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DEDICACE
Je dédie avant tout ce travail au Maitre de l’univers pour la santé, la
force et l’intelligence qu’il m’a accordées pour mener à bien ce travail.
A toute ma famille pour leurs prières et soutien moral, plus précisément à mes
ʺdieuxʺ : papa ADIPO AYEMOU PHILIPPE et maman ASSI ROSINE
BRIGITTE qui continuent toujours d’œuvrer pour ma réussite et de toujours
m’inculquer des valeurs nobles.
Merci également à ma tata ANDO API DELPHINE pour tout le soutien que
tu m’as apportée, des mots ne suffiront pas pour exprimer la générosité dont tu fais
preuve.
REMERCIEMENTS
Le travail soumis à notre étude n’a été possible que par la volonté de Dieu, le
maître de l’univers qui nous donne inspiration, sagesse et intelligence. C’est
pourquoi nous lui adressons nos remerciements.
disponibilité.
DEDICACE…………………………………………………………………...….I
REMERCIEMENTS………………………………………………………………II
AVANT-PROPOS…………………………………………………………...…....X
INTRODUCTION................................................................................................P11
1. Situation géographique……………………………………………………...P14
2. Historique…………………………………………………………………...P14
3. Missions……………………………………………………………………P15
4. Activités………………………………………………...…………….……P16
5. Organigramme de l’IPCI………………………………………………...….P18
CHAPITRE Ⅱ : PRESENTATION DE L’UNITE DES AGENTS DES
INFECTIONS DU TRACTUS GENITAL (UA-ITG)
1. Organigramme……………………………….……………………………...P19
1.1. Organigramme fonctionnel de pilotage…………………….....……P22
2. Les activités ……………………………………...…………………..……..P23
3. Le poste de travail du laboratoire de diagnostic………………….…………P23
3.1. Le poste Réceptions……………….…………………...…….……..P23
3.2. Le poste Analyses……………………………….…………..……...P23
6.1Le personnel…………..……………………..…………………………..…P26
1- MATERIEL…………………………………………………………….….P31
1.1- Cadre et période de stage………………………………....…….…..P31
1.2- Période d’étude……………………………………….….…………P31
1.3- Matériels d’étude…………………………………………...………P31
2- METHODES……………………………..……………..…………………P31
1- PRESENTATION…………………………………………..…………P32
1.1-Les milieux de culture……………………………...……………..P32
1.2- Les réactifs et consommables………….…………...…………….P32
1.3- Les fournitures de bureau…………………………...……………P34
Ⅰ-RESULTATS……………………………………………………………...P41
1-Bilan trimestriel des résultats de chaque bon de commande au cours de l’année
2022…………………………………………………………………………..P41
a-milieu de culture………………………..……………………………….P41
b-réactifs et consommables……………………………..………………...P42
b -réactifs et consommables………………...…….……………………….P45
Ⅱ-INTERPRETATIONS……………………….……………………………P46
Conclusion partielle……………...…………………………………….…….P46
CRITIQUES ET SUGGESTIONS…………….....………………………….P47
CONCLUSION GENERALE……………………………………………….P48
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GESTION DES COMMANDES D’INTRANTS
DE LABORATOIRE DU 1 ER JANVIER AU 31 DECEMB
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES…………….……………………...P49
ANNEXES…………………………………………...………………..…….P50
CHAP : Chapman
CHU : Centre Hospitalier Universitaire
CNR : Centre National de Référence
DASRI : Déchet A Sujet de Risque Infectieux
EMB : Eosine Méthyl Blue
ECB : Examen Cyto Bactériologique
GSC : Gélose au Sang Cuit
IPCI : Institut Pasteur de Côte d’Ivoire
ISO : Organisation de Normalisation
Internationale
OMS : Organisation Mondiale de la Santé
PU : Prélèvement Urétral
PNLS : Programme National de Lutte contre le Sida
PCV : Prélèvement Cervico-Vaginal
PCR : Polymerase Chain Reaction
