UE 2 – Biologie Cellulaire

La cellule

I – La théorie cellulaire
Ils ont étudié cette fois-ci de nombreux tissus vivants (végétaux et animaux) et ont alors énoncé
les bases de la théorie cellulaire : la cellule est l’unité structurale et fonctionnelle du vivant.

II – Définition et propriétés de la cellule

1) Définition
2) Les propriétés de la cellule

De plus, elle possède une machinerie biochimique de base commune à toutes les cellules que
ce soit une bactérie ou un être vivant multicellulaire

III) Classification

1) Les deux grandes classes de cellules

De plus, les archaebactéries possèdent des caractéristiques (présence d’introns, de duplication

de gènes et de mécanismes de réplication) qui sont beaucoup plus proches des eucaryotes que
des procaryotes.
Les scientifiques étudient encore aujourd’hui ces archaeactéries afin de pouvoir mieux dater et
expliquer la phylogénie de ces domaines du vivant.

2) Les acaryotes

(Grippe, sida, Sars-CoV-2)

Exemple :
Le SIDA, également appelé VIH (Virus de l’Immunodéficience Humaine).
Les virus possède un matériel génétique soit sous la forme d’une molécule d’ADN soit d’ARN.

3) La classe de procaryotes
 Les archaebactéries (3e domaine du vivant) sont des bactéries archaïques, anciennes qui vivent
dans des conditions extrêmes (milieux hyper-salins, températures extrêmes, pH proches de zéro
...). et grâce à ces Dans ces habitats divers et hostiles, elles ont développé des métabolismes très particuliers
(photosynthèse parfois).

a) La diversité des cellules procaryotes

En plus de cette diversité morphologique, on retrouve une très grande diversité de métabolisme (certains sont
capables de photosynthèse) et d’habitat (certains procaryotes vivent et se reproduisent dans des milieux
aérobies, d'autres anaérobies).

b) La cellule procaryote type

4) La classe des eucaryotes (titre à rajouter page de garde)

a) La diversité des cellules eucaryotes
3. des virus : le VIH, la grippe, la poliomyélite, SARS-CoV-2…

• elles ont acquis des particularités qui servent les besoins de l'organisme comme entité.

Exemples de types de cellules :

• Cellules musculaires squelettiques, dans le tissu musculaire
• Globules blancs et globules rouges, dans le sang
• Adipocytes, dans le tissu adipeux

b) La cellule animale eucaryote type

Dans la cellule, chaque composant est entouré́ d'une membrane (le noyau est entouré d’une double
membrane et les autres composants d’une simple membrane)
Il y a donc une mise en jeu de mouvements intracellulaires au sein de la cellule mais aussi des
mouvements de l’intracellulaire vers l’extracellulaire et inversement.

Dans la cellule, chaque composant est entouré d'une membrane (le noyau et la mitochondrie sont entourés
d’une double membrane et les autres composants d’une simple membrane), il en résulte une augmentation du
rapport surface membranaire/volume cellulaire ♥.

La présence de ces composants va aussi induire la nécessité de transports intracellulaires spécifiques et

complexes pour que les molécules organiques puissent passer d’un compartiment à un autre ou sortir/entrer
de la cellule. Il y a donc une mise en jeu de mouvements intracellulaires au sein de la cellule mais aussi des
mouvements de l’intracellulaire vers l’extracellulaire et inversement.

c) Les organismes modèle d’études

On prend des souris KO (Knock Out) : souris dont on a invalidé entièrement un gène.
Quand la souris est viable, on peut alors étudier l’impact sur le reste du métabolisme et définir la fonction du
gène invalidé. On a ainsi étudié des étapes du développement, ainsi que de l’immunologie.

Infos :

Tous les mots dans les diapos peuvent faire l’objet d’items au concours ! Mme Dieudonnée relie ses
diapos en faisant ses qcms.

A la demande du Pr Dieudonné, le plan du cours à partir des méthodes d’études de la cellule à été
modifié pour une meilleure compréhension. J’ai donc regroupé les préparations des échantillons
sous chaque type de microscopie ce qui donne maintenant :

Cette partie de cours comprends des notions sur les méthodes en histologie.
Il est important que vous compreniez bien toutes les techniques décrites ici, afin de réussir au mieux les
exercices de biologie cellulaire.
Vous remarquerez certainement quelques contradictions entre les cours d’UE2 sur les notions suivantes, je
sais que c’est très perturbant mais essayez de bien séparer les informations de chaque cours.
N’hésitez pas à poser des questions au prof pendant les séminaires ou les TDs à ce sujet.
Les méthodes d’étude sont très importantes en biologie, elles ont notamment permis de mettre en évidence
l’organisation des cellules ainsi que leurs propriétés.

1 – La microscopie optique (MO)

a) Echelle du vivant et résolution des systèmes d’observation

NB : 1 micron = 1 micromètre = 1μm = 10-6 m

Avec la microscopie optique, on peut passer à une observation de 0,2 mm à 0,2 μm (échelle de la cellule).
Avec la technologie plus sophistiquée du microscope électronique, on passe de 0,2 mm à 0,2 nm (échelle de
la molécule).

b) Microscope optique
• Image obtenue : Selon la préparation de l’échantillon, on peut observer des images en noir
et blanc (pour des cellules vivantes) ou des images colorées (par un colorant) ou des images
fluorescentes (par un marqueur fluorescent). On obtient généralement une image en 2D, mais
grâce à l’utilisation de certains logiciels et microscopes certaines peuvent être en 3D.

