Métabolisme des acides aminés

Plan du cours

Origine des amino-acides :

Alimentation
Transamination
Conversion

Catabolisme des amino-acides : réactions générales

Décarboxylation
Désamination, Transamination
Cycle de l'urée, Ammoniogenèse
AAs cétogènes et glucoformateurs

Transformations des amino-acides en produits spécialisés :

Neuromédiateurs et autres amines biogènes
Bases puriques et pyrimidiques, hème
(métabolismes vus ultérieurement)
Glutathion
Synthèse de la créatine

Métabolisme et dérivés particuliers de certains AAs :

Glycine
Arginine
Met et Cys
Phe et Tyr
 Alimentation
50-100 g
Secrétion
50g Protéines : env 10 kg
(principalement muscles)

Protéolyse

Intestin Synthèse 300-400 g

protéique
Absorption AAs libres
100 g Sang
(jusqu’à 150g)

10 g
Catabolisme

Acides Urée
cétoniques (20-35 g)

Glucose Corps cétoniques, lipides

Biosynthèse des AAs

Transamination

Conversion
réversible : Glycine ↔ Sérine
non réversibles :
Méthionine -> Cystéine par transsulfuration d’homocystéine
Phénylalanine -> Tyrosine par hydroxylation
Aspartate -> Alanine par décarboxylation
Glutamate -> Proline par cyclisation
Autres :
Arginine : produite au cours du cycle de l’urée
 Décarboxylation

Catabolisme
des amino-acides
COOH

R-CH

NH2

Transamination
MÉTABOLISME DE LA Désamination
CHAINE CARBONÉE :
AA Glucoformateurs
AA Cétogènes
Ammoniogenèse
Glutaminogenèse
Cycle de l’urée

Décarboxylation des AAs

Réaction irréversible

R-CH (NH2) - COOH → R- CH2- NH2 + CO2

Amino-acide Amine

O - CO2 O
O OH O - CO2
OH
N OH N
OH
NH2 NH2 N NH2 N NH2
GABA
Glutamate (Ac γ- aminobutyrique) Histidine Histamine

O OH
- CO 2
OH
NH 2 5-OH-
N Tryptophane NH 2
Oxydase N

Tryptophane Sérotonine
(5-OH-Tryptamine)
AA AMINE FONCTION

Trp Sérotonine Neuromédiateur

Glu γ-amino butyrate Neuromédiateur

His Histamine Neuromédiateur, médiateur immunitaire

Dopamine,
Tyr Noradrénaline, Neuromédiateurs,

Adrénaline hormone

Asp ß-alanine Composant du coenzyme A

Cys Cystéamine Composant du coenzyme A

Ser Ethanolamine Composant des phospholipides

Thr Amino-propanol Composant de la vitamine B12

Désamination oxydative

FAD + H2O
R-CH - NH R-C=NH
R-C=O + NH3
COOH COOH
COOH

2 H+

Ac Glutamique + NH3 + ATP → 

Glutamine + ADP + Pi
 La transamination

AA + ac α-cétoglutarique <--------> α-cétoacide + Ac Glutamique

Apoenzyme
Amino-acide +
NH - (CH2)4 - Lys
CH
2- O3 POH 2C Phosphate de pyridoxal
R-CH -NH 2 O-

COOH
N CH3
H
+

R-C=O NH2
NH2 - (CH2)4 - Lys
α-cétoacide COOH 2- O3 POH 2C
CH
O-
Phosphate de
COOH pyridoxamine
CH3
N
H
(CH2)2-C =O +

Ac α-céto COOH
glutarique + NH - (CH ) - Lys
24
CH
COOH 2- O3 POH 2C O-
(CH 2)2-C H -NH2
N CH3
COOH H
Ac glutamique +
 NH3

α-céto NADH, H+
Acide aminé
glutarate

L-glutamate Réoxydation
Transaminase
deshydrogénase (chaines
transport d’e-)
Acide Ac
α-cétonique glutamique NAD+

H2O
 Le cycle de l'urée

Mitochondrie

Désamination
NH3 + CO 2 + 2 ATP + H 2O
NH3 intestinal Carbamyl-phosphate
synthétase
H2N-CH-COOH Carbamyl
H2 N-COO- P
phosphate
Ornithine (CH2 ) 3

NH2 OCT
(ornithine- Pi
carbamyl
transférase)
H2N-CH-COOH
(CH2)3

NH

C Citrulline
Arginosuccinate
NH2 O
H2N-CH-COOH
(CH2)3

NH
Arginosuccinate
C synthétase
Citrulline
NH NH-CH-COOH +
CH2 ATP Aspartate
-> AMP + PP
COOH
 Cycle de l'urée (suite)

