Université des Frères Mentouri Constantine 1 Faculté SNV ; Département de Microbiologie

Cours de Microbiologie Industrielle et Biotechnologies Master 1 Biologie Moléculaire des Microorganismes (BMM)
Responsable de la matière : Dr. BOUCHELOUKH Warda Année Universitaire : 2023/2024

Introduction

- La microbiologie industrielle est une branche de la microbiologie appliquée dans laquelle les
micro-organismes sont utilisés pour la production de substances importantes.

- Un micro-organisme est cultivé dans des conditions physico-chimiques contrôlées au sein d’une
enceinte de grand volume spécialement conçu à cet effet : le bioréacteur ou fermenteur.

- Les fermentations industrielles concernent un grand nombre de secteurs : l’alimentaire, la

santé, l’environnement, l’agriculture et l’élevage, la chimie, et les ressources énergétiques.

- Les produits microbiens peuvent être classés en :

A. Produits
a) Aliments, agents aromatisants, compléments alimentaires, boissons et vitamines
b) Acides organiques
c) Solvants organiques
d) Enzymes et transformations microbiennes
e) Inhibiteurs
f) Produits des micro-organismes génétiquement modifiés
g) Gazes
B. Cellules et biomasses
a) Biomasses
b) Cellules
c) Vaccins
C. Activités
a) Biotransformation
b) Dégradation
c) Solubilisation/accumulation

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1. Processus de fermentation

- Un processus de fermentation typique comporte des étapes de traitement en amont et de

traitement en aval (Figure 1).

Figure 1. Organigramme simplifié du processus de fermentation.

1.1. Traitement en amont

1.1.1. micro-organisme producteur

- Les facteurs clés relatifs à un micro-organisme producteur sont :

• la stratégie pour obtenir un micro-organisme industriel,
• l’amélioration de la souche,
• le maintien des cultures,
• la préparation d’un inoculum fiable et
• le développement continu de souches sélectionnées.

1.1.2. Milieu de fermentation

- La sélection de sources de carbone et d’énergie et d’autres nutriments essentiels, ainsi que

l’optimisation des milieux, sont essentiels pour augmenter le rendement d’un processus.
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- Dans de nombreux cas, la base des milieux industriels sont les déchets issus d’autres procédés
industriels.

1.1.3. Fermentation

- Les micro-organismes industriels sont cultivés dans des conditions rigoureusement contrôlées
pour l’optimisation de la croissance microbienne ou la production d’un produit microbien cible.
- La culture en biomasses se fait en utilisant des bioréacteurs.

1.2. Traitement en aval

- Le traitement en aval comprend tous les procédés qui suivent la fermentation.

- Ils comprennent :
• la récolte des cellules,
• la perturbation des cellules,
• La récupération des produits et leur purification, et
• L’élimination de tous les déchets.

2. Métabolites microbiens
- Les métabolites microbiens sont les produits du métabolisme microbien.
- Les produits métaboliques microbiens peuvent être classés en :

2.1. Métabolites primaires

- Les métabolites primaires sont produits au cours de la phase exponentielle, en tant que des
produits finaux, et ils sont impliqués dans la croissance et la reproduction.

- Dans ce cas, la courbe de production est associée à la courbe de croissance, et les métabolites
sont produits en quantité suffisante pour soutenir la croissance cellulaire.

2.2. Métabolites secondaires

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- Les métabolites secondaires sont synthétisés à la fin de la croissance et ne sont pas impliqués
dans la croissance, le développement ou la reproduction des cellules.

- Les métabolites secondaires sont produits par des micro-organismes lorsqu'un ou plusieurs
nutriments contenus dans le milieu de culture sont appauvri.

3. Biocatalyse
- La biocatalyse implique l’application de cellules microbiennes entières, des extraits cellulaires,
des enzymes purifiées, des cellules immobilisées ou des enzymes immobilisées.

- Les biocatalyseurs sont des molécules protéiques complexes formées dans les cellules vivantes.

- Les enzymes ont toutes les propriétés d’un véritable catalyseur.

3.1. Classification des biocatalyseurs

➢ Oxydoréductases
➢ Transférases
➢ Hydrolases
➢ Lyases
➢ Isomérases
➢ Ligases