Physiologie cellulaire

IEPR 1021
Prof. Norman Heglund
bureau: b022
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mecredi 9h00 à 14h00,
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jeudi 9h00 à 15h00,
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vendredi 13h30 à 19h30
 La thermodynamique
L’énergie et ses transformations est appelée thermodynamique
du grec 'therme' qui signifie chaleur,
et 'dynamis', qui signifie puissance.

La partie de l'univers que l’on étudie est appelée le système

et tout le reste est le milieu.

Exemples du système:
• l'univers entier (dans ce cas, il n'y a pas de milieu)
• l'atmosphère du monde
• un récipient de laboratoire contenant une solution en réaction
• un organisme
• un organe
• une cellule
Un système thermodynamique fermé typique. Le conteneur fermé
contient initialement un volume d'hydrogène et d’oxygène;
l'hydrogène et l’oxygène vont réagir pour former de l’eau, de
la chaleur et réaliser du travail. Aucune matière n’est échangée
avec le milieu, bien que de la chaleur ait été transférée vers le
milieu et que du travail ait été fait sur le milieu.
La Première Loi de la Thermodynamique
(la loi de conservation de l'énergie)

L'énergie perdue par un système est égale à l'énergie

gagnée par le milieu,
et vice versa.
 L'énergie totale d'un système est la somme de toutes les énergies
cinétiques et potentielles des parties du système

L'énergie totale du système est égale à l'énergie interne du système

 L'énergie totale d'un système est la somme de toutes les énergies
cinétiques et potentielles des parties du système

L'énergie totale du système est égale à l'énergie interne du système

E = Efinal - Einitial
 L'énergie totale d'un système est la somme de toutes les énergies
cinétiques et potentielles des parties du système

L'énergie totale du système est égale à l'énergie interne du système

E = Efinal - Einitial

• le nombreE indique l'ampleur de la modification d’énergie

• le signe indique la direction du changement d’énergie
E est positif quand Efinal est plus grand que Einitial
(dans ce cas de l’énergie est gagnée sur le milieu)
E est négatif quand Efinal est plus petit que Einitial
(de l’énergie est perdue dans le milieu)
Un système peut échanger de l’énergie avec le milieu de deux façons:
• la chaleur
• le travail

E = q - w

Où
+q est la chaleur ajoutée au système
+w est le travail réalisé sur le système

-q, la modification d'énergie est appelée exothermique

+q, la modification d’énergie est appelée endothermique 
 Fonctions d'état

L'énergie interne d'un système est déterminée par son état courant,
et non par son état précédent.

Par exemple
l'énergie interne d'un système est fonction de la
température courante, de la pression, de l'emplacement...
mais pas de sa température passée, de sa pression passée
ou de son emplacement passé
Qu'est-ce qui n'est pas une fonction d'état?
Qu'est-ce qui n'est pas une fonction d'état?

Le travail 
travail = force multiplié par la distance

Travail pression-volume
 travail = force multipliée par la distance

Travail pression-volume

W=Fd le travail = la force multipliée par la distance

 travail = force multipliée par la distance

Travail pression-volume

W=Fd le travail = la force multipliée par la distance

P = F/A la pression = la force divisée par la surface
 travail = force multipliée par la distance

Travail pression-volume

W=Fd le travail = la force multipliée par la distance

P = F/A la pression = la force divisée par la surface
F=PA donc la force = la pression multipliée par la surface
 travail = force multipliée par la distance

Travail pression-volume

W=Fd le travail = la force multipliée par la distance

P = F/A la pression = la force divisée par la surface
F=PA donc la force = la pression multipliée par la surface
W=PAd on substitue
 travail = force multipliée par la distance

Travail pression-volume

W=Fd le travail = la force multipliée par la distance

P = F/A la pression = la force divisée par la surface
F=PA donc la force = la pression multipliée par la surface
W=PAd on substitue
V = A d le changement de volume = la surface multipliée par
la distance
 travail = force multipliée par la distance

Travail pression-volume

W=Fd le travail = la force multipliée par la distance

P = F/A la pression = la force divisée par la surface
F=PA donc la force = la pression multipliée par la surface
W=PAd on substitue
V = A d le changement de volume = la surface multipliée par
la distance

W = P V donc le travail = la pression multipliée par le

changement de volume
 Enthalpie

quand le volume du système est constant

E = qv

(l’indice v indique que le volume est constant)

La relation à volume constant est utilisée dans la bombe

calorimétrique, comme nous le verrons plus bas
Dans la plupart des systèmes vivants, la pression est presque
constante.
Quand la pression est constante:
qp = E + P V
(l’indice p indique que la pression est constante)

La quantité E + PV est appelée enthalpie

du mot grecque ‘enthalpein’ qui signifie la chaleur,
la lettre ‘H’ est utilisée pour désigner l’enthalpie.
Donc à pression constante:
Hfinale - Hinitiale = ∆H = ∆E + P ∆V
H est appelé la chaleur de réaction, et c'est une fonction d'état.

