HISTOIRE ET PREHISTOIRE DE LA MICROBIOLOGIE ( ET DES GRANDES EPIDEMIES) Biblio : des bactries et des hommes Hansen ditions Privat Histoire

ire de la mdecine Chaste ditions ellipse Le mystre des pidmies Dr Rodhain ditions Pasteur Internet

 25/1 1. La perception des maladies infectieuses dans l'Antiquit : l'gypte, la Grce, le Proche-Orient . Prhistoire de la microbiologie: les miasmes, la gnration spontane. Le concept dhygine : Semmelweiss trop en avance sur son temps Brigitte Le Fur 1/2 N2. La rvolution pasteurienne : Louis Pasteur, lie Metchnikoff, Jules Bordet, tienne Laveran, Charles Nicolle Histoire de la vaccination maladies bactriennes Agns Rosenau 8/2 N3 histoire de la vaccination : la rage Denys Brand

15/2 N4. Les grandes pidmies: le cholra, la lpre, la peste et la tuberculose Philippe Lanotte 22/2 N5. Histoire de la vaccination anti-variolique : la variolisation, Jenner, l'radication, variole et poliovirus. Conception systme de production des vaccins. Virus et vecteurs, vaccination, transgense et thrapie gnique Denis Rasschaert

1/03 N6. Le voyage de La Pinta, histoire dune pidmie : la syphilis. Les bactries aujourdhui. Laurent Mereghetti 15/3 N7 Lutilisation des antibiotiques Agns Petit

22/3 N8 Des animaux et des hommes, histoire dune pidmie: la grippe et Ebola . Denis Rasschaert 29/3 N9. Certains virus sont responsables de cancers chez lhomme. La fin dun doute ? Denis Rasschaert 5/4 N10 Du Kuru en Nouvelle-Guine la maladie de la vache folle : mergence dun nouveau concept dagent pathogne. Alain Goudeau examen date des UE libres

La microbiologie avant Pasteur

1864 : le dbat sur la gnration spontane Avant? Les pidmies et la mdecine Histoire des pidmies Lhomme et son environnement variable Histoire de la microbiologie Lhomme et ses croyances(variables)

Le mode de vie
Isol Chasseur ou leveur En village En ville Voyages Mlanges de population Niveau de vie Guerres, famines, catastrophes

Le mode de vie
laube de la prhistoire, les hommes vivaient de la chasse et de la cueillette, par groupe de vingt cinquante individus. Ce mode de vie nomade, en petites hordes, ne comportait pas de risque dpidmie. La rvolution agricole du nolithique sest produite entre 10 000 et 5 000 ans avant notre re. La population mondiale est alors passe de quelques millions plusieurs centaines de millions dindividus vivant dans des villages puis dans des villes. Cette rvolution est lorigine de nombreuses maladies infectieuses. Un grand nombre de germes sont passs des animaux domestiqus (moutons, chvres, boeufs, porcs) lhomme.

Le mode de vie
De multiples pidmies (variole, rougeole, tuberculose) ont frapp les populations urbaines, entranant une grande mortalit. Puis, les survivants tant immuniss contre les germes, ceux-ci nont pu se maintenir chez lhomme quen infectant les jeunes enfants, non rsistants. Ainsi se dvelopprent les maladies infectieuses de lenfance, qui subsistent encore aujourdhui. Se sont galement maintenus, depuis la prhistoire, les germes ne provoquant pas dimmunit prolonge, comme celui du paludisme qui passe des moustiques lhomme Le dveloppement de la tuberculose en Europe, au XIXe sicle, est associ la rvolution industrielle, entranant lexode des populations rurales vers les faubourgs ouvriers misrables des villes.

Le grand dbat avant Pasteur

Depuis le nolithique, lhumanit se sert des fermentations et oxydations bactriennes pour fabriquer des boissons, des aliments ou des vtements, sans savoir que ce sont les bactries butyriques qui nettoient le chanvre ou le lin, les bactries lactiques qui fabriquent beurres et fromage, les bactries actiques qui produisent vin et vinaigre. Deux thories saffrontent depuis lantiquit : la gnration spontane et la panspermie.

