Métabolisme des

acides aminés
Pr Ag Souleymane THIAM
LBBM

1
 Objectifs
1. Identifier les processus généraux du catabolisme
des AA
2. Décrire la réaction de transamination
3. Décrire les étapes et la régulation de l’uréogenèse
4. Énumérer 5 composés d’intérêt biologique
5. Citer les mécanismes de biosynthèse des AA non
essentiels
6. Enoncer le principe de dosage de l’urée
7. Citer 3 aminoacidopathies en précisant l’enzyme
déficitaire
2
 I.1 Définition
• Le métabolisme des acides aminés est
l’ensemble des processus mis en jeu par
l’organisme pour dégrader ou synthétiser
des acides aminés
• On parlera des acides aminés protéinogènes

3
 I.2 Intérêt
• Energétique: production d’énergie
• Anabolique
– Glucose, corps cétoniques, lipides, amines biogènes
• Pathologique
– Maladies hépatiques
• Cytolyse : dosage transaminases
– Maladies rénales
• Insuffisance rénale: dosage urée et créatinine
– Encéphalopathie, coma urémique
– Aminoacidopathies
4
 I.3 Rappels
Protéines alimentaires Protéines endogènes

Acides aminés

- Essentiels
- Non essentiels

5
 I.3 Rappels
• AA hydrophobes : ??
• AA polaires non chargés : ??
• AA polaires chargés positivement : ??
• AA polaires chargés négativement : ??

6
 II. Processus généraux du
catabolisme des AA
1. Transamination
2. Désamination
3. Catabolisme du squelette carboné des AA
4. Décarboxylation
5. Conversion

7
Vue générale du catabolisme des AA

8
 II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés

▪ Transamination :
▪ transfert de -NH2 des AA sur l’ -cétoglutarate
pour former le Glutamate.
▪ La désamination oxydative du glutamate conduit au
NH4+
▪ Désamination non oxydative : clivage de -NH2 et
production de NH4+
▪ Ammonium : toxicité incompatible avec son
accumulation
9
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés

10
 II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
1. Les transaminations

▪ Elles transfèrent, le plus souvent, la fonction -NH2

de quelques AA sur l’ -cétoglutarate pour former du
glutamate.
▪ Métabolisme mitochondrial du glutamate
▪ une partie du glutamate conduit à l’aspartate par
transamination sur l’oxaloacétate par l’isoenzyme
mitochondriale de l’ASAT :
▪ une partie du glutamate subie une désamination
oxydative par action de la glutamate
déshydrogénase
11
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
1. Les transaminations
▪ Enzymes de catalyse : aminotransférases ou
transférases.
▪ Coenzyme : phosphate de pyridoxal (Vit B6)
▪ Coenzyme obligatoire pour la catalyse de nombreuses
réactions : transamnation, décarboxylation,
racémisation...
▪ Lieu de transamination : foie sauf pour les AA
ramifiés Val, Ile, Leu dont la transamination se fait
exclusivement dans le muscle

12
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
1. Les transaminations

13
 Transamination par
l’ALAT/ASAT
Alanine Alpha cétoglutarate
Aspartate
Alanine aminotransférase (ALAT)
PALP Aspartate aminotransférase (ASAT)

Pyruvate
Oxaloacétate Glutamate

14
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
2. La désamination non oxydative

▪ Libération directe du groupement -NH2 de

divers AA: Ser, Thr, Trp, Met, Asn sous
forme d’ammoniac NH3
▪ Deux enzymes
▪ Glutaminase : elle hydrolyse la glutamine en
glutamate et en NH3
▪ Complexe multienzymatique : il clive le
glycocolle en NH3 et en C02. Il nécessite
plusieurs coenzymes dont le NAD+
15
Désamination non oxydative: Gln
O COOH
II I
H2N-C-(CH2)2 – CH Glutamine
I
NH2

Glutaminase NH3

COOH
I
HOOC-(CH2)2 – CH
Glutamate
I
NH2 16
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
3. Désamination mitochondriale du glutamate
▪ Enzyme de catalyse : L-glutamate déshydrogénase
▪ Enzyme inhabituelle car pouvant utiliser soit le
NAD+ soit le NADP+.
▪ Elle est régulée de façon allostérique :
▪ Inhibiteurs : GTP, ATP
▪ Activateurs : GDP, ADP
▪ Un abaissement de la charge énergétique accélère
donc l’oxydation des acides aminés.

