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AMINOÁCIDOS
GENERALIDADES
Aminoácidos esenciales
Actividad óptica
Propiedades ácido-básicas
Bioquímica 2º Curso
AMINOÁCIDOS LOS AMINOÁCIDOS
AMINOÁCIDOS PROTEINOGÉNICOS
GENERALIDADES 20 -L-AMINOÁCIDOS
REPRESENTACIÓN REPRESENTACIÓN
LOS AMINOÁCIDOS
ESPACIAL
Aminoácidos proteinógenicos
Aminoácidos proteinogénicos poco frecuentes
Aminoácidos no proteinogénicos
Aminoácidos esenciales
REPRESENTACIÓN
PROPIEDADES DE LOS AMINOÁCIDOS PLANAR
Propiedades espectrales
Propiedades ácido-básicas
Grupo amino
Propiedades químicas
-Reacciones del grupo carboxilo Carbono
-Reacciones del grupo amino Átomo de hidrógeno
-Reacciones de la cadena lateral 3 LETRAS
NOMENCLATURA 1 LETRA
AMINOÁCIDOS
LETRAS GRIEGAS
ÁTOMOS NÚMEROS
CICLOS NÚMEROS
CLASIFICACIÓN CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS
COO-
CON CARGA +
R CON CARGA -
Glu Asp
CADENA LATERAL D E
ESPECÍFICA
AMINOÁCIDOS PROTEINOGÉNICOS POCO FRECUENTES
AMINOÁCIDOS ESENCIALES
PLANTAS
4-HIDROXIPROLINA
5-HIDROXILISINA ARGININA*
DESMOSINA COLÁGENO
HISTIDINA*
ISODESMOSINA PHENILALANINA
-METIL LISINA ISOLEUCINA
ELASTINA
-N-TRIMETIL LISINA LEUCINA
3-METIL HISTIDINA LISINA
FORMIL METIONINA MIOSINA
METINIONINA
FOSFOSERINA TREONINA
A. GLICOSILADOS N-TERMINAL DE TRIPTÓFANO
PROTEÍNAS VALINA
PROCARIOTAS
AMINOÁCIDOS NO PROTEINOGÉNICOS
PROPIEDADES DE LOS AMINOÁCIDOS
-ALANINA ÁCIDO
HOMOCISTEÍNA PANTOTÉNICO
HOMOSERINA
PROPIEDDES ESPECTRALES
ORNITINA METIONINA AMINOÁCIDOS AROMÁTICOS
CITRULINA
-AMINOBUTÍRICO VALINA
DOPANIMA
SERIE D ARGININA
-CIANOLALANINA
UREA
AC. DIENCÓLICO
CANAVANINA TIROSINA
S-ADENOSIL-MET
AC. -AMINOADÍPICO TOXICOS
HISTAMINA
AZASERINA INTERMEDIARIOS
TIROXINA
ANTIBIÓTICOS
HORMONAS
ACTIVIDAD ÓPTICA -Sistema de Cahn-Ingold-Prelog
-Convención de Fischer
PROPIEDADES ÁCIDO-BÁSICAS AMINOÁCIDOS CON CADENA LATERIAL IONIZABLE
PROPIEDADES DE PROTEÍNAS
SEPARACIÓN E IDENTIFICACIÓN
+H
3N-CHR-COO
+H
3N-CH2R+ CO2
-
H2N-C=0
REACCIÓN DE CLORURO DE
DABSILO
REACCIÓN DE CLORURO DE DANSILO
Después de la hidrólisis
OXIDACIÓN DE LA CISTEÍNA
FORMACIÓN DE MERCÁTIDOS
2-MERCAPTOETANOL
DITIOTREITOL
IDOACETATO
REACTIVO DE SANGER
DITIOTREITOL
IDOACETATO
REACTIVO DE SANGER
AMINOÁCIDOS APOLARES
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
ESTRUCTURA DE
LOS
L-AMINOÁCIDOS
Bioquímica 2º Curso
AMINOÁCIDOS POLARES SIN CARGA
AMINOÁCIDOS APOLARES
AMINOÁCIDOS POLARES SIN CARGA AMINOÁCIDOS POLARES SIN CARGA
AMINOÁCIDOS POLARES SIN CARGA AMINOÁCIDOS POLARES CON CARGA POSITIVA
AMINOÁCIDOS POLARES CON CARGA POSITIVA AMINOÁCIDOS POLARES CON CARGA NEGATIVA
INFORMACIÓN RESPECTO A LOS AMINOÁCIDOS Phe y Trp
Phe. Grupo fenólico comparable al del benceno
Ala, Val, Leu e Ile Absorbe la luz a 260 nm. Propiedades espetrales
Son inertes químicamente Trp. Grupo Indólico– INDOL-ALANINA
Poseen cadenas de hidrocarburo alifáticas, hidrofóbios Absorbe la luz a 279 nm. Propiedades espectrales
Mantienen y establecen estructura en las proteínaS. Es escaso en la proteínas. Un residuo o pocos
Ala- Grupo metilo Tienen gran tamaño
Val-Grupo propilo Ausencia de polaridad
Leu e Ile- Grupo butilo isomérico
El más abundante es la Ala. Menos hidrofóbico Met
Interactúan entre ellos. Excluyen agua Aminoácido con azufre ETER-TIÓLICO
His
Presenta un grupo Imidazolio
Se ioniza dentro del intervalo de pH fisiológico
a pH 6,3 aproximadamente el 50% es la His tiene carga +
a pH 7 solo el 10% tiene carga +
Participa en numerosas reacciones enzimáticas
Ejerce un efecto tampón o amortiguador en la sangre. Participa
activamente en la estructura de las proteínas séricas.
Asp y Glu
Tienen dos grupos carboxilos
Tienen carga – a pH fisiológico
Según el pH actúan como dadores o aceptores de H+
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
Problemas
Bioquímica 2º Curso
Dado el siguiente hexapéptido: Asp-Tyr-Ser-Cys-His-Lys. Calcular el valor del punto isoeléctrico (pI)
y escribir todas las formas iónicas del péptido. Predecir la dirección de migración electroforética
del péptido a pH: 2,255; pH: 5,675; pH: 7,185; pH: 9,405 y pH: 12,025. Ácido aspártico (pK1 = 1,99;
pK2 = 9,90 y pKR = 3,90), tirosina (pK1 = 2,20; pK2 = 9,11 y pKR = 10,13), serina (pK1 = 2,19 y pK2 =
9,21), cisteina (pK1 = 1,92; pK2 = 10,78 y pKR = 8,33), histidina (pK1 = 1,80; pK2 = 9,33 y pKR = 6,04),
lisina (pK1 = 2,16; pK2 = 9,18 y pKR = 10,79)
+ 2,16
(P+3)
5º H N
3 Asp Tyr Ser Cys His Lys COOH 1º
9,90
2º COOH OH 4º SH NH3 7º
3,90 8,33 H N +N H +
10,79
3º 6,04
6º
OH
10,13 pK1 (Lys) = 2,16
+
(P+2)
H3 N Asp Tyr Ser Cys His Lys COO
COOH OH SH NH3
H N +N H +
OH
pKR (Asp) = 3,90
+
(P+1) H3 N Asp Tyr Ser Cys His Lys COO
COO OH SH NH3
H N +N H +
OH
pKR (His) = 6,04
+
(P0)
H3 N Asp Tyr Ser Cys His Lys COO pI
COO OH SH NH3
H N N +
OH
pKR (Cys) = 8,33
+
(P-1) H3 N Asp Tyr Ser Cys His Lys COO
COO OH S NH3
H N N +
OH
pK2 (Asp) = 9,90
COO OH S NH3
H N N +
COO OH S NH3
H N N +
COO OH S NH2
H N N
pH < pI pH = pI pH > pI
Sin carga
Cargado + CATIÓN Cargado ANIÓN
neta
Dado el siguiente péptido: Arg-Phe-Glu-Asn-Tyr, escribir todas las formas iónicas y determinar el
valor del punto isoeléctrico (pI). Predecir la dirección de migración electroforética a pH: 1,95; pH:
5,15; pH: 6,53; pH: 8,27 y pH: 13,13. Arginina (pK1 = 1,82; pK2 = 8,99 y pKR = 12,48), fenilalanina (pK1
= 2,16 y pK2 = 9,18), ácido glutámico (pK1 = 2,10; pK2 = 9,47 y pKR = 4,07), asparagina (pK1 = 2,00 y
pK2 = 8,84 ), tirosina (pK1 = 2,20; pK2 = 9,74 y pKR = 10,13)
+ +
H3 N Arg Phe Glu Asn Tyr COOH H3 N Arg Phe Glu Asn Tyr COO
3º 8,99 1º 2,20 pK1 (Tyr) = 2,20
+ NH2 COOH CONH2 + NH2 COOH CONH2
5º 12,48 2º 4,07
(P+1)
(P+2) 4º OH OH
10,13
pI pKR (Glu) = 4,07
+
H2 N Arg Phe Glu Asn Tyr COO
H3 N Arg Phe Glu Asn Tyr COO
pK2 (Arg) = 8,99
H2 N Arg Phe Glu Asn Tyr COO H2 N Arg Phe Glu Asn Tyr COO
pKR (Arg) = 12,48
+ NH2 COO CONH2 NH COO CONH2
(P-2) (P-3)
O O
pH < pI pH = pI pH > pI
Sin carga
Cargado + CATIÓN Cargado ANIÓN
neta
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
PÉPTIDOS.