LEgypte
Mdecine trs rpute Grand nombre de papyrus mdicaux de 1800 -1400 pidmies de poliomylite, variole, maladies parasitaires. Hygine dveloppe

LEgypte
Mdecine
selon laspect des urines, des selles et des crachats.

Traitements:
incantations, magie et remdes base de vgtaux, substances animales ou minrales, fumigations

Sur les plaies:

empltres de pain moisi

Infections oculaires
utilisation de lantimoine ou du cuivre

Embaumement des momies:

herbes, parfums, natron : carbonate de Sodium recueilli au fond des lacs sals.

Prdominance du surnaturel

LEgypte

La Grce
La logique La science grecque La mdecine grecque (Hippocrate) Les philosophes La bibliothque dAlexandrie Les mathmatiques Les explications par des causes naturelles

La Grce
Aristote
classe le vivant par complexit croissante ( 500 espces animales)
Il croit la gnration spontane.

La mdecine grecque :
Poudrage de plaies avec des mdicaments (pharmaka)

Les atomes : rien ne nat de rien

La Grce
Evolution de la mdecine grecque en 2 priodes la premire divine et surnaturelle ;
Malgr le caractre logique de leur philosophie et de leur mdecine, les grecs de l'Antiquit ont eu recours la religion pour demander la gurison de leurs malades. Asclpios, dieu de la mdecine, avait ses temples et ses prtres. Ce courant religieux assure sa permanence au cours des sicles et des millnaires pour ce qui concerne les maladies en gnral et les maladies mentales en particulier

la seconde humaine et clinique domine par la grande figure d'Hippocrate, Athnes ;

 HIPPOCRATE (Vme sicle avant Jsus Christ)

est le mdecin qui a effectu la synthse des connaissances de son temps, il est l'origine de la "thorie humorale". Selon celle-ci, la sant est fonction de l'quilibre des humeurs (sang, bile ...).. Le mdecin cherche restaurer l'quilibre, notamment par une alimentation et des mdicaments appropris, ce qui n'exclut pas l'coute du malade.

La Grce
LA PESTE D'ATHNES Maladies nosocomiales avant la lettre
Les mdecins, qui soignaient pour la premire fois cette maladie, par ignorance, ne l'enrayaient pas, mais c'tait eux qui mouraient le plus, puisque c'tait aussi eux qui l'approchaient le plus, et aucun autre moyen humain ne pouvait l'enrayer. Toutes les supplications que les gens venaient adresser dans les sanctuaires, ou toutes les consultations d'oracles et autres choses de cette sorte, tout cela tait inutile.

A la fin, ils y renoncrent, vaincus par le mal.

Thucydide, Histoire II, XLVII, 4.

La Chine
Lacupuncture -600 La pharmacope :
herbes et racines, feuilles, insectes, minraux, graines

Prophylaxie de la variole:
variolisation ds lan 800:

Recueil de croutes sur des malades qui sont souffles dans la narine dun enfant au moyen dun petit tube en ivoire. Utilisation de la variole de vache ds le 16 sic le au lieu de 19 en occident.

La Chine

Rome
Hygine publique: eau dalimentation, rseau dgouts Hygine corporelle
En -100: Terentius Varron :, propos des marais insalubres: parce quon y trouvait des tres minuscules qui pntraient par le nez et par la bouche et qui taient responsables de graves maladies.

Rome
Celsus en 17 :
Cautrisation des morsures de chien enrag

Galien en 160 :
la thriaque : un mlange de divers ingrdients aux vertus multiples: Elle contenait de la chair de vipre et protgeait des poisons et de la peste.

Il labore la thorie des tempraments (sanguin, phlegmatique, colrique, mlancolique)

GALIEN (IIme sicle)

Rome
La peste justinienne tire son nom de lempereur byzantin, Justinien, qui rgna au sixime sicle. Lhistorien Procope la dcrite ainsi :
"ceux dont le bubon prenait le plus daccroissement et mrissait en suppurant en rchapprent pour la plupart mais lissue tait fatale pour ceux chez qui le bubon conservait sa duret... la maladie a commenc chez les Egyptiens et de l sempara de toute la terre"...

Le Moyen-Age
De 476 1453 : Repli des connaissances Le rle des monastres :
la mdecine tait interdite, on utilisait les simples mais surtout la prire , les exorcismes et les impositions des mains.

