Virus Agent pathogène

Introduction sur les virus

Virus, c’est quoi ?
Matériel génétique (acide nucléique) protégé par une capside +/- enveloppe et
capable de se répliquer dans une cellule hôte.

A virus is a piece of bad news wrapped up in protein”—Sir Peter

Medawar
• Définition moderne des virus édictée par André Lwoff en 1957 :
« Les virus sont infectieux et potentiellement pathogènes ; ce sont des entités nucléo-
protéiques possédant un seul type d’acide nucléique (ARN ou ADN) ; ils sont reproduits
(par la cellule) à partir de leur matériel génétique ; ils sont incapables de croître et de
se diviser ».
• Micro-organisme composé :
• D’un génome (ARN ou ADN)
• D’une capside (protéines)
• Option : enveloppe lipidique
• Option : tégument (herpèsvirus)
• Parasite intracellulaire obligatoire
• Multiplication intracellulaire
• Possibilité de résister dans le milieu extérieur

Virus= micro-organismes infectieux à multiplication intracellulaire

obligatoire, composé d’un matériel génétique (ad ou are) entouré de capside protéique +/- d’une
enveloppe virale dérivée des membranes celllaires.

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Notion de taille

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observation des particules virales

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Structure
• Le génome :
• ADN ou ARN
• Non segmenté ou segmenté
• Mono ou bicaténaire
• ARN de polarité positive (=ARNm) ou négative
• Gènes souvent sur zones chevauchantes du génome
• 1er élément de classification des virus : classification de Baltimore

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Classification de Baltimore des virus *
• La capside
• Protection du génome viral
• Structure polymérisée d’un nombre limité de protéines différentes
• Symétrie icosaédrique ou symétrie hélicoïdale (= 2ème élément de classification)

• L’enveloppe : 3ème élément de classification

• Absente : virus nus
• Présente : virus enveloppé
• Dérive des membranes cellulaires

• Le tégument
• Couche protéique supplémentaire entre la capside et
l’enveloppe (herpèsvirus)
Ex. Virus respiratoires-les nus

Ex. Virus respiratoire-enveloppé

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Entrée du virus dans la cellules
• La particule virale doit rejoindre le cytoplasme cellulaire sans détruire la cellule
cible
• Mécanismes d’entrée dépendent de la structure virale
• Entrée des virus est conditionnée par différents facteurs
- facteurs d’attachement
- récepteurs cellulaires -> tropisme viral

• La particule virale doit rejoindre le noyau cellulaire dans certains cas

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Entrée-decaptation

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Les virus utilisèrent et détournent la machinerie cellulaire a leur
avantage
• Les constituants cellulaires nécessaires à la réplication virale sont répartis
dans différents compartiments de la cellule
- dans le noyau
• ADN polymérase cellulaire pour certains petits virus ADN
• ARN polymérase ADN dépendante cellulaire
• machinerie d’épissage des ARNm....

- dans le cytoplasme
• ribosomes pour la traduction protéique
• réticulum endoplasmique et appareil de Golgi pour les protéines virales sécrétées /
mécanismes de glycosylation des protéines d’enveloppe
• mitochondries: déclenchement de la mort cellulaire programmée / support à protéines
impliquées dans l’activation voie Interféron

• «Virus can’t do it themselves»

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 - La synthèse préalable de protéines virales est nécessaire à la réplication /transcription pour
tous les virus

- La réplication des virus les plus «simples» repose en très grande partie sur la machinerie
cellulaire
- Les virus plus complexes codent pour des protéines virales nécessaires à la réplication,
mais ont besoin de certaines protéines cellulaires
• Réorganisation de l’organisation cellulaire: «viral factories»
- cytoplasme: Virus ARN (membrane associated replicase complexes), certains gros virus
ADN

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- noyau: virus ADN > réorganisation des compartiments nucléaires (chromatine, corps
nucléaires PML...)

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• Réplication du génome viral
• fait intervenir une enzyme virale dans la plupart des cas
• a lieu soit dans le cytoplasme de la cellule (virus à ARN hors rétrovirus et virus de la grippe,
poxvirus), soit dans le noyau de la cellule (virus à ADN, rétrovirus, virus de la grippe)

• Réplication des virus à ADN

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réplication du génome viral: ADN polymérases ADN dépendantes
→ cellulaires: petits virus qui ne codent pas pour une ADN polymérase
—> virales: la réplication débute après la synthèse des protéines virales (dont l'ADN
polymérase) impliquées dans la réplication du génome > virus à ADN plus gros
(herpesviridae ++)
transcription du génome viral: production des ARNm viraux
- ARN polymérase ADN dépendante cellulaire
- ARN polymérase Il cellulaire les ARNm viraux subissent les processus d'apprêtage
habituellement observés pour les ARNm cellulaires: épissage, polyadénylation en 3', adjonction
d'une coiffe en 5'

• Réplication des virus à ARN

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les antiviraux

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