Chapitre 10 Microbiote et santé

Prénom et nom :
Activité unique : le microbiote humain
« Si vous qui croyez que votre intestin n'est bon qu'à se vider et qu'il pendouille
inutilement le reste du temps dans votre ventre, vous allez être surpris en découvrant la
richesse et la complexité du microbiote*, le petit monde de bactéries, d'archées et de
champignons qui l'habite !
Les recherches de ces dernières décennies ont en effet montré que ce microbiote
jouait un rôle fondamental dans l'organisme et ont mis en évidence son influence sur
notre système immunitaire et notre comportement. »
L'EXPOSITION « MICROBIOTE » D'APRÈS "LE CHARME DISCRET DE L'INTESTIN" DU 4 DÉCEMBRE 2018 AU 4 AOÛT 2019 à la
CITE DES SCIENCES ET DE L’INDUSTRIE - PARIS
*Le microbiote humain représente l’ensemble des micro-organismes qui vivent dans et sur le corps humain, qui se nourrissent
de ce que l’on mange et qui participe à notre bonne santé. Cette relation entre l’Homme et son microbiote est appelée
symbiose.

Problème : Qu’est-ce que le microbiote ? Quels sont les rôles et les perturbations du microbiote ?

Objectif de connaissance : symbiose ; hôte et microbiote ; unicité et diversité du microbiote, compétition entre microbes.
Evaluation
Capacités Indicateurs d’évaluation Auto-évaluation
enseignant
- Les étapes ont été suivies scrupuleusement
S2 Mettre en œuvre un
- Les manipulations sont correctement réalisées A B C D A B C D
protocole
- Les résultats sont exploitables
- Les résultats sont correctement exploités
S3 Raisonner - Interprétation exacte et justifiée A B C D A B C D
- Conclusion valide

ATELIER 1 : A LA DECOUVERTE DU MICROBIOTE HUMAIN (20 min)

Consignes :
A l’aide des données présentées dans les documents 1 et 2 ci-dessous :
- Déterminer les différentes familles de micro-organismes présents dans le corps humain et indiquer la famille
prépondérante : Il existe 3 familles de micro-organismes : les archées, les bactéries et les champignons. D’après le document 1, les
bactéries sont prépondérantes, avec 7 types sur les 11 présentes dans le corps.

- Indiquer l’organe humain qui possède le plus de micro-organismes : Le colon est l’organe humain qui possède le plus de
micro-organismes
- Dans le document 2, calculer la quantité totale de cellules bactériennes présentes dans un organisme humain ainsi que leur
proportion respective en % (cases grisées à remplir).
- Calculer le rapport entre la quantité de cellules bactériennes et la quantité de cellules humaines (L’être humain est composé
de 3,0 .1013 cellules) : 1,3
Document 1 :
Chapitre 10 Microbiote et santé
 Chapitre 10 Microbiote et santé

Tous les tissus de notre organisme

Document 2 : Estimation haute du nombre de bactéries dans différents organes humains en contact avec le milieu extérieur
(peau, muqueuses digestive,
Localisation Quantité de cellules bactériennes Proportion respiratoire
de cellules bactériennes (en %) sont
et génitale)
Colon 3,8.1013 colonisés
97,43 par des micro-
Plaque dentaire 1,0.10 12 organismes
2,56 formant notre
11 microbiote.
0,25
Intestin grêle postérieur 1,0.10
Salive 1,0.1011 0,25
Peau 1,0.10 11 0,25
7 −5
Estomac 1,0.10 2 , 56.10
−5
Intestin grêle antérieur 1,0.107 2 , 56.10
Total 3 , 9.10
13 100 %

ATELIER 2 (40 min)

Objectif : Montrer que le microbiote intestinal a un

rôle indispensable dans l’immunité.

On réalise l’expérience suivante : on injecte des

quantités variables d’une bactérie pathogène, la
Salmonelle, à deux lots de souris. Le premier lot est
constitué de souris saines et le 2 ème lot de souris
traités à la streptomycine, un antibiotique. Les
antibiotiques détruisent une grande partie du
microbiote.
NB : Les salmonelles (Salmonella) sont des bactéries qui provoquent chez l'espèce humaine des maladies telles que la fièvre typhoïde, la fièvre paratyphoïde et
la salmonellose, une des principales causes de toxi-infection alimentaire collective (TIAC).

Consignes : On se propose de modéliser, à l’aide d’un logiciel en ligne, les interactions du microbiote avec des agents
pathogènes.
- A partir des valeurs du tableau ci-dessus, on émet l’hypothèse que les bactéries du microbiote entrent en compétition avec
les bactéries pathogènes (Salmonelle). Proposer une expérience qui permette de tester cette hypothèse ; puis définir les
paramètres fixes et le paramètre variable :
- Paramètres
- paramètres fixes = bactéries pathogènes + nutriments + phagocytes
- paramètre variable = bactéries non pathogènes

Vous allez utiliser une modélisation numérique afin de mettre en évidence la compétition entre le microbiote et les bactéries
Salmonelle.
Le logiciel utilisé est Edu’modèles disponible sur le lien suivant :
https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/edumodeles/algo/index.htm?modele=microbiote2bact

Principe de fonctionnement de Edu’modèles :

Ce modèle comporte 4 types d’agents :
Des nutriments, représentés par des points noirs (les bactéries pathogènes ou non ont besoin de nutriments pour vivre et se
reproduire)
Des bactéries non pathogènes représentées par des cercles verts
Des bactéries pathogènes représentées par des cercles rouges
Quelques phagocytes, représentés par des carrés violets

Son fonctionnement s’appuie sur 3 règles :

Afin de modéliser le fait qu’une bactérie ait besoin de croître avant de pouvoir se diviser, on définit la règle algorithmique
suivante : “bactérie + nutriment => bactérie + bactérie”
Afin de modéliser la phagocytose, on définit la règle algorithmique suivante : “phagocyte + bactérie pathogène => phagocyte”
Les nutriments sont renouvelés en permanence, soit à chaque tour

- Exécuter le modèle sans modifier aucun paramètre. (NB : on pourra augmenter la vitesse de l’animation pour atteindre
rapidement 5000 tours)
- Faire une capture écran du graphique ainsi obtenu, le copier dans le compte-rendu.
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- Modifier le paramètre choisi d’après le protocole défini précédemment, en sélectionnant l’agent (le paramètre variable)
et en sélectionnant « Modifier cet agent » puis « Nombre d’agents de ce type au démarrage ». Dans notre cas, il s’agit de
diminuer le nombre de bactéries non pathogènes (celles du microbiote).
- Réaliser trois nouvelles simulations avec différentes valeurs du paramètre sélectionné (durée identique de 5000 tours).
- Pour chaque simulation, effectuer une capture d’écran du graphique ainsi obtenu et le coller dans le compte-rendu.
Placer également la légende.
Capture d’écran des graphiques suite aux modélisations
1ère modélisation avec 30 bactéries non pathogènes 2ème modélisation avec bactéries non pathogènes

3ème modélisation avec bactéries non pathogènes 4ème modélisation avec 0 bactérie non pathogène

- Observer les résultats obtenus et interpréter les :

- Conclure en validant ou invalidant l’hypothèse de départ et répondre à l’objectif de l’activité 2 :

Visionnez en conclusion de l’activité la vidéo suivante : https://www.reseau-canope.fr/corpus/video/les-

roles-du-microbiote-sur-la-sante-232.html