Catabolisme ou dégradations ►

Composés Produits Sous Produits

structurés dissociés Produits Ultimes

◄ Anabolisme ou Synthèses
• Lipides • A. Gras, Acools
• Glucides • oses CO2
A. Pyuvique,
• Protides et • A. Animés H2O
Acétyl~CoA,
protéines • Nuclétides,
NH3
• Acides Nucléiques B. Azotées

Processus mis en jeu

* dégradations : Oxydation ( + E )
* Synthèses : réduction ( - E )
Pr. Salwa ABID
Métabolisme
des lipides

Pr. Salwa ABID

Pr. Salwa ABID

Catabolisme
des lipides

Concerne essentiellement les AG

Pr. Salwa ABID

 Dissociation des lipides
en AG et alcool

-Il existe 3 voies possibles de dégradation des

AG:
 b-oxydation
 w-oxydation

 a-oxydation

Pr. Salwa ABID

 Catabolisme des Acides Gras

Acides Gras:
Longue chaîne carboné, sans ramification
Un nombre pair de carbones, extrémités COOH et CH3
AG saturés et insaturés

Pr. Salwa ABID

La b-oxydation (AG saturés)

II- Mécanisme
Etape 1 : Activation des AG
- Les acides gras sont activés par leur fixation sur le CoenzymeA
- L’activation est catalysée par l’acyl-CoA synthétase

R-CH2-COOH + ATP + HSCoA  R-CH2-COSCoA + AMP + PPi

AG Acyl~CoA

- L’AG est activé (niveau énergétique ) et fixé sur le CoA

- Consommation d’un ATP

Pr. Salwa ABID

Etape 2 : 1ère Déshydrogénation (oxydation)
- déshydrogénation entre les carbones a et b de l’acyl-CoA
- l’enzyme est l'acyl-CoA déshydrogénase à FAD/ a,b déshydrogénase
- FAD récepteur des 2 H  il est réduit
- création d’une double liaison entre Ca et Cb

b a b a
R-CH2-CH2-CH2-COSCoA + FAD  R-CH2-CH=CH-COSCoA + FADH2

Etape 3 : Hydratation
- addition d’une molécule de H2O sur la double liaison
- l’enzyme est une Hydratase

b a b a
R-CH2-CH=CH-COSCoA + H2O  R-CH2-CH-CH2-CO-SCoA
OH
b-hydroxyacyl-CoA
Pr. Salwa ABID
Etape 4 : 2ème Déshydrogénation (oxydation)
- Elle porte sur le Cb

- L'enzyme est la b-hydroxyacyl-CoA déshydrogénase à NAD+/ b-déshy.

- NAD+ récepteur des 2 H

- L'oxydation de la fonction alcool conduit à une fonction cétone

b b
R-CH2-CH-CH2-COSCoA + NAD+  R-CH2-C-CH2-COSCoA + NADH H+
OH O

Etape 5 : Rupture
- Rupture de la liaison et le Ca et le Cb

- L'enzyme est la b-cétothiolase

- Libération d’un acétyl~CoA [AG nC AG (n-2)C]

b a b a
R-CH2-C-CH2-COSCoA + HSCoA  R-CH2-COSCoA + CH3COSCoA
Pr. Salwa ABID
O
 III- Bilan d’un cycle de b-oxydation
1- Bilan en carbones
Acyl-CoA (nC) CoASH
FAD
NAD+

FADH2
NADH+ H+

Acyl-CoA (n-2)C Acétyl-CoA

Pr. Salwa ABID

 2- Bilan enzymatique
Intervention de 5 enzymes. Tous réversibles sauf (E2)
- Enzyme d’activation de l’AG
 Acyl-CoA synthétase (E1)
- 1ère déshydrogénase à FAD
 Acyl-CoA déshydrogénase à FAD (E2)
- Enzyme d’hydratation
 Hydratase (E3)
- 2ème déshydrogénase à NAD+
 b-hydroxyacyl-CoA déshydrogénase à NAD+ (E4)
- Enzyme de rupture ou clivage
 b-cétothiolase (E5)Pr. Salwa ABID
 3- Bilan énergétique
- La b-oxydation implique l’élimination de 2 x 2H
- Les H sont transportés par les coenzymes : FAD
et NAD+ sous leur forme réduite

FADH2 ou NADH H+ 2 ADP ou 3 ADP

Réoxydation des Phosphorylation

transporteurs oxydative

FAD ou NAD+ 2 ATP ou 3 ATP

 Production de 5 ATP / Cycle

Pr. Salwa ABID
IV- Hélice de Lynen
- Etude de l’Acide Caprique (AG saturé à 10C)