SAB+CHL : Sabouraud+ Chloramphénicol
UA-ITG : Unité des Agents des Infections du Tractus
Génital
UGA : Unité de Gestion et d’Approvisionnement
UPIL : Unité de Production des Intrants de
Laboratoire
URAP : Unité de Réception et d’Accueil des
Prélèvements
VIH : Virus de l’immunodéficience humaine
IST : Infection Sexuellement Transmissible
AVANT PROPOS
Le groupe CSI-Pole Polytechnique créé en 1998 avec l’autorisation N°558 /559
MESRS/DAH/CF du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche
Scientifique, agréé par le FDFP est une grande école qui a pour le conseil
l’assistance aux entreprises ainsi que l’enseignement supérieur. Groupe à vocation
généraliste, son objectif est de proposer une synergie d’activités au service de la
compétence des hommes et de la performance des entreprises. Il est composé de
plusieurs écoles supérieures qui sont :
Comptable et Financière
Humaines
Commerce International
Compétences
Cette dernière école où nous avons été formés a en son sein, la filière Industrie
Agroalimentaire et Chimique option Contrôle. Pour apporter un appui à l’action de
l’Etat, plusieurs entreprises mettent à la disposition des étudiants des stages
pratiques.
C’est dans ce cadre que l’Institut Pasteur de Cote d’Ivoire (IPCI) a accepté de
nous accueillir pour nous permettre de parfaire notre formation.
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GESTION DES COMMANDES D’INTRANTS
DE LABORATOIRE DU 1 ER JANVIER AU 31 DECEMB
INTRODUCTION
occupe une place de choix au niveau du laboratoire de l’UA-ITG car elle participe
au fonctionnement continue de l’analyse d’un échantillon. C’est dans cette optique
que ce thème suivant nous a été soumis : <<Gestion des commandes d’intrants
de laboratoire du 1er JANVIER au 31 DECEMBRE 2022 à l’unité des agents
des infections du tractus génital de l’institut Pasteur de côte d’ivoire >>.
Ainsi notre mission sera de faire le bilan de la gestion des commandes des
intrants au sein du laboratoire de l’UA-ITG.
● Objectifs spécifiques
PREMIERE PARTIE
REVUE
BIBLIOGRAPHIQUE
1-Situation géographique
2-Historique
L’IPCI fait partie du réseau international des Instituts Pasteur et est placé sous la
En Octobre 1991, par le décret n 091-645 du 09 Octobre 1991, l’IPCI a été érigé
en établissement Public à caractère Industriel et Commercial.
3-Les Missions
L’IPCI, établissement de recherche scientifique et technologique, a pour mission
d’entreprendre des recherches en matière de santé. A ce titre il est chargé de :
4-Les Activités
- Au plan de la formation
5. Organigramme de l’IPCI
Conseil de Gestion
Conseil Scientifique
Directeur
sBioéthique
Communication
Unité de
biochimie et
UPA UA-ITG UVR UEE Plateforme
Hématologie URAP
BM
clinique
UM UBC UMCE
UAFH
Epidémiologie, Bioinformati-
Unité de UMM UGA
Recherche que
Toxicologie UBRA
clinique
ASSU-RMI
Imagerie
Bio banque CHB
UBMT
MTA
Pôle Chimie
Prévention
Prophylaxie et
Biosécurité
1. Examen bactériologique
Le sperme venu de l’URAP, prélevé avec une pipette transfert, est déposé sur la lame
pour réalise l’état frais en vue de l’observation au microscope à l’objectif 40 pour voir
la présence et la mobilité des spermatozoïdes, puis on procède à l’ensemencement des
milieux SAB + CHL et BCP ou EMB.
Pour ce test, nous disposons d’un seul écouvillon venu de l’URAP accompagné d’une
lame déjà étalée que nous allons ensemencer sur le milieu GSC ou Tayer Martin,
l’ensemencement se fait en surface par des stries transversales serrées.
