MORPHOLOGIE ET CLASSIFICATION DES VIRUS PAR PR NOUBOM MICHEL MC/CD MHI OBJECTIFS
• Comprendre les différentes structures
virales • Connaître les différentes morphologies virales • Comprendre les éléments nécessaires et la classification des virus Plan du cours • I INTRODUCTION • II STRUCUTURE DES VIRUS • III MORPHOLOGIE DES VIRUS • IV CLASSIFICATION DES VIRUS • V CONCLUSION I NTRODUCTION Définition du virus par André Lwoff 1953 • 1) agent infectieux avec une structure spécifique : génome, capside, enveloppe éventuelle • 2) incapacité de croître ou de se diviser par scissiparité comme les bactéries • 3) aucune source énergétique propre, aucun enzyme du métabolisme énergétique • 4) multiplication au sein d'une cellule vivante en détournant à son profit tous les mécanismes de synthèse uniquement à partir de son matériel génétique • 5) Le virion sortant de la cellule est complet, terminé pas de modification hors de la cellule Sa structure particulaire est bien définie pour chaque espèce de virus II STRUTURE DES VIRUS • Tous les virions, qu’ils soient entourés d’une enveloppe ou non, sont construits autour d’une nucléocapside centrale. • La nucléocapside est composée d’un acide nucléique, soit de l’ADN soit de l’ARN, maintenu dans une coque protéique appelée capside. • La capside protège le matériel génétique viral et favorise ainsi son transfert éventuel d’une cellule hôte à une autre. II STRUTURE DES VIRUS GENOME -Peut être constitué d’un ARN ou d’ADN . Le génome à ARN est monocaténaire pour la majorité des virus ou bicaténaire (Reoviridaes et des birnaviridaes). Génome à ARN de polarité +( même polarité que l’ARNm) et polarité – Le génome à ADN est bicaténaire à l’exception des parvoviridaes et circoviridaes où il monocaténaire II STRUTURE DES VIRUS CAPSIDE • De nature protéique, entourant le génome ou le core • Constituée de protéines de structure appelées unités de structure (US) • Auto-assemblage des US se fait selon des arrangements • réguliers selon 2 types de symétrie : • - hélicoïdale • - cubique II STRUTURE DES VIRUS SYMÉTRIE DES CAPSIDES • Certaines capsides sont hélicoïdales en forme de cylindre protéique creux; elles peuvent être rigides ou flexibles. • Certaines capsides sont de forme icosahédrique.
• Un icosahèdre est un polyèdre régulier avec 20 faces
triangulaires équilatérales et 12 sommets
• Les virus complexes sont ceux dont la symétrie de
capside n’est pas totalement icosahédrique ou hélicoïdale. II STRUTURE DES VIRUS CAPSIDE À SYMÉTRIE HÉLICOÏDALE • Modèle : capside du virus de la mosaïque du tabac • - bâtonnet rigide et creux de 300 nm de long sur 17 nm de large • - AN = une molécule d’ARN monocaténaire, enroulée en hélice • entourée par 2200 US protéiques identiques entre elles • - 1 US = polypeptide de 17 500 daltons (158 acides aminés) Capside à symétrie hélicoïdale Capside à symétrie cubique • L'icosaèdre = polyèdre régulier • * 12 sommets • * 20 faces qui sont des triangles équilatéraux • * 30 arêtes Capside à symétrie cubique I.3 Organisation générale II STRUTURE DES VIRUS Organisation générale • 1 US à chaque angle du triangle équilatéral soit 3 x 20 = 60 US • 1 face est constituée de plusieurs facettes = icosadeltaèdre • 1 US à chaque angle de chaque facette soit 3 US • Si T = Nombre de facettes par face • 20 faces ; on aura 20 x T = Nombre total de facettes • 3 US / facette soit 3 x 20 x T = 60 T = Nombre total d'US II STRUTURE DES VIRUS LES CAPSOMERES Capsomères = association des US - par 5 = pentons ou pentamères, situés aux sommets de l’icosaèdre - par 6 = hexons ou hexamères, situés au niveau des faces et des arêtes quand le nombre de triangulation est >10 II STRUTURE DES VIRUS Détermination du nombre total de capsomères • 1) à l'aide du nombre de capsomères situés sur une arête • N = 10 x (n-1)2 + 2 • N = Nombre total de capsomères • n = Nombre de capsomères situés sur une arête, y compris ceux des 2 sommets Exemple: • Herpesviridae : n = 5 N = 162 • Adenoviridae : n = 6 N = 252 II STRUTURE DES VIRUS Détermination du nombre total de capsomères • 2) à l'aide du nombre de triangulation T • N = 10 T + 2 Exemple: Herpesviridae : T = 16 N = 162 Adenoviridae : T = 25 N = 252 II STRUTURE DES VIRUS Disposition de l'acide nucléique dans la capside -soit pelotonné tel quel dans la capside Pour les virus de petite taille en général (Picornaviridae) - soit associé à une ou plusieurs protéines particulières distinctes des protéines de capside • nucléoïde central ou core (Adenoviridae ou • Herpesviridae) • Les