- Formule : CH3-(CH2)8-CO~SCoA
CH3-(CH2)8-CO~SCoA CoA~SH
CH3-CO~CoA
CH3-(CH2)6-CO~SCoA
CoA~SH
CH3-CO~CoA
CH3-(CH2)4-CO~SCoA
CoA~SH

CH3-(CH2)2-CO~SCoA CH3-CO~CoA
CoA~SH
CH3-CO~SCoA CH3-CO~CoA

Pr. Salwa ABID

Autres types d’oxydation
I- w-Oxydation

Il s’agit d’une double b-oxydation

w-oxydation
CH3-(CH2)2n-COSCoA CoAS~CO-(CH2)2n-COSCoA
AG

b’ b
CoAS~CO-CH2-(CH2)2n-2- CH2-COSCoA

site 1 site 2

Pr. Salwa ABID

 I- w-Oxydation

-Processus de dégradation incomplet

formation d’un composé non dégradable par
b-oxydation, Composé résiduel:
*L’acide succinique (COOH-CH2-CH2-COOH)
*Le diacétyl (COOH-COOH)
Exple: AG 10C le diacétyl
AG 12C l’A. succinique

Pr. Salwa ABID

Autres types d’oxydation
II- a-Oxydation

Processus de « correction » structurale

a-oxydation
AG Nbre C impair AG Nbre C pair

Pr. Salwa ABID

La b-oxydation (AG insaturés)
Exemple : Acide Oléique: AG 18C insaturé (D 9-10)
10 9 b3 b2 b1
CH3-(CH2)7-CH=CH-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CH2-CO~SCoA

1er cycle
2ème cycle
3ème cycle
Elimination de 2C sous forme d’acétyl~CoA à chaque cycle de b-oxydation

Après 3 cycles il reste :

g b a Introduction d’une étape

CH3-(CH2)7-CH=CH-CH2-CO~SCoA supplémentaire (isomérisation)

D g-b b-a Isomérase

g b a On retrouve un schéma
CH3-(CH2)7-CH2-CH=CH-CO~SCoA classique de b-oxydation
Pr. Salwa ABID
 Biosynthèse
des Acides Gras

Pr. Salwa ABID

2- Système enzymatique
- 1 enzyme d’activation: AcétylCoA carboxylase
- 1 complexe multienzymatique renfermant
plusieurs enzymes au sein d’une même
structure : Synthétase E

ACP~SH

E
Cys~SH
2 pôles réactifs :
- ACP~SH (Associé à E exhibe un thiol SH)
- Cys~SH (Appartenant àABID
Pr. Salwa E exhibe un thiol SH)
 3- Mécanisme de la synthèse de Wakil
Synthèse en 5 étapes

Etape 1 : Activation de l’acétyl~CoA par carboxylation

Il s’agit de la fixation d’un carbone supplémentaire

CO2 Mn++

CH3-C-SCoA *
COO-CH2-C-SCoA
O O
ATP AMP+PPi
AcétylCoA (2C) MalonylCoA (3C)

L’enzyme : AcétylCoA Carboxylase à Co Biotine

Pr. Salwa ABID

Etape 2 : Fonctionnement du système Synthétase E
3 sous étapes

2-1 Transfert de l’acétyl~CoA sur

la Cys de E

CH3-C-SCoA
ACP~SH O ACP~SH
E E
Cys~SH Cys~S-C-CH3
CoASH O

Pr. Salwa ABID

2-2 Transfert du Malonyl~CoA sur
l’ACP associée à E

*COOH-CH -C-SCoA
*
2
ACP~SH O ACP~S-C-CH2-COOH

E E O
Cys~S-C-CH3
Cys~S-C-CH3
O CoASH O

Pr. Salwa ABID

 2-3 Réaction entre l’acétylCoA et
le Malonyl~CoA
Acétoacétyl~ACP

12 34
* H
ACP~S-C-CH2-COO ACP~S-C-CH2-C-CH3

E O
Cys~S-C-CH3
E O O
*
CO2
Cys~S-H
O

Pr. Salwa ABID

Etape 3 : 1ère Réduction

ACP~S-C-CH2-C-CH3 ACP~S-C-CH2-CH-CH3

E O O Réductase 1 E O OH

Cys~S-H
de E Cys~S-H

NADPH + H+ NADP+

Pr. Salwa ABID

Etape 4 : Déshydratation

ACP~S-C-CH2-CH-CH3 ACP~S-C-CH CH-CH3

E O OH
Déshydratase E O
Cys~S-H de E Cys~S-H

H2 O

Pr. Salwa ABID

Etape 5 : 2ème Réduction

butyryl~ACP

ACP~S-C-CH CH-CH3 ACP~S-C-CH2-CH2-CH3

E O Réductase 2
de E
E O

Cys~S-H Cys~S-H

NADPH + H+ NADP+

Pr. Salwa ABID

 6- Démarrage d’un tour de Wakil suivant
Transfert du fragment d’AG (4C) de l’ACP à la Cys)

