Médecine et maladies infectieuses 37 (2007) 266–269

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Article original

Émergence des souches de salmonelles

multirésistantes aux antibiotiques à Lomé (Togo)
Emergence of multidrug resistant Salmonella strains in Lome (Togo)
A.-Y. Dagnraa,*, K. Akollya, A. Gbadoeb, K. Ahoa, M. Davida
a
Laboratoire de bactériologie–virologie, CHU Tokoin, 08 BP 8742 Lomé, Togo
b
Service de pédiatrie, CHU Tokoin, Lomé, Togo
Reçu le 28 novembre 2006 ; accepté le 27 février 2007
Disponible sur internet le 24 avril 2007

Résumé
Objectifs. – Comparer les pourcentages de résistance aux antibiotiques de Salmonella enterica responsable d’infections humaines à Lomé sur
deux périodes.
Méthodes. – Trois cent trente-deux souches de Salmonella enterica isolées entre 1998–2002 (n = 168) et 2003–2004 (n = 164) ont été inclues
dans l’étude. L’antibiogramme a été réalisé par la méthode de diffusion sur gélose Mueller-Hinton.
Résultats. – La répartition des 332 souches a été, 147 (44,3 %) Salmonella Typhi, 97 (29,2 %) Salmonella Typhimurium, 74 (22,3 %) Salmo-
nella Enteritidis et 14 (4,2 %) Salmonella spp. Les proportions de souches résistantes au chloramphénicol, à l’amoxicilline et au cotrimoxazole
(antibiotiques de première intention) sont passées respectivement de 33, 46 et 57 % en 1998–2002 à 73, 79 et 82 % en 2003–2004 (p < 0,0001).
Sur les 164 souches de salmonelles isolées entre 2003–2004, 108 (72 %) étaient résistantes à la fois au chloramphénicol, cotrimoxazole et
amoxicilline. Le pourcentage de souches résistantes à la ciprofloxacine, aux aminosides ou à la ceftriaxone était inférieur à 10 %.
Conclusion. – Les fluoroquinolones et les céphalosporines de troisième génération constituent actuellement les antibiotiques de première
intention dans le traitement des salmonelloses.
© 2007 Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
Abstract
Objective. – This study had for aim to compare antibiotic resistance of 332 Salmonella enterica strains identified in human samples in the
course of infections, in Lome.
Design. – The strains were collected over two periods: 1998–2002 (N = 168) and 2003–2004 (N = 164). The antibiotic susceptibility test was
performed by disk diffusion assay.
Results. – The main serotypes identified were 147 Salmonella Typhi (44.3%), 97 Salmonella Typhimurium (29.2%), and 74 Salmonella Enter-
itidis (22.3%). The proportions of strains resistant to chloramphenicol, cotrimoxazol, and amoxicillin (first line antibiotics) varied respectively
from 33, 46, and 57% in 1998–2002 to 73, 79, and 82% in 2003–2004 (P < 0.0001). The percentage of resistance to ciprofloxacin or ceftriaxone
was inferior to 10%.
Conclusion. – Fluoroquinolones and third generation cephalosporins have become the first line antibiotics for the treatment of Salmonella in
Lome (Togo).
© 2007 Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.

Mots clés : Multirésistance aux antibiotiques ; Salmonella

Keywords: Multiresistance to antibiotics; Salmonella

* Auteurcorrespondant.
Adresse e-mail : a.dagnra@voila.fr (A.-Y. Dagnra).

