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Apolaire Polaire
Hydrophobe Hydrophiles
La Glycine est le seul AA qui n'as pas de carbone asymétrique, c'est l'AA le plus simple
.
Formule des AA °Les AA sont en steriomère L (donc asymétrique et optiquement actif)
°Les AA sont ionisable
. COOH COO- COO-
Peptides
Oligopeptide Polypeptide
2-10 AA 10-99 AA
Les protéines Forme globale
Roles
Globulaire Fibreuse
Exp : Régulière Non régulière °Ici la proteine prend une °Constitué de plusieurs ( 2 ou plus )
Répétitive Non répétitive structure 3D, tel que : sous-unités :
Gly Val Leu ... partie hydrophile --> exterieur -Sous-unité = protomère
Hélice alpha Feuillet beta Boucle Coude partie hydrophobe --> interieur -Plusieurs sous-unités = Oligomère
°Vient apres la traduction °Stabilisé par 4 liaisons : 2 sous-unité = dimère
°Séquance d'acides aminés °Stabilisé par des °Stabilisé par des
-Ionique 4 sous-unité = Tétramère
relié par des liaisons liaisons hydrogènes liaisons hydrogènes -Hydrogène 6 sous-unité = Héxamère
peptidiques ( pont S-S qlq intrachaines interchaines -Hydrophobe °Insoluble dans l'eau ( car il y a bcp
°2 types : °2 types :
fois ) gauche et droite -Parallèle
-Van der waals d'AA Hydrophobes ) Sous-unité
°Commence par N-Terminal -Antiparallèle (+stable) ( pont dissulfure )
à gauche et se termine par
C-Terminal à droite
NB:
Myoglobine : 1 globule rouge = 280 millions Hb
-Protéine (metalloprotéine) simple riche en hélice apha
-Transporte O2 vers les muscles
Hémoglobine 1 Hb = 4 site de fixation d'O2
Type Fixation O2
Hb muttante
Oxyhémoglobine Désoxyhémoglobine -L'O2 se fixe sur HB sur la chaine latérale d'un résidu d'histidine
-Lorsque l'O2 se fixe , le Fe2+ se déplace de sa position initiale
-La chaine a à + d'affinité avec O2 donc c'est elle qui fixe l'O2 en
-L'anomalie est due à la substitution des A.A premier puis fait augmenter l'affinité des autres chaines
-Existent +300 anomalies (cooperativité entre les chaines pour 02)
Hb avec O2 Hb avec CO2
-Remarque : 2,3 DPG bloque Hb en etat T (tendu) = pas de
PO2 favorise la -Instabilité de la structure de Hb = altération de la
forme oxy
mouvement = pas de cooperativité = bloque Hb de capter O2
fonction
Méthode de séparation
CO2 pour N-Terminal
Electrophorèse Solubilité en solution saline Hb fixe H+ pour C-Terminal HbA1 possède 2 chaine alpha et 2 chaine beta
Substrat Produit
Les enzymes °Les E allostériques Ont une courbe sigmoide
°Les E michaelienne ont une courbe hyperbole
°Représentation de lineweaver burk l'ordonné à l'origine = 1/Vmax
°La constante de Michalis (Km) = concentration de S à laquelle la
vitesse de la réaction enzymatique = 1/2 Vmax
Cofacteur
Sont des protéines, catalyseur de reactions enzymatique spécifique de substrat déterminé, augmentent la vitesse de réaction sans affecter l'équilibre, possède
un site actif capable de reconnaitre, transformer (catalyser) et fixer le substrat agissent à tres faible concentration et sont inchangés à la fin de la réaction
1) transporte ou complete
le substrat
2) recevoir un produit
3) participe à la structure Classes Nomenclature Les inhibiteurs
de l'enzyme
Nom Numéro matricule
Inorganique Organique 1 Oxydoréducteur Irréversible Réversible
2 Transférase Modele enzymatique normal
Substrat+ase Compose de 4
Exp : °Se fixe sur l'enzyme et stoppe la
Petite molécule ou °Coenzyme (molécule complexe) 3 Hydrolase chiffres
saccharase fonction de l'enzyme
Ions minéraux : °indispensable dans la reaction Exp : EC 3.4.4.5 ° plus [I] plus V
S+ E ES P + E
4 Lyase ou
Mg2+ Na+ K+ ... enzymatique Classe Exp :
-peut etre synthetisé par Substrat + Aspirine, inhibiteur des COX, Compétitif Non compétitif
Sous-classe
l'organisme 5 Isomérase transformation modifie le site catalytique de E par
+ ase Réaction chimique acétylation
-ou apporté par l'alimentation
6 Ligase Exp : Caractéristique et empeche
(vitamine)
lactate de l'enzyme donc la
formation L'affinité diminue L'affinité non modifié
déshydrogénase de prosta- La Vmax non modifié La Vmax diminue
glandines
Site de fixation Site actif
B1 = Thiamine TPP ( Thiamine pyrophosphate ) CoE lié groupement prosthétique Décarboxyation oxydative Béribéri syndrome de wernicke