H2N-CH-COOH
H2N-CH-COOH
(CH2) 3
(CH2) 3
NH Arginosuccinase NH
C
C
NH NH-CH-COOH
NH NH2
CH2 Ac fumarique
Arginine
COOH
Arginosuccinate
Arginase

H2N-CH-COOH

(CH2) 3 O Urée
NH2 C
Ornithine NH2
NH2

Urée
 Ammoniogenèse

O O
O O
NH 2 HO
OH OH
NH 2 NH 2
Tubule
Glutamine Ac Glutamique
rénal

NH3

H+ + NH3 NH4+

Urine
Elimination du groupement aminé : bilan

Catabolisme de la R-CH - NH2

chaine carbonée COOH

Transamination
Désamination
-1 ATP

Glutamine Ac glutamique

Glutamate
Glutaminase Déshydrogénase

AMMONIOGENESE UREOGENESE
(rein) (foie)
- 3 ATP
Urine Sang puis urine
AAs cétogènes et AAs glucoformateurs
AAs à
2 OU 3C
TRP AAs à 5C
ALA
CYS LEU ARG
GLY LYS HIS
SER PRO
THR
GLN

Pyruvate Acétoacétate
GLU

Isocitrate AAs à 4C
α-cétoglutarate
MET
Citrate VAL

Succinyl-CoA

Oxaloacétate ILE
Succinate

Malate
Fumarate Acétyl CoA
ASP
ASN
PHE
AAs à 4C TYR
 Dérivés biologiquement actifs des AAs

Aspartate Fumarate
Bases puriques
Glycine, Glutamine, Aspartate NH3 Glycine

N
N
Bases pyrimidiques
Glutamine et Aspartate N Gln
N

Gln NH3
Glu
N NH3
Aspartate Glu

N
HCO3-
 Le glutathion

Synthèse du glutathion : Glu + Cys + Gly + 2 ATP ---> Glutathion + 2 (ADP+Pi):

γ
CO COOH

CH2 NH CH NH CH2
CH2 CH2 CO
CH SH
Thiol
COOH NH2

Cystéine ADP Glycine ADP

+ + + +
ATP Pi ATP Pi
Glutamate γ-Glu Cys γ-Glu Cys Gly
γ-glutamyl- Glutathion
synthétase Glutathion
cystéine synthétase

Réactions impliquant la fonction thiol :

Détoxification des peroxydes par le glutathion :

2 GSH + R O OH GSSG + H2O + ROH

Glutathion-peroxydase
Sélénium
Régénération du glutathion réduit par la glutathion-réductase :

GSSG + NADPH, H+ ---> 2 GSH + NADP+

Glutathion-réductase

Conjugaison du glutathion aux xénobiotiques électrophiles :

GSH + R -----> G-S-R Glutathion-transférase

Catabolisme hépatique de l’insuline (réduction des ponts S-S)

 Le glutathion
Réactions impliquant le résidu γ-glutamyl :

Cys-Glu AA
γ-Glu-AA GSH

Gamma-glutamyl-transférase

γ-Glu-AA GSH
Glu

La créatine

HN = C- NH - (CH2)3- CH - COOH
NH2 NH2
NH2 - CH2 - COOH

Transamidination

HN = C - NH2 - CH2 - COOH

NH2 - (CH2)3- CH - COOH
NH2 NH2
Ac guanidino-acétique Ornithine
S-adénosyl méthionine

Méthylation

S-adénosyl homocystéine
CH3
HN = C - N - CH2 - COOH
NH2 Créatine
 CH3 ATP ADP CH3
HN = C -N - CH2 - COOH HN = C -N - CH2 - COOH
NH2 Créatine NH - P
Créatine kinase Créatine-phosphate

- H2O - PO4
CH3 - H2O
HN = C - N - CH2
Créatinine
NH CO

Arginine : synthèse de NO
 Cycle des méthyle activés

Tétrahydro
folate Méthionine
(THF)
N5,N10 Glycine S-Adénosylméthionine
Méthionine
Bétaïne Homocystéine
méthylène Synthase
Vit B12 méthyltransférase
THF
Bétaïne
Méthylène S-Adénosylhomocystéine
Tétrahydrofolate N5 méthyl
Réductase (MTHFR)
THF Homocystéine

