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STRUCTURE ,

MORPHOLOGIE ET
CLASSIFICATION DES VIRUS
PAR PR NOUBOM MICHEL
MC/CD MHI
OBJECTIFS

• Comprendre les différentes structures


virales
• Connaître les différentes morphologies
virales
• Comprendre les éléments nécessaires et
la classification des virus
Plan du cours
• I INTRODUCTION
• II STRUCUTURE DES VIRUS
• III MORPHOLOGIE DES VIRUS
• IV CLASSIFICATION DES VIRUS
• V CONCLUSION
I NTRODUCTION
Définition du virus par André Lwoff 1953
• 1) agent infectieux avec une structure spécifique : génome,
capside, enveloppe éventuelle
• 2) incapacité de croître ou de se diviser par scissiparité
comme les bactéries
• 3) aucune source énergétique propre, aucun enzyme du
métabolisme énergétique
• 4) multiplication au sein d'une cellule vivante en détournant
à son profit tous les mécanismes de synthèse uniquement à
partir de son matériel génétique
• 5) Le virion sortant de la cellule est complet, terminé pas de
modification hors de la cellule
Sa structure particulaire est bien définie pour chaque espèce
de virus
II STRUTURE DES VIRUS
• Tous les virions, qu’ils soient entourés d’une
enveloppe ou non, sont construits autour d’une
nucléocapside centrale.
• La nucléocapside est composée d’un acide
nucléique, soit de l’ADN soit de l’ARN, maintenu
dans une coque protéique appelée capside.
• La capside protège le matériel génétique viral et
favorise ainsi son transfert éventuel d’une cellule
hôte à une autre.
II STRUTURE DES VIRUS
GENOME
-Peut être constitué d’un ARN ou d’ADN .
Le génome à ARN est monocaténaire pour la
majorité des virus ou bicaténaire (Reoviridaes
et des birnaviridaes).
Génome à ARN de polarité +( même polarité
que l’ARNm) et polarité –
Le génome à ADN est bicaténaire à l’exception
des parvoviridaes et circoviridaes où il
monocaténaire
II STRUTURE DES VIRUS
CAPSIDE
• De nature protéique, entourant le génome ou
le core
• Constituée de protéines de structure appelées
unités de structure (US)
• Auto-assemblage des US se fait selon des
arrangements
• réguliers selon 2 types de symétrie :
• - hélicoïdale
• - cubique
II STRUTURE DES VIRUS
SYMÉTRIE DES CAPSIDES
• Certaines capsides sont hélicoïdales en forme de cylindre
protéique creux; elles peuvent être rigides ou flexibles.
• Certaines capsides sont de forme icosahédrique.

