Rétrovirus humains

L3

Professeur Moussa Fafa Cissé

Médecin Biologiste
Faculté de Médecine de Dakar
 Préambule

03/01/24 2
 Cible – Pré requis

• Cible
– Étudiants en L3S6
– Faculté de Médecine Iba Mar Diop
• Pré requis
– Notions de base Virologie générale
– Notions de bases en génétique moléculaire

03/01/24 3
 Objectifs
• Définir un rétrovirus
• Classer les rétrovirus humains
• Décrire la structure du VIH
• Décrire le cycle de multiplication du VIH
• Décrire le principe des tests utilisés lors du
diagnostic d’une infection à VIH
• Citer paramètres biologiques évolutivité SIDA
• Citer les classes d’ARV disponibles
 Plan de la leçon

• 1. Introduction
• 2. Classification des Rétrovirus
• 3. Virus immunodéficience humaine
• 4. Human T Cells Leukemia Virus
• 5. Conclusion
1. Introduction
1.1. Définitions
 Rétrovirus

• Virus à ARN positif

– Diploïde
– Linéaire
– Monocaténaire
• Possédant la reverse transcriptase
 Reverse transcriptase

• Enzyme particulière
• Permettant la synthèse d’ADN
• À partir d’un brin d’ARN
Transcriptase inverse
1.2. Intérêt de la leçon
 Épidémiologique

• SIDA = maladie incurable

• Pandémie à tendance endémique
• Forte prévalence Afrique et Asie
 Biologique

• Utilisation en Génie génétique

• Utilisation de la RT en Biologie moléculaire
• Mise au point nouvelles molécules antivirales
1.3. Historique
 Reverse transcriptase

• Découverte en 1975
– Équipe de Temin HM et al.
– Équipe de Baltimore D et al.
• Fonction : ADN pol ARN dépendante
 HTLV1

• Découverte: 1980-1982
– Équipe de Gallo R et al.
– Équipe de Hinuma et al.
• 1er rétrovirus humains décrit
Human T Cells Leukemia Virus
 VIH

• Françoise Barré-Sinoussi, 1983  VIH1

• Françoise Brun-Vézinet, 1986  VIH2
• Pièce anatomique datant de 1959
• 1er cas SIDA,1960  marins norvégiens
Virus Immunodéficience Humaine
2. Classification des Rétrovirus
 Classification

• Famille : Retroviridae
• Genres : Lentivirus, Deltaretrovirus
• Espèces : VIH, HTLV
• Types : VIV1 , VIV2 , HTLV1 , HTLV2
• Sous-types du VIH1 : A, B, C, D, E, F
 Lentivirus

• Human Immunodeficiency Virus : HIV

• Simian Immunodeficiency Virus : SIV
• Feline Immunodeficiency Virus : FIV
Maladies chroniques, non oncogéniques
Absence d’oncogènes
 Deltaretrovirus

• Human T Cells Leukemia 1 : HTLV1

• Human T Cells Leukemia 2 : HTLV2

Maladies chroniques, oncogéniques

Présence de l’oncogène tax
 Rétrovirus humains

• Virus Immunodéficience Humaine : VIH

• Human T Cells Leukemia Virus : HTLV
3. Virus Immunodéficience
Humaine
3.1. Structure du virion
3.1.1. Génome viral
 Caractéristiques du génome

• ARN (+)
• Linéaire
• Monocaténaire
• Non segmenté
• Diploïde
Diploïde = 2 copies identiques
Organisation du chromosome

• 3 gènes structuraux
– Pol  enzymes virales
– Gag  antigènes de groupe
– Env  antigènes d’enveloppe (spicules)
• Gènes de régulation
– tat, rev, nef, vif, vpu, vpr
 Enzymes virales

• Reverse transcriptase  rétro transcription

• Intégrase  insère ADNv dans noyau cellule
• Protéase  maturation virions fils
Cibles des ARV
3.1.2. Enveloppes virales
 Capside

• Symétrie cubique
• Formée par la protéine p24
• Antigénique  classification
• Immunogène  anticorps non protecteurs
Ac recherchés lors dépistage sérologique
 Matrice

• Recouvre la capside
• Formée par la protéine p17
• Immunogène  anticorps non protecteurs
Ac recherchés lors dépistage sérologique
 Péplos

• Recouvre le matrix
• Composé de phospholipides
• Provient de la membrane cytoplasmique
Rôle dans infectivité du virus
3.1.3. Spicules virales
 Types de spicules