Pour l’analyse de l’examen du PV, l’agent de l’URAP nous envoie trois écouvillons
dont deux écouvillons de CDS (le cul de sac de Douglas) et un écouvillon du col de
l’utérus. On prend l’écouvillon utilisé pour le prélèvement du col qu’on étale sur la
lame étiquetée par le numéro provenant de l’URAP. La lame est utilisée pour les deux
étalements. Au-dessus de la lame est marquée le col et au centre le CDS. Ensuite on
ensemence l’écouvillonnage effectué au niveau du col sur la gélose Tayer Martin par
des stries transversales serrées sur la surface.
L’un des écouvillons CDS est étalé sur la lame et l’autre est utilisé pour
l’ensemencement sur les différents milieux de culture.
Recherche de mycoplasmes
La cytobrosse qui a servi au prélèvement est déchargée dans le milieu A 3 tandis que
pour le prélèvement du sperme, on prélève une goutte de sperme à l’aide d’une pipette
transfert qu’on introduit dans le milieu A3. Apres homogénéisation 100 µL est
déchargés dans les différents puits mis en culture l’étuve à 37°C.
1-1-Poste de coloration
A ce poste, une fois les lames séchées, elles sont flambées à la flamme du bec bunsen
et sont acheminées au poste de coloration pour le GRAM.
1-2-Poste microscopique
Les lames qui ont été colorées au GRAM sont observées au microscope après ajout de
l’huile à immersion sur la lame à l’objectif ×100.
2. Organisation de l’UA-ITG
Afin de répondre efficacement aux objectifs qui lui sont assignés, l’UA-ITG est
organisée en deux (2) grands laboratoires et un centre de référence que sont :
- Le laboratoire du diagnostic
2.1. Organigrammes
Les deux organigrammes ci-dessous expliquent le fonctionnement de l’UA-ITG.
Management
Pr FAYE-KETTE
Chef de laboratoire
Pr FAYE-KETTE
3-Les activités
Les différents examens effectués au sein de notre unité sont :
- Examen cytobactériologique standard des exsudats cervico-vaginaux
(PCV)
- Examen cytobactériologique standard des exsudats (PU) ;
Examen cytobactériologique du sperme (Spermoculture).
3.1.1- Préanaalytique
À ce poste, nous sommes tenus de :
- Recueillir le prélèvement auprès de l’agent de l’URAP (les
prélèvements sont déposés sur un portoir dédié à cet effet) ;
- Enregistrer les bulletins des échantillons dans le registre de réception
puis dans le cahier correspondant à la nature du prélèvement
biologique ;
- Remplir les fiches d’analyse microbiologiques qui serviront de repère
pour effectuer les analyses.
3.1.2-Analytique
À ce poste, on réalise à partir des échantillons les opérations suivantes :
- Étiquetage des lames, des tubes à hémolyses et boites de pétris contenant
les milieux de cultures (Sab+Chl, BCP ou GSC ou EMB, UTIC, CHAP et
GONO) avec le numéro URAP du patient ;
- Ensemencement des différents milieux de cultures ;
- Examens macroscopiques : réalisation de l’état frais ;
- Examens microscopiques : réalisation de la coloration de GRAM.
A ce poste, après les 24 heure d’incubation à l’étuve nous faisons sortir les
différents milieux de cultures pour faire la lecture. A ce niveau, si la lecture est
négative et qu’il s’agit d’un examen simple (Examen Cytobactériologique ECB)
le résultat est imprimé immédiatement par le biologiste. Il signe le résultat et le
décharge dans le registre de transmissions de résultat, les agents de l’URAP
viennent prendre les résultats et ils émargent dans le registre pour dire que les
résultats sont sortis. Dans le cas contraire ou la lecture est positive et qu’il s’agit
des Levures, d’E. coli, Streptocoque et GONO nous envoyons la ou les boites de
pétris incriminées dans les unités suivants (l’unité de MYCOLOGIE pour faire
l’antifongigramme des levures, l’unité d’ASSURMI pour faire l’antibiogramme
des E. coli et Streptocoques et l’unité CNR-GONOCOQUE pour faire
l’identification et un antibiogramme du GONO). A la fin de leur recherche chaque
laboratoire apporte son résultat afin qu’on puisse imprimer notre résultat et les
déchargés dans le registre de transmissions des résultats.