• Un icosahèdre est un polyèdre régulier avec 20 faces


triangulaires équilatérales et 12 sommets

• Les virus complexes sont ceux dont la symétrie de


capside n’est pas totalement icosahédrique ou
hélicoïdale.
II STRUTURE DES VIRUS
CAPSIDE À SYMÉTRIE HÉLICOÏDALE
• Modèle : capside du virus de la mosaïque du tabac
• - bâtonnet rigide et creux de 300 nm de long sur 17
nm de large
• - AN = une molécule d’ARN monocaténaire,
enroulée en hélice
• entourée par 2200 US protéiques identiques entre
elles
• - 1 US = polypeptide de 17 500 daltons (158 acides
aminés)
Capside à symétrie hélicoïdale
Capside à symétrie cubique
• L'icosaèdre = polyèdre régulier
• * 12 sommets
• * 20 faces qui sont des triangles
équilatéraux
• * 30 arêtes
Capside à symétrie cubique
I.3 Organisation générale
II STRUTURE DES VIRUS
Organisation générale
• 1 US à chaque angle du triangle équilatéral soit 3
x 20 = 60 US
• 1 face est constituée de plusieurs facettes =
icosadeltaèdre
• 1 US à chaque angle de chaque facette soit 3 US
• Si T = Nombre de facettes par face
• 20 faces ; on aura 20 x T = Nombre total de
facettes
• 3 US / facette soit 3 x 20 x T = 60 T = Nombre
total d'US
II STRUTURE DES VIRUS
LES CAPSOMERES
Capsomères = association des US
- par 5 = pentons ou pentamères, situés
aux sommets de l’icosaèdre
- par 6 = hexons ou hexamères, situés au
niveau des faces et des arêtes quand le
nombre de triangulation est >10
II STRUTURE DES VIRUS
Détermination du nombre total de capsomères
• 1) à l'aide du nombre de capsomères situés sur
une arête
• N = 10 x (n-1)2 + 2
• N = Nombre total de capsomères
• n = Nombre de capsomères situés sur une arête, y
compris ceux des 2 sommets
Exemple:
• Herpesviridae : n = 5 N = 162
• Adenoviridae : n = 6 N = 252
II STRUTURE DES VIRUS
Détermination du nombre total
de capsomères
• 2) à l'aide du nombre de triangulation T
• N = 10 T + 2
Exemple:
Herpesviridae : T = 16 N = 162
Adenoviridae : T = 25 N = 252
II STRUTURE DES VIRUS
Disposition de l'acide nucléique
dans la capside
-soit pelotonné tel quel dans la capside
Pour les virus de petite taille en général
(Picornaviridae)
- soit associé à une ou plusieurs protéines
particulières distinctes des protéines de capside
• nucléoïde central ou core (Adenoviridae ou
• Herpesviridae)
• Les protéines internes du nucléoïde central sont
basiques le plus souvent, neutralisant les charges
acides de l'AN
II STRUTURE DES VIRUS
L’ENVELOPPE
• Elément facultatif n'existant pas chez tous les virus
• virus animaux à capside hélicoïdale sont tous
• enveloppés : Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae,
• Rhabdoviridae
• virus animaux à capside icosaèdrique sont
• - soit nus : Picornaviridae
• Adenoviridae
• - soit enveloppés : Herpesviridae
• Togaviridae
• Certains virus possèdent des structures ± complexes
appelées projections de surface ou spicules à la surface
de l'enveloppe
II STRUTURE DES VIRUS
ORIGINE DE L’ENVELOPPE
• Cellulaire acquise au cours de la multiplication du
virus, aux dépens de certaines membranes de la cellule
• Herpesviridae : membrane nucléaire
• Togaviridae : membrane intracytoplasmique (réticulum
endoplasmique ou appareil de golgi)
• Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae : membrane
cytoplasmique
• Virale protéines appelées péplomères codées par le
génome viral, se fixant dans les membranes cellulaires, au
moment de la morphogenèse du virion
Formation de l’enveloppe
exemple du virus de la grippe
II STRUTURE DES VIRUS
COMPOSITION CHIMIQUE
• Lipides provenant de la cellule-hôte (ces virus
enveloppés sensibles aux solvants des lipides
(éther), au désoxycholate de Na, à la chaleur)
• Glucides sous forme de glycolipides ou
glycoprotéines, synthétisés par la cellule
• Protéines codées par le virus = Ag responsable
de la formation d’Ac
II STRUTURE DES VIRUS
CONSÉQUENCES DE LA PRÉSENCE D’UNE ENVELOPPE
• conditionne la taille et la morphologie du virus
Les virus enveloppés sont grossièrement sphériques
Exception : famille des Rhabdoviridaes (Virus de la rage) avec la
forme d'un obus
Rôle dans:
- le pouvoir infectieux fixation sur les cellules par les protéines
de l'enveloppe
- le pouvoir antigénique, suscitant la formation d'anticorps
- Fragilité des virus enveloppés : sensibilité à différents agents
physiques et chimiques, dessiccation…
• Les virus nus sont plus résistants que les virus enveloppés
III Morphologie des virus
• Un virus peut être considéré comme une
simple boite renfermant un peu de
matériel génétique.
• La boite, ou capside, est constituée par
l'assemblage de briques semblables, les
capsomères qui sont des molécules de
nature protéique.
III MORPHOLOGIE DES
VIRUS
• une capside hélicoïdale
• les capsomères sont rattachés au filament
d'ARN qui est enroulé en hélice (cette
forme de capside n'existe pas chez les
virus à ADN).
IIIMORPHOLOGIE DES VIRUS
• une capside polyédrique : ces capsides
ont une forme géométrique icosaédrique
(polyèdre à 20 faces). Il existe pour cela
deux types de capsomères. Ceux
constitués par 5 monomères identiques,
qui vont former les sommets de chaque
face, et ceux constitués par 6 monomères
qui vont constituer les arêtes et les faces
de la capside.
IIIMORPHOLOGIE DES VIRUS
• la combinaison de ces deux formes :
Certains bactériophages possèdent ainsi
une "tête" polyédrique et une "queue"
hélicoïdale, quelquefois complété par la
présence de "pattes", les fibres caudales
III MORPHOLOGIE DES
VIRUS
• la combinaison de ces deux formes
IV CLASSIFICATION DES VIRUS
Elle tient compte:
De la nature de l‘acide nucléique
* ADN ou ARN
* le nombre de chaînes = mono ou bicaténaires
* le P.M.
* la forme = linéaire ou circulaire
De la symétrie de la capside
* hélicoïdale
* cubique
De la présence ou non d'une enveloppe
Du nombre de capsomères pour les virus à symétrie cubique
DU diamètre de la nucléocapside pour les virus à symétrie
hélicoïdale
IV CLASSIFICATION DES VIRUS
• Les caractères généraux partagés par les virus de la même
famille coïncident généralement avec leur origine
commune.
• Les noms de familles virales se terminent par "viridae", les
noms de sous-familles par "virinae" et les noms de genre
par "virus".
• La totalité des virus connus à ce jour à été groupé en 74
familles et groupes, dont 21 contenant les virus capable
d’infecter l’homme
• Actuellement un 22ème groupes est provisoirement réservé
aux virus non classé à cause de leurs propriétés
particulières et leurs diversités
• Dans ce groupe on trouve: les virus delta de l’hépatite
delta,les astrovirus , les Torovirus
IVCLASSIFICATION DES VIRUS
V CONCLUSION
• La connaissance de la structure de la
morphologie virale d’apprécier la
différence réelle qui existe entre la
bactérie et le virus
• Par ailleurs ce chapitre permet à
l’apprenant de comprendre pourquoi le
virus est un parasite obligatoire

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