Résistances aux antibiotiques

Dr Aissatou .A. NIANG

Maitre assistante

Bactériologie - virologie

4 ième année médecine, 2023

 Objectifs
1. Définir les résistances aux antibiotiques

2. Définir l’antibiogramme

2. Expliquer les mécanismes de résistance

3. Enumérer les supports génétiques de la résistance aux

antibiotiques

4. Expliquer les bases de la lecture interprétative de l’ABG

 Conditions d’action des antibiotiques

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I. Rappels :
1. Action des antibiotiques
2. Sites d’action des antibiotiques
 II. Résistance aux antibiotiques

Capacité d’une souche bactérienne de se

multiplier dans une concentration d’ATB > à celle qui inhibe la

majorité des souches appartenant à la même espèce

Elle peut être naturelle ou acquise

 II. Résistance aux antibiotiques
• Résistance naturelle : rare
• transmission verticale (descendance)
• propre à un genre, à une espèce
• support = noyau

• Résistance acquise : fréquente

• transmission horizontale
• touche petite partie genre/espèce
• support = plasmides, noyau
 Supports génétiques de la résistance
Résistance naturelle
• Caractéristique propre appartenant
à l’ensemble des souches d’une
espèce
• Chromosome
• Phénotype sauvage
• Caractère inné: transmission
verticale
• Critère d'identification
ex: E. coli et Vancomycine
Résistance acquise
• Acquisition de mécanismes de
résistance par une souche d'une espèce
habituellement sensible
• Plasmidique +++
• Phénotypes de résistance
• Transmission horizontale
• Evolutive
• Marqueur épidémiologique
ex: E. coli et Ampicilline
. Antibiogramme = méthode d’analyse qui a pour but de
déterminer la CMI de plusieurs antibiotiques face à la
croissance bactérienne

Concentration minimale inhibitrice ou CMI = la plus petite

concentration d'antibiotique suffisante pour inhiber la
croissance d'une souche de bactéries
Antibiogramme

* Indications

Aide au choix du Surveillance

traitement +++
Prédiction de la sensibilité
d’un germe à un ou
plusieurs antibiotiques
Identification
épidémiologique
bactérienne
Mise en évidence des
de la résistance
résistances naturelles bactérienne

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 Methodes d’étude de la CMI
• Dilution en milieu solide :
- Antibiotique incorporé dans la gélose (concentrations croissantes)
- Inoculum standardisé ensemencé par pointe (appareil semi
automatique)
- Plusieurs souches à la fois
- Plus faible concentration sans culture visible
• Dilution en milieu liquide :
- Inoculum bactérien standardisé
- Contact avec des concentrations croissantes d'antibiotiques selon une
progression géométrique de raison 2 : 0,25 / 0,5 / 1 / 2 / 4 / 8 / 16 /
32 / 64 / 128 / 256 … mcg par ml
• Diffusion en gélose :
E-test (méthode epsilométrique)
- Bandelettes : gradient de concentration d’ATB :0,016 à 256 mg/l ou de 0,002 à 32 mg/l
- Ensemencement / Dépôt bandelettes
- Ellipse d'inhibition : les points d'intersection avec la bandelette définissent la CMI (lecture
directe)
Méthode de diffusion en milieu gélosé: Antibiogramme standard
Disques d’antibiotiques
Référentiel: CASFM (Comité de l’Antibiogramme de la Société Francaise
de Microbiologie)
Zone d’inhibition
 Résultats exprimés en catégories cliniques
• Sensible (S) = forte probabilité de succès thérapeutique si
voie systémique et posologie recommandée
- CMI <<<< Concentrations in vivo

• Résistant (R) = forte probabilité d’échec thérapeutique quels

que soient le type d’administration et la dose administrée
- CMI > Concentrations in vivo

• Intermédiaire (I) = succès thérapeutique imprévisible

- CMI = Concentrations in vivo
Mécanismes de la résistance
1.
IMPERMEABILITE
4.
MODIFICATION
DE CIBLE

2. EFFLUX

3.
INACTIVATION
ENZYMATIQUE

Une espèce bactérienne peut posséder plusieurs mécanismes concomitants

 Lecture interprétative de l’antibiogramme
Nécessite de connaître :
o les résistances naturelles de chaque espèce
o les mécanismes de résistance acquises connues
Résistance naturelle
- Entérobactéries : Pénicilline G
- Klebsielles : Amoxypénicillines et Carboxypénicillines
- Streptocoques : Aminosides, Polymyxines
- Pneumocoque : Aminosides, Acide Fusidique, Polymyxines
- Entérocoques / Pénicillines M, Aminosides, Céphalosporines 17
Résistance naturelle
 Objectifs de la lecture interprétative

Vérifier la cohérence Transformer un résultat catégorisé

germe/antibiogramme «S» en «I» ou «R» en raison d'un
risque d'échec thérapeutique