• gp41  située dans le péplos

• gp120  située à la surface
gp = glycoprotéines
 Fonctions des spicules

• gp 120  fixation du virus à la cellule

• gp41  pénétration du virus dans la cellule
 Propriétés des spicules

• Antigéniques  typage et sous-typage

• Immunogéniques  anticorps spécifiques

Anticorps recherchés lors dépistage sérologique

3.1.4. Propriétés physiques
 VIH est sensible

• Alcool à +70°C
• Eau de javel diluée à 10%
• pH acide (<6) et alcalin (>10)
• Chauffage pendant 30’, à +56°C
 VIH est stable

• +37°C pendant 11 jours

• +20°C pendant 15 jours
• -40°C longtemps
3.2. Cycle multiplication VIH
 Cellules cibles au VIH

• Lymphocytes TCD4 ou T4
• Monocytes Macrophages
• Cellules de Kupffer
• Cellule de la Microglie
• Cellules de Langherans
Cluster differenciation = CD
 Récepteurs cellulaires

• Corécepteurs
– CCR5
– CXCR4
• Récepteur principal = CD4
3.2.1. 1ères étapes
• Fixation de la gp120 sur le CD4
• Pénétration par fusion-lyse
• Décapsidation dans le cytoplasme
3.2.2. Réplication du VIH
 Rétro transcription ARNv

• RT se fixe sur l’ARNv

• Puis le rétro transcrit en ADNv
• Enfin elle détruit l’ARNv
ARNv  ADN viral
 Intégration de l’ADNv

• Intégrase se fixe sur l’ADNv

• Puis l’insère dans le noyau cellulaire
• Précisément dans l’un des chromosomes
 Synthèse des ARNv fils

• ADNv est transcrit en pluiseurs ARNv

• Qui seront les noyaux des virus fils
Synthèse des protéines virales

• ADNv est transcrit en ARNmv

• ARNmv sont traduits en protéines
• Par les ribosomes de la cellule infectée
3.2.3. Dernières étapes
 Assemblage – Maturation virus
fils
• Formation de capsides vides
• ARNv fils intègrent capsides vides
• Maturation des capsides par la protéase virale
Cela se passe dans le cytoplasme cellule infectée
 Libération des virus fils

• Virus fils
• Bourgeonnent
• Au niveau membrane cytoplasmique
3.3. Épidémiologie du VIH
3.3.1. Hôte naturel du VIH
 Réservoir du HIV

• Homme malade
• Absence de porteur sain
• Virus strictement humain
Liquides biologiques contagieux

• Lait maternel
• Greffons d’organes
• Sang et ses dérivés
• Sécrétions génitales
3.3.2. Transmission du VIH
 Trois « S »
• Sexe
– Homosexuelle  30%
– Hétérosexuelle  70%
• Sang
– Transfusion
– Accident exposition sang
• Seringue  injection, tatouage …
 Transmission Mère-Enfant

• Dernières semaines grossesse : 1/3 cas

• Pendant l’accouchement : 2/3 cas
• Pendant l’allaitement : 5-7% cas
3.3.3. Répartition du VIH
 Afrique sub-saharienne

• Taux d’infection : 5% à 36%

• Virus présents : VIH1 et VIH2
• Nombreux sous-types
3.4. Infection à VIH
3.4.1. Physiopathologie
infection
 Contamination

• Monocytes – Macrophages
– Infectés en 1er lieu
– Deviennent des « réservoirs » du virus
– Propagent le virus dans l’organisme
• Lymphocytes T4
– Infectés secondairement
– Leur lyse  immunodépression
 4 heures
VIH

exposition infectante

cellule dendritique

transfert et pénétration

lymphocyte CD4+
intégration génome
proviral et transfert au

2 jours
relais ganglionnaire

4-11 jours
ganglion lymphatique

multiplication virale
dissémination générale
virémie
3.4.2. Phases infection à
VIH
 Primo-infection

• Fièvre
• Éruption
• Asthénie
• Adénopathie
Symptomatique 1 fois sur 2 ; contagieuse
 Phase de séropositivité

• Durée moyenne = 2-10 ans

• Totalement asymptomatique

Mais très contagieuse

 SIDA

• Évolution lente
• Maladie chronique
• Inexorablement mortelle
• Émaillée de complications diverses
Syndrome Immuno Déficience Acquise
 Complications

• Infections opportunistes
– Virales
– Parasitaires
– Bactériennes
• Cancers …
 Infection due au VIH2

• Potentiel épidémique faible

• Évolution très lente vers le SIDA
• Réactions antigéniques croisées avec VIH1

Localisation originelle = Afrique Ouest

3.4.3. Paramètres biologiques
 Paramètres virologiques

• Anticorps anti VIH

– Anti p24
– Anti gp41
– Anti gp120
– Anti gp160
• ARN viral : nombre copies par ml de sang
 Paramètre cytologique