protéines internes du nucléoïde central sont basiques le plus souvent, neutralisant les charges acides de l'AN II STRUTURE DES VIRUS L’ENVELOPPE • Elément facultatif n'existant pas chez tous les virus • virus animaux à capside hélicoïdale sont tous • enveloppés : Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, • Rhabdoviridae • virus animaux à capside icosaèdrique sont • - soit nus : Picornaviridae • Adenoviridae • - soit enveloppés : Herpesviridae • Togaviridae • Certains virus possèdent des structures ± complexes appelées projections de surface ou spicules à la surface de l'enveloppe II STRUTURE DES VIRUS ORIGINE DE L’ENVELOPPE • Cellulaire acquise au cours de la multiplication du virus, aux dépens de certaines membranes de la cellule • Herpesviridae : membrane nucléaire • Togaviridae : membrane intracytoplasmique (réticulum endoplasmique ou appareil de golgi) • Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae : membrane cytoplasmique • Virale protéines appelées péplomères codées par le génome viral, se fixant dans les membranes cellulaires, au moment de la morphogenèse du virion Formation de l’enveloppe exemple du virus de la grippe II STRUTURE DES VIRUS COMPOSITION CHIMIQUE • Lipides provenant de la cellule-hôte (ces virus enveloppés sensibles aux solvants des lipides (éther), au désoxycholate de Na, à la chaleur) • Glucides sous forme de glycolipides ou glycoprotéines, synthétisés par la cellule • Protéines codées par le virus = Ag responsable de la formation d’Ac II STRUTURE DES VIRUS CONSÉQUENCES DE LA PRÉSENCE D’UNE ENVELOPPE • conditionne la taille et la morphologie du virus Les virus enveloppés sont grossièrement sphériques Exception : famille des Rhabdoviridaes (Virus de la rage) avec la forme d'un obus Rôle dans: - le pouvoir infectieux fixation sur les cellules par les protéines de l'enveloppe - le pouvoir antigénique, suscitant la formation d'anticorps - Fragilité des virus enveloppés : sensibilité à différents agents physiques et chimiques, dessiccation… • Les virus nus sont plus résistants que les virus enveloppés III Morphologie des virus • Un virus peut être considéré comme une simple boite renfermant un peu de matériel génétique. • La boite, ou capside, est constituée par l'assemblage de briques semblables, les capsomères qui sont des molécules de nature protéique. III MORPHOLOGIE DES VIRUS • une capside hélicoïdale • les capsomères sont rattachés au filament d'ARN qui est enroulé en hélice (cette forme de capside n'existe pas chez les virus à ADN). IIIMORPHOLOGIE DES VIRUS • une capside polyédrique : ces capsides ont une forme géométrique icosaédrique (polyèdre à 20 faces). Il existe pour cela deux types de capsomères. Ceux constitués par 5 monomères identiques, qui vont former les sommets de chaque face, et ceux constitués par 6 monomères qui vont constituer les arêtes et les faces de la capside. IIIMORPHOLOGIE DES VIRUS • la combinaison de ces deux formes : Certains bactériophages possèdent ainsi une "tête" polyédrique et une "queue" hélicoïdale, quelquefois complété par la présence de "pattes", les fibres caudales III MORPHOLOGIE DES VIRUS • la combinaison de ces deux formes IV CLASSIFICATION DES VIRUS Elle tient compte: De la nature de l‘acide nucléique * ADN ou ARN * le nombre de chaînes = mono ou bicaténaires * le P.M. * la forme = linéaire ou circulaire De la symétrie de la capside * hélicoïdale * cubique De la présence ou non d'une enveloppe Du nombre de capsomères pour les virus à symétrie cubique DU diamètre de la nucléocapside pour les virus à symétrie hélicoïdale IV CLASSIFICATION DES VIRUS • Les caractères généraux partagés par les virus de la même famille coïncident généralement avec leur origine commune. • Les noms de familles virales se terminent par "viridae", les noms de sous-familles par "virinae" et les noms de genre par "virus". • La totalité des virus connus à ce jour à été groupé en 74 familles et groupes, dont 21 contenant les virus capable d’infecter l’homme • Actuellement un 22ème groupes est provisoirement réservé aux virus non classé à cause de leurs propriétés particulières et leurs diversités • Dans ce groupe on trouve: les virus delta de l’hépatite delta,les astrovirus , les Torovirus IVCLASSIFICATION DES VIRUS V CONCLUSION • La connaissance de la structure de la morphologie virale d’apprécier la différence réelle qui existe entre la bactérie et le virus • Par ailleurs ce chapitre permet à l’apprenant de comprendre pourquoi le virus est un parasite obligatoire