Détecter les phénotypes de résistance Généraliser des résultats à des

impossibles ou hautement improbables antibiotiques non testés

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 Conditions
Liste d’antibiotiques testés fonction de la bactérie
Antibiotiques dits ‘’marqueurs’’ dans la liste
Disposition des antibiotiques par famille
Disposition particulière des disques de la même famille

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 Trois étapes pour cette lecture:

1. Pour chaque famille d’antibiotiques, on observe le

résultat brut in vitro obtenu pour un certain nombre
de molécules judicieusement choisies: on obtient
ainsi un phénotype de résistance « observé »

2. De ce phénotype de résistance « observé »,

on déduit un mécanisme biochimique de
résistance

3. Une fois le mécanisme élucidé, on en déduit

toutes les résistances croisées pour établir le panel
de l’ensemble des molécules concernées par le
mécanisme de résistance incriminé 21
 Lecture interprétative
Ex 1 : Staphylocoques et bêta-lactamines

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 Phénotype sauvage
SENSIBILITE NATURELLE RESISTANCE NATURELLE
- bêta-lactamines - colistine
- aminosides - acide nalidixique
- fluoroquinolones
- aztreonam
- phénicolés
- fosfomycine
- cotrimoxazole
 Antibiotique
Molécules Pénicilline G S R R
testées Céfoxitine S S R
Amoxicilline S R R
Augmentin S S R
Molécules Ticarcilline S R R
déduites Pipéracilline S R R
Céfalotine S S R
Ceftriaxone S S R

Phénotype Sauvage Pénicillinase Méti-R

Mécanisme Sécrétion de Modification
de résistance bêta-lactamase de cible
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 Antibiotique
Molécules Pénicilline G S R R
testées Céfoxitine S S R
Amoxicilline S R R
Augmentin S S R
Molécules Ticarcilline S R R
déduites Pipéracilline S R R
Céfalotine S S R
Ceftriaxone S S R

Phénotype Sauvage Pénicillinase Méti-R

Mécanisme Sécrétion de Modification
de résistance bêta-lactamase de cible
25
Staphylococcus aureus

Pensez vous que ce résultat est correct?

Phénotype?
Interprétation?
Pensez vous que cet antibiogramme est correct?
NON
 Lecture interprétative
Ex 2: Entérobactéries et bêta-lactamines

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 Phénotype sauvage

SENSIBILITE NATURELLE RESISTANCE NATURELLE

- bêta-lactamines (exceptions) - pénicilline G
- aminosides - oxacilline
- quinolones et fluoroquinolones
- glycopeptides
- phénicolés
- acide fusidique
- fosfomycine
- cotrimoxazole
 Mécanisme de
Groupe Espèces
résistance naturelle
0 Proteus mirabilis, Salmonella spp Aucun
Céphalosporinase bas niveau
1 Escherichia coli, Shigella spp
non inductible

2 Klebsiella pneumoniae, klebsiella oxytoca, Citrobacter koseri Pénicillinase

Enterobacter aerogenes, E. cloacae, Citrobacter freundii,

3 Serratia marscesens, Morganella morganii, Hafnia alvei
Céphalosporinase inductible

Pénicillinase et
4 Yersinia enterocolitica
Céphalosporinase
5 Proteus vulgaris, Proteus penneri Cefuroximase
Kluyvera spp, Citrobacter sedlakii, Ranhella aqualitis,
6 Erwinia persicina
BLSE chromosomique
 Résistances naturelles: phénotypes sauvages

G0 G1 G2 G3 G4 G5 G6

Amox S S/I R R R R R

Amox +
Ac clav S S/I S R R S R

Ticarcilline S S R S R S R

Céfalotine S S/I S R R R R
 Résistances acquises: principaux phénotypes de résistance

Phénotypes Interprétation
Amox Augm C1G C2G C3G AZT C4G IPM

Pénicillinase R S S S S S S S

Céphalosporinase bas niveau R R R R/S S S S S

Céphalosporinase haut niveau R R R R R R S S

Bêta-lactamases à spectre élargi (BLSE) R S/I/R R R R R R S

 Règles de prescription
- Diagnostic positif
- Antibiotique actif sur le germe
- Etude du terrain : contre indications, grossesse,
immunodépression…
- Bonne diffusion dans le tissu concerné
- Moindre coût à efficacité égale
- Association d’antibiotiques
 Conséquences de la résistance aux antibiotiques
• Conséquences nombreuses:
• Allongement durée d’hospitalisation
• Impasse thérapeutique
• Coût économique
• Pronostic vital

Facteurs favorisant la résistance aux antibiotiques

• Utilisation irrationnelle des antibiotiques
• Développement des marchés illicites
• Qualité des antibiotiques
Conclusion
 L’antibiogramme est une technique standardisée, donc facile à réaliser
 Incontournable pour un laboratoire de Bactériologie réalisant la culture
 Outil indispensable pour la surveillance de la résistance aux
antibiotiques (exigence au niveau mondial)

Interprétation: indispensable, délicate mais bien codifiée

Utilisation satisfaisante des résultats issus de l’antibiogramme :

responsabilité du biologiste et du prescripteur
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