17
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
3. Désamination mitochondriale du glutamate
COOH
COOH
I
HOOC-(CH
HOOC-CH 2)2 –
2-CH2 – CH
II
NH3
NH 2
Glutamate
NAD+ (NADP+)
L-glutamate
déshydrogénase
NH3 NAD+ (NADPH,H+)

COOH
COOH
II
HOOC-CH2-CH2
HOOC-(CH – CO
2)2 – CO

Alphacétoglutarate
18
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés

▪ En résumé :
▪ Le glutamate issu des transaminations poursuit
son métabolisme dans la mitochondrie où il est
transporté grâce à un transporteur spécifique.
▪ La majeure partie de l’azote des acides aminés
transite par le glutamate pour être libéré sous
forme de NH3 et d’aspartate qui sont des
substrats du cycle de l’urée.

19
 II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Destinées de l’ion ammonium NH4+

Hépatique Musculaire Intestinale

Alanine
Glutamine (+++)

NH4+

Bases azotées

Urée NH4+ Acides uriques

20
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)

▪ Le rôle central du Foie

▪ organe central de la régulation du catabolisme
azoté
▪ Le foie possède deux possibilités d’éliminer
l’ammoniac : sous forme d’urée (+++) et sous
forme de glutamine

21
 II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)
Cytosol
Fumarate H2O
Arginine
5
4 Arginase Urée Mitochondrie
Argininosuccinate
Ornithine
3 2 Carbamoyl-phosphate
Aspartate Citrulline
1

HCO3- + NH4+
22
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)

1- La formation du carbamoyl-phosphate
▪ Enzyme : Carbamoyl-phosphate synthétase
mitochondriale
▪ consommation de deux liaisons riches en
énergie
▪ réaction irréversible (étape régulatrice)
▪ enzyme activée par la N-acétyl-glutamate

23
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)

24
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)
2- La synthèse de la citrulline
▪ Enzyme: L’ornithine-carbamoyl-transférase
▪ Transport de la citrulline de la mitochondrie vers
le cytosol

25
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)
3- La synthèse de l’argininosuccinate
▪ Enzyme: l’argininosuccinate-synthétase
▪ Consommation de deux liaisons riches en
énergie

26
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)
4- La synthèse de l’arginine et le recyclage du
fumarate
▪ Enzyme: l’argininosuccinate lyase
▪ Le fumarate retourne dans la mitochondrie (cycle
fumarate/ Aspartate)
▪ Le fumarate est hydraté en malate par la fumarase
▪ Le malate est transporté dans la mitochondrie

27
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)
4- La synthèse de l’arginine et le recyclage du
fumarate
▪ Le malate est déshydrogéné en OA par la malate
Dhase
▪ L’OA est transaminé en Aspartate par l’ASAT
▪ L’Aspartate est transporté dans le cytosol
cycle de l’urée
▪ Le cycle fumarate/Aspartate réunit le cycle de
l’urée et celui de Krebs

28
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)

29
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)
5- La synthèse de l’urée
▪ Enzyme: arginase
▪ Régénération de l’ornithine qui retourne
dans la mitochondrie

30
Cycle de l’urée 31
« Bicyclette » de Krebs

32
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)
▪ Bilan des réactions du cycle de l’urée :

Aspartate + NH3 + CO2 + 3 ATP

Urée + fumarate + 2 ADP + AMP + 2 Pi + PPi

33
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)
▪ Régulation :
▪ N-acétylglutamate = principal activateur de la
carbamylphosphate synthétase I
▪ L’accroissement de N-acétylglutamate par les
repas riche en viande se traduit par une
synthèse accrue d’urée.

34
 II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)
▪ Destinées de l’urée :
▪ L’urée diffuse du foie vers le sang qui le draine vers le
rein où elle est filtrée et excrétée
▪ Une partie de l’urée synthétisée par le foie diffuse du
sang vers l’intestin.
▪ Elle y est clivée en CO2 et en NH3 par l’uréase
bactérienne.
▪ L’ammonium ainsi formé est en partie dans les fèces ou
réabsorbée dans le sang.
▪ L’hyperazotémie de l’insuffisance rénale contribue à
l’hyperammoniémie. 35
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
4. Formation de l’urée (Uréogenèse)

Rein Excrétion
Urée

Urée
Foie Sang
Urée Uréase
bactérienne
Intestin CO2
+
NH3

Hyperammoniémie
 II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
5. Régulation

En postprandial: apport d’AA et alcalose activent

l’uréogenèse de plusieurs façons :
▪ Abondance de NH3 et de CO2 issus du catabolisme
des nutriments
▪ Activation de la glutaminase par NH3.
▪ La glutamine est alors hydrolysée en NH3 et en glutamate.
▪ Le glutamate mène au N-acétylglutamate, puissant
activateur allostérique de la carbamylphosphate synthétase.
▪ Activation des enzymes de l’uréogenèse :
accroissement transformation de l’ammoniac en urée.

