NASSOR YOHANE

KARIM HASSANALY FAYAZ

TG1

L’ADN DE L’OCÉAN,
DÉCRYPTÉ PAR
TARA
ET
LE CEA-GENOSCOPE
 TARA
Tara, est un voilier français destiné à la recherche scientifique
et à la défense de l'environnement.
Mais c'est aussi une fondation (Tara Océan), consacrée à
l’Océan en France, qui développe une science ouverte et
innovante permettant de prédire l’impact du changement
climatique.

CEA-GENOSCOPE

Le Genoscope est un centre national de séquençage français

situé sur la Génopole d'Évry avec des laboratoires de
recherche académique et des entreprises de biotechnologies.
Celui-ci s'occupe du séquecage de l'ADN et du traitement
informatique des données.

2008
 OBJECTIFS
Comprendre la diversité génétique des espèces présente dans
les récifs coralliens.
Comprendre quels gènes s'expriment selon les environnements.

COMMENT ?
Pour comprendre la diversité génétique des espèces présentes
dans les récifs coralliens, le groupe TARA et la CEA-genopscope
vont effectuer des plongées dans différents endroits et
profondeurs afin de récolter des échantillons d'espèces liées aux
coraux (coraux, micro algues et micro organismes).

Une fois les échantillons récoltés, ils vont utiliser le séquenceur

MinIon afin d'étudier l’ADN des espèces prélevées et les
comparer à ceux déjà connues afin de voir s'il y a de nouvelle
espèces.
Notamment, cela a permis d'identifier certains espèce comme :
Naviculales, minidiscus, Raphid-pennate...
COMMENT FONCTIONNE
LE SÉQUENÇAGE ?
L'objectif est d'extraire l’ADN des échantillons afin de cibler
certains gênes marqueurs pour identifier les espèce de coraux,
de micro algues symbiotiques et de micro organismes associés
à ces coraux.
Le séquençage ainsi que les traitement informatique des
données est effectué par Genoscope.
La 1ère étape consiste à préserver les échantillons prélevées
en ajoutant un tampon de préservation dans les morceaux de
corail et en les préservant à une température de -20°C.

Après les avoir transportés jusqu'au site du Génoscope dans

des conditions de température adéquates, les morceaux de
corail sont broyés pour extraire les polypes et les organismes
associés. Les ADN et les ARN sont ensuite séparés des débris
cellulaires. Puis on ajoute des adaptateurs aux extrémités des
fragments pour qu'ils soient ensuite analyser par les
séquenceurs.
Les données récoltées sont traitées par des logiciels afin de
constituer des bases d'ADN. Ensuite un contrôle de qualité
est effectué par un programme afin de vérifier si le
séquençage s'est bien passé.
L'étape finale est d'étudié ces données, notamment grâce au
supercalculateur du CEA, afin de comprendre la biodiversité
du corail.

 AVANTAGES
Les intérêts à travailler à partir de séquençage d'ADN sont
de pouvoir étudier des organismes d'une taille inférieur à 10
µm, qui ne sont pas identifiable par une caméra intelligente.

La biodiversité désigne la variété des formes de vie sur la

Terre.
L'étude de l'abondance et celle de la richesse spécifique sont
complémentaire l'une de l'autre pour décrire la biodiversité,
car pour être estimer la biodiversité, celle-ci dépend du
nombre d'individus composant une espèce ainsi que le
nombre d'espèces qui peuplent ce milieu.