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Biologie - Cours: 2: La synthèse des protéines

Biologie - Cours: 2: La synthèse des protéines

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La synthèse des protéines

1

Objectif général
Expliquer les différentes étapes menant du gène à la protéine

Collège Lionel-Groulx

2

Plan du cours
Introduction: L’ARN? Le code génétique? 1. La transcription
a. L’initiation b. L’élongation c. La terminaison

2. La maturation de l’ARNprém
a. La modification des extrémités de l’ARNprém b. L’épissage

3. La traduction
a. L’initiation b. L’élongation c. La terminaison

4. Les modifications posttraductionnelles 5. Les mutations ponctuelles
Figure
La synthèse des protéines

1

Objectif général
Expliquer les différentes étapes menant du gène à la protéine

Collège Lionel-Groulx

2

Plan du cours
Introduction: L’ARN? Le code génétique? 1. La transcription
a. L’initiation b. L’élongation c. La terminaison

2. La maturation de l’ARNprém
a. La modification des extrémités de l’ARNprém b. L’épissage

3. La traduction
a. L’initiation b. L’élongation c. La terminaison

4. Les modifications posttraductionnelles 5. Les mutations ponctuelles
Figure

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La synthèse des protéines

1

Objectif général
Expliquer les différentes étapes menant du gène à la protéine

Collège Lionel-Groulx

2

Plan du cours
Introduction: L’ARN? Le code génétique? 1. La transcription
a. L’initiation b. L’élongation c. La terminaison

2. La maturation de l’ARNprém
a. La modification des extrémités de l’ARNprém b. L’épissage

3. La traduction
a. L’initiation b. L’élongation c. La terminaison

4. Les modifications posttraductionnelles 5. Les mutations ponctuelles
Figure 17.3 b), p. 340
3

• Macromolécule • Acide nucléique:

L’ARN

– Base azotée (A, U, G, C) – Sucre (ribose) – Groupement phosphate

• Appariement avec l’ADN • Types d’ARN:
– – – – – ARN prémessager (ARN prém) ARN messager (ARNm) Petit ARN nucléaire (pARNn) ARN ribosomique (ARNr) ARN de transfert (ARNt)
Figure 5.26, p. 91
4

Le code génétique
1 génon → 1 codon → 1 acide aminé
64 génons = 64 codons = 20 acides aminés + codons d’arrêt

Il y a de la redondance dans le code génétique: plusieurs codons donnent le même acide aminé

Figure 17.4, p. 341

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5

Le code génétique

Figure 17.5, p. 342

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6

Le code génétique
• Cadre de lecture:
– L’ARN doit être lu dans le bon sens et à partir du bon endroit pour former une protéine fonctionnelle. – Sens 5 ’→ 3 ’
Figure 5.26, p. 91

• CAGUGGAGUGCGGUU = CAG UGG AGU GCG GUU Gln Trp Ser Ala Val ≠ AGU GGA GUG CGG Ser Gly Val Arg
Collège Lionel-Groulx 7

ADN → ARNprém→ ARNm → Protéine 2 3 1
1. Transcription 2. Maturation de l’ARN 3. Traduction
Animation de la transcription et la traduction

8

1.La transcription - Une vue d’ensemble

Figure 17.7, p. 343

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9

a. L’initiation
• Facteurs impliqués:
– ADN:
• Promoteur du gène • boîte TATA

– Facteurs de transcription – ARN polymérase II

Complexe d’initiation de la transcription

Figure 17.8, p. 344
10

b. L’élongation
• Facteurs impliqués:
– – – – ADN ARN polymérase II (v = 60 nt/sec) Acides nucléiques libres Action simultanée de plusieurs ARN polymérases II

Figure 17.7, p. 343

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11

c. La terminaison
• Facteurs impliqués:
– ADN (séquence AAUAAA ou région de terminaison) – ARN polymérase II

• Résultat = Libération de l’ARN prém (transcrit)

Figure 17.7, p. 343

12

Promoteur

ARN polymérase II Initiation

ARN prém en formation Élongation

ARN prém en formation

Terminaison

ARN prém Collège Lionel-Groulx

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2. La maturation de l’ARNprém
• Deux modifications importantes:
a. Les modification des extrémités de l’ARNprém b. L’épissage

• • •

Lieu: noyau Résultat: ARNprém → ARNm Buts:
– – – Protection de l’ARNm Transport de l’ARNm Préparation de l’ARNm à la traduction
14

a. Les modifications des extrémités de l’ARNprém
• Extrémité 5’:
– Ajout d’un nucléotide G modifié = Coiffe 5’

• Extrémité 3’:
– Ajout de plusieurs nucléotides A = Queue poly-A

• Fonctions:
– Transport de l’ARNm – Protection de l’ARNm

Figure 17.9, p. 345

15

b. L’épissage
• La molécule d’ARNprém est beaucoup plus longue que nécessaire.
– Les régions codantes sont des séquences d’ARN qui seront traduites en protéines. Ce sont les exons. Exons = séquences exprimées. – Les régions non codantes sont des séquences d’ARN qui ne seront par traduites. Ce sont les introns. Introns = intrus…

• Processus d’excision des introns et de recollage des exons de l’ARNm.

