Protéines 

:
Structure :
 La séquence en acides aminés détermine la structure primaire.
 La configuration des chaines peptidiques dans l’espace détermine la structure
secondaire et tertiaire.
 L’association des plusieurs chaines peptidiques détermine la structure quaternaire.

Les liaisons :
Hydrogènes + ioniques + pont disulfure ( entre 02 AA soufrés)

Fonction des protéines :

- Structurale
- Enzymatique
- hormonale.
- récepteurs et transport membranaire.
- Source d’énergie.
- Immunitaire (immunoglobulines).
- Contractiles (myosines/actine) .

La digestion des protéines :

Au niveau de l’estomac :

- Dénaturation des protéines par l’action d’Hcl (défaire la structure quaternaire et

tertiaire en structure primaire)
- Activation de la pepsynogène en pepsine par l’action d’Hcl.
- Pepsine commence à dégrader les protéines en olygoproteines.

Au niveau de l’intestin (diodinum) :

-Intervention des enzymes pancréatiques ( trypsine, chymotrypsine qui sont des

endopetidase) et carboxypeptidase (exopeptidase).

- Dégradation des oligopeptides en AA + polypeptides + tripeptides + dipeptides).

Au niveau de bordure de brosse :

- Intervention des enzymes intestinale (peptidase)

- Dégradation des polypeptides en tripeptides et dipeptides et AA.

Au niveau de l’intérieur des cellules épithéliales :

- L’intervention des enzymes (peptidase cytoplasmique) et aminopeptidase

(exopeptidase)
- Dégradation des tripeptides et dipeptides en AA.
 L’absorption :
- Les AA libre par transport actif secondaire lié au Na ++ (cotransport avec Na ++ ).
- Les tripeptides et dipeptides par transport actif secondaire lié au gradium de H+

Métabolisme des protéines :

AA Synthèse protéines plasmatiques

Les AA passent par le
foie en premier lieu
Désamination

Acides cétonique cycle de crebs (S/E)

exés triglycérides

Métabolisme des AA :

Digestion
Protéines alimentaire  AA dans le sang.
Absorption
Les principales actions :

 Décarboxylation des AA
 Transamination et désamination oxydative des AA.
 Désamination non oxydative.
 Elimination de l’ammoniac.

1-Décarboxylation
Carboxypeptidase
R-CH(NH2)-COOH (AA ) R-CH2-NH2+ CO2 ( amin)

2- Transamination :

La 1ère transamination au niveau du foie:

aminotransférase
AA + α Cétoglutarate α Cétonique + L-glutamate

La 2ème transamination au niveau du foie:

ASAT (Aspartate amino transférase)

L- Glutamate + Oxaloacétate aspartate + α Cétoglutarate

GOT( glutamate oxaloacétate transférase)

 Transamination au niveau de l’intestin :

ALAT (Alanine amino transférase )

L- Glutamate + pyruvate Alanine + α Cétoglutarate

GPT( glutamate pyruvate transférase)

Désamination oxydative : (dans le foie et dans le muscle) mitochondrie :

 Nécessite NAD ou NADP comme cofacteur .

 Activé par ATP et GTP .
 Inhibé par ADP et GDP .

TRANSAMINASE
AA + α Cétoglutarate α- Cétonique + L-glutamate
NAD Glutamate
déshydrogénase
NH3
NADH
Cycle de crebs A α-cétoglutarique

Acétyl COA

Urée
Alanine
Glutamine

Commentaire :

 Transfert du groupement aminé de l’AA sur α- Cétoglutarate grâce a une enzyme

transaminase. Résultat : avoir un Acide α- Cétonique + L- glutamate
 Acides cétoniques vont constitués une source d’énergie pour la cellule soit on passant
par Acetyl COA soit par intermédiaire du cycle de crebs.
 L-glutamate va subir une oxydation et on va lui enlevé la fonction amin donc une
désamination oxydative. l’enzyme ici c’est Glutamate deshydrogénase .
 Apres perdre sa fonction amine l-glutamate devient A α-cétoglutarique et il peut aller
chercher une autre fonction aminé d’un autre AA.
 Le NH3 est éliminé sous forme urée soit il est caché sous forme Glutanine et Alanine.