EL ENLACE PEPTÍDICO
Bioquímica 2º Curso
PÉPTIDOS. GENERALIDADES
EL ENLACE PEPTÍDICO
DETERIMINACIÓN DE LA SECUENCIA DE RESIDUOS DE UN
POLIPÉPTIDO O PROTEÍNA
PURIFICACIÓN DE LA PROTEÍNA
ENLACE PEPTÍDICO
NOMENCLATURA OLIGOPÉPTIDOS
POLIPÉPTIDOS
PROTEÍNAS
GÉNESIS
HIDRÓLISIS DE PROTEÍNAS
FINES FUNCIONALES
ORIGEN
RIBOSÓMICO
NO RIBOSÓMICO
EL ENLACE PEPTÍDICO
Amida sustituida
N C
Lectura (il)*
Residuos
Híbrido de resonancia
Carácter de doble
enlace parcial
70% 30%
Acercamiento de la
distancia del enlace C-N
Solapamiento de los
Un doble enlace puro C-O permitiría orbitales del N y C
la rotación alrededor del C-N
Consecuencias
Método de Sanger
Enlaces no covalentes
Ácidos o bases
Calor
Urea 8 M
Desnaturalización SDS
Guanidina 6M
-mercaptoetanol
Desnaturalización
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
Oxidación en
presencia de Urea
8M
Renaturalización proteica
Trazas de
-mercaptoetanol
Urea
Existen 105 formas para aparear 8 Cys en Cistinas
C) HIDRÓLISIS TOTAL YDETERMINACIÓN DE LA COMPOSICIÓN DE RESIDUOS
QUÍMICA
1. HIDRÓLISIS ÁCIDA HCl 6 N (120ºC 14-16 h)
Se destruye Trp
Se destruyen Ser y Thr
2. HIDRÓLISIS ALCALINA Asn y Gln Asp y Glu
Hidracinolisis
Carboxipeptidasa A
Carboxipeptidadas Peptidil-L-aminoacido hidrolasa , E.C. 3.4.2.1
ENZIMÁTICA
Cloruro de Dabsilo
Degradación de Edman
ENZIMÁTICA
Aminopeptidasas
2. Hidrólisis parciales
Química
QUÍMICA Enzimática
Hidrólisis ácidas o básicas controladas
Reacción con bromuro de cianógeno CNBr
ENZIMÁTICA Endopeptidasas
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
E) SECUENCIACIÓN POR LA TECNOLOGÍA DEL DNA RECOMBINANTE
Complementación química-génica
GRAMICIDINA
ASPARTAMO
glutamil-L-cisteinglicina
GLUTATION
HORMONAS PEPTÍDICAS
PÉPTIDOS.
SÍNTESIS QUÍMICA DE
CADENAS
POLIPEPTÍDICAS
Bioquímica 2º Curso
ACTIVACIÓN DE AMINOÁCIDOS
SÍNTESIS
PÉPTIDOS
CONFIGURACIÓN Y CONFORMACIÓN
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García PLEGAMIENTO DE LAS PROTEÍNAS
PROTEÍNAS HÉLICE
CONFORMACIÓN
ESTRUCTURA SUPERSECUNDARIA
Bioquímica 2º Curso
CONFIGURACIÓN Y CONFORMACIÓN CLASIFICACIÓN MACROSCÓPICA DE LAS PROTEÍNAS
ESPONTÁNEO
ESTRUCTURA SECUNDARIA
ASISTINDO CHAPERONAS
PROTEÍNAS ASISTENTETES Ordenación regular y periódico de
las cadenas en el espacio a lo largo
LÁS PROTEÍNAS SE SINTETIZAN COMO POLÍMEROS de una dirección
LINEALES Y POSTERIORMENTE SE PLIEGAN EN
ESTRUCTURAS TRIDIMIENSIONALES
LAS PROTEÍNAS SE PLIEGAN POR ESTABILIZACIÓN
ESTRUCTURA TERCIARIA
PROGRESIVA DE INTERMEDIARIOS Y NO POR
BÚSQUEDA ALEATORIA Plegamiento de cadenas que poseen
estructura secundaria de un modo
compacto
LAS PROTEÍNAS PUEDEN PERDER ESTA ESTRUCTURA.
SE DESNATURALIZAN
ESTRUCTURA CUATERNARIA
La desnaturalización consiste en la pérdida de todas las
estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y Acoplamiento de varias cadenas
cuaternaria) quedando la proteína reducida a un polímero polipeptídicas con estructura
estadístico. terciaria
Consecuencias inmediatas son:
- Disminución drástica de la solubilidad de la Proteínas oligoméricas
proteína, acompañada frecuentemente de
precipitación
- Pérdida de todas sus funciones biológicas
- Alteración de sus propiedades hidrodinámicas
ESTRUCTURA SECUNDARIA DE LAS PROTEÍNAS
Difracción de rayos X
Sobre proteínas cristalizadas
CARACTERISTICAS GENERALES
Hélice repetida
Vueltas necesarias para Disposición de los aminoácidos
encontrar un aa en la
misma posición: 5;18 aa ≈
27 Å
Un puente de H entre el CO
de un aminoácido y el NH
del quinto por detrás
Dextrogira
Caracterísiticas planares Ángulos = -57º = -47º Diagrama de Ramachandran-Colbes
Giro de hélice DEXTROGIRA para L-aa
Hélice 310
Paso de rosca: 0.59 nm
Traslación por residuo: 0.19
Residuos por vuelta: 3
= -49º
= -26º
Hélice
La hélice tiene 4,1 residuos por
vuelta. ángulos (φ, ψ) de -55°, y CONFORMACIÓN
puentes de H cada 5 residuos.
Generada por inserción de un
aminoácido en una hélice alfa
FIBROINA DE LA SEDA
PLUMAS DE LAS AVES
ESCAMAS DE LOS REPTILES
Caracterísiticas planares
Cadenas antiparalelas Ángulos = -139º = 135º
Lámina antiparalela
Diagrama de Ramachandran-Colbes
Tipos de aminóácidos
Hidroxilación de lisina
Estructura molecular
Tropocolágeno-3 Cadenas arrolladas levogiramente
Disposición de los monómeros de colágeno en la
3 residuos/ vuelta cada una de peso molecular en torno a los 300 microfibrilla, que da lugar a un patrón estriado al
kDa, alrededor de 1000 microscopio electrónico
Formación de entrecruzamiento Formación de entrecruzamiento
covalente entre cadenas de colágeno a covalente entre cadenas de colágeno a ESTRUCTURA SUPERSECUNDARIA
través de lisina y al-lisina, (vía base de través de dos al-lisinas, (vía
Schiff) condensación aldólica) -Hélice-vuelta-hélice
-Cuatro hélices empaquetadas
- Siete hélices transmembrana y hélice anfipática
- Cremallera de leucina
- Unidad
- Meandro
-Dedo de Zn
- Mano EF
Hélice-vuelta-hélice
Cuatro α-hélices empaquetadas
Biosíntesis del colágeno
-héliceanfipática
Siete hélices transmembrana
(bacteriorrodopsina)
Dedo de Zn
Meandro
Construcción de dominios
grandes a partir de otros más
pequeños.
Mano EF
Piruvato
quinasa
ESTRUCTURA TERCIARIA
ESTRUCTURA CUATERNARIA
AJUSTE INDUCIDO Combinación de dos o más cadenas, para
formar una unidad completa. Las interacciones
entre las cadenas no son diferentes de los de
estructura terciaria, pero se distinguen sólo
por estar entre cadenas en lugar de dentro de
la cadena.