ACP~S-C-CH2-CH2-CH3 ACP~S-H
E O
E
Cys~S-H Cys~S-C- CH2-CH2-CH3
O

Fixation d’un 2ème acétylCoA activé sous forme de malonylCoA

MalonylCoA

ACP~S-H
*
COOH-CH -C-SCoA
2 *
ACP~S - C-CH2-COOH
O
E E O

Cys~S-C- CH2-CH2-CH3 Cys~S-C- CH2-CH2-CH3

O O

Pr. Salwa ABID

Réaction de de l’Acyl avec le Malonyl

ACP~S - C-CH2-COOH *
E O

Cys~S-C- CH2-CH2-CH3 Fragment D’AG de 4C

O

*CO 2

Fragment d’AG de 6C

ACP~S - C-CH2- C-CH2-CH2-CH3

E O O

Cys~S-H
Pr. Salwa ABID
8- Hélice de Wakil Etude de A. Caprique (AG saturé à 10C)

ACP-S~CO-CH2-COOH + 1 CO2
E + 1 ATP
Cys-S~CO-CH3
+ 1 acétylCoA + 1 (1erc)
ACP-S~CO-(CH2)2-CH3 + 2 NADPH + H+
E
- 1 CO2
Cys-SH

ACP-S~CO-(CH2)4-CH3
E
Cys-SH

ACP-S~CO-(CH2)6-CH3
E
Cys-SH

ACP-S~CO-(CH2)8-CH3
E
Cys-SH Pr. Salwa ABID
Libération de l’AG synthétisé et bilan
ACP-SH
ACP-S~CO-(CH2)8-CH3
E H OH
E
Cys-S~CO-(CH2)8-CH3
Cys-SH

ACP-SH
E
Cys-SH HOOC-(CH2)8-CH3
Complexe multienzymatique libéré A. Caprique néosynthétisé

Pr. Salwa ABID

Synthèse des AG insaturés
Synthétisés à partir de leur équivalents saturés : il faut créer
la double liaison

Exemple: A. Oléique à partir de l’A. Stéarique

CH3-(CH2)16-COOH A. Stéarique

Activation

CH3-(CH2)16-CO~SCoA StéarylCoA

CH3-(CH2)7-CH2- CH2-(CH2)7-CO~SCoA
O2 gazeux
Oxydase ou NADP+
désydrogénase
NADPH + H+
CH3-(CH2)7-CH=CH-(CH2)7-CO~SCoA OléylCoA

Polyéthyléniques: même mécanisme; respecter la règle de disposition des

doubles liaisons par famille d’insaturés et l’alternance du motif malonyl
Pr. Salwa ABID
Métabolisme
des Lipides

Pr. Salwa ABID

A- Catabolisme des Glycérolipides

Catabolisme d’un glycérolipide débute par une dissociation :

dissociation
Glycérolipide A. Gras + Glycérol + P -X

Catabolismes
particuliers de b-Oxydation Catabolisme Catabolisme
chaque composant glucidique spécifique de X

Pr. Salwa ABID

 I- Action des lipases pancréatiques

Isomérisation
spontanée
a a a a
R1-C-O- CH2 HO-CH2 R2-C-O-CH2 HO-CH2
O b Lipase b O b Lipase b
R2-C-O-CH R2-C-O-CH HO-CH HO-CH
O R1-C-OH O R2-C-OH
R3-C-O-CH2 O HO-CH2 HO-CH2 O HO-CH2
a’ R3-C-OH a’ a’ a’
O
O
Triglycéride b-Monoglycéride a-Monoglycéride Glycérol
Pr. Salwa ABID
 II- Action des phospholipases

PLA
a
R1-C-0- CH2
O
PLB b
R2-C-0- CH
O PLC PLD

CH2 - O - P -O-X
’
a

Etude d’un exemple : a,b dipalmityl-phosphatidyl-choline

Pr. Salwa ABID
B- Biosynthèse des Glycérolipides
Ils ont un précurseur commun : l’Acide phosphatidique

I- Synthèse de l’A. Phosphatidique

HO CH2 R1 C O CH2 R1 C O CH2

O O
(1) (2)
HO CH HO CH R2 C O CH
O
CH2 OP CH2 OP CH2 OP
Glycérol phosphate A. Lysophosphatidique A. phosphatidique