FAD flavine adénine dinucléotide (oxydé) FADH2 (réduit) CoE lié groupement prosthétique des
B2 = Riboflavine Oxydoréduction Dermatose
FMN flavine mononucleotide ( FMNH2) flavoprotéines
B3 = Niacine = PP = Nicotinamide = NAD+ nicotinamide dinucléotide (oxydé) NADH (réduit ) CoE libre
Oxydoréduction Pellagre
Acide nicotinique NADP+ nicotinamide dinucléotide p ( NADPH ) NADH absorbe dans l'UV a 340 nm
Choline - -
-
Coenzyme Q = UQ = ubiquinone CoE mobile CRM Oxydoréduction Q/QH2 -
(Ne dérive pas de vitamine)
Glucides
->Sont des molécules organiques -> Constitue la matière organique -> Alimentaire -> 200 à 300 gr par jour
-> Sont des aldéhydes ou des cétones -> Réservoir d'énérgie -> Métabolique (Néoglucogénèse) -> 150gr pour le cerveau et 50gr par organe
-> Possèdent des groupes hydroxyles (-OH) -> Intérmédiaire métabolique -> 1gr = 4 Kcal
-> Formule : (CH2O)n -> Structural (polysacharides) paroie cellulaire -> Adulte 70Kg au repos a besoin 2400 Kcal
-> Constituant de l'ADN et l'ARN dont 50% de glucide ( sportif 55% )
-> Lié à des protéines et des lipides -> Enfant 8-10 gr/Kg et /j
-> Enfant prématuré 15 gr/Kg et /j
-> Les agées diminue leur apport en glucides
Glucides
Ose Oside
Composé non hydrolysable Glucolipide Oses liés par des liaisons osidiques
portant une fonction carbonyle Liaison osidique : covalente, libère 1H20
et des fonctions alcool
Holoside Hétéroside
Monosacharide Dérivés d'oses constitué uniquement d'ose ose + composé non glucudique
1 ose
Epimère Oses
non hydrolysable
Propriété
uche a dr
a ga oite
H -C- OH OH -C- H
?-... ?-...
( Chaise ou
H OH bateau )
Rotation 90°
(6C) Héxose --------> pyranose (5C + 1O)
Triose
Le Glucose a 2 forme
anomérique ? et ?
Butanose
Dérivés d'oses
Estérification du glucose
Pentose
Les osides
Oses liés par des liaisons osidique. La liaison osidique est une
liaison covalente reliant des oses avec élimination de H2O
Hétéroside
Holoside
°Insoluble dans l'eau Complètement Amphiphile : °Ester d'Acide gras + Structural Autre roles Energitique Exogène Endogène
°Soluble dans les solvants organique hydrophobe apolaire hydrophobe (apolaire) Glycérol
et °Formé de C, H et O
hydrophile (polaire) mais peuvent contenir : Des membranes Réserves Alimentaire Synthèse à
Classifications des lipides P : phospholipide (lipoprotéines) Médiateurs partir du
S : Lécithines Hormones Saponification glucose
Lipide dérivé et Lipide Neutre : N : Sphingomyéline Vitamines
Lipide simple Lipide complexe
précurseurs de lipides Glycéride et ester Ose : Cérébroside Coenzymes
K K+ + H2O
-> Les glycérides : -> Les phospholipides : Acides gras de cholestérol Alcool : Sphingosine Emulsifiants RCOOH + ou OH ------> RCOO-,
Glycérol
Glycérol
Glycérol
Glycérol
nbr de C Nom de l'A.Gras position de la 1ère = liaison
en partant de CH3 + AG -----> ou AG ou
4 Butyrique Exp pratique :
AG
6 Caproique ?(1) ?(2) ?(3)
1 3
8 Caprylique 2 Diglycéride
10 Caprique C18:3 W3 ? 9,12,15 = Acide linolénique (soja) Glycérol AG AG
Glycérol
Glycérol
Glycérol
AG
si pas = liaison, on met Cn:0 + -----> AG ou AG ou
12 Laurique
Exemple d'A.Gras insaturé : AG
14 Myristique AG AG
Acide cérébronique : (1,2)? (2,3)? (1,3)?
16 Palmitique Acide gras saturé -> Acide oléique : 1 = liaison C18:1 W9
C24:0 avec un OH sur Abondant dans les graisses végétales et animales
18 Stéarique AG AG
le C2 aussi appelé C? -> Acide linoléique :(tournesol) 2 =laison C18:3 W9
Glycérol
Glycérol
20 Arachidique Acide gras essentiel et précurseur de l'acide Triglycéride (résérve de lipide) situé dans les
+ AG -----> AG
arachidonique C20:4 adipocytes et transporté par les lipoprotéines
22 Béhénique
NB : Le C du COOH est -> Acide arachidonique : 4 = liaison C20:4 W6
le C1 Acide gras essentiel précurseur des prostaglandines AG AG
24 Lignocérique
Strutural : 2
Les lipides
20C
Phospholipides Stérides Eicosanoides Sphingolipides
P
polaire PGA,B,E,F TXA2 Présent au °Constituant des membranes cellulaires (cortex cérébral)
hydrophile Présent dans tous Présent au niveau niveau des °Ce sont des phospholipdes
Phospholipide apolaire hydrophobe
-> 1 OH sur le 3C les tissus des plaquettes leucocytes °Contiennent le plus souvent des AG insaturés
AG °La sphingosine est liée à :
-> 4 noyaux stérol
Glycérol