Proteínas diméricas
Cadenas iguales
Cadenas distintas
Insulina
ESTRUCTURA CUATERNARIA Inmunoglobulina G
Fab
Oligosacárido
Fab
Hemoglobina A1 Hemoglobina A1 Fc
(forma T, desoxi-) (forma R, oxi-)
1
1
2 1 2 1 H1 L1
H2 L2
2 2
ESTRUCTURA CUATERNARIA
PLEGAMIENTO DE LAS PROTEÍNAS
Durante biosíntesis---RIBOSOMAS
ESPONTÁNEO
ASISTINDO CHAPERONAS
PROTEÍNAS ASISTENTETES
PLEGAMIENTO
LÁS PROTEÍNAS SE SINTETIZAN COMO POLÍMEROS
LINEALES Y POSTERIORMENTE SE PLIEGAN EN
ESTRUCTURAS TRIDIMIENSIONALES
Nativo N
Desnaturalizado U (unfolded =desenrrolado)
N U
Grupo heterogéneo de conformaciones no nativas
Estructura residual secundaria, nativa o no nativa
Sin estructura terciaria
Estado nativo (N) Tendencia a la agregación
Existen como:
Compactación óptima
Precursores cinéticos de N
Grupos polares en el exterior En trazas en equilibrio con N
Mínima superficie expuesta En ausencia de cofactores específicos
Resultado de vías muertas del plegamiento
Organización jerárquica de la estructura
Flexibilidad óptima
Conformación única y cooperativa
Mínimo energético
Proteína 1 Glóbulo 2 Proteína
Estado desnaturalizado (U) desplegada fundido plegada
Expansión máxima (5-10 veces el volumen de N) (unfolded) (molten globule) (folded)
Máxima superficie expuesta al solvente
No existen interacciones preferenciales entre residuos
Infinitas conformaciones
Estado ideal, modelo teórico que describe aproximadamente el
comportamiento de muchas proteínas en condiciones fuertemente
desnaturalizantes
Christian ANFINSEN SELECCIÓN ACUMULATIVA
R. DAWKINS
El Relojero Ciego
SE CONSERVAN LOS
INTERMEDIARIOS
PARCIALMENTE
CORRECTOS
Trazas de
-
mercaptoetanol
Urea
1. PDI- Protein disulfuro isomerase Proteínas que se unen a polipéptidos en una conformación inestable,
2. PPIasas- Prolil cis-trans isomerasas FOLDASAS facilitando su correcto plegamiento, estado oligomérico ó destino final
3. Chaperoninas Actúan como enzimas al disminuir la barrera energética que separa el estado
nativo de otros mal plegados: aceleran el correcto plegamiento
Son enzimas que catalizan pasos de velocidad limitante en el No contienen información sobre modelos particulares de plegamiento, sino que
proceso de plegado de una proteína. Por ejemplo formación de ayudan a las proteínas mal plegadas a encontrar su conformación nativa
puentes disulfuro o isomerización cis-trans en los residuos de
prolina NUCLEOPLASMINAS
El número de puentes disulfuros posibles se Situación de estrés genera cadenas polipeptídicas desnaturalizadas y se produce
incrementa drásticamente con el número de un aumento en la expresión de HSP
Cys presentes en la cadena:
Estructura:
GroEL: 14 x 57 kDa (2 anillos de 7)
GroES: 7 x 10 kDa
Heterooligómeros de 2 anillos
Con 8 o 9 subunidades cada anillo
Chaperonina de E.coli
Mayor flexibilidad
Caída en trapas cinéticas insalvables
Desnaturalización parcial en el transporte
Facilidad de degradación
Enfermedades del plegamiento anómalo de proteínas
“Enfermedades conformacionales”
SÍNTESIS DE POLINUCLEÓTIDOS
LOS
NUCLEÓTIDOS
Bioquímica 2º Curso
ÁCIDOS NUCLÉICOS. SUS COMPONENTES AZÚCARES
HETERÓSIDOS
Asociación Base-azúcar
NUCLEÓSIDO NUCLEÓTIDO
Con purinas enlace N-glucosídico 1´- 9
BASES NITROGENADAS
PURINA
BASES PÚRICAS
9 9
1´ 1´
Adenosina Desoxiadenosina
PIRIMIDINA
BASES PIRIMIDÍNICAS
2-TIO 9 9
URACILO
FLUORO 1´ 1´
URACILO
NITROURA
CILO
Guanosina Desoxiguanosina
Con piridinas enlace N-glucosídico 1-1´ Nucleótidos cíclicos
1
Uridina Citidina 1´
Desoxiuridina
Desoxicitidina Derivados Nucleotídicos
AMP dAMP
GMP dGMP
CMP dCMP
UMP dUMP
TMP dTMP
Citidina trifosfato (CTP)
Coenzimas FUNCIONES METABÓLICAS DE LOS NUCLEÓTIDOS
Adenina
Fosforribosa METABOLISMO ENERGÉNICO ATP
P-P
pantoténico MEDIADORES FISIOLÓGICOS
COMPONENTES DE COENZIMAS
INTERMEDIARIOS ACTIVADOS
De azúcares: UDP-Glc, GDP-Man
De lípidos: CDP-diacilgliceroles
Adenina CDP-colina
Ribitol
EFECTORES ALOSTÉRICOS
Anillo de
isoaloxacina UNIDADES MONOMÉRICAS DE LOS ÁCIDOS
NUCLEICOS
SÍNTESIS DE POLINUCLEÓTIDOS
NOMECLATURA
Deshidratación
Polimerasas
P EN 5’ Y 0H EN 3’
5’ 3’
pApGpCpApT
5’ 3’
P EN 5’ Y OH EN 3’
ApGpCpApTp
5’ 3’
OH EN 5’ Y P EN 3’
AGCAT
CONVENIO
EXTREMO 5’ 3’ EXTREMO
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
ÁCIDOS NUCLEÍCOS
Bioquímica 2º Curso
DNA
INTRODUCCIÓN
A-DNA
CUANDO LA HUMEDAD ES MENOR DEL 75%
HÉLICE MAS ANCHA 11 pb POR VUELTA:28 A
BASES NO APILADAS PARALELAMENTE AL EJE
NO FORMACIÓN DE DÍMEROS DE TIMINA POR UV
A-DNA
Z-DNA
EN PRESENCIA DE ALTAS
CONCENTRACIONES DE
CATIONES
ALTERNANCIA DE PURINAS Y
PIRIMIDINAS
ES LEVÓGIRA 12 pb POR
VUELTA: 45 A
SUPERENROLLAMIENTO
FORMA MAS COMPACTA QUE FACILITA EL
EMPAQUEAMIENTO
DEXTRO
LEVO
¿ESTRUCTURA TERCIARIA?
EL DNA DE EUCARIOTAS
Formado por cromosomas donde se acomplejan DNA lineal y proteínas
Cada cromosoma contiene una única cadena lineal de 107-109 pb.
Muchos son organismos diploides (el hombre 23 pares).
El contenido de una célula humana es de 8 x 109 pb
Equivale a 3 metros de longitud.
Están en el núcleo formando parte de la cromatina.
La cromatina es el complejo DNA-proteínas
Controlan la expresión génica
Permite la compactación del DNA
La eucromatina puede corresponder a dominios relajados donde se produce la
transcripción.
EL GENOMA DE LOS EUCARIOTAS
Es mucho mayor que el de los procariotas. El del DNA satélite- Repeticiones en tandem (ATAAACT)n
hombre es 1.000 veces mayor que el de E. coli. que no codifican ni se transcriben. Pueden servir para
la unión de las proteínas del huso mitótico.
Solamente se expresa el 5-10%.
Duplicaciones génicas- Repeticiones genicas que
Codifica para 20.000-25.000 genes permiten la producción elevada de determinados
tránscritos (genes de rRNA, tRNA, histonas,…)
DNA PLASMÍDICO
Vectores de transformación con autonomía replicativa PROPIEDADES DEL DNA
DISPOSICIÓN FUNCIONAL DEL DNA Es ácido
Rígido y viscoso
Genes estructurales
Se desnaturaliza y renaturaliza
Secuencias reguladoras
Efecto hipercrómico
Operones
Viscosidad
Metabolones
Son más resistentes y estables que las proteínas
Proteínas inducibles Son frágiles
Proteínas constitutivas Sensibles a nucleasas
RNA
CADENA DE RIBONUCLEOTIDOS A, G,U,C
TIPOS DE RNA
RNA mensajero
RNA ribosómico
Participa en la síntesis de proteínas
Es el más abundante (80% del total)
Derivan del DNA
Disposicíon pseudoduplohelicoidal (70%)
Difieren en tamaño y densidad (ribosomas)
Procariotas: 50S (23S, 5S, más de 30 proteínas)
30S (16S, más de 20 proteínas)
Eucariotas: 60S (28S, 5,8S, 5S, más de 50 proteínas)
40S (18S, más de 30 proteínas)
Algunos poseen actividad enzimática
Ribozimas (presentes en la subunidad
mayor del ribosoma)
PROPIEDADES DEL RNA
Es ácido
Menos viscoso pero más denso Soluble en soluciones salinas diluidas
Posee efecto hipercrómico Son más resistentes y estables que las proteínas
Sensibles a nucleasas
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
LOS LÍPIDOS
Bioquímica 2º Curso
INTRODUCCIÓN
Grupo de moléculas principal presentes en la células
No son poliméricas. Se agregan
Mayor variedad estructural
Concepto de Lípido
Los lípidos son biomoléculas orgánicas formadas básicamente por carbono e
hidrógeno y generalmente también oxígeno; pero en porcentajes mucho más
bajos. Además pueden contener también fósforo, nitrógeno y azufre
Según su composición
Los lípidos se clasifican en dos grupos, atendiendo a que
posean en su composición ácidos grasos (Lípidos
saponificables) o no lo posean ( Lípidos insaponificables ).
Lípidos saponificables
Lípidos insaponificables
Simples
Terpenos
Acilglicéridos
Céridos Esteroides
Complejos Prostaglandinas
Fosfolípidos
Glucolípidos
Según su complejidad
Lípidos Simples Lípidos Complejos
Glicéridos Fosfolípidos
Céridos Glicolípidos
Estéridos Terpenos
Prostaglandinas
ÁCIDOS GRASOS
ÁCIDOS GRASOS
Hexanoico Aceite de
Octanoico Aceite de
Coco -- 5,5 a 9,9%
H-(CH2)7 -CO-O- H Palma -- 3 a 4%
Caprico Aceite de
ÁCIDOS GRASOS
Laurico Aceite de
Coco -- 44 a 52%
H-(CH2)11 -CO-O- H Palma -- 46 a 52%
Miristico Aceite de
Algodón -- 0,5%
Soja -- 14%
H-(CH2)13 -CO-O- H Sésamo -- 0,1%
Coco -- 13 a 19%
Palma -- 14 a 17%
Palmítico Aceite de
Algodón -- 21,9%
Soja -- 14%
H-(CH2)15 -CO-O- H Sésamo -- 8,2 a 9,4%
Coco -- 7,5 a 10,5%
Palma -- 6,5 a 9%
ÁCIDOS GRASOS
Estearico Aceite de
Algodón -- 1,9%
Sésamo -- 3,6 a 3,7%
H-(CH2)17 -CO-O- H Coco -- 1 a 3%
Palma -- 1 a 2,5%
Araquidico Aceite de
Algodón -- 0,1%
Sésamo -- 0,8 a 1,2%
H-(CH2)19 -CO-O- H
Coco -- 0 a 0,4%
Oleico Aceite de
Algodón -- 30,7%
C 17 H33 -CO-O- H Sésamo -- 35 a 45%
Cis-9 Coco -- 5 a 8%
Palma -- 13 a 19%
Soja -- 23%
ÁCIDOS GRASOS
Linoleico Aceite de
Algodón -- 44,9%
Sésamo -- 40 a 48%
C 17 H31 -CO-O- H
Coco -- 1,5 a 2,5%
Cis-9 Cis-12
Palma -- 0,5 a 2%
Soja -- 35%
Linolénico Aceite de
Soja -- 8%
C 17 H29 -CO-O- H
Cis-9 Cis-12 Cis-15
Araquidónico
Aceite de
C 19 H29-CO-O- H Algodón -- 0,1%
Cis-5 Cis-8 Cis-11 Cis-14
REACCIONES DE LOS ÁCIDOS GRASOS
Saponificación
LÍPIDOS SIMPLES
Son lípidos simples formados por la esterificación de
una, dos o tres moléculas de ácidos grasos con una
Glicéridos molécula de glicerina. También reciben el nombre de
glicéridos o grasas simples
MONOGLICÉRIDOS
DIGLICÉRIDOS
TRIGLICÉRIDOS
H-(CH2)n -CO n de 12 a 20
Céridos (Ceras)
H-(CH2)n´ - O n´ de 19 a 31
Las ceras son ésteres de ácidos grasos de cadena larga, con alcoholes
también de cadena larga. En general son sólidas y totalmente insolubles
en agua. Todas las funciones que realizan están relacionadas con su
impermeabilidad al agua y con su consistencia firme. Así las plumas, el
pelo , la piel, las hojas, frutos, están cubiertas de una capa cérea
protectora.