37
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
5. Régulation

▪ En condition de jeûne :
▪ la synthèse d’urée est en baisse et il existe une
acidose physiologique.

38
II-Catabolisme de l’azote des Acides Aminés
5. Régulation

39
III- Catabolisme du squelette carboné des AA

Formation des acides organiques

▪ Après l’élimination de la fonction amine
des acides aminés, les chaînons carbonés ou
squelettes carbonés sont métabolisés en
acides organiques :
▪ Oxaloacétate, -cétoglutarate , pyruvate,
fumarate, Acétyl CoA, Acétoacetyl CoA et
Succinyl CoA.

40
III- Catabolisme du squelette carboné des AA

Destinées des acides organiques

▪ Cétogenèse
▪ Néoglucogenèse
▪ Lipogenèse
▪ Formation d’énergie (cycle de Krebs et CRM)

41
42
III- Catabolisme du squelette carboné des AA
1. Cétogenèse à partir des AA
▪ Acides aminés cétogènes :
▪ Isoleucine (acétyl-CoA)
▪ Tryptophane et Lysine (acétoacétyl-CoA)
▪ Leucine (HMG-CoA) : AA cétogène pur
▪ Phénylalanine et Tyrosine (acétoacétyl-CoA)
▪ Acétyl-CoA, Acétoacétyl-CoA et HMG-CoA sont
des substrats de la cétogenèse.
▪ Remarque : les corps cétoniques sont
l’acétoacétate, l’hydroxybutyrate et l’acétone.

43
 AA cétogènes et /ou glucoformateurs

▪ Bilan :
▪ 14 AA glucoformateurs non cétogènes
▪ 4 AA glucoformateurs et cétogènes
▪ 2 AA cétogènes exclusifs 44
III- Catabolisme du squelette carboné des AA
2. Lipogenèse à partir des AA

▪ Généralités
▪ Site de la lipogenèse : Foie
▪ Synthèse à partir de l’acétyl-CoA
▪ NADPH, H+ apporte les hydrogènes
indispensables à la biosynthèse.

45
IV- Biosynthèse de composés spécialisés

• Histamine Histidine
• Catécholamine  tyrosine
• Sérotonine  tryptophane
• Cadavérine  lysine
• Éthanolamine  sérine
• GABA  Glutamate
• Taurine  cystéine

46
IV- Biosynthèse de composés spécialisés
▪ Histamine : rôle +++ dans les réactions allergiques

Décarboxylase

▪ Histamine : puissant vasodilatateur

▪ Agents interférant avec Histamine = médicaments
antihistaminiques 47
 IV- Biosynthèse de composés spécialisés

Exemples de dérivés d’AA : Catécholamines

▪ Catécholamines
▪ Dopamine: dopa carboxylase
▪ Norépinéphrine et épinéphrine: tyrosine
hydroxylase
▪ Neurotransmetteurs (cerveau, système nerveux
autonome)
▪ Catécholamines synthétisées à partir de la
tyrosine/ Phe.
48
49
IV- Biosynthèse de composés spécialisés

Exemples de dérivés d’AA : Sérotonine

▪ Sérotonine ou 5-hydroxytryptamine
▪ Multiples fonctions de la sérotonine (douleur,
comportement, régulation sommeil, température et
pression sanguine)
▪ La sérotonine est synthétisée à partir du tryptophane
sous l’action de la tryptophane hydroxylase pour
donner le 5-hydroxytryptophane qui sera décarboxylé
en sérotonine.