• Taux de lymphocytes T4

Taux normal = 800 ± 300/mm3

 Paramètres clés de la
surveillance

• Taux de lymphocytes T4
• Charge virale = nombre copies ARNv/ml sang
3.5. Diagnostic biologique
infection
3.5.1. Indications du diagnostic
 Suspicion clinique

• Infection à répétition chez un sujet

• Transmission mère - enfant
• Cas contacts de patient séropositif
 Bilans systématiques

• Dépistage volontaire
• Dons de sang, organes, sperme
• Bilans préopératoire, prénuptial
3.5.2. Diagnostic sérologique
 Marqueurs viraux recherchés

• Anti gp120
• Anti gp41
• Anti p24
• Anti p17
• Anti p7
Il s’agit uniquement des anticorps
Tests du diagnostic sérologique

• Tests du dépistage de l’infection

– ELISA indirecte
– Immunochromatographie sur membrane
• Test de confirmation de l’infection
– Western blot (WB)
 ELISA indirecte
Enzyme
( galactosidase)
•
Anti globuline
(Ac de la chèvre)

Ac VIH

Ag VIH
Plaque ELISA
Puits
Attendre 1H; laver
(1)
Ac VIH ?

(2)

Ajouter sang malade

Ag VIH
 Attendre 1H; laver

Ajouter substrat

Enzyme

Anti globuline

Ajout anti globuline

Test (-) Test (+)

Western blot
3.5.3. Diagnostic direct
 Indications

• Diagnostic infection chez enfant 0-18 mois

• Mise sous ARV + surveillance traitement
 Produits pathologiques

• Plasma
• Sérum sanguin
• Lait maternel
• Sécrétions génitales
• Cellules mononuclées du sang
Marqueurs viraux recherchés

• ARN viral
• Virus entier
• Antigène p24
 Tests de recherche du VIH

• ARNv  RT-PCR
• Virus entier  culture cellulaire
• Antigène p24  ELISA directe
3.6. Éléments de thérapeutique
3.6.1. Traitement antirétroviral
3.6.1.1. Données générales
 Avertissement

• Aucun effet sur ADNv intégré

• Suspend uniquement la réplication
• Virémie remonte dès arrêt ARV
Traitement est à vie et à la mort
 Quand commencer

• TCD4  200 mm3

• Quelle que soit la charge virale
3.6.1.2. Classes d’ARV
 ARV anti entrée du virus

• Fuzeon ou Enfuvirtide ou T20

• Celsentri ou Maraviroc
Cible = Spicules virales
 ARV anti réplication (1)

• Azidothymidine (AZT)  anémie

• ddc, d4T  neuropathies
• ddi  pancréatite
• 3TC  peu toxique
Inhibiteurs nucléosidiques
Cible = RT virale
 ARV anti réplication (2)

• Névirapine
• Éfavirenz
• Autres
Inhibiteurs non nucléosidiques
Cible = RT virale
 Anti intégration ADNv

• Isentress
• Raltegravir
Cible = Intégrase virale
 Anti maturation protéines
• Saquinavir
• Ritonavir
• Indinavir
• Nelfinavir
• Amprénavir
• Lopinavir
Cible = Protéase virale
3.6.2. Prévention
 Mesures générales

• Lutte contre les AES

• Lutte contre la toxicomanie
• Informer, Éduquer, Communiquer
• Fidélité, abstinence, préservatifs
• Sécuriser les dons de sang, d’organes
 Mère en grossesse

• Mettre mère sous AZT ou Névirapine

– Début dernier bimestre grossesse
– Perfusion d’ARV pendant l’accouchement
– Pratiquer une césarienne
• Continuer les ARV après accouchement
 Nouveau-né

• Bilan  ELISA, WB, RT-PCR

• Interdire l’allaitement maternel
• Mettre nné sous ARV si contaminé
 Accident exposition sang

• Personnel médical
– Arrêt immédiat
– Consultation chez médicale
• Bilan, suivi, traitement, suivi
– Médecin Référent
– Médecin du Travail
Confère cours Hygiène hospitalière
4. Human T Cells Leukemia
Virus
 Épidémiologie

• Zones d’endémie
– Japon
– Afrique
– Caraïbes
• Transmission idem VIH
 Maladies

• Cancers
– Lymphome à cellules T
– Leucémie lymphoïde à cellules T
• Paralysie spastique tropicale
 Diagnostic virologique

• Culture du virus
• Détection et dosage de l’ARNv

Taux de CD4 sans intérêt, non utile

 Éléments de thérapeutique

• ARV sont inefficaces sur HTLV1

• Prévention générale idem VIH

Maladies chroniques, « incurables »

5. Conclusion
• SIDA = problème de santé publique
• SIDA fait peur car lié au comportement sexuel
• SIDA = maladie incurable; ce n’est pas un cancer
Merci