Estéridos Los estéridos, mayoritariamente de
origen eucariota son derivados del
ciclopentanoperhidrofenantreno, un
compuesto con cuatro anillos
fusionados no polares
Ésteres de
Colesterol
Ácidos biliares
Glicina
Hormonas esteroideas
Como ejemplo el Cortisol (C21). Afectan
Glucocorticoides
al metabolismo de glúcidos, proteínas
y lípidos. Relacionados con la
inflamación y el estrés
Mineralocorticoides
Regulan la excreción de sal y agua por
los riñones
Cortisona
Andrógenos y estrógenos
Afectan al desarrollo y a la función sexual
MINERALOCORTICOIDES
Hormonas
esteroideas Pregnenolona
Aldosterona
GLUCOCORTICOIDES
Cortisol
ANDROGENOS ESTROGENOS
Androstenediona Estrona
Testosterona Estradiol
Dihidrotestosterona
LÍPIDOS COMPLEJOS
Son lípidos saponificables en cuya estructura molecular además de
carbono, hidrógeno y oxígeno, hay también nitrógeno, fósforo, azufre o
un glúcido.
Son las principales moléculas constitutivas de la doble capa lipídica de la
membrana, por lo que también se llaman lípidos de membrana. Son
también moléculas anfipáticas
Fosfolípidos Esfingolípidos
Glicolípidos
Fosfolípidos
IMPORTANCIA BIOLOGICA
-
Fosfolípidos
FOSFOGLICÉRIDOS
Ácido fosfatídico
Lecitina o fosfatidilcolina
Cefalina o fosfatidiletnolamina
Inositol
Fosfatidilserina
Fosfatidilinositol
Esfingolípidos
NH2
Ceramidas o acilesfingosinas
NH
–
CO
–
R
Fosfoenfingosinas
Fosofoesfingolípidos
–
CH3 – (CH2)12 – CH –– CH – CHOH – CH – CH2 – O – P ––O
–
–
NH O
–
–
CO CH2
CH2
–
R CH3- N-CH3
CH3
Glicoesfingolípidos.
Cerebrósidos.
Globósidos
Gangliósidos.
Cerebrósido con NANA
CH -O- CH2
CH O
H-(CH2)n´ -CO-O- CH2
CHOH CHOH
CHOH-CHOH
Eicosanoides
Prostaglandinas
La familia incluye varios miembros: PGD2, PGE2, PGF2…
que actúan a través de diversos receptores
Tromboxanos
Se producen en la plaquetas. Incluye varios miembros como A2, B etc.
que actúan a través de diversos receptores
Leucotrienos
Se aislaron pro primera vez de los leucocitos. Inclye miembros como
LTC4, LTD4, LTE4 … que actúa a través de diversos receptores
Vitamina A (retinol)
Vitamina D
Vitamina E (tocoferol)
Vitamina K
Lipoproteínas
Colesterol (libre)
Apoproteínas
Triglicéridos
Colesterol (éster)
Esquema de la
estructura de una
Núcleo lipoproteína
Membrana de lípidos
GLÚCIDOS
INTRODUCCIÓN
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García FUNCIONES E IMPLICACIONES DE LOS GLÚCIDOS
REPRESENTACIÓN ESTEREOQUÍMICA-
CONFIGURACIÓN
Bioquímica 2º Curso
INTRODUCCIÓN
FUNCIONES E IMPLICACIONES DE LOS GLÚCIDOS
CLASE PRINCIPAL DE BIOMOLÉCULAS
ALMIDÓN
75% DE LA MATERIA ORGÁNICA ALMACENAMIENTO DE ENERGÍA GLUCÓGENO
AMINOÁCIDOS
SU ESTUDIO SE HA RETRASADO INTERMEDIARIOS METABÓLICOS LÍPIDOS
TAMAÑO CELULOSA
SON HETEROGENEOS COMPOSICIÓN ELEMENTOS ESTRUCTURALES QUITINA
POLIS. BACT.
SÍNTESIS DE OTRAS MOLECÚLAS
DIFÍCIL CARACTERIZAICÓN
ATP DNA
NO TIENEN MOLDE DE INFORMACIÓN GÉNICA RNA GLICOPROTEÍNAS
GLICOLÍPIDOS
MANANO
POLIMONOSACÁRIDOS EN SUFIJO ANO GLUCANO
XILANO
EXCEPCIONES ALMIDÓN, QUITINA, DEXTRINA
RIBOSA RIBULOSA
XILOSA XILULOSA
FILIACIÓN DE LAS OSAS ALDOSAS
TRIOSAS
TETROSAS
PENTOSAS
HEXOSAS
D si OH a la Derecha
Fischer y Rosanoff 1891(D y L)
L si OH a la Izquierda
Bigvoet 1951
CICLACIÓN DE LOS MONOSACÁRIDOS
CETOSAS
Cada cetosa n-3
En todas las aldosas (pentosas o hexosas) se genera un
isómeros ópticos
hemiacetal entre el aldehído y el alcohol del último átomo de
carbono asimétrico.
Hemiacetal: función que se produce al reaccionar un alcohol con
un aldehído.
REPRESENTACIÓN ESTEREOQUÍMICA-
CONFIGURACIÓN
Ciclación de monosacáridos Derivados de las hexosas
Anómeros • Aminoazúcares
Ej. C2 de la glucosa OH---NH2 GLUCOSAMINA
• Desoxiazúcares
Ej. C6 de la glucosa OH---CH3 FUCOSA
• Oxidación del carbono aldehídico (ácidos aldónicos)
Ej C1 de la glucosa GLUCONATO
• Oxidación del carbono C6 (ácidos urónicos)
Ej C6 de la glucosa GLUCURONATO
• Derivados fosforilados (importantes en el metabolismo)
Ej. GLUCOSA-6-P, Gliceraldehido 3-P, DHAP
Biosíntesis de aminoazúcares activados Conversión N-acetil glucosamina 6 P
en N-acetil glucosamina 1 P
Frc 6P + Glutamina Glcosamina 6P + glutámico
Aminotransferasa
Síntesis de Lactosa
1. Galactosiltransferasa:
que transfiere UDP- Gal a
N-acetil-glucosamina
generando N-
acetillactosamina.
-lactoalbúnica: de la
glándula mamaria que altera a
la galactosiltransferasa para
que utilice como aceptor la
glucosa para dar lactosa
DISACÁRIDOS
DISACÁRIDOS Glucógeno
POLISACÁRIDOS
Almidón (amilosa)
ESTRUCTURA DE LA CELULOSA
Almidón (amilopectina)
LAS GLICOPROTEÍNAS
QUITINA
Glucocalix del eritrocito
PAREDES BACTERIANAS
Modelo dinámico del
oligosacárido en la
ESTRUCTURA DEL PROTEOGLICANO Ribonocleasa B (Rnasa B
DEL CARTÍLAGO BOBINO . Conformaciones
permitidas del
oligosacárido Man5 NAG2
que está unido a un único
sitio sobre la proteína
BIOSÍNTESIS DE GLICOPROTEÍNAS
N-GLICOSILACIÓN
FIJACIÓN N-GLICOSÍDICA FIJACIÓN O-GLICOSÍDICA
FIJACIÓN DE GPI
PROCESAMIENTO DE LOS
OLIGOSACÁRIDOS DE LAS
GLICOPROTEÍNAS
Tipos de N-oligosacáridos SÍNTESIS DE UN O-OLIGOSACÁRIDO
Biosíntesis de oligosacáridos de los grupos sanguíneos PROPIEADES QUÍMICAS DE LAS OSAS
PROPIEDADES GENERALES
SOLUBLES EN AGUA
POCO SOLUBLES EN ETANOL
ESPECTRO IR CARACTERÍSTICO
NO ABSORBEN LA LUZ UV
SE IDENTIFICAN POR:
PODER ROTATORIO
COMPORTAMIENTO CROMATOGRÁFICO
FORMACIÓN DE ÉSTERES
FORMACIÓN DE ÉTERES-ÓXIDOS
ACETILACIÓN DE LOS HIDROXILOS
OXIDACIÓN DEL ALCOHOL PIRMARIO
Distribución: Muy distribuidas, desde las bacterias hasta los organismos más
evolucionados.