50
51
IV- Biosynthèse de composés spécialisés

Exemples de dérivés d’AA : Créatine

▪ Synthèse à partir de la Gly, de l’Arg et Met
▪ Créatine phosphate est obtenue de la
créatine:
▪ support énergétique (muscle)
▪ Cyclisation spontanée = créatinine excrétée
dans les urines.
▪ Créatinine : marqueur fonction rénale
52
53
V- Biosynthèse des AA non indispensables

Classes d’AA
▪ AA essentiels (apport exogène obligatoire :
aliments)

▪ AA non indispensables (synthétisés par

l’organisme), concernés par la biosynthèse

54
V- Biosynthèse des AA non indispensables

▪ Mécanismes de synthèse:
▪ Transfert de groupement amine d’AA (Ala, Asp
et Glu) sur les -cétoacides (pyruvate,
oxaloacétate, -cétoglutarate )

▪ Fixation de l’ammoniac sur la fonction γ

carboxylique de Glu ou β carboxylique de Asp

▪ Conversion

55
V- Biosynthèse des AA non indispensables

▪ 10 Amino-acides non essentiels

▪ Alanine, Aspartate, glutamate, glutamine,
asparagine, proline, sérine, glycine, cystéine,
Tyr
▪ AA synthétisables par l’organisme humain
▪ Synthèse à partir de métabolites
intermédiaires
▪ Synthèse possible à partir d’AA essentiels

56
V- Biosynthèse des AA non indispensables

▪ Synthèse d’AA à partir d’α-cétoacides

▪ Transfert de groupement amine
▪ Accepteurs : pyruvate, oxaloacétate et α-
cétoglutarate
▪ Voie directe de synthèse d’AA
▪ Rôle important dans l’équilibre azoté

57
V- Biosynthèse des AA non indispensables
1. Réaction de Transamination

Formation de l’Alanine

58
V- Biosynthèse des AA non indispensables
1. Réaction de Transamination
Formation de l’Aspartate
Oxaloacétate Glutamate

Aspartate Alphacétoglutarate
59
V- Biosynthèse des AA non indispensables
2. Réaction d’amination

Formation du glutamate

60
V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse par amidification d’AA

Processus généraux :
▪ liaison amide : ammonium / groupe β ou γ-COOH
▪ Synthèse de glutamine à partir du glutamate
▪ Synthèse d’asparagine à partir de l’aspartate
▪ Forme de conservation de l’ammoniaque

▪ Contribution à l’élimination de l’ammonium,

composé toxique pour le cerveau;

61
V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse par amidification d’AA

Synthèse de la glutamine

62
V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse par amidification d’AA

Synthèse de la glutamine
▪ Rôles au sein de la cellule :
▪ Donneur de groupement amine
▪ Assimilation d’azote

▪ Glutamine: principal transporteur d’ion

ammonium dans le système circulatoire
63
 V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse par amidification d’AA

Synthèse de l’asparagine
- Donneur d’amine : glutamine

64
V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse des autres AA

Synthèse de la sérine
▪ Précurseurs :
▪ 3-phosphoglycérate : métabolite de la glycolyse

▪ Glycine : interconversion sérine/glycine qui par

transfert du groupe hydroxy-methyl conduit à la
sérine

65
V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse des autres AA

Synthèse de la sérine à partir du 3-

phosphoglycérate
▪ 3-phosphoglycérate est oxydé en 3-
phosphopyruvate qui conduit par
transamination à la 3-phosphosérine.
▪ 3-phosphosérine est hydrolysée pour donner
la sérine

66
Synthèse de la sérine à partir du 3-
phosphoglycérate
NAD+

67
V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse des autres AA
Interconversion entre la sérine et la glycine

68
V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse des autres AA

Synthèse de la cystéine
▪ 2 réactions consécutives :
▪ Synthèse de la cystathionine à partir de la
sérine et de l’homocystéine dérivant de la
méthionine (AA essentielle)
▪ Hydrolyse de la cystathionine en -
cétoglutarate et en cystéine
▪ La synthèse de cystéine est tributaire de
l’apport exogène de la méthionine
69
V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse des autres AA
Synthèse de la cystéine

70
V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse des autres AA

Synthèse de la tyrosine
▪ Caractéristiques :
▪ Phénylalanine :AA précurseur de la tyrosine
▪ Phénylalanine : AA essentiel
▪ Rôle ++ de l’alimentation
▪ Enzyme de catalyse : phénlalanine hydroxylase
▪ Coenzyme : tétrahydrobioptérine

71
 V- Biosynthèse des AA non indispensables
3. Synthèse des autres AA
Synthèse de la tyrosine

72
 VI. Applications
1. Analytique
▪ Exploration de nombreuses fonctions:
▪ Hépatique : transaminases (ALAT, ASAT, OCT)
▪ Rénale : dosage de créatinine et de l’urée
▪ Médullosurrénale : catécholamines et dérivées

