Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
Capture D'écran . 2024-04-22 À 22.12.08
Capture D'écran . 2024-04-22 À 22.12.08
3 Définitions .......................................................................................... 6
4 Les enzymes....................................................................................... 7
5 L’énergie .......................................................................................... 12
8 Sources ........................................................................................... 24
1 Introduction
La cellule est une usine chimique miniature où se produisent des milliers de
réactions dans un espace microscopique.
Les glucides associés à de l’azote peuvent être convertis en acides aminés qui se
lient pour former des protéines ; inversement, durant la digestion, les protéines
sont décomposées en acides aminés qui pourront à leur tour être convertis en
glucides. Les petites molécules se combinent pour former des polymères que la
cellule peut ensuite hydrolyser selon ses besoins.
Les réactions qui ont lieu dans une cellule sont coordonnées et régulées avec
précision. Par sa complexité, son efficacité, son intégration et sa sensibilité aux
moindres changements, la cellule présente une activité chimique sans égale.
Carte métabolique
Glycogène
(n+1) Glycolyse Néoglucogenèse
Catabolisme des Anabolisme des Trans-énoyl-CoA
graisses (β-oxydation) graisses
D-Glucose Triglygéride
Glycogène (n) Glycogène (n) Cycle de Krebs Cycle de l’urée
Trans- / désamination Glycogénogenèse Acyl-CoA
des acides aminés et glycogénolyse
Corps cétoniques Fermentation lactique Acyl-CoA
Glucose-1- Utilisation des chaînes carbonées des acides aminés Acide gras β-hydroxyacyl-CoA
Glucose-6- phosphate (glucoformateurs, cétogènes, mixtes)
phosphate
Voie des pentoses phosphates
Voie des
pentoses
TRP
phosphates Lactate
β-cétoacyl-CoA
ASN ASP
Mitochondrie
Malonyl-ACP
Oxaloacétate Malonyl-CoA
α-cétoacide Acide aminé
Urée Pyruvate Acétyl-CoA
Butyryl-ACP
Fumarate Acyl-ACP
Fumarate Acétoacétyl-ACP
Isocitrate
Carbamoyl-
TYR
phosphate
PHE
GLU
Citrulline Succinate Crotonyl-ACP
α-cétoglutarate
Arginino- THR / MET
succinate Succinyl-CoA GLN / ARG
VAL / ILE β-hydroxybutyryl-ACP
Aspartate HIS / PRO
Une fois à l'intérieur des cellules de l'organisme, les nutriments passent par une
gamme extraordinaire de réactions biochimiques qui, ensemble, forment ce qu'on
appelle le métabolisme (metabolê : changement). Au cours du métabolisme, des
substances sont continuellement élaborées et dégradées. Les cellules consomment
de l'énergie pour pouvoir extraire des nutriments une plus grande quantité
d'énergie, puis elles utilisent cette énergie pour subvenir à leurs besoins. Même au
repos, l'organisme dépense beaucoup d'énergie.
Pour rappel, un nutriment est une petite molécule qui est directement assimilable
par nos cellules. Certains nutriments sont issus de la digestion de molécules plus
grandes alors que d’autres pas (ex. vitamines, eau, sels minéraux). Ils
appartiennent tous à une des six catégories de molécules citées ci-dessous.
- Les vitamines
2) Structure : les nutriments peuvent être utilisés pour construire des structures
cellulaires (ex : actine/myosine, phospholipides, calcium)
3 Définitions
Objectifs d’apprentissage :
3.1 Métabolisme
Le terme métabolisme correspond à l’ensemble des réactions chimiques qui
se déroulent à l'intérieur des cellules.
L'énergie libérée par les réactions cataboliques peut être emmagasinée, puis servir
aux réactions anaboliques.
4 Les enzymes
Objectifs d’apprentissage :
4.1 Définitions
Les enzymes sont des protéines qui servent de catalyseurs biologiques. Elles
sont capables, à faible dose, d’accélérer considérablement les réactions du
métabolisme, sans y participer vraiment ; on les retrouve intactes, à la fin de la
réaction.
Le réactif sur lequel une enzyme agit s’appelle substrat. L’enzyme se lie à son
substrat (ou à ses substrats, lorsqu’il y a deux ou plusieurs réactifs). Pendant que
les deux sont réunis, l’action catalytique de l’enzyme convertit le substrat en
produit(s) de la réaction :
Enzyme
Substrat(s) Produit(s)
Par exemple, l’enzyme appelée saccharase (la plupart des noms d’enzymes se
terminent par –ase) scinde le saccharose (disaccharide) en ses deux
monosaccharides, le glucose et le fructose :
Saccharase
Une enzyme peut reconnaître son substrat même parmi des composés très
apparentés, de sorte que chaque enzyme catalyse une réaction spécifique. Par
exemple, la saccharase n’agit que sur le saccharose : elle ignore les autres
disaccharides, comme le maltose.
L’image ci-dessous montre l’ajustement induit entre une enzyme et son substrat.
Dans une réaction enzymatique, le substrat se lie au site actif de l’enzyme pour
former un complexe enzyme-substrat. Une fois la transformation du substrat
en produit terminée, le produit quitte le site actif. Ce dernier est donc libre
d’accepter une autre molécule de substrat. Le cycle entier se produit tellement vite
qu’une seule molécule d’enzyme transforme habituellement un millier de
molécules de substrat par seconde.