Pour retenir vous pouvez vous dire que le colorant est un produit chimique, donc « dangereux », et
qu’il va le plus souvent tuer les cellules lors de son application.
1) Étalement cellulaire de cellules sanguines fixées avec leur noyau coloré

2) Culture cellulaire en MO à contraste de phase (lumière située sous l'échantillon biologique et

oculaire situé au-dessus, aussi appelé MO inversé) ; permet d'observer des cellules vivantes, ici en
phase de multiplication.

3) A partir d’une coupe d’un tissu ou un organe entier, on obtient une coupe colorée qu’on appelle
coupe histologique

Microscopie à fluorescence

La microscopie à fluorescence utilise un fluorochrome, une molécule qui va réagir avec certains
composant de la cellule, toujours en utilisant la lumière blanche.

Fonctionnement général : La lumière va passer à travers un premier filtre où elle va laisser passer
une seule longueur d’onde qui nous intéresse λexcitation qui va venir exciter notre molécule
fluorescente, molécule qui va interagir avec un composant cellulaire et ensuite émettre une longueur
d’émission (λémission) qui va sortir par un deuxième filtre qui est celle que l’on va voir réellement.
Obtention d’une image fluorescente sur fond noir.

⚠ La source de lumière étant la lumière blanche (photons), cela reste de la MO

Vous trouverez pas mal de schéma explicatif sur Internet pour vous aider à comprendre le
mécanisme de fluorescence

Parmi les méthodes de microscopies à fluorescence, on retrouve la microscopie confocale :

La microscopie confocale est une technique utilisant la fluorescence :

[…]
c) Préparation des échantillons en MO
En résumé :
➢ Soit on réalise des coupes à partir d’un tissu ou d’un organe qui a été rigidifié au
préalable (inclusion dans la paraffine♥♥♥), coupes relativement fines d’une épaisseur
comprise entre 2 et 8 μm.
Il est important de comprendre que l’étape de coupe succède toujours à une étape de rigidification, il
sera plus facile de couper un objet rigide plutôt qu’un objet mou. Plusieurs techniques de
rigidifications existent.
➢ Soit on fait un étalement cellulaire♥ mais l’épaisseur de l’échantillon ne doit jamais
dépasser cette dizaine de micromètres.

[…]
L’utilisation d’anticorps n’est pas le seul type de marquage indirect, il y a aussi la GFP (cf plus bas;))

J’ai mis en MAJUSCULE les termes « direct » et « indirect » sur laquelle la prof a insisté

[…]
• Marquage DIRECT à la protéine fluorescente verte (GFP)

[…]

Ne vous inquiétez pas vous reverrez ces méthodes au cours des EDs, mais il faut les connaître pour
bien appréhender des exos de biocell
N.B : on parle de fluorochrome ou de marqueur fluorescent, c’est la même chose, par contre
le terme colorant fluorescent n’existe pas !
 • Marquage spécifique : FISH (Hybridation in situ en fluorescence) (cellules vivantes pendant l’étude) :

On a affaire à des sondes moléculaires (ce sont des fragments d'ADN ou d'ARN) qui sont couplées à des
fluorochromes in vitro. De part la complémentarité des bases, ces sondes vont venir reconnaître et s’associer in
vivo aux séquences d'ADN ou d'ARN spécifiques qui nous intéressent.

2 – La microscopie électronique (ME)

a – Microscope électroniques

• Signal : Le microscope électronique, à la différence du microscope optique, utilise des flux

d’électrons pour observer les échantillons.
[…]

→ On ajoute donc artificiellement des métaux lourds à l'échantillon biologique, par une étape de
métallisation, pour avoir comme un écran sur lequel vont rebondir les électrons ou sur lequel ils vont
être dévié.

[…]
Afin d’étudier des échantillons en MET, il faut :
• Réaliser des coupes ultra fines (entre 60 et 100 nm), les coupes en ME sont beaucoup plus
fines que en MO.
• Utiliser des agents de contraste.

En effet, le matériel biologique étant essentiellement constitué d’atomes légers (carbone, hydrogène,
oxygène) qui ont un faible pouvoir de diffusion des électrons.

3 – Le tri cellulaire

Le tri cellulaire est utile lorsque l'on veut faire une culture à partir d'un tissu ou d'une suspension cellulaire
hétérogène

a – La cytométrie en flux

Application de la cytométrie en flux : L’étude du cycle cellulaire ♥♥

Cet exemple n’est plus dans le cours mais on vous le laisse pour mieux comprendre cette technique.

b – Les billes magnétiques

- C’est une technique très simple, assez coûteuse et relativement rapide.

 MAJ de l’image

c -c – Le gradient de densité

- Dans un tube à essai, on réalise un gradient de densité (saccharose/sucrose dans des concentrations
croissantes).

Merci de bien vouloir utiliser le code couleur suivant :

En rouge : les parties à enlever
En bleu : les parties modifiées
En vert : les parties ajoutées