Quand le H d'une réaction chimique est négatif, la chaleur est

émise par le système vers le milieu, et la réaction est appelée
exothermique.

Quand le H d'une réaction chimique est positif, la chaleur du milieu

est absorbée par le système, et la réaction est appelée endothermique.
La modification d'enthalpie, H, est mesurée par un calorimètre.

La capacité calorifique est l'énergie nécessaire pour changer de

1oC une mole (la capacité calorifique molaire)
ou un gramme (la capacité calorifique spécifique) d'une substance.
 Substance Température (oC) Capacité
calorifique
spécifique (J/g oC)
Eau liquide (H2O) 15 4,184
Glace (H2O) -11 2,03
Aluminium (Al) 20 0,89
Carbone (C) 20 0,71
Fer (Fe) 20 0,45
Mercure (Hg) 20 0,14
Les calorimètres utilisent les valeurs de la capacité calorifique
pour calculer le H d'une réaction
Il est aussi possible d'utiliser un calorimètre à volume
constant, connu comme 'une bombe calorimétrique'.
Dans ce cas, H = qv et comme PV est zéro,
H = qv
 La Loi de Hess
Si une réaction est faite d'une série d'étapes, le H total est
la somme du H de chaque étape.

C'est une conséquence de la Première Loi de Thermodynamique

et du fait que H est une fonction d'état
Par exemple, il est difficile de mesurer le H de la réaction suivante
dans un calorimètre parce que du CO2 est toujours formé:
C + 1/2 O2 -> CO
Par exemple, il est difficile de mesurer le H de la réaction suivante
dans un calorimètre parce que du CO2 est toujours formé:
C + 1/2 O2 -> CO
Cependant, il est possible de mesurer les deux réactions suivantes
dans un calorimètre:
C + O2 -> CO2 H = -393,5 kJ/mol
CO + 1/2 O2 -> CO2 H = -283,0 kJ/mol
Par exemple, il est difficile de mesurer le H de la réaction suivante
dans un calorimètre parce que du CO2 est toujours formé:
C + 1/2 O2 -> CO
Cependant, il est possible de mesurer les deux réactions suivantes
dans un calorimètre:
C + O2 -> CO2 H = -393,5 kJ/mol
CO + 1/2 O2 -> CO2 H = -283,0 kJ/mol
Et puisque H est une fonction d'état:
C + O2 -> CO2 H = -393,5 kJ/mol
CO2 -> CO + 1/ 2 O2 H = +283,0 kJ/mol
Par exemple, il est difficile de mesurer le H de la réaction suivante
dans un calorimètre parce que du CO2 est toujours formé:
C + 1/2 O2 -> CO
Cependant, il est possible de mesurer les deux réactions suivantes
dans un calorimètre:
C + O2 -> CO2 H = -393,5 kJ/mol
CO + 1/2 O2 -> CO2 H = -283,0 kJ/mol
Et puisque H est une fonction d'état:
C + O2 -> CO2 H = -393,5 kJ/mol
CO2 -> CO + 1/ 2 O2 H = +283,0 kJ/mol
Et par conséquent:
C + 1/2 O2 -> CO H = -110,5 kJ/mol
 Les calorimètres sont souvent utilisés pour mesurer la chaleur de
combustion (H) de produits alimentaires pour l'information
nutritionnelle et diététique. Le tableau ci-après donne quelques
exemples.

La consommation d'énergie moyenne d'un être humain est d'environ

10.000 à 13.000 kJ/jour, ce qui équivaut à la quantité d'énergie
consommée par une ampoule de 120 à 150 Watts.
Un système qui n'est pas en équilibre change spontanément dans un
mode très spécifique.

Par exemple
• une brique laissée en l'air tombe au sol
• un clou brillant se rouille
Un système qui n'est pas en équilibre change spontanément dans un
mode très spécifique.