Figure 17.10, p. 346

16

b. L’épissage
• Fonctions:
– Nécessaire pour le transport de l’ARNm au cytoplasme. – Épissage différentiel de l’ARN permet d’avoir plusieurs protéines avec un même gène. – Fonction évolutive?

Figure 19.8, p. 400

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17

b. L’épissage
• Complexe d’épissage:
– Ensemble de protéines et de petits ARN nucléaires (pARNn) coupant l’ARNprém. – Protéines + pARNn = petites ribonucléoprotéines nucléaires ou pRNPn

Figure 17.11, p. 347

18

La maturation de l’ARNprém
ADN

Signal poly(A) Exon Intron Exon Intron Exon

ARN prém

Introns D’ARN

Épissage

ARNm
Coiffe 5’ Codon de départ Codon d’arrêt Queue poly(A) 19

Figure 19.5, p. 397

Figure 17.3 b), p. 340
Collège Lionel-Groulx 20

3. La traduction – une vue d’ensemble

Figure 17.13, p. 349

Collège Lionel-Groulx

21

L’ARNt
• Plusieurs ARNt différents • Fonctions:
– Interprétation des codons de l’ARNm – Transport des acides aminés vers le ribosome

• Structure:
– Anticodon s’appariant avec l’ARNm – Site de liaison avec l’acide aminé

Figure 17.14, p. 349

• C’est la molécule traductrice.
22

L’aminoacyl-ARNt-synthétase
• 20 types = 20 acides aminés • Fonction:
– Appariement de l’ARNt avec l’acide aminé correspondant en prenant l’énergie de l’ATP.
Figure 17.15, p. 350
23

Le ribosome
• Organite cytoplasmique (composé d’ARNr et de protéines) fabriqué dans le nucléole.
• Fonctions:
– Appariement du codon de l’ARNm avec l’anticodon de l’ARNt. – Formation du polypeptide

• Structure:
– Petite sous-unité ribosomique – Grande sous-unité ribosomique

• Sites importants
– Site A – Site P – Site E
Figure 17.16, p. 351
24

Le ribosome
• Polyribosomes:
– Traduction simultanée d’un même ARNm par plusieurs ribosomes.

Figure 17.20, p. 354

Collège bass.bio.uci.edu Lionel-Groulx

25

a. L’initiation
• Facteurs impliqués:
– – – – – ARNm (codon de départ AUG) ARNt d’initiation et acide aminé Met Petite sous-unité ribosomique Grande sous-unité ribosomique GTP
Complexe d’initiation de la traduction

• Lieu: cytoplasme

Figure 17.17, p. 352

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b. L’élongation
• Facteurs impliqués:
– – – – ARNm ARNt Ribosome 2 GTP

Figure 17.18, p. 353

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27

c. La terminaison
• Facteurs impliqués:
– ARNm (codons d’arrêt UAG, UAA et UGA) – Facteur de terminaison – Hydrolyse

Figure 17.19, p. 354

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Résumé
• Film: Protein Synthesis Translation 2008 http://fr.youtube.com/watch?v=yJdAxuIA6QM

• Film: Translation: the movie http://vcell.ndsu.edu/animations/translation/movieflash.htm

29

Figure 17.26, p. 360

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30

4. Les modifications post-traductionnelles
• Obtention d’une protéine fonctionnelle
– Repliement du polypeptide selon une structure en 3D spécifique. – Regroupement de différents polypeptides. – Découpage d’un polypeptide.

Figure 5.20, p. 87

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31

4. Les modifications post-traductionnelles
• Ciblage des protéines
– Ajout de molécules qui permettent d’envoyer les protéines à des endroits spécifiques dans la cellule ou à l’extérieur de la cellule.

Figure 17.21, p. 355

32

L’exocytose

Figure 7.10, p. 134

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5. Les mutations ponctuelles
• Mutation:
– Modification du bagage génétique d’une cellule.

• Mutation ponctuelle:
– Modification chimique d`une paire de bases azotées – 2 catégories:
• Les substitutions • Les insertions et les délétions

• Mutations spontanées:
– Erreurs survenant durant les processus cellulaires normaux touchant l’ADN. – Ex.: la réparation de l’ADN.

• Mutagènes:
– Agents physiques ou chimiques qui changent l’ADN. – Ex.: les rayons UV
34

Les substitutions

Figure 17.24, p. 358

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35

Les insertions et les délétions

Figure 17.25, p. 358

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36

Figure 17.23, p. 357

37

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