INTRODUCTION A LA

MICROBIOLOGIE GENERALE
I- Introduction
II- Historique
III- Le monde microbien

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 I- Introduction

La microbiologie est l’étude des organismes vivants de très petite

taille, qui ne peuvent pas être perçus à l’œil nu. Ces organismes sont
appelés : microorganismes

microorganismes = microbes = germes = souches = isolats = semence

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Echelle d’observation du vivant

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 Le terme microorganisme est donc employé pour décrire un organisme de
petite taille observé uniquement au microscope (voir échelle page 3)

Remarque : les virus ne sont pas des cellules mais simplement un matériel génétique
entouré d’un manteau protéique, ils sont incapables de mener une existence
indépendante (ce sont des parasites obligatoires)

Principales différences entre cellules eucaryotes et procaryotes :

Cellule animale Cellule végétale Cellule bactérienne

Cellules possédant des organites Cellule sans organites
(= cellules eucaryotes) (= cellule procaryote)

Membrane X X X
Cytoplasme X X X
Noyau X X
Paroi X X
Chloroplaste X
Mitochondrie X X
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 Les organismes procaryotes regroupent les unicellulaires présentant un noyau
diffus ( bactéries, cyanobactéries et archéobactéries)

Les eucaryotes regroupent l’ensemble des organismes unicellulaires ou

multicellulaires à noyau individualisé

(+ plus de détails dans la suite du cours)

La science du classement des microorganismes est appelée taxonomie

(taxinomie) ou systématique : essentielle pour l’identification des souches
microbiennes

Joseph Pitton de Tournefort (botaniste français, 1656-1708) a réuni les

espèces en genres

Carl Von Linné (naturaliste suédois, 1707-1778) fondateur de la systématique

ou taxonomie, a classé les organismes en groupes ou taxons de plus en plus larges

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 Pour qu’un organisme soit formellement reconnu par les taxonomistes, il doit
être nommé selon des règles internationales précises :

Un nom générique (nom de genre avec une majuscule) suivi d’un nom
d’espèce avec une minuscule (l’ensemble forme le nom binomial d’un
microorganisme)

Un genre peut contenir plusieurs espèce. Les genres sont regroupés en

familles, les familles en ordres, les ordres en classes et les classes en
embranchements. Un règne regroupe plusieurs embranchements.

Règne Embranchement Classe Ordre Famille Genre Espèce

Un taxon (= clade) contient un ancêtre et tous ses descendants

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 Exemple : Classification du colibacille bien connu, Escherichia coli :

Règne : Procaryote
Phylum : Proteobacteria
Classe : Gammaproteobacteria
Ordre : Enterobacteriales
Famille : Enterobacteriaceae
Genre : Escherichia
Espèce : Escherichia coli ( le nom de l’espèce est binomial)

(Remarque : On emploie souvent la notation E. coli :

le nom du genre est représenté par l’initiale)

La mention « sp. » placée après le genre (ex. Bacillus sp.) signifie que la
souche n’a pas été identifiée au-delà du genre

La mention « spp. » placée après le genre (ex. Penicillium spp.) est utilisée
pour désigner un ensemble d’espèces du même genre

Remarque : les noms sont latins, s’écrivent en italique, et au niveau de la

dénomination d’une espèce le nom du genre prend une majuscule 7