C’est dans cette section du laboratoire que nous avons effectué notre stage avec
un personnel dynamique et dévoué.
6.1. Le Personnel
Consommables
- Microscopes - Coton - Système
- Eau physiologique
- Eau distillée
- Violet de gentiane
- Lugol
- Fuschine
- Micropipettes
Les BPH (Bonnes Pratiques d’Hygiènes) sont des règles à adopter pour éviter
toute contamination des produits biologiques au cours de la manipulation et de
la conservation de ceux-ci. Ce sont des techniques qui ont pour finalité
d’identifier l’ensemble des conditions et les activités de bases nécessaires pour
assurer en permanence un environnement hygiénique lors des manipulations, du
conditionnement des produits biologiques afin d’offrir à la population des
résultats fiables.
Les locaux, le matériel et les installations doivent être situés, conçus et construis
de manière à :
- Etc.
b- La Main d’œuvre
Tout employé impliqué dans le processus de manipulation, de contrôle et de
stockage des produits biologiques doit être compétent sur la base de la
formation initiale et professionnelle, du savoir- faire et de l’expérience.
c- Matériel
La conception et la construction, l’équipement et les contenants utilisés au
laboratoire doivent être quotidiennement nettoyés et désinfectés afin de prévenir
toute contamination extérieure pouvant fausser la composition de la flore
biologique.
d- La Matière première
Les matières premières (produits biologiques) et articles de conditionnement
doivent être conformes aux normes (critères) définies et appropriés pour assurer
la qualité des résultats d’analyses.
e- La Méthode
Des procédures de travail doivent être établies et appliqués à la lettre afin
d’assurer le résultat final et la maîtrise des BPH des différentes manipulations
dans la zone technique du laboratoire.
1. MATERIEL
1.1- Cadre et période de stage
Le stage s’est déroulé d’Octobre 2022 à Janvier 2023 à l’Unité des Agents du
Tractus Génital (UA-ITG) du département de Bactériologie-Virologie de l’Institut
Pasteur de Cote d’Ivoire sur le site de Cocody. Cette étude a porté sur les bons de
commandes d’intrants de laboratoire au cours de l’année 2022.
2. METHODES
Des registres de chaque type de commande existent déjà au sein de l’UA-ITG.
Après chaque commande, une photocopie du bon est faite et rangée selon la nature
de la commande. Il s’agit de vérifier l’existence de la totalité des bons durant
l’année 2022. En cas d’absence de certains bons, se rendre immédiatement à
l’UGA qui dispose également des registres dans lesquels tout t’y est afin de nous
mettre à jour. Cela nécessite une bonne communication et compréhension entre
l’UA-ITG et L’UGA.
1. PRESENTATION
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GESTION DES COMMANDES D’INTRANTS
DE LABORATOIRE DU 1 ER JANVIER AU 31 DECEMB
- EMB : Eosine Méthyl Blue : sert à la recherches les entérobactéries telles que
Escherichia coli
- GELOSE AU SANG CUIT : appelé aussi gélose chocolat, c’est un milieu non
sélectif utilisé pour isoler les bactéries. En UA-ITG il permet la culture des
bactéries en particulier le genre Neisseria.
- Lames porte-objet : c’est une petite plaque de verre utilisé pour étaler un
échantillon afin de réaliser soit l’état frais soit la coloration de Gram
- Lamelles couvre-objet : c’est une petite et fine plaque de verre utilisée pour
recouvrir un échantillon contenu sur la lame porte-objet.