-En un tipo de células (pepsina) o en múltiples células
-Asociadas a orgánulos (fosforilación oxidativa)
-Fracción soluble (glucolisis)
-Asociadas a estructuras (ATPasa).
Componentes físicos:
- Sitio de unión al sustrato
Sitio activo
- Sitio catalítico
- Sitio alostérico
+
Enzima Sustrato
Holoenzima
Centro o sito activo
Especificidad: Capacidad de la enzima para modelar su estructura proteica.
Característica clave en el control metabólico.
Dos tipos:
1.- Esteroespecificidad: Determina isómeros.
2.- Especificidad geométrica: Diferencia identidades de grupos químicos.
ENERGÍA DE ACTIVACIÓN
ENERGÍA DE ACTIVACIÓN
Modelo comparativo de la disminución de la energía de activación por la acción de la
enzima.
1) La reacción no se
produce pues hace falta
Enzima una energía de activación
para que transcurra
espontáneamente.
Substrato
2) La enzima disminuye o
elimina la energía de
activación necesaria y la
reacción transcurre
espontáneamente.
Producto
CINÉTICA ENZIMÁTICA
Cinética enzimática:
Estudia la velocidad del cambio del estado inicial de los reactantes a su estado final y
los factores que la modifican.
Velocidad de reacción:
Cambio de concentración de sustrato y producto en la unidad de tiempo (cantidad de
producto generado en la unidad de tiempo).
[S6]
[S5]
[S4]
Producto
[S3]
[S2]
[S1]
Tiempo
Factores que afectan a la velocidad de reacción.
V V
[E] [S]
ORDEN DE REACCIÓN
(V1) (V2)
K1 K2
E+S E-S E+P
K-1
(V-1)
Vmax x [S]
V = Km + [S]
ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN
(V1) (V2)
K1 K2
E+S E-S E+P Vmax x [S]
V = Km + [S]
K-1
(V-1)
Representación de Michaelis-Menten Representación de Lineweaver-Burk
V
Vmax
1 Vmax
Km 1 Km
= . 1 + 1
V Vmx [S] Vmx
Modulación de la actividad enzimática: Regulación enzimática
EI [I]
1/Vmx
- Inhib
-1 1/[S]
-1/Km Km 1+ [I] Ki
Vmx [S]
V= 1 Km [I] 1 1
[I] = 1+ +
Km 1+ + [S] V Vmx Ki [S] Vmx
Ki
2.- No competitiva: El inhibidor retrasa la formación del
complejo ES
K1 K2
E+S ES E+P
+ K-1 +
I I
Ki Ki
EI + S ESI
1/V
[I]
1
1+ [I] Ki
Vmx
- Inhib
1/[S]
-1/Km
Vmx
[I] [S] 1 Km [I] 1 1 [I]
1+ Ki = 1+ + 1+
V= V Vmx Ki [S] Vmx Ki
Km + [S]
Inhibidor competitivo Inhibidor no competitivo
3.- Incompetitiva: El inhibidor se une a ES pero no a E.
K1 K2
E+S ES E+P
K-1 +
I
Ki
ESI
V
Vmx - Inhib
1/V [I]
Vmx1
[I]
- Inhib
1
1+ [I] Ki
Vmx
Km Km1
[S]
-1 1/[S]
Km 1+ [I] Ki -1/Km
Vmx [S]
V=
Km + 1+
[I]
[S] 1 Km 1 1 [I]
Ki = + 1+
V Vmx [S] Vmx Ki
Modificación covalente:
➢ Mecanismo ping-pong
ENZIMAS
ALOSTERICAS
Enzimas alostéricas
inhibitor
Activador alostérico: favorece la Inhibidor alostérico: impide la unión
unión del sustrato del sustrato
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
TÉCNICAS DE
SEPARACIÓN Y ANÁLISIS
DE BIOMOLÉCULAS
Bioquímica 2º Curso
ESTRATEGIA GENERAL
-Fraccionamiento
-Reducir pérdidas de nuestra proteína
-Eliminar selectivamente otros componentes
Bacterias Precipitado
Elección de órgano Purificar
Eucariotas unicelulares
-Lisis osmótica
Extracción Precipitado -Digestión enzimática
-Detergentes
-Disolventes orgánicos Acetona
Células Lisis o Tolueno
-Crioruptura
ruptura
-Ruptura mecánica
Filtrado o
Centrifugación Descartar
Precipitado
Molino de bolas
Citosol Ultracentrifugación
Sobrenadante Batidoras
Orgánulo Membrana
French Press
Sonicación
Sobrenadante Membranas Potter
Purificar Solubilizar
HOMOGENEIZACIÓN Y/O EXTRACCIÓN PROTEICA
Homogeneización total
Homogeneización diferencial (separación de orgánulos)
Métodos de homogeneización
-Sonicación
-Mecánicos
-Congelación
Potter
-Choque osmótico
Molino de bolas
-Choque térmico
Batidora (Omnimixer)
-Detergentes (tritón)
Politron
-Disolventes orgánicos (tolueno)
Prensa de French
PRECIPITACIONES FRACCIONADAS
D. EFECTO DE LA TEMPERATURA
Desnaturalización
Ruptura de interacciones no covalentes entre los aminoácidos
E. EFECTO DE DETERGENTES
Agentes tensoactivos -Iónicos
-Catiónicos -
Aniónicos
F. CRISTALIZACIÓN -No iónicos
Fenómeno por SOBRESATURACIÓN
No es criterio de pureza
LOWRY
Reactivo de Folin
Reacciona con Tyr y en menor medida con Trp, Cys e His
Color azul
Cuantificación a 750 nm
ULATRAVIOLETA BRADFORD
Reacciona con TRP, Tyr y Phe Azul de Coomassie
Cuantificación a 280 nm Reacciona con enlaces peptídicos
Color azul
Cuantificación a 595 nm
TINCIÓN POR PLATA
TINCIÓN POR ROJO PONCEAU
TINCIÓN POR AZUL ALCIAN (Glicoproteínas)
TINCIÓN POR CARBOCIANINA CATIÓNICA
-Metodos espectrofotométricos
Sustratos, productos o ligandos que absorben a determinadas
longitudes de onda.
-Métodos fluorimétricos
Sustratos, productos o ligandos que absorben y emiten a
diferentes longitudes de onda (10 veces más sensibles).
-Métodos radioquímicos
Proteínas, sustratos, productos o ligandos marcados
radiactivamente (100 veces más sensibles).
Marcado por fotoafinidad.
-Métodos inmunoquímicos
Por reacción Ag-Ac (hasta 1000 veces más sensibles).
-Otros
Inmovilización, solubilidad, densidad, color, afinidad, etc.
CRITERIOS DE PUREZA EN PROTEÍNAS
CRITERIO DE SOLUBILIDAD
CRITERIO DE ULTRACENTRIFUGACIÓN
CRITERIO CROMATOGRÁFICO
CRITERIO ELECTROFORÉTICO
CRITERIO BIOLÓGICO
CRITERIO QUÍMICO
TABLA DE PURIFICACIÓN
SISTEMAS DE PURIFICACIÓN
Purificación analítica
Purificación preparativa e industrial
FPLC
LA CROMATOGRAFÍA
Khromatos Graphoos ● Tswett (1903). Cromatografía de adsorción
● Kuhn y Lederer (1930). Cromatografía de adsorción
Color Escrito ● Izmailov y Sharaiber (1938). Cromatografía en capa fina
● Martin y Siynge (1941). Cromatografía de reparto
GENERALIDADES ●Gonsden, Gordon y Martin (1943). Cromatografía en papel
● Separación de sustancias
● Distribución de componentes
A
FASE ESTACIONARIA. FASE MÓVIL
● Fundamento B
-Remoto: Propiedades físico o físico-químicas
FASE FASE
-Solubilidad -Adsorción MÓVIL ESTACIONARIA
-Volatilidad -Tamaño
-Carga -Reactividad (Química y Bioquímica)
-Próximo: Imposibilidad de que dos sustancias distintas presenten todas las características iguales en los mismos
sistemas cromatográficos
CROMATOGRAFÍA DE ADSORCIÓN
FASE ESTACIONARIA → SÓLIDO
Alúmina Gel de sílice Otros
FASE MÓVIL
Gas Líquido
SEPARACIÓN ● Uno de los componentes es más intensamente adsorbido por
el sólido que otros
● FENÓMENO DE SUPERFICIE
CROMATOGRAFÍA DE REPARTO
FASE ESTACIONARIA → LÍQUIDO (H2O)mantenido en un soporte
FASE MÓVIL
●LÍQUIDO: Saturada de FE resultando dos fases
inmiscibles
●GAS
SEPARACIÓN
Fase
DISTRIBUCIÓN EN CONTRACORRIENTE: móvil
Desarrollo
Ampolla de decantación
FE: Tubos enlazados
FLUJO
MUESTRA propiciado por
CAPILARIDAD
CROMATOGRAFÍA EN PAPEL
CROMATOGRAFÍA EN COLUMNA
ELUCIÓN Y RECOGIDA DE FRACCIONES
EMPAQUETADO RESERVORIO
COLUMNA f. móvil
LECHO
CROMATOGRÁFICO
f. estacionaria APLICACIÓN
MUESTRA
COLUMNA MUESTRA
FLUJO
gravedad
llave DIFUSIÓN
SEPARACIÓN
FRACCIONES
Espectrofotométrico
ANÁLISIS DEL
CONTENIDO DE LAS
FRACCIONES Abs 280nm – Proteínas
Otras Abs - Colorantes
1 2 3 4 5 6 7 8 9
PERFIL DE ELUCIÓN
Moléc. distribuida
en f.móvil
Moléc. distribuida
en f.estacionaria
respuesta del detector
1 2 3 4 5 6 7 8 9
fracción
•Gradiente de pH CROMATOGRAFÍA DE INTERCAMBIO IÓNICO
•Gradiente salino
Molec. MENOR CARGA (+)
RÁPIDAS
APLICACIÓN
PERFIL DE ELUCIÓN
MUESTRA q+
Q+
ELUCIÓN
Na+
-
1 2 3 4 5 6 7 8 9
fracción
1 2 3 4 5 6 7 8 9
fracción
CROMATOGRAFÍA DE AFINIDAD
Se unen al ligando de la f.
estacionaria.
