a été détecté à 100 % avec le test m-PIMA™ HIV-1/2 Detect.

SUPPORT TECHNIQUE
Pour le support technique, merci de contacter le distributeur local ou d’appeler le
numéro suivant selon la région:

Europe &
+44 161 483 9032 EME.techsupport@abbott.com
Moyen-Orient

Afrique +27 10 500 9700 ARCIS.techsupport@abbott.com

Asie-Pacifique +61 7 3363 7100 AP.techsupport@abbott.com

Amérique latine +57 1 482 4033 LA.techsupport@abbott.com

Russie & CEI +44 161 483 9032 ARCIS.techsupport@abbott.com

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GUIDE DE LA CARTOUCHE 41
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