Désamination non oxydative cytosolique  : (déshydratation + désamination) :

Concerne la sérine, la thréonine et histidine. (Enzyme déshydratase )
Serine pyruvate + NH4
 Thréonine α - cétobutyrate + NH4

Désamidation : NH3
Asparagine Aspartate (enzume Asparaginase)

NH3
Glutamine glutamate (enzyme glutaminase)

Elimination du NH3 :

1-Au niveau du foie :

ADP ATP (enzyme glutamine synthase : active dans tous les
tissus à l’exception du l’intestin et du rein
Glutamate glutamine
Produite par le muscle et le foie)

NH4+

Glutamine glutamate ( enzyme : glutaminase)

NH4+
Uréogenèse (production de l’urée)

Quitte le Corp S/F urine

Si NH4 en excès on fait appel à α- Cétoglutarate (cycle de crebs) qui va être convertir
en glutamate et après en glutamine .Donc ce process de détoxication va diminuer le nombre
d’ammoniac.

2- élimination du NH3 au niveau du rein (amoneogenèse)

H2O NH3

Glutamine glutamate
Glutaminase
NAD Désamination
H2O
oxydative
NH3 NADH
A α- Cétoglutarique

Néoglucogenèse
Cycle de crebs
Energie Glucose

Les 02 NH3 vont être pris en charge pour être éliminer au niveau des reins.
3- Elimination au niveau des intestins :

Commentaire : la glutamine vient au niveau de l’intestin via le muscle ou autres

tissus.

La glutamine soit se transforme en glutamate sous l’action du glutaminase et libération

du NH4+ qui va voyager vers le foie pour former du l’urée (uréogenèse).

Soit la glutamine va subit une transamination (la fonction amine va etre enlever du
glutamine et passer vers le pyruvate pour former l’alanine (enzyme c’est glutamine
amino transférase) puis l’alanine va rejoindre le foie via le sang pour participer à la
néoglucogenèse.

Résultat de la transamination du glutamine est α- Cétoglutaramate qui va subir une

désamination donc on obtient α- Cétoglutarate et libération du NH3 .Ce dernier va rejoindre le
foie pour former l’urée (uréogenèse).

Pourqoui faut-il éliminer NH3?

- On doit l’éliminer car il est très toxique.

- Le NH3 est liposoluble, il peut donc pénétrer dans le cerveau (neurotoxique).

- La réaction de formation du glutamate suivante se produit NH3+αCG →

glutamate, on a alors une déplétion en αCG. La conséquence de la déplétion
est que le cycle de Krebs est ralenti (la phosphorylation oxydative n’a plus
lieu).

L’ATP n’est plus synthétisée. Cela entraine la mort des cellules neuronales qui sont
ATP dépendante
Cycle de l’urée :

Le bilan :NH3+ CO2+ Aspartate + 3ATP → Urée + Fumarate + 2ADP + AMP + 2Pi +

PPi

Les 5 étapes du cycle de l’urée

Dans la mitochondrie

1. Synthèse du carbamoyl-phosphate: irréversible

- condensation NH3 et HCO3
- consommation 2 ATP
2. Synthèse de la citrulline
- Transport de la citrulline de la mitochondrie vers le cytosol

Dans le cytosol

3. Synthèse de l’arginosuccinate irréversible

- Transfert NH de l’aspartate sur la citrulline
3

- Consommation 01 ATP
4. Synthèse de l’arginine et recyclage du fumarate

5. Synthèse de l’urée
Régulation du cycle de l’urée:

-En cas de jeûne, absence de lipides et ou de glucides . les protéines sont utilisées
pour produire de l’énergie (beaucoup de NH3) et donc les enzymes impliquées dans le cycle
de l’urée sont synthétisées en grande quantité.