Elución específica.
PERFIL DE ELUCIÓN
ELUCIÓN
LAVADO ESPECÍFICA
LAVADO
ELUCIÓN
ESPECÍFICA
1 2 3 4 5 6 7 8 9
TIPOS DE GELES
CONJUNTO DE TÉCNICAS QUE PERMITEN
ELECTROFORESIS SEPARAR MOLÉCULAS CARGADAS AL SER
F = E/d x q SOMETIDAS A UN CAMPO ELÉCTRICO.
ELECTROFORESIS EN PAPEL
ELECTROFORESIS EN AGAROSA
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García INTRODUCCIÓN
BIOENERGÉTICA
OXIDACIONES BIOLÓGICAS
INTRODUCCIÓN
RENDIMIENTOS ENERGÉTICOS
ATP COMO MONEDA ENERGÉTICA
CONTROL METABÓLIC0
ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
CONCENTRACIÓN ENZIMÁTICA
COMPARTIMENTALIZACIÓN
Bioquímica 2º
BIOENERGÉTICA
INTRODUCCIÓN Las células necesitan de energía para poder realizar sus
REACCIONES QUÍMICAS actividades de desarrollo, crecimiento, renovación de sus
estructuras, síntesis de moléculas, etc.
UNA REACCIÓN CADA VEZ
La energía química que utiliza una célula animal
REACCIONES CELULARES para realizar trabajo proviene principalmente de la
oxidación de sustancias incorporadas como
alimentos. (carbohidratos, grasas)
REACCIONES SECUNDARIAS
SUSTRATOS Y PRODUCTOS Al producirse una transformación química, generalmente
OPTIMIZACIÓN se rompen enlaces y el contenido de energía de las
MILES DE REACCIONES SIMULTÁNEAS moléculas aumenta o disminuye. (G aumenta o
disminuye)
BIOENERGÉTICA
La “moneda” de intercambio de Energía en los
Estudio de las transformaciones de energía que procesos biológicos es el ATP
tienen lugar en la célula, y de la naturaleza y
función de los procesos químicos en los que se
basan esas transformaciones, las cuales siguen
las leyes de la termodinámica OXIDACIÓN-FUENTE DE ENERGÍA
MONÓMEROS
POLÍMEROS
INTERMEDIARIOS METABÓLICOS
OXIDACIONES BIOLÓGICAS EQULIBRIO QUÍMICO
SON COMBUSTIONES
CALORÍMETRO
Reacción directa (1): V1= k1[A][B]
Desde el punto de vista energético, una reacción con un G El ATP a pH fisiológico se encuentra como ATP4-. Las
positivo no podría ocurrir a no ser que exista un aporte de 4 cargas negativas se encuentran próximas y
energía que la haga posible. originan tensiones intramoleculares que
desaparecen al hidrolizarse en ADP+Pi o AMP+PPi.
Dicho aporte, lo proveen compuestos de alto contenido
energético, que se caracterizan por tener enlaces que al Los productos de la hidrólisis se solvatan mejor y se
romperse liberan una alta cantidad de energía. Este proceso estabilizan por resonancia contribuyendo a disminuir
se llama acoplamiento. G y desplazando la reacción hacia la derecha
Energía libre de la
hidrólisis de enlaces
fosfato del ATP y otros
enlaces fosfato
metabólicamente
relevantes
REACCIONES ENERGÉTICAMENTE ACOPLADAS
METABOLISMO INTERMEDIARIO
Una reacción altamente exergónica
puede hacer que otra endergónica
ocurra si ambas se acoplan ALMACENAMIENTO Y Biosíntesis de ác. Nucleicos
Gº’(kcal/mol) GÉNESIS DE ENERGÍA Biosínteis de proteínas
nombre
METABOLISMO ENERGÉTICO
ATP ADP + P -7,3
ADP AMP + P -7,7 RUTAS CENTRALES
AUTÓTROFOS
A C Gºac
BIOCHEMICAL PATHWAYS
http://www.expasy.org/cgi-bin/show_thumbnails.pl
METABOLISMO METABOLISMO
GLUCOLISIS DE AMINOÁCIDOS DE LÍPIDOS Y
ESTERIORIDES
METABOLISMO
OXIDATIVO
Rutas metabólicas
ANABOLISMO DE FOTOSÍNTESIS
HIDRATOS DE CARBONO
Características:
CONCENTRCIÓN DE SUSTRATO
CONTROL ALOSTÉRICO
MODIFICACIÓN ENZIMÁTICA ADENLACIÓN
FOSOFORILACIÓN
ADENILACIÓN
ADP-RIBOSILACIÓN
ADP-RIBOSILACIÓN
C0NCENTRACIÓN
ENZIMÁTICA
SINTESIS ENZIMÁTICA
DEGRADACIÓN ENZIMÁTICA INDUCCIÓN
REPRESIÓN Compartimentalización
COMPARTIMENTALIZACIÓN
PROCARIOTAS
EUCARIOTAS
AUMENTO DE EFICACIA
FUNCIÓN REGULADORA
Permeabilidad
No difusión
Complejos multienzimáticos
CONTROL METABÓLIC0 CONTROL METABÓLIC0
ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
CONCENTRCIÓN DE SUSTRATO
CONTROL ALOSTÉRICO
MODIFICCIÓN ENZIMÁTICA Control hormonal
FOSOFORILACIÓN
ADENILACIÓN
ADP-RIBOSILACIÓN
C0NCENTRACIÓN
ENZIMÁTICA
Transducción de señal
SINTESIS ENZIMÁTICA
DEGRADACIÓNENZIMÁTICA INDUCCIÓN
REPRESIÓN AMPc
Segundos mensajeros Fosfoinositol
COMPARTIMENTALIZACIÓN Ca
PROCARIOTAS
EUCARIOTAS
Modificación de la expresión génica
AUMENTO DE EFICACIA
FUNCIÓN REGULADORA
Permeabilidad
No difusión
Complejos multienzimáticos
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
GLUCOLISIS
Bioquímica 2º Curso
GLUCOLISIS
INTRODUCCIÓN
REACCIONES DE LA GLUCOLISIS
BALANCE ENERGÉTICO
REGULACIÓN DE LA GLUCOLISIS
INHIBIDORES DE LA GLUCOLISIS
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
INTRODUCCIÓN
RUTA CENTRAL DEL CATABOLISMO DE GLÚCIDOS
Glycos---DULCE
GLUCOLISIS Lysis-----LIBERACIÓN
VISIÓN GENERAL
GLUCOSA 2 PIRUVATO
10 Reacciones
2 ATP
2 NADH
ATP Fermentación
Aeróbica Piruvato homoláctica
Ciclo de Krebs
Y fosforilación Fermentación Calor
oxidativa alcohólica Anaeróbica
Calor
Anaeróbica
Etanol
Lactato
REACCIÓN GLOBAL
HÍGADO
MÚSCULO Y CORAZÓN
REACCIONES DE LA GLUCOLISIS
Hexoquinasa
Inespecífica
En hígado Glucoquinasa
Mecanismo bi-bi al azar
Plegamiento inducido
AGº’= -16,7 kJ/mol
Plegamiento inducido
Fosfoglucoisomerasa
Mecanismo:
1. Entra la G6P
AGº’= +1,7 kJ/mol
2. Ácido de la Lys abre el anillo.
3. Base (Imidazol de la His) capta H+ del
C2. Intermediario cis-enediolato.
4. El protón se coloca en C1
5. Cierre del anillo para formar el
producto
Fosfofructoquinasa
Mediciones en músculo
AG’º= -1,3 kJ/mol
Estereoespecífica
Participación de un Glu y de
una His.