1215 : premire universit de mdecine,

En 1395 elle contient 13 livres.

Les hpitaux : mouroirs chrtiens Mdecine prive : saignes Chirurgiens et barbiers sont mpriss

Le Moyen-Age
Le Moyen age est le temps des grandes pestes. Lessor du commerce maritime, les grands dplacements caravaniers le long des routes de la soie ont facilit les pidmies : la tuberculose, la lpre et surtout la peste noire, qui culmina dans le monde eurasiatique de 1347 1351.

Le Moyen-Age
Le toucher royal, les processions, les plerinages Ainsi les rois de France taient censs gurir les crouelles par le toucher,en prononant la phrase le Roi te touche, Dieu te gurit . htels-Dieu

Le Moyen-ge htel-Dieu

La Renaissance
C'est la fin de la grande peste. 50 % de la population a t dcime. Priode humaniste Galile : le perspicillus premier microscope
Linfiniment grand et linfiniment petit.

Les grands flaux :la syphilis avec le retour de Christophe Colomb

Typhus Diphtrie Variole Rougeole peste grippe

Incision dun bubon de peste

Les mdecins de la Renaissance

Ambroise Par
Remplace le traitement des plaies lhuile bouillante par des pansements propres

Rabelais (mdecin diplm en 1537)

thique mdicale : science sans conscience.

Fracastor
voque la possibilit de germes: le seminaria responsables de maladies infectieuses Il fut le premier soutenir la thse de la contagion par des parasites microscopiques , "par un venin qui infecte lair" pouvant se diffuser par "le contact immdiat avec le pestifr lui-mme.... avec lair que les pestifrs expirent ou encore les laines, fourrures, vtements, livres quils ont touchs"

La Renaissance

Le XVII sicle et XVIII

Inquisition
Cest ainsi que lIndex, pointant les livres interdits, est mis en place et que Galile sera condamn pour ses thses en 1633

Les acadmies scientifiques Le microscope:

Robert Hooke Van Leeuwenhoek Kircher
Il observe le sang de malades atteints de la peste : animalcules, serpentuli, virus, vermiculi.

Lathisme 1747 Leau de Javel 1789

LES PREMIERS EXPERIMENTATEURS ET L INVENTION DU MICROSCOPE

Grce au microscope optique invent en 1590, langlais Robert Hooke, tudiant une coupe de lige, observe en 1665 une multitude de logettes ressemblant des cellules de moine. C'est de l que vient le mot "cellule". la plus petite unit du monde vivant.

Van Leeuwenhoek matre drapier

:le premier bactriologiste:
il fabrique 247 microscopes 1674, il observe une goutte de pluie au X270 . Il voit des animalcules (levures et des bactries) 1680: dans la bire: certaines formes sont parfaitement rondes, dautres irrgulires, dautres formes de trois ou quatre globules colls les uns contre les autres. 1684 le nombre des animaux qui peuplent les dents de lhomme est si important que je crois quil excde la population du royaume.

Le XVII sicle et XVIII

La microscopie mondaine

Le microscope aiguise la curiosit des savants, mais engendre aussi parfois des descriptions surralistes. Ainsi, cette publication d'un certain Louis Joblot, pourtant approuve par l'Acadmie des sciences de Paris en 1716, qui, partir d'une infusion danmone, rapporte la dcouverte d'un animal minuscule - un animalcule - figure humaine, avec des pattes et une queue...

Joblot
Languillule du vinaigre: ces serpens ont une queue fort aigue et cest ce qui a donn occasion croire que le vinaigre ne piquoit que par limpression que ces petits animaux faisoient.

Le XVII sicle et XVIII

Escroqueries au microscope
Systme dun mdecin anglois sur la cause de toutes les espces de maladies avec les surprenantes configurations des diffrentes espces de petits insectes quon voit par le bon moyen dun microscope. Le mdecin recueille le sang et avec un microscope truqu montre des infusoires quil extermine avec une larme deau forte (acide) et vend sa potion miraculeuse.

Le XVII sicle et XVIII

Carl Von Linn:
Classification universelle des espces: genre et espce.

Spallanzani
Contre la gnration spontane

Buffon
Pour la gnration spontane

Lpineux problme de la gnration spontane

Aristote:

Le XVII sicle et XVIII

il y a des animaux qui naissent deux-mmes sans tre produits par des animaux semblables.