- La carbamylphosphate synthétase (CPS1) est régulé (activé) par N-acétyl glutamate .Ce
dernier est synthétisé à partir de l’acétyl COA et du glutamate quand la concentration du
glutamate est importante provenant de la dégradation des protéines alimentaire
(les AA en excès).
 Catabolisme des protéines : 03 voies :

 Lysosomiale
 Voie Ca++ dépendante
 Voie ubiquitine.

Voie lysosomiale :(foie –rein) : ATP dépendante :

► Ciblage sélectif des protéines a dégrader ( ……..

►Macoautophagie (Enveloppement d’une portion entière de cytoplasme et
internalisation des protéines intracéllulaire de grandes tailles)
►Microautophagie (Invagination de corps multivésiculaire d’origine endosomique
et internalisation des protéines intracéllulaire de petites tailles )
►Hétérophagie (Internalisation de protéines extracellulaires → vésicules )
Les vésicules lysosomiales formés vont permettre aux protéases lysosomiales
(cathepsine, carboxypeptidases…..) de dégrader les protéines cibles.
Voie Ca++ dépendante (calpaine/calpastatine) :
 Calpaine activé en fonction de la concentration en Ca
 Calpastatine inhibe la calpaine
 Donc l’activité protéolytique (degradation des protèines de cytosquelette) en fonction
de l’équilibre calpaïnes/calpastatine

Voie Ubiquitine- protéasome dépendante ATP :

Commentaire :

- L’enzyme E1 (avec la fonction thiol (s-h) va s’associer avec ubiquitine

l’assemblage nécessite ATP.
- Transfert du l’Ubiquitine de l’enzyme E1 vers une autre enzyme E2.
- Après fixation sur l’enzyme E2 le complexe (E2 –Ubiquitine) va
reconnaitre une autre enzyme E3.
- L’ensemble E2-E3-Ubiquitine vont reconnaitre la protèine cible (a degrader)
qui va se fixer sur E3.
- Il y’aura un transfert de plusieurs ubiquitine sur la 1ère Ubiquitine formant
protéosome (complexe protéique).
- Apres dégradation de la protéine cible il y’aura libération des Ubiquitine qui
vont aller chercher d’autres protéines a dégrader, des enzymes E3 et E2 + les
peptides issus de la dégradation.
Catabolisme du squelette carboné : l’acide α- Cétonique issue de la transamination et
désamination va subir les réaction suivante :

 Production d’énergie (cycle de crebs).

 La néoglucogenèse.

 Précurseur de la cétogenèse.

 Précurseur de la synthèse des acides gras.

Le catabolisme hépatique des squelettes carbonés des 20 AA conduit à la formation de 7

intermédiaires:
1. α-cétoglutarate,
2. Oxaloacétate,
3. Fumarate,
4. Pyruvate
5. Succinyl-CoAacétoacétate
6. Acétyl-CoA.

Deux acides aminés sont cétoformateurs purs:

- Lysine
- Leucine
Quatre acides aminés sont mixtes:

- Isoleucine
- Phénylalanine
- Tryptophane
- Tyrosine
Les 14 autres acides aminés sont glucoformateurs purs.

→ donc tous les AA sont glucoformateurs sauf « la leucine et la lysine ».

Le catabolisme des acides aminés glucoformateurs peut rejoindre la néoglucogenèse

hépatique:

- Soit au niveau du pyruvate,

- Soit au niveau d’un intermédiaire du cycle de l’acide citrique: α-

cétoglutarate, succinyl CoA, fumarate, oxaloacétate.

Le catabolisme des acides aminés cétoformateurs peut rejoindre la cétogenèse hépatique:

- Soit au niveau d’acétyl-CoA

- Soit au niveau d’acétoacétate
Rôle du foie :

1. Désamination des acides aminés (pour conversion en glucose ou synthèse d’ATP).

2. Formation de l’urée avant son excrétion par le rein; sinon (cirrhose, hépatite),
accumulation d’ammoniac dans le sang.

3. Formation des protéines plasmatiques (sauf gamma-globulines); si diminution

[protéines plasmatiques] → mitose rapide des hépatocytes (volume du foie
augmente) + synthèse accrue.
4. Transformation: inter-conversion des acides aminés non essentiels