Formación de un
intermediario enediolato
Gliceraldehido-3-fosfato deshidrogenasa
1 4 5
3
2
Fosfoglicerato quinasa
Fosfoglicerato mutasa
Piruvato Quinasa
BALANCE ENERGÉTICO
A) Hexoquinasa y glucoquinasa
B) Fosfofructoquinasa
C) Piruvato quinasa
Hexoquinasa y glucoquinasa
Hexoquinasa
Km = 0,1 mM
Inhibida por su producto
Funciona en el cerebro
Glucoquinasa
Km = 10 mM
No inhibida por su producto
Activada por Frc 6P y por Frc 1P
Efecto tampón de concentración de
Glc ( en sangre 5 mM)
Funciona en el hígado
Su acción se contrarrestra con la
Glc 6 Pasa
Es inducible por la insulina----
Respuesta lenta
Fosfofructoquiasa
Regulación:
Estado energético
Ambiente celular
Disponibilidad de combustibles
Regulación hormonal
Alta concentración de O2
Ciclo de Krebs
k’eq [ADP]2
[AMP] = Alta[AMP] inhibe la Frc 1,6 biPasa
[ATP]
Ambiente Celular
Acidosis láctica
Cesar ejercicio
Nitrogliceriana
Bloquedadores -adrenérgicos
Control hormonal
Mediadores
Fructosa 2,6
bifosfato
Fosfofructoquinasa 1
Fosfofructoquinasa 2
Efecto del Glucagón sobre la Glucolisis
Piruvato quinasa
Nucleótidos
G 1P
Pentosas
OTROS GLÚCIDOS EN LA RUTA fosfato
Amino Glicolípidos
Azuc. Glicoproteínas
Lípidos
Glicerol-3
fosfato
2,3 BPG
Serina
Aminoácidos aromáticos
Asp Pirimidinas
Asn
Alanna
Glicerol
Fructosa
Galactosa
Lactosa
INHIBIDORES DE LA GLUCOLISIS
2-Desoxiglucosa
Es sustrato de la hexoquinasa que la convierte en 2-
DesoxiGlc 6P pero no es sustrato de la
fosfoglucoisomerasa
Arsenico
GLUCOGENOLISIS
Bioquímica 2º Curso
GLUCOGENOLISIS
FOSFORÓLSIS
GLUCÓGENO FOSFORILASA
GLUCOSIDASA
GLUCOGENOGÉNESIS
Bioquímica 2º Curso
UDP-GLUCOSA
Glucógeno sintasa
Glucógeno sintasa
El cebador de la glucógeno sintasa es una cadena corta de
residuos de glucosa ensamblados por una proteína
denominada glucogenina:
+ GLUCOGENINA
Tyr194
Protein-Tyr
glucosil
transferasa
UDP Glc-Glucogenina
GLUCOGENINA
Glucógeno sintasa
Tyr194
…
REGULACIÓN DE LA GLUCOGENOGÉNESIS
INACTIVACIÓN DE LA GLUCOGENOGENESIS
Sintasa A Sintasa B
P
METABOLISMO DEL GLUCÓGENO HEPÁTICO Y
CONTROL DE LA GLUCEMIA
Cuando se suministra
glucosa, la actividad de
la glucógeno fosforilasa-
A hepática disminuye
rápidamente y, después
de un tiempo (o tiempo
de latencia) aumenta
rápidamente la actividad
glucógeno sintasa.
DOBLE CAMINO
Ciclo de Cori
GLUCONEOGÉNESIS
No se genera NADH
6ATPhig+ 2(ADP +Pi)hem 6(ADP+ Pi)hig + 2ATP hem
Bioquímica 2º Curso
CORI GLUCOLISIS
Ciclo de la alanina Ciclo de Cori
Muchas
reacciones son
inversas a las
de la glucolisis:
La de la Lactato
Deshidrogenasa
Otras reacciones no
son reversibles en
Si se genera NADH
condiciones
intracelulares:
6 ATP: Lanzadera Malato-Aspartato
Piruvato Quinasa
4 ATP: Lanzadera Glicerol Fosfato vía FADH2 Fosfofructoquinasa
Hexoquinasa
10ATPhig+ 6,8(ADP +Pi)mus 10(ADP+ Pi)hig + 6,8ATP mus
ALANINA GLUCOLISIS
Piruvato Fosfoenolpiruvato
Ciclo de Cori
2 REACCIONES Gasta 1 ATP
PIRUVATO Precisa CO2
Es MITOCONDRIAL
PYR CARBOXILASA
OXALACETATO
PEP CARBOXIQUINASA
Gasta 1 GTP
FOSFOENOLPIRUVATO Genera CO2
Es MITOCONDRIAL Fosfoglicerato quinasa
y CITOSÓLICA Se gastan 2 ATP
GDP + ATP GTP + ADP
Nucleótido difosfoquinasa
Aminoácidos cetogénicos
Acetaldehido y Acetil CoA
Acetil CoA
Piruvato DH
Pyr + NAD + CoASH Acetil CoA + NADH + CO2
Glicerol
Fructosa
Galactosa Propionato Regulación de la Gluconeogénesis
Cilclos sustrato
OXIDACIÓN DEL PIRUVATO
Piruvato Acetil-CoA
Piruvato deshidrogenasa
O
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
CH3 – C – COO- + NAD+ + CoA-SH
OXIDACIÓN DEL O
AMP
Pirofosfato de Tiamina
COENZIMAS DE FLAVINA
Derivadda de la Vit B2: Riboflavina: FAD y FMN
FMN: Mononucleotido de flavina.
Anillo de Isialoxazina + Ribitol + Fosfato
FAD: FMN + Fosfato + Adenina
Niacina
COENZIMA A
2 TPP + Acetaldehido
En la Fermentación de la glucosa a etanol, el hidroxietil-
6 TPP generado se convierte en acetaldehido por acción
de la piruvato decarboxilasa de la levadura
1716-1794
Christian Eijkman
Casimir Funk
SEGUNDA MITAD DEL XX: Estudio de las vitaminas a
nivel estructural y de enfermedades carenciales.
IDEAS GENERALES CLASIFICACIÓN DE LAS VITAMINAS
Son sustancias orgánicas CARACTERÍSTICAS DE SOLUBILIDAD
Algunas se forman, aunque en poca cantidad, por la flora Es el grupo más abundante
intestinal (K, B1, B12) Solubles en soluciones acuosas
Se absorben intestinalmente con facilidad
La mayoría favorecen transformaciones esenciales Están íntimamente relacionadas
No participan en la formación de estructuras tisulares
NOMBRES NOMBRES
ergocalciferol, colecalciferol tocoferoles
FUENTE
FUENTE
Aceites vegetales con
El pescado graso y sus ácidos grasos
aceites. En menor proporción poliinsaturados (de soja,
los huevos, el hígado y la maiz, girasol) y sus
mantequilla. derivados. El germen de
La ingesta excesiva provoca trigo, las nueces.
hipercalcemia e Es termorresistente pero
hipercalciuria, el calcio se muy sensible a la luz y a
deposita en tejidos blandos la oxidación ambiental:
generando cálculos y lesiones importante su extracción.
renales.
VITAMINA K VITAMINA B1
NOMBRES NOMBRES
filoquinona, menaquinona Tiamina (B1).
y menadiona Pirofosfato de tiamina (TPP)
FUNCIÓN DEFICIENCIA
FUNCIÓN DEFICIENCIA Transferencia de aldehído. Beri-beri (pérdida de peso,
Coagulación sanguínea Es rara. Provoca hemorragias por Necesaria para metabolizar problemas de corazón,
dificultad en la coagulación y grasas, proteínas, ác. disfunciones neurológicas).
detención del crecimiento. nucleicos y principalmente Frecuente con dietas de arroz
carbohidratos blanco y harina o pescado
Es sintetizada por la flora
microbiana del tractol crudo. Absorción intestinal.
gastrointestinal (efecto antibióticos Las bacterias intestinales
y posibles carencias en recien generan parte de la misma.
nacidos). Se absorbe del mismo
modo que las anteriores
FUENTE
FUENTE Carnes, cereales integra-
les y legumbres. Pobre en
Especialmente abundante frutas y verduras
en la alfalfa y verduras (excepto guisantes).
con muchas hojas. En
La pasteurización,
menor proporción en
almacenamiento a Tª
aceites de colza y oliva,
ambiente y el hervido
en la yema de huevo y en
alteran su presencia
el salvado de cereales.
Es resistente al calor
pero sensible a la luz.
VITAMINA B2--- RIBOFLAVINA
VITAMINA B6
NOMBRES NOMBRES
Riboflavina (B2) Piridoxina (B6)
(color amarillo) (piridoxal, ácido piridóxico, piridoxamina)
Fosfato de piridoxal (PLP)
FUNCIÓN
Transferencia de grupo hacia
o desde los aminoácidos.
Participa en la formación de
FUNCIÓN DEFICIENCIA hormonas y de señalización DEFICIENCIA
Oxidación-reducción. Lesiones de la boca, dermatitis, del sistema nervioso. En el Su deficiencia es rara.
Participa en los procesos de fotofobia y opacidad corneal. metabolismo lipídico y en el
Se almacena en el músculo.
aprovechamiento de Debilidad y pérdida de apetito. del triptófano y formación de
niacina. Facilita la liberación Depresión, confusión,
componentes energéticos Se absorbe en el intestino (más convulsiones.
(oxidación de glucosa y en los hipotiroideos y menos en de glucógeno y la
ácidos grasos). los hipertiroideos) incorporación de Fe a la Hb. Absorción rápida por el
intestino delgado.
La hipervitaminosis es tóxica,
FUENTE FUENTE genera neuropatías sensoriales.
Carnes y lácteos. Carnes, pescados y
Vegetales verdes. huevos. Cereales
Estable al calor pero integrales y los
fotosensible. cacahuetes. Pobre en
lácteos, frutas y carne
roja.
Muy sensible a la luz.
La de vegetales se
absorbe menos y se
pierde (50%) por
congelación.
ACIDO FÓLICO NIACINA
NOMBRES NOMBRES
Ácido fólico Niacina (Ácido nicotínico y nicotinamida)
(folacina o folato) Forma parte de los coenzimas NAD y NADP
FUENTE
NOMBRES NOMBRES
Ácido pantoténi-co (Vit. B5) Cobalamina, Cianocobalamina
Forma parte de la Coenzima A Color rojo
FUNCIÓN
Transferencia de grupos
FUNCIÓN DEFICIENCIA metilo; reestructuraciones
intermoleculares.