Harvey:
les animaux et les vgtaux naissent tous soit spontanment soit dautres tres organiss, soit de la putrfaction de leurs excrments.

Buffon :
le crin de cheval peut se transformer en vers Corruptio unius generatio alterius

Lpineux problme de la gnration spontane

Au Moyen Age, des voyageurs assurent avoir vu des "arbres oies", ainsi que des vgtaux sortant de fruits en forme de calebasse. L:alchimiste Paracelse, au XVIE sicle, donne une recette pour fabriquer en laboratoire un tre humain miniature, un homuncule. En 1648, Jean-Baptiste Van Helmont, chimiste et mdecin Bruxelles, propose une recette pour crer en vingt et un jours des souris partir de grains de bl et d'une chemise sale de femme, la sueur humaine jouant le rle de principe vivifiant.

La panspermie
Lautre explication est la panspermie : lunivers est sem de germes de vie prexistants qui flottent dans lair. Hraclite au 4 sicle avant notre re explique que : lme divine de lunivers est disperse partout en de multiples fragments porteurs de vie .

La panspermie
Depuis l'antiquit jusquau XVII :
Lunivers est form de germes prexistants qui flottent dans lair

Virgile:
Les juments andalouses portent la tte au vent et y respirent le Zphyr au lever du soleil. De l, sans tre accouples, elles conoivent par la seule influence du vent.

1676 Claude Perrault:

de petits tres invisibles sont lorigine de toute vie animale et nattendent que le contact dune liqueur subtile pour les vivifier.

contre la gnration spontane

Redi sattaque la gnration spontane
Il montre en 1667 que les asticots ne naissent pas spontanment grce un grillage quil met au-dessus de la viande Cest le pre de la parasitologie

Swammerdam
Cest le comble de labsurdit dimaginer que la pourriture soit capable dengendrer des animaux aussi bien organiss que les abeilles.

Joblot
Premire strilisation

Les thrapeutiques au XVII sicle et au XVIII

Pendant les 200 ans qui suivent microbes et maladies ne sont pas relies car depuis lantiquit et Hippocrate, lorigine des maladies est lie des miasmes. On relie tremblement de terre, ruption volcaniques, passages de comtes, conjonctions astrales et maladies. On parle des exhalaisons putrides : vapeurs morbifiques : odeurs nausabondes, tout ce qui pue tue. On utilise des plantes pour chasser les odeurs dsagrables.

Les thrapeutiques au XVII sicle et au XVIII

Au 17 saignes, purges, ventouses : Quelques mdicaments base de plantes Au 18 mercure contre la syphilis : Lge dor du charlatanisme : Mesmer
1778:sances autour dun baquet deau dont schappaient des tiges de fer.

Jusqu la fin du 19 sicle :

on accuse les odeurs dgout dtre responsables des fivres.

D'ou vient l'eau de Javel ?

On doit la dcouverte des hypochlorites au Comte Claude, Louis BERTHOLLET (17481822) Chimiste franais, mdecin de formation.
Il mit au point l'eau de Javel en 1789 pour les lavandires des bords de Seine Javel, petit village aux portes de Paris l'poque. L'eau de Javel est compose d'une solution aqueuse d'hypochlorite de sodium de formule NaOCl. Sa concentration s'exprime en degrs chloromtriques ( Chl).

Les pidmies au 17 et 18
La peste La variole
La variolisation et Edward Jenner

Le XIX sicle
mergence de lre industrielle Accroissement du pauprisme Les guerres napoloniennes Expansion coloniale Darwin et Lamarck Thorie cellulaire 1838 Rfutation de la gnration spontane 1888 les chromosomes Pouchet pour la gnration spontane 1865 : la gntique:Mendel

Le XIX sicle
1831: le cholra La fivre jaune La variole La typhoide Le typhus La tuberculose La fivre puerprale

Le XIX sicle
Mais la rvolution pasteurienne est dj en marche on parle du contagium vivum : tres vivants invisibles. Semmelweiss Lister Tyndall Pasteur

Ignace Philippe Semmelweis

assistant maternit Vienne 1840 Il ne met pas longtemps pour dcouvrir les ravages que fait la fivre puerprale et se trouve confront la tragdie qui se droule chaque jour dans ce service. Les parturientes lui apprennent que les femmes redoutent venir accoucher dans cet hpital, tant les risques de fivre ou de mort sont levs.
Dans ces conditions seules les femmes qui au dernier moment ne trouvaient pas d'autres possibilits, se rsignaient y tre admises. - Semmelweis examine les statistiques avant 1840, poque o les tudiants en mdecine ne frquentaient pas encore les hpitaux et n'tudiaient l'anatomie que dans les livres et non par dissection. La ltalit tait alors la mme dans les deux services, c'est dire faible pour l'poque: 1,25% environ.