Acide folique
 Métabolisme de Phe et Tyr

(BH4)
Fe++

Hormones
Tyr thyroïdiennes

DOPA
4-hydroxyphenyl pyruvase

Dopamine

Dopaquinone
Alcaptone
Noradrénaline

Mélanines
Métabolites Adrénaline
Synthèse des catécholamines
 COMT

MAO

Hormones thyroïdiennes

Phe

Phenylcétonurie

Tyrosinémie
Type II Tyr

DOPA
4-hydroxyphenyl pyruvase
Tyrosinémie
Type III
Dopaquinone Albinismes
Alcaptone
Alcaptonurie

Mélanines
Maléyl acétoacétate
 Métabolisme des porphyrines

1) Synthèse des porphyrines : hème

2) Dégradation et métabolisme de la bilirubine
Protoporphyrine Hème
 Catabolisme de l'hème

Bilirubine
conjuguée
 Synthèse des purines : schéma général

Ribose-5-P

1) Synthèse du Phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP)

2) Assemblage du noyau purine sur le ribose phosphate (IMP)

Synthèse de l'adénylate Synthèse du guanylate

(AMP) (GMP)

O O

O P O CH2 O ATP AMP O P O CH2

H O H
O O O O
H H H H
H OH H O P O P OH
PRPP synthﾎtase
PRPP synthétase O O
OH OH OH OH

Ribose-5-P PRPP

1
C 5 7
N C N
2 C C C8
N 4 N
3 9
 Glycine

ATP

O H
C ADP
+ Pi
NH

CH
2 +
N H3
N10-formyl
C O THF THF CH
2
NH C O
NH
R ib o s e -P
R ib o s e -P
Formylglycinamide ribonucléotide
Glycinamide ribonucléotide

ATP Gln

ADP
+ Pi Glu

O H N
C HC
H2O
NH
CH
C
CH N
2 H N
HN C 2
ATP ADP
+ Pi R ib o s e -P
NH
5-Aminoimidazole
R ib o s e -P
ribonucléotide
Formylglycinamidine ribonucléotide
 O
O
Aspartate HOOC
C C
O N NH CH HN N
2 2 C
C
CH CH
CH
+ HOOC CH
2
CH
C
HOOC
COOH N
C ATP ADP HN
2
N + Pi Ribose-P
H N 5-Aminoimidazole
2 4-N-succinocarboxamide
R ib o s e -P Ribonucléotide
5-Aminoimidazole 4-carboxylate
ribonucléotide

O
COOH
O H2O C
H N N
C 2 C CH
N CH +
HN C CH
C
CH N
H N
HC C 2 COOH
N Ribose-P
N 5-Aminoimidazole
4-carboxamide
Ribonucléotide Fumarate
R ibose-P
Inositate (IMP)

Régulation

Synthèse de l’IMP : bilan Ribose 5-P

ADP
Ribose-5-P IMP GDP
+ 2 Gln + 2 Glu
PRPP
+ 1 Gly
+ 1 Asp + 1 fumarate AMP
+ 2 N10 formyl THF + 2 THF GMP
+ 5 ATP + 5 ADP IMP
Phosphoribosylamine

Antifolates

IMP
 Synthèse de l'AMP

Synthèse du GMP

Synthèse du GMP

Dégradation des purines : formation d'ac urique ; la goutte

OH

C
N
N
N N
Allopurinol

Allantoïne
 Métabolisme des bases pyrimidiques
4

3
C 5
Carbamoyl phosphate
N C Aspartate

2 C C6
N
1

O
O O Pi H
NH2
C N C COOH
C O P O + HOOC CH2 CH H
Aspartate H2N CH2
COOH
H2N O transcarbamoylase
COOH
Carbamoyl Phosphate Aspartate
N-Carbamoylaspartate

O
O
O
H
+
H2O C
C
HN CH2
NH2 CH2
COOH
COOH
Dihydroorotase C C
C C
O N H
O N H H
H
Dihydro-orotate
N-Carbamoylaspartate
OO O

CC C
HNN
H CH
CH HN CH
O OO
C CC CC CC C CH
HN CH PRPP PPi + CO2 O O
O O O
O NN H N
OO
C C C O POO CH
CH22 O O P O CH2
O Orotidylate O
O N Orotate
H O O
O Orotidylate dﾎcarboxylase O Uridylate
phosphoribosyl HH Orotidylate
transfﾎrase
H
H H H (UMP)
Orotate
H HH H H
H

OH OH
OH OH OH OH

O NH2
Glutamine Glutamate
C + + C
HN CH ATP + H2O ADP + Pi + 2H+ N CH

C CH C CH
O N O N

UTP Ribose triphosphate CTP Ribose triphosphate