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Module : Enzymologie

TD n °= d’enzymologie : Nomenclature et classification

Notes :

EC veut dire Enzyme classification

06 grandes classes dépendantes des types de réactions :

Classe 01 : Oxydoreductases :

En biochimie , les oxydoreductases sont des enzymes catalysant les réactions d’oxyreducation , en transférant les ions de H + et des électrons ,une enzyme catalysant une réaction de type : A - +B--)A+ B -

On écrit alors EC 1

Classe 02 : Transférases :

Sont des enzymes dont le rôle est de catalyser le transfert d’un groupement fonctionnel d’une molécule , catalysant une réaction de type : (A-x)+B -- ) A + (B-x)

On écrit alors EC2

Classe 03 :Hydrolases :

Constituent une classe d’enzymes qui catalysent les réactions d’hydrolyse de molécule suivant la réaction générale de type : (R-R* ) +H 2 O ( -- ) ( R – OH ° + ( R’ - H )

Classe 04 : lyases :

Catalysent les liaisons covalentes grâce a d’autres moyens que l’hydrolyse ou l’oxydation , elle forme ainsi souvent des doubles liaisons ou des molécules cycliques , catalysant une réaction de type :

A --) B+C , Exemple : AMPC ( adénosine mono phosphate cyclique )

Classe 05 : Isomères :

Des enzymes qui catalysent les changements au sein d’une molécules , souvent par réarrangements des groupements fonctionnels et conversion de la molécule en un de ses isomères , catalysant une réaction de type : A -- ) A ‘

Classe 06 : Ligases :

Des enzymes qui catalysent la jonction entre 02 molécules par des nouvelles liaisons covalentes avec hydrolyse de L’ATP ou d’autres molécules similaires , il existe de nombreux types de ligases en fonction du type de liaison covalente qu’elle catalyse , elle utilise généralement ATP ou GTP

Module : Enzymologie Prof : Mme dib

TD n°= 02 d’enzymologie : la cinétique michaelis

Exercice 01 :

La representation de la cinétique d’une reaction enzymatique selon

l’expression Linweaver- Burk permet de montrer que la droite obtenue croise

l’axe des ordonnées a 0.037

Tant dis que la pente de cette droite obtenue est de 1.04 x 10 -3

Q) Quelle est la constante de michaelis km ?

Solution 01 :

V max = 0.037

Vi = pente 1.04 x 10 -3

Exercice 02 :

, Km = 1/ Vmax x Vi = 1/ 0.037 x 1.04 x 10 -3

=

2.8 x 10 -2 M

On utilise la constante de michaelis km d’une enzyme avec plusieurs substrats de structures voisines .

Les resultats sont les suivants :

5 x 10 -4 M / 3 x 10 -3 M / 3.5 x 10 -4 M

/ 6 x 10 -2 M / 5.5 x 10 -2 M

Q

1 ) Quelle est le but de cette expérience ?

Q

2 ) Interprétez les résultats .

Solution 02 :

Le but est de voir le dégrée de l’affinité entre l’enzyme et le substrat

L’affinité correspond a l’inverse de km , l’enzyme a plus d’affinité pour son substrat c'est-à-dire celui qui possede la km la plus faible