La figure ci-dessous illustre le site actif et le cycle catalytique d’une enzyme. Une
enzyme peut convertir une ou plusieurs molécules de réactifs en une ou plusieurs
molécules de produits. L'enzyme illustrée ici transforme deux molécules de
substrat en deux molécules de produits.
Les protéines sont fabriquées par les ribosomes selon les informations contenues
dans les gènes (contenus dans l’ADN), par l’intermédiaire de l’ARN messager. On
dit que les gènes « codent pour » des protéines.
Les figures ci-dessous illustrent l’expression génétique dans une cellule eucaryote.
L’expression génétique :
L’expression génétique :
Une voie métabolique est une séquence d’étapes au cours desquelles une même
molécule subit des modifications jusqu’à l’obtention d’un produit donné.
Chaque étape de la voie spécifique est catalysée par une enzyme spécifique :
code pour…
La figure ci-dessous illustre les premières étapes de la glycolyse (les enzymes sont
indiqués en bleu) :
Gène :
Phenylanaline hydrolase
Enzyme :
Phenylanaline hydrolase
5 L’énergie
Objectifs d’apprentissage :
- Citer et expliquer les deux mécanismes par lesquels les organismes vivants
obtiennent leurs composés organiques.
- Donner des exemples de composés organiques (nutriments issus des
glucides, lipides et protéines) ;
- Citer les règnes qui utilisent ces deux mécanismes.
Les cellules dépensent continuellement de l’énergie sous les formes les plus
variées : chaleur, mouvement, transport, croissance, reproduction, ….
Pour assurer leur métabolisme, les organismes vivants doivent donc trouver une
source d’énergie dans leur milieu ambiant. La nourriture (contenant de l’énergie
chimique), plus particulièrement les composés organiques, constitue cette
source.
Il existe deux mécanismes par lesquels les organismes vivants obtiennent ces
composés organiques :
L'étape 1 est la digestion qui a lieu dans le type digestif. Le sang apporte les
nutriments absorbés aux cellules des tissus.
L'étape 2 a lieu dans les cellules des tissus. Les nutriments récemment absorbés
sont soit utilisés pour synthétiser des lipides, des protéines ou du glycogène par
des voies anaboliques, soit dégradés par des voies cataboliques dans le cytoplasme
des cellules. L'une des principales voies cataboliques de l'étape 2 est la glycolyse.
ADP + P ATP
Cette réaction chimique libère l’énergie nécessaire pour faire réagir plusieurs
molécules d’ADP avec plusieurs molécules de phosphate inorganique (P) pour
former des molécules d’ATP.
Il est important de noter que cette équation est une version simplifiée de la réalité.
En effet, diverses étapes ont lieu entre l’oxydation du glucose et la synthèse d’ATP.
La respiration cellulaire est divisée en 3 grandes étapes :
1. La glycolyse
2. Le cycle de Krebs (ou cycle de l’acide citrique)
3. La phosphorylation oxydative
C’est une molécule qui contient deux liaisons phosphate à haute teneur en énergie
(énergie potentielle chimique). Les liaisons entre les groupements phosphate de
l’ATP peuvent être rompus par hydrolyse (réaction chimique dans laquelle une
liaison est rompue par action d'une molécule d'eau).
Hydrolyse de l’ATP :
Structure de l’ATP :
L’adénosine est formée d’une molécule d’adénine (molécule organique) ainsi que
d’une molécule de ribose (glucide).
Énergie
Énergie destinée au
provenant du travail
catabolisme cellulaire
Les enzymes sont des molécules, plus précisément des protéines particulières, qui
jouent le rôle de catalyseurs des réactions biochimiques. Les enzymes ne sont donc
pas vivantes. Une seule molécule d’enzyme peut catalyser des milliards de
milliards de fois la même réaction. Les organismes n’ont donc besoin d’enzymes
qu’à des concentrations très faibles. Ils les synthétisent eux-mêmes.
• Plus rapidement
• De manière sélective
Une enzyme sélective permet d’effectuer une réaction particulière avec une
substance particulière. Ainsi, la maltase scinde une molécule de maltose en
produisant deux molécules de glucose, mais elle est incapable de scinder une
molécule de lactose, alors que la lactase peut le faire.
Exemples d’enzymes
7.2.1 Pesticides
De nombreux pesticides provoquent la mort des organismes (plantes,
insectes, etc.) en inhibant les enzymes indispensables à des réactions
vitales de leur métabolisme. C’est ainsi qu’agit le glyphosate
(herbicide Roundup ®), l’un des herbicides les plus controversés que
l’Union Européenne était sur le point d’interdire en 2018 parce qu’il est
vraisemblablement cancérigène. Les pesticides sont en grande partie responsables
de la forte régression de la biodiversité. Plus de ¾ des insectes et 40 % des oiseaux
ont disparu de Suisse au cours des 30 dernières années.
L’AZT est un médicament de synthèse utilisée dans les trithérapies contre le SIDA.
C’est un inhibiteur d’une enzyme utilisée par le virus du SIDA.
8 Sources
- Marieb E & Hoehn K. (2019). Anatomie et physiologie humaines. Pearson.
- Campbell N. A. (2012). Biologie. Pearson.