- Les colorants : nous utilisons le violet de Gentiane (colore toutes les bactéries en
violet foncé), le Lugol (agent mordant, il fixe le violet sur les bactéries) et la
Fuschine (recolore en rose les bactéries décolorées par l’alcool mais n’agit pas sur
celles déjà colorées en violet).
- Huile de paraffine : c’est une huile utilisée dans le test de mycoplasme afin de
créer une anaérobiose total nécessaire à la croissance des mycoplasmes.
- Pipettes pasteurs : ce sont des tubes fins généralement en verre utilisés pour faire
le prélèvement ou l’ensemencement des échantillons.
-Eau physiologique : milieu dans lequel nous déchargeons les cytobrosses pour la
recherche de Chlamydia.
-Sachet Zip : ils sont utilisés pour conserver les échantillons lors du déplacement
ou transport.
- Ethanol et acétone : il sert à fixer les échantillons sur les lames après flambage. Il
est également utilisé comme décolorant au cours de la coloration de Gram. L’ajout
de l’acétone dans l’alcool rend la décoloration encore plus efficace.
- Les bons de commande : il s’agit d’une fiche destinée à exprimer les besoins
par les différents services précisant les références de chaque produit et les
quantités demandées. Idéalement il peut se faire sur un carnet de bon à feuilles
auto carbonées. Le bon de commande doit être approuvé par le chef de service ou
son intérimaire.
But et laboratoire des IST est établie pour que la structure dispose
justification d'un stock suffisant pour couvrir la consommation jusqu'à la
réception de la commande suivante .
Par qui ? Le responsable chargé de la gestion des commandes et cette
Responsable(s) commande est approuvée par le responsable de laboratoire Dr
KOUAME BELINDA
A quel moment ●Chaque semaine, plus précisément les JEUDIS pour les
? Périodicité milieux de culture, réactifs et consommables
●Chaque mois pour les fournitures de bureau
●Des commandes urgentes peuvent être passées lorsqu’il y a
une urgence au niveau de l’ UA-ITG
Comment ? 1.Quantifier les besoins pour le réapprovisionnement à l’aide
Tâches à d’un inventaire physique des stocks.
accomplir 2.Remplir correctement le bon de commandes selon les
instructions sur le mode de remplissage consignées par le bon
de commande.
NB : Les fautes et ratures annulent la commande.
3.Faire émarger par le responsable de laboratoire
4.Envoyer le bon de commande
A l’UGA, émarger le registre d’entrée puis déposer après
vérification du responsable.
Etagère du milieu
* Y ranger les petits matériels tels que les tubes à hémolyse,
micropipettes, lames et lamelles….
NB : l’ordre est exigé
Etagère du bas
* Y ranger, les autres articles tels que les fournitures de
laboratoire et documents personnels.
Conditions de stockage
- Disposer d’un local sec, aéré et bien ventilé
- Bien agencer le local : aire de stockage, aire de quarantaine
- Assurer les conditions minimales de sécurité (local fermant à
clef)
- Assurer la propreté
- Eviter le rayonnement solaire direct sur les produits
- Disposer de palettes, d’étagères et d’armoires fermant à clé
- Mettre les produits à l’abri des rongeurs et insectes
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GESTION DES COMMANDES D’INTRANTS
DE LABORATOIRE DU 1 ER JANVIER AU 31 DECEMB
TABLEAU 6 :
Ⅰ-RESULTATS
a- Milieux de culture
Tableau8 :
b - Réactifs et consommables
Tableau 9 :
Dans ce tableau, nous remarquons que les réactifs et consommables ont étés livrés
de façon partielle, par contre les embouts P1000 et gel hydro alcoolique ont étés
livrés totalement.