(1) : 1ère estérification (transacylase) + R1COSCoA CoASH

(2) : 2ème estérification (transacylase)

Pr. Salwa ABID + R2COSCoA CoASH
II- Synthèse des glycérolipides
R1 C O CH2 R1 C O CH2

O O

HO CH R2 C O CH
X + CTP
O
CH2 O P Phosphatase
CH2 O P CDP-X + Pi
A. Lysophosphatidique A. phosphatidique
Pi transacylase

Pi Phosphatase R1 C O CH2 R1 C O CH2

CMP + Pi
O O
R1 C O CH2 R1 C O CH2
R2 C O CH R2 C O CH
O O
O O
HO CH R2 C O CH
CH2 OH R3 C O CH2
O
O
CH2 OH CH2 O P X
Di et / ou
Monoglycéride Phosphatidyl - X Triglycéride
Pr. Salwa ABID
X = Ethanolamine; Serine; Choline
 C- Biosynthèse des Sphingolipides
Lipides dont l’alcool aminé est la sphingosine
I- Synthèse de la sphingosine
la sphingosine est synthétisée à partir d’A. palmitique et de Ser
Etape 1 Réductase

CH3-(CH2)14-CO~SCoA CH3-(CH2)14-CHO + CoASH

A. Palmitique NADH + H+ NAD+ Palmitaldéhyde

NH2
Etape 2 Ser
COOH-CH-CH2-OH
CH3-(CH2)12-CH2-CH2-CHO CH 3-(CH2)12-CH2-CH2-CH-CH-CH2-OH
Palmityl-Ser-Aldol OH NH2
Palmitaldéhyde décarboxylase Dihydrosphingosine

Etape 3
Déshydrogénase
CH3-(CH2)12-CH-CH-CH-CH-CH2-OH CH3-(CH2)12-CH CH-CH-CH-CH2-OH
H H OH NH2 OH NH2
NAD+ NADH + H+
Dihydrosphingosine Pr. Salwa ABID Sphingosine
II- Synthèse des sphingolipides simples = céramides
Association sphingosine + AG

CH3-(CH2)12-CH CH-CH-CH-CH2-OH R-C~SCoA

HO NH2 + O

Sphingosine

CoASH

CH3-(CH2)12-CH CH-CH-CH-CH2-OH
HO NH-C=O
R

Sphingolipide simplePr.
ou céramide
Salwa ABID
III- Synthèse des sphingolipides complexes
Association sphingosine + AG + X
1- Les sphingomyélines L’élément X = P -Choline
= céramide + P -Choline
CH3-(CH2)12-CH CH-CH-CH-CH2-OH
HO NH-C=O
R
HO-CH2-CH2-N(CH3)3
Activation + CTP
de la
choline=
Pi
CDP-choline CDP-0-CH2-CH2-N(CH3)3 CMP + pi

CH3-(CH2)12-CH=CH-CH-CH-CH2-O- P –CH2-CH2-N+(CH3)3
HO NH-C=O
R
Pr. Salwa ABID
 2- Cérébrosides et Gangliosides
L’élément X = ose ou polyoside (glucide)

CH3-(CH2)12-CH CH-CH-CH-CH2-OH
HO NH-C=O
R

Glucose + UTP
Activation
du glucose
Pi
UDP-Glucose
UDP

CH3-(CH2)12-CH CH-CH-CH-CH2-O-Glucose
HO NH-C=O
R

Cérébroside
Pr. Salwa ABID
 CH3-(CH2)12-CH CH-CH-CH-CH2-OH
HO NH-C=O
R

Polyoside + UTP
Activation
du polyoside Pi
UDP-Polyoside
UDP

CH3-(CH2)12-CH CH-CH-CH-CH2-O-Glu-Glu…Glu
HO NH-C=O polyoside
R

Ganglioside
Pr. Salwa ABID
 Les
Lipoprotéines

Pr. Salwa ABID

Organisation et structures
I- Caractéristiques

Micelle +-+

+
+
+ +

Pr. Salwa ABID

II- Différents types de lipoprotéines
Lipides

%
Type Densité % protéines % Triglycérides Phospho- % Choestérol schéma
Lipides

Chylo-
microns
0,94 1,5 96 0,8 1,7

VLDL 0,97 10 60 15 15

LDL 1,03 25 10 20 45

HDL 1,14 50 3 30 17

Pr. Salwa ABID

Les structures
membranaires

Pr. Salwa ABID

Les membranes
- Double couche

- Constitution:

* double couches de phosphoLipides

P-sérine, P-choline

* protéines insérées

- Fluide, dynamique, se renouvelle

Pr. Salwa ABID

Métabolisme des lipides (processus général)

Pr. Salwa ABID