Ignace Philippe Semmelweis

- Semmelweis observe la diffrence de ltalit des deux services d'accouchements l'hpital , depuis que les tudiants pratiquent des dissections l'hpital. Dans un service, la ltalit pouvait atteindre 30%, dans l'autre 1% 2% seulement. Le premier tait tenu par les mdecins et les tudiants en mdecine, le second par les sages-femmes et les lves sages-femmes. Les commissions charges d'valuer les causes de ces dcs nombreux et inexpliqus ne proposaient pas de solution. Semmelweis se trouve rapidement confront un mal sur lequel il est le seul s'interroger et qu'il tentera d'radiquer force d'observations et de rflexions, gardant toujours l'esprit que l' "on meurt davantage chez Klin que chez Barcht."

Ignace Philippe Semmelweis

C'est alors qu'il observa que les tudiants se dplaaient des salles de dissection cadavriques vers les salles d'accouchements, sans prcaution particulire. Il remarqua que s'exhalent des relents cadavriques des mains des professeurs, assistants, tudiants qui pratiquent des dissections sur les cadavres et c'est ainsi qu'ils se rendent au chevet des femmes en couches. Il en conclut qu'il devait y avoir un AGENT INVISIBLE , causant la mort et que l'on devait viter de transfrer cet agent de la salle d'autopsie la salle d'accouchement.

Il eut donc l'ide, de faire pratiquer un lavage systmatique des mains, de tous les tudiants, l'aide d'une solution de chlorure de calcium, bien que
cette mesure ne corresponde aucune exigence scientifique l'poque. partir de 1847, il interdit aux tudiants en mdecine de quitter les salles de dissection sans s'tre lav les mains, ce qui entrane immdiatement une baisse significative des taux de la mortalit qui passe de 12% 3%. Il tend ses formalits de dsinfection toute personne ayant t au contact d'une malade, d'instruments de chirurgie ou de pansements, il ordonne l'isolement des femmes malades :

la mortalit tombe 1%.

Ignace Philippe Semmelweis

Semmelweis fait part de son observation son Matre Klin, auquel il demande de se soumettre galement au lavage systmatique des mains. Sans doute vex, Klin rvoqua son assistant sans mnagement. Semmelweis s'loigne alors Venise. A son retour Vienne il apprend la mort de son ami Kolletchka professeur d'anatomie, des suites d'une piqre anatomique. La ncropsie avait montr une suppuration des mninges, de la plvre, du pritoine, les mmes observations qui avaient t faites sur les cadavres des femmes mortes de fivre puerprale, observe immdiatement Semmelweis. "Puisque Kolletchka, pensa-t-il est mort des suites d'une piqre cadavrique, ce sont donc les exsudats prlevs sur les cadavres qu'on doit incriminer dans le phnomne de contagion." A partir de l il est convaincu que la cause est identique et que les particules cadavriques inocules par la piqre puissent tre aussi transportes par les mains des mdecins chez les femmes examines. Il remarqua avec perspicacit, pour la premire fois, le rle de la transmission manuporte du "processus pathogne". Les tudiants en mdecine qui venaient examiner les femmes en travail aprs avoir dissqu des cadavres, sans s'tre lav les mains, furent dsigns comme responsables. Il constata que les femmes examines par les lves sages-femmes, qui n'avaient pas accs la salle d'anatomie, taient beaucoup moins souvent atteintes par la fivre puerprale. Il nota galement que les femmes qui accouchaient dans la rue, de peur de mourir l'hpital, taient pargnes par la maladie

Ignace Philippe Semmelweis

"quand on fera l'histoire des erreurs humaines, on trouvera difficilement des exemples de cette force et on restera tonn que des hommes aussi comptents, aussi spcialiss, puissent, dans leur propre science, demeurer aussi aveugles, aussi stupides." Ce quoi Klin rpondit: "Monsieur Semmelweis prtend que nous transportons sur nos mains de petites choses qui seraient la cause de la fivre puerprale. Quelles sont ces petites choses, ces particules qu'aucun oeil ne peut voir ? C'est ridicule ! Les petites choses de Monsieur Semmelweis n'existent que dans son imagination !".