Transferencia de grupos acilo. Es rara. Sintetizada parcialmente
En la síntesis de proteínas y
Necesario para el metabolismo por la flora intestinal. Genera
el metabolismo de
de los ácidos grasos alteraciones metabólicas
aminoácidos y ácidos grasos
(metabolismo energético). afectando al sistema nervioso ,
piel e hígado. Provoca DEFICIENCIA
hipertensión, náuseas y fatiga
generalizada. Anemia perniciosa, anemia, acidosis
metilmalónica. Trastornos
FUENTE neurológicos y alteraciones de la
división celular. Se absorbe en el
Abundante en tejidos intestino y se acumula en el hígado y
animales, cereales FUENTE riñón. Sintetizada por la flora
integrales, hongos, bacteriana en baja concentración
legumbres, nueces, Fuentes animales: hígado y
yema de huevo, etc. riñón, lácteos, huevos y
Muy estable. carne. Pescado graso y
moluscos. Es casi
inexistente en los vegetales.
Es muy sensible a la
pasteurización, la luz, pero
resiste la cocción.
VITAMINA C VITAMINA H
NOMBRES NOMBRES
Ácido ascórbico Biotina
FUNCIÓN DEFICIENCIA
FUNCIÓN DEFICIENCIA Carboxilación dependiente de Poco común. Provocada por el
ATP y transferencia del grupo consumo de clara de huevo
Antioxidante en conjunción Escorbuto (encías inflamadas y
carboxilo. En el metabolismo cruda (avidina). Genera alopecia,
con la vit. E. En la síntesis de sangrantes, hemorragias
de carbohidratos y ácidos dolor muscular, fatiga,
colágeno y otros subdérmicas, dolores
grasos. En la síntesis de dermatitis, aumento del
componentes. Aumenta las articulares. Mayor aporte en
glucógeno. colesterol. Posibles niveles
defensas del organismo fumadores, ancianos
bajos en ancianos, alcohólicos y
frente a las infecciones, la hospitalizados, alcohólicos
pacientes hemodializados o con
cicatrización de heridas, las crónicos, diabéticos, etc. Se
nutrición parenteral.
alergias, el cáncer, … absorbe por el intestino. Un
exceso provoca cálculos.
FUENTE
FUENTE
Unida a las proteínas de
Vegetales y frutas. la mayor parte de los
Menores en carnes y alimentos (carne,
pescados y nula en verduras, cereales,
cereales. Es muy sensible fruta, etc.).
al calor, al oxígeno y a la
Sensible a la oxidación.
presencia de metales.
Seguro en frutas enteras
y zumos recientes.
NECESIDADES VITAMÍNICAS
INGESTAS RECOMENDADAS DE VITAMINAS POR
PERSONA (IDR)*
Se buscan valores que determinen las cantidades necesarias
(Internacional Dosis Recomendada) pero éstas varían de un
individuo a otro como consecuencia de diferentes factores como: CATEGORÍA B1 B2 B6 B1 NIACI FÓLI C A D E K
NA CO
-El estado de desarrollo (mayor en los niños). 2
LACTANT 0,3- 0,4- 0,3- 0,3- 5-6 25-35 30- 375 7-10 3- 5-10
0,4 0,5 0,6 0,5 35 4
-La actividad física (el ejercicio físico requiere actividad ES
metabólica). NIÑOS 0,7-1 0,8- 1,0- 0,7- 9-13 50-100 40- 400- 10 6- 15-30
1,2 1,4 1,4 45 700 7
-Las drogas (los fumadores necesitan mayores VARONES 1,2- 1,4- 1,7- 2 15-20 150- 50- 1000 10 10 45-80
cantidades de vit. C). 1,5 1,7 1,2 200 60
Anticonceptivos orales con el ácido fólico, la vit. LACTANCIA 1,6 1,8 2,2 2,6 20 280 90 1300 10 10 65
C, B6 y B12.
Antibióticos de amplio uso neomicina y
tetraciclina con la K, A, D y B12.
Fármacos adelgazantes afectan a la absorción de
las vit. Liposolubles.
-La dieta (una ingesta elevada de ácidos grasos
poliinsaturados, omega 3 y 6, incrementa las necesidades de *Valores expresados en miligramos diarios excepto para el fólico,
vitamina E). la B12, A, D y K que se reflejan en microgramos.
CICLO DE
KREBS
Bioquímica 2º Curso
INTRODUCCIÓN
VISIÓN GENERAL
2 CO2
Acetil-CoA
8 Reacciones
GTP
3 NADH
CoA-SH
FADH2
8 REACCIONES
REACCIÓNES 1-4 :
GÉNESIS DE UN ANIÓN ORGÁNICO DE 6 C Y PÉRDIDA DE 2 CO2
REACCIONES 5-8:
REGENERACIÓN DEL OXALACEATO
REACCIONES DEL Citrato sintasa
CICLO DE KREBS
Malato
deshidrogenasa
Aconitasa
Fumarasa
Isocitrato
deshidrogenasa
Succinato
deshidrogenasa
-Cetoglutarato
deshidrogenasa
Succinil CoA
sintetasa
Citrato sintasa
Isocitrato deshidrogenasa
-Cetoglutarato deshidrogenasa
Succinato deshidrogenasa
AGº’= 0 kJ/mol
Fumarasa
RESUMEN GENERAL
36/38 ATP
REGULACIÓN DEL CICLO
DE KREBS
REACCIONES
ANAPLERÓTICAS
Bioquímica 2º Curso
RUTAS ANAPLERÓTICAS
Necesidad de reponer intermediarios del
ciclo de Krebs: Rutas de Relleno
RUTAS ANAPLERÓTICAS
En Plantas:
PEP + HCO3- OAA + Pi
Ruta que regenera Malato
Enzima
málica
+ HCO3- + NADH + H+
Reacciones de Transaminación
-cetoglutarato
CICLO DEL GLIOXILATO
Isocitrato
liasa
+
Malato
sintasa
+ CoASH + H+
+
Ciclo del glioxilato
TRANSPORTE
ELECTRÓNICO Y
FOSFORILACIÓN
OXIDATIVA
Bioquímica 2º Curso
TRANSFERENCIA DE ELECTRONES
Las reacciones enzimáticas producen equivalentes de reducción:
NADH y FADH2
Ocurre en la membrana interna de la mitocondria y conlleva la
transducción de energía utilizable:
SISTEMA DE TRANFERENCIA DE ELECTRONES
FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
E= Potencial observado a 1 M
Ecuación de Nerts E’o= Potencial estándar a pH 7,0
R= Constante de los gases
2,3 RT [oxidante] T= Tª en Kelvin
E= E’o + log N= Nº de electrones transferidos
nF [reductor] F= Constate de Faraday
Componente endergónico:
2 elecrones
Constante de faraday ∆E’o
Para producir 3ATP se precisa 21 Kcal/mol, luego el proceso es
exergónico y se produce espontáneamente si están las enzimas
Enzimas que actúan en la transferencia de electrones en la mitocondria
+ RH2 +H+R
TIPOS:
A. Deshidrogenasas que transfieren electrones a transportadores distintos del Oxígeno
B. Oxidasas que utilizan el oxígeno molecular : CATALASA
3- PROTEÍNAS FERROSULFURADAS
Dihidroubiquinona
UBICACIÓN METABÓLICA
COMPONENTES PROTEICOS
NADH-Coenzima Q Reductasa
Citocromo c oxidasa
COMPONENTES
PROTEICOS
SECUENCIA DE REACCIONES DE LA CADENA RESPIRATORIA
I NADH-Coenzima Q reductasa
II Succinato-Coenzima Q reductasa
III Coenzima Q-citocromo c reductasa
IV Citocromo C oxidasa
NADH-Coenzima Q
Reductasa Go’ = -81 kJ/mol
Compuesto proteico de
850 kDa: 25 polipéptidos.
FMN unido covalentemente
8 agrupaciones Fe-S
(3Fe4S4 y 5Fe2S2)
Compuesto proteico de
4 polipéptidos:
CoQH2+ 2 cit c[Fe(III)] + 2H+ dentro CoQ + 2 cit c[Fe(II)] + 4H+ fuera
Citocromo c oxidasa
2 cit cred + 2 H+ + 1/2 O2 + 4H+ dentro 2 cit cox + H2O + 4H+ fuera
HIPOTESIS QUIMIOSMÓTICA
Propuesta en 1961 por MITCHELL
El intermediario es la fuerza
proteomotriz
Los protones que han salido al especio intermembranal por la CADENA RESPIRATORIA
entan de nuevo debido a un gradiente de concentración por el canal de la ATP sintasa
ATP Sintasa
Espacio intermembran
Tallo
()
Anillo C
Matriz
COMPONENTES
PROTEICOS
DESACOPLANTES
E INHIBIDORES
SISTEMAS LANZADERA
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
Bioquímica 2º Curso
UNIVERSIDAD DE LEÓN
Miguel A. Ferrero García
RUTA DE LAS
PENTOSAS Producción de Ribosa-5-P:
ácidos nucleicos, ATP, CoA, NAD+, FAD...
FOSFATO
Bioquímica 2º Curso
REACCIONES DE LA RUTA DE LAS PENTOSAS FOSFATO 6-fosfogluconato deshidrogenasa
Fase Oxidativa
Glucosa 6-fosfato deshidrogenasa
Fase no Oxidativa
• Es absolutamente específica para el NADP+.
• Su deficiencia es la enfermedad de origen
genético más frecuente. Se estima que unos 400 Ribulosa 5-fosfato
millones de personas son deficientes en esta
Ribulosa 5-fosfato
enzima.
isomerasa epimerasa
• Las mujeres deficientes heterocigóticas de raza
negra son más resistentes a la malaria.
Lactonasa
Fase Oxidativa
Transcetolasa
Transaldolasa
Fase
No Oxidativa
Transcetolasa
FASE OXIDATIVA
Ribulosa-5-P Ribosa-5-P
Ribosa-P isomerasa
Producción de NADPH
Obtención de Ribosa-5-P
FASE NO OXIDATIVA
Ecuación global
(2) (1)