c -Fournitures de bureau
Tableau 10 :
a- Milieux de culture
6000
5000
4000
3000
2000
1000
0
L l
B
CH AP IC
GS
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V
commande livraison
b- Réactifs et consommables
12000
10000
8000
6000
4000
2000
0
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commande livraison
c-Fournitures de bureau
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commande livraison
Ⅱ- INTERPRETATIONS
Après analyse, il ressort de façon générale que l’UGA ne fournit que la moitié des
intrants demandés. En effet, depuis l’avènement de la Covid 19 les systèmes
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GESTION DES COMMANDES D’INTRANTS
DE LABORATOIRE DU 1 ER JANVIER AU 31 DECEMB
CONCLUSION PARTIELLE
CONCLUSION GENERALE
Au terme de l’étude sur la gestion des commandes des intrants de l’année 2022
au sein du laboratoire de l’UA-ITG, il ressort de façon générale que le laboratoire
des IST a été à moitié satisfait au niveau des commandes d’intrants. On en déduit
alors que, pour la réalisation de ses différents examens cytobactériologiques
(SP, PU et PV) l’UA-ITG n’a utilisé que 50% des intrants demandés pour toute
l’année 2022. Parmi les intrants de l’UA-ITG les milieux de culture représentent
l’intrant qui a eu le maximum de commande avec une demande considérable de
20860 milieux de culture par rapport aux réactifs et consommables et fournitures
de bureau où les demandes s’élèvent respectivement à 13026 ,55 et 550
commandes pour toute l’année.
CRITIQUES ET SUGGESTIONS
Nous constatons certaines insuffisances au niveau de la gestion des commandes
d’intrants tant chez l’UGA que l’UA-ITG que nous relevons ci-dessous :
- Le non-respect des commandes quantifiées ;
- Le non-respect des délais de livraison ;
- La non-conformité de certains milieux de culture ;
- Des lames souvent de mauvaise qualité ;
- Rupture de stock chez le fournisseur ;
- Absence de mise en place de logiciel commande/livraison ;
- Absence de mise en place de destruction des produits périmés ;
- Commande surestimée ;
- Suspension du test de mycoplasme par manque de réactifs ;
- Ensemencer sur la même gélose des échantillons de quatre patients
différents ;
- Faire l’Etat frais des PCV de deux patientes différentes sur une même lame.
Pour y remédier, nous suggérons :
- Le respect des commandes quantifiées ;
- Le respect strict des délais de livraison ;
- La conformité des milieux de culture au niveau de l’épaisseur (90mm) ;
- Prendre des intrants de bonne qualité ;
- S’assurer que les fournisseurs/partenaires seront toujours aptes et
dynamiques à livrer les intrants dans le délai préétablir ;
- Mettre en place un système de destruction des produits périmés ;
- Etablir un logiciel de commande/livraison afin d’avoir une idée bien précise
des entrées et sorties, le laboratoire doit assigner à une personne la
responsabilité du programme, analyser les besoins du laboratoire, et
déterminer le stock minimum nécessaire pour une période donnée ;
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GESTION DES COMMANDES D’INTRANTS
DE LABORATOIRE DU 1 ER JANVIER AU 31 DECEMB
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES
♦ KOUAME N’zebo Désiré, Dr en microbiologie. Support de cours-Sécurité des
aliments page 17
♦ Approvisionnement et inventaire : module 4 fiche contenu 4-4 page 5 et 4-8
page 11
♦ Conséquences sanitaire et sociales de la COVID 19 du ministère de l’EUROPE
ET DES AFFAIRES ETRANGERES d’Octobre 2020 Page 1/1
♦ RAJAONARISON Jacques Pascal Ministre de la Santé Publique Médecin
Général GUIDE et PROCEDURES de GESTION des INTRANTS de SANTE
LIES aux IST et au VIH. Edition 2011 chapitre Ⅲ Page 36
♦ RESOLAB -GESTION DES STOCKS -CHAPITRE 4
ANNEXES
Fin