73
 Dosage de l’urée par uréase
Uréase
Urée + H2O NH4+ + CO2

L-GDH

NH4+ + ACG + NADH,H+ Glutamate + NAD

Mesure vitesse de disparition de NADH,H+ lue à 340 nm

74
 Dosage des ALAT
ALAT
Ala + ACG Pyruvate + Glutamate

LDH
Pyruvate + NADH,H+ Lactate + NAD+

Mesure vitesse de disparition de NADH,H+ lue à 340 nm

75
VI. Applications
1. Analytique
• Valeurs normales
– Urée : 0,20-0,45 g/l (2 -6,5mmol/l)

– ALAT : < 35 UI/L

76
VI. Applications
2. Pathologiques

▪ Cytolyse hépatique: élévation des

transaminases
▪ Insuffisance rénale (aigüe ou chronique)
augmentation de l’urée et/ou de la
créatinine
▪ Encéphalopathie : hyperammoniémie

77
VI. Applications
2. Pathologiques

▪ Aminoacidopathies: affections héréditaires :

▪ Phénylcétonurie +++
▪ Leucinose
▪ Alcaptonurie: homogentisate oxydase
▪ Homocystinurie: Cystathionine synthase
▪ Déficit en tyrosinase (défaut de synthèse de
mélanine ou albinisme)….

78
 Phénylcétonurie
Généralités :
▪ 1ère description 1934 par Fölling
▪ Retard mental associé une excrétion urinaire
accrue d’acide phénylpyruvique
▪ Aminoacidopathie héréditaire la mieux connue
▪ Dépistage systématique dans certains pays
(France)
▪ Traitement : régime alimentaire pauvre en
phénylalanine
79
Phénylcétonurie
Données d’étude génétique :
▪ Maladie héréditaire
▪ Transmission sur un mode autosomique récessif
▪ Sujet hétérozygote : porteur sain
▪ Affection relativement fréquente : 1/20 000

80
 Phénylcétonurie
Phényl pyruvique

Phénylalanine
THBT NADH,H+
Phénylalanine
Dihydrobioptérine réductase
hydroxylase
DHBT NAD+
Tyrosine

THBT: Tétrahydrobioptérine
DHBT: Dihydrobioptérine 81
Phénylcétonurie
Faits cliniques dominants :
▪ Signes précoces variables : vomissements,
convulsions, odeur de moisi des urines
▪ Retard psychomoteur :retard de la station assise,
de la marche, de la parole.
▪ Retard intellectuel
▪ Remarque : évolution favorable avec
traitement précoce.
82
Phénylcétonurie
Signes biologiques (biochimie) :
▪ Elévation du taux sanguin de phénylalanine et
de phénylpyruvate
▪ Excrétion urinaire accrue d’acide phényl-
pyruvique, d’acide phényl-lactique et des
catabolites de l’acide phénylpyruique

83
Phénylcétonurie
Test diagnostic systématique :
▪ Test de Guthrie : dosage bactériologique de la
phénylalanine sanguine
▪ Échantillon : goutte de sang déposé sur papier
filtre
▪ Test effectué entre le 4ème et le 10ème jour de la
vie (intérêt +++ du diagnostic précoce)

84
85
 Leucinose ou Mapple Syrup Urine
Disease (MSUD)
▪ Maladie héréditaire
▪ Déficit en déshydrogénase des acides -
cétoniques à chaîne ramifiée.
▪ Urines riche en acides -cétoniques à
chaîne ramifiée (odeur de sucre caramélisé)

86
 Déficit en tyrosinase
Fait marquant :
▪ Le déficit en tyrosinase conduit à un défaut
de synthèse de pigments mélaniques
aboutissant à l’albinisme
▪ Accumulation de tyrosine
▪ Transmission héréditaire variable selon le
type génétique (6 types génétiques
d’albinisme)
87
 Déficit en tyrosinase
Types génétiques d’albinismes :
▪ Albinisme oculo-cutané de type I (transmission
autosomique récessive, dépigmentation complète
de la peau, des cheveux et des yeux)
▪ Albinisme de type II (idem type I mais type II dû à
un allèle différent)
▪ Albinisme de type III (idem type I avec en plus
une neutropénie (vulnérabilité aux infections,
évolution rapidement fatale)

88
 Déficit en tyrosinase
Types génétiques d’albinisme (suite)
▪ Albinisme de type IV (retrouvé chez les Israélites,
surdité associée)
▪ Albinisme isolé de l’œil (transmission récessive
liée au sexe)
▪ Albinisme cutané partiel ou piébaldisme
(transmission autosomique dominante)

89