Par exemple
• une brique laissée en l'air tombe au sol
• un clou brillant se rouille

Le contraire n'est pas vrai, un changement spontané ne peut pas aller

dans deux directions différentes: les briques ne s’éloignent pas du sol
spontanément, et les clous rouillés ne deviennent pas spontanément
brillants.
Un système qui n'est pas en équilibre change spontanément dans un
mode très spécifique.

Par exemple
• une brique laissée en l'air tombe au sol
• un clou brillant se rouille

Le contraire n'est pas vrai, un changement spontané ne peut pas aller

dans deux directions différentes: les briques ne s’éloignent pas du sol
spontanément, et les clous rouillés ne deviennent pas spontanément
brillants.

Les changements spontanés se font toujours vers un état de

plus faible énergie.
Logiquement, les réactions exothermiques (chaleur émise par le
système) généralement se produisent spontanément…
Logiquement, les réactions exothermiques (chaleur émise par le
système) généralement se produisent spontanément…

mais le fait d'être uniquement exothermique n'est pas suffisant

pour garantir qu'une réaction se produira spontanément.

Par exemple
la glace fond spontanément à la température de la pièce,
pourtant le changement est clairement endothermique
(chaleur absorbée du milieu).
Logiquement, les réactions exothermiques (chaleur émise par le
système) généralement se produisent spontanément…

mais le fait d'être uniquement exothermique n'est pas suffisant

pour garantir qu'une réaction se produira spontanément.

Par exemple
la glace fond spontanément à la température de la pièce,
pourtant le changement est clairement endothermique
(chaleur absorbée du milieu).

Pourquoi la glace fond-elle à la température de la pièce, si

les changements spontanés se font toujours vers un état de basse
d'énergie?
La raison est que les molécules dans le produit (l'eau liquide) sont
plus au hasard que dans le réactif (la glace); les molécules d'eau sont
plus libres de se déplacer dans l'eau que les molécules dans la
structure cristal de glace.

Ce phénomène est appelé 'entropie' (symbole: S); l'entropie est

associée à la spontanéité.
Plus le système est désorganisé, plus l'entropie est grande (plus
positive), et plus l'énergie est basse.
L'entropie, comme l'enthalpie, est une fonction d'état, et par
conséquent:
Sfinale - Sinitiale = S
 Deuxième Loi de la Thermodynamique

La Deuxième Loi de la Thermodynamique affirme que si un processus

est spontané, il doit avoir pour résultat une augmentation de l'entropie
de l'univers.

Donc, même si l'entropie d'un système peut diminuer, le changement

de l'entropie total (système plus milieu) doit être positif.
 Deuxième Loi de la Thermodynamique

La Deuxième Loi de la Thermodynamique affirme que si un processus

est spontané, il doit avoir pour résultat une augmentation de l'entropie
de l'univers.

Donc, même si l'entropie d'un système peut diminuer, le changement

de l'entropie total (système plus milieu) doit être positif.

Pas très utile, il faut un critère de spontanéité basé seulement sur le

système, indépendamment du milieu. Mais dans ce cas la Deuxième
Loi de la Thermodynamique peut être répétée comme: tout système
isolé (c.-à-d. qui n'échange pas de matière ou d'énergie avec le
milieu) qui subit un changement doit finir dans un état plus désorganisé.
 Deuxième Loi de la Thermodynamique

La Deuxième Loi de la Thermodynamique affirme que si un processus

est spontané, il doit avoir pour résultat une augmentation de l'entropie
de l'univers.

Donc, même si l'entropie d'un système peut diminuer, le changement

de l'entropie total (système plus milieu) doit être positif.

Pas très utile, il faut un critère de spontanéité basé seulement sur le

système, indépendamment du milieu. Mais dans ce cas la Deuxième
Loi de la Thermodynamique peut être répétée comme: tout système
isolé (c.-à-d. qui n'échange pas de matière ou d'énergie avec le
milieu) qui subit un changement doit finir dans un état plus désorganisé.

Encore, pas très utile…

 Énergie libre
L'énergie libre implique à la fois l'enthalpie et l'entropie d'un
système. C'est la portion de l'énergie totale qui peut être utilisée
pour faire du travail quand la température est constante dans tout
le système. Le rapport a été développé par J. Willard Gibbs et est
exprimé dans l'équation d'énergie libre de Gibbs:

G = H - TS
Si la température est constante nous pouvons écrire:

G = H - TS
G = H - TS

G négatif (-G):
• processus spontané
• travail maximum fait par le système

G positif (+G):
• l’inverse du processus spontané
• travail minimum qu’il faut faire sur le système
 Limites de l’application de G

• il applique seulement à T et P constante

• pas d’indication de la vitesse