Ignace Philippe Semmelweis

Il publie mais est rejet. Il meurt en hpital psy de septicmie aprs stre entaill lors dune dissection. Il sera rhabilit 20 ans plus tard.

1858-1864 : Querelle Pouchet/Pasteur

sur la gnration spontane. A lassaut des cimes, la conqute des salons. -1861-1866 : les org du vinaigre, du vin et de la bire. -1865-1869 : la maladie du ver soie -Tyndall : analyse de lair de Londres 60% des grands oprs meurent dinfections. 1878 : on parle de microbes : lasepsie se substitue lantisepsie car les pulvrisations dacide phnique provoque des inflammations.

Pasteur dmontre que la gnration spontane de microorganismes nexiste pas

et que toute apparition de vie dans un bocal apparemment clos est en fait due des poussires, des germes vhiculs par l'air l'insu de l'observateur.

Et pour tre sr qu'il n'y a pas d'influence de l'environnement dans ce phnomne, Pasteur refait ses expriences dans le jura et sur la mer de Glace, au-dessus de Chamonix.

Pasteur
Ce rsultat a un certain retentissement dans la socit du Second empire. En effet, cette poque, nombreux sont les Franais, plutt conservateurs, qui sont hostiles la thorie de la gnration spontane. Ils l'associent la thorie de l'volution de Darwin selon laquelle, pour rsumer, l'homme descend du singe.
Pasteur, lui-mme conservateur, aurait, en partie du moins, entrepris ses recherches dans le but de soutenir les valeurs traditionnelles.

Et en 1864, il s'exclame : Quelle victoire cela serait pour le matrialisme s'il pouvait dmontrer que la matire pouvait sauto-organiser et fabriquer la vie toute seule!
une leon donne en 1861 la Socit chimique de Paris.

1869 : les dbuts de lantisepsie : Joseph Lister

. Il tablit l'importance de nettoyer les blessures et de les isoler afin de les protger des microbes. Il dsinfecte les instruments de chirurgie et utilise comme agent antiseptique de l'acide phnique, utilis l'poque comme produit de traitement chimique des gouts.

1869 : les dbuts de lantisepsie : Joseph Lister

En 1867, il prsente sa dcouverte dans un article "Du principe d'antisepsie dans la pratique mdicale" qui est reu avec beaucoup de scepticisme par le milieu mdical. Mais en deux ans, Lister russit faire chuter le taux de mortalit de ses oprations de 50% 15%. La dsinfection qu'il prne finira par s'imposer tous, ce qui lui vaudra d'tre reconnu comme le fondateur de la chirurgie moderne.

Tyndall et Pasteur
Tyndallisation :Procd de strilisation consistant chauffer plusieurs reprises un milieu une temprature qui dtruit les microbes sans altrer la composition chimique. Pasteurisation

La coloration de Gram
Pasteurella Listeria Coques, bacilles,Gram+/ Microbe? = microorganisme Virus,prion, bactrie, moisissure, levure, parasite.

 LE MONDE VIVANT -REGNE ANIMAL

Absorption Eucaryotes multicellulaires

-REGNE VEGETAL
Photosynthse Eucaryotes multicellulaires-

REGNE DES FUNGI :

Absorption moisissures levures Eucaryotes Multi et unicellulaires Reproduction sexue et asexue-

REGNE DES PROTISTES :

Algues, Protozoaires (amibes, sporozoaires, cilis, flagells.)Eucaryotes unicellulaires. Photosynthse ou absorption. Reproduction sexue et asexue

-REGNE DES MONERA :

les Bactries et les Archobactries Procaryotes unicellulaires. Reproduction asexue Photosynthse ou absorption.

Les virus
Pas de mtabolisme Pas de cellule

Les prions
Pas dADN