0399-077X/$ - see front matter © 2007 Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
doi:10.1016/j.medmal.2007.02.002
 A.-Y. Dagnra et al. / Médecine et maladies infectieuses 37 (2007) 266–269
1. Introduction
Les salmonelles, bactéries très répandues en milieu tropical,
sont responsables de fièvres typhoïdes et de salmonelloses non
typhiques qui représentent une cause majeure de diarrhées dans
le monde avec un taux important de mortalité infantile [1,2]. À
part Salmonella Typhi, les formes graves des infections dues à
des sérotypes comme Enteritidis et Typhimurium (septicémies,
localisations extradigestives) deviennent de plus en plus fré-
quentes à cause de l’immunodépression due à l’infection au
virus de l’immunodéficience humaine (VIH) [3,4]. L’utilisation
du chloramphénicol dans le traitement de la fièvre typhoïde à
partir de 1948 a réduit d’une façon importante la mortalité liée
à cette affection. Au Togo, le traitement des infections aux sal-
monelles tout sérotype confondu repose sur l’utilisation de
l’amoxicilline, du cotrimoxazole et surtout du chloramphénicol ;
le chloramphénicol malgré ses effets secondaires hématologiques
est l’antibiotique de première intention pour le traitement des
salmonelloses chez l’enfant à cause de son coût moins élevé.
Les fluoroquinolones et les céphalosporines compte tenu de
leur coût sont moins utilisées et constituent les médicaments de
seconde ligne. Depuis 2003, des échecs thérapeutiques avec
l’utilisation des antibiotiques de première ligne sont observés
dans le service de pédiatrie du centre hospitalier et universitaire
(CHU) Tokoin (Lomé, Togo).
L’objectif de cette étude est de déterminer les proportions de
souches résistantes aux antibiotiques des salmonelles isolées
dans nos hôpitaux.
2. Matériel et méthodes
2.1. Origines des souches
L’étude a été réalisée sur deux périodes :
● une première période de 1998 à 2002 (cinq ans) rétrospec-
tive pendant laquelle nous avons colligé les résultats des
antibiogrammes des souches de salmonelles isolées au
CHU Tokoin et au CHU Campus de Lomé ;
● une deuxième période prospective de 2003 à 2004 pendant
laquelle nous avons isolé, identifié et collecté les souches de
salmonelles dans les CHU Tokoin et Campus et à la cli-
nique Alpia de Lomé. L’isolement a été fait sur gélose Hek-
toen ou gélose nutritive (bacille à Gram négatif, mobile
péritriche, non exigeant et aérobie facultatif) et l’identifica-
tion à partir de la galerie API 20E (bio-Mérieux).
2.2. Sérotypage des souches de salmonelles
Les sérotypes ont été déterminés par test d’agglutination sur
lame avec les immuns sérums de groupe et des immuns sérums
spécifiques dirigés contre les antigènes O, H et Vi des salmo-
nelles.
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2.3. Résistance aux antibiotiques
L’antibiogramme a été réalisé par la méthode de diffusion
sur gélose Mueller-Hinton de disques d’antibiotiques (bio-
Mérieux). L’interprétation des résultats a été faite selon les
règles et les recommandations du Comité d’antibiogramme de
la Société française de microbiologie (http://www.sfm.asso.fr).
Les antibiotiques suivants ont été testés : amoxicilline, l’asso-
ciation amoxicilline et acide clavulanique, céfalotine, céfoxi-
tine, ceftriaxone, gentamicine, nétilmicine, acide nalidixique,
ciprofloxacine, doxycycline, cotrimoxazole et chloramphénicol.
2.4. Analyse statistiques des données
Les données ont été analysées par le logiciel Épi Info ver-
sion 6.04b. Le test statistique de Chi2 a été utilisé pour com-
parer les valeurs avec un intervalle de confiance à 95 %.
3. Résultats
L’étude a été réalisée sur 332 souches de salmonelles dont
168 isolées entre 1998 et 2002 et 164 entre 2003 et 2004. Les
sérotypes Typhi, Enteritidis et Typhimurium ont représenté
95,8 % des 168 souches isolées en 1998–2002 et 91,5 % des
164 souches isolées en 2003–2004 (Tableau 1). La proportion
des souches de S. Typhi et Salmonella Enteritidis isolées était
respectivement de 38,7 et 35,1 % en 1998–2002 contre 50 et
9,2 % en 2003–2004 avec une différence statistiquement signi-
ficative (p < 0,0001).
Les souches de salmonelles ont été isolées à partir de divers
produits pathologiques dans les situations cliniques suivantes
(Tableau 2) : 231 septicémies (69,6 %), 53 entérocolites
(16 %), 14 infections urinaires (4,2 %), dix péritonites par per-
foration intestinale (3 %), dix ostéomyélites (3 %), huit arthri-
tes septiques (2,4 %) et six pleurésies purulentes (1,8 %). Sur
147 souches de S. Typhi, 132 (89,8 %) ont été isolées des
hémocultures.
La sérologie VIH s’est révélée positive chez 89 sur 195
patients testés (45,6 %). Les sérotypes en cause chez les 89
patients séropositifs au VIH ont été, 41 Salmonella Typhimu-
rium (46 %), 22 S. Typhi (24,7 %) et 18 S. Enteritidis (20,2 %),
cinq S. Dublin (2,6 %) et trois S. Panama (1,6 %).
Les proportions de souches résistantes de S. Typhi,
S. Typhimurium et S. Enteritidis aux antibiotiques de première
Tableau 1
Distribution par sérotypes de 332 souches de Salmonella spp isolées en
pathologie humaine à Lomé
Table 1
Distribution according to serotype for 332 Salmonella spp strains identified in
human samples in Lomé
Sérotypes 1998–2002 2003–2004 Total
n = 168 (%) n = 164 (%) n = 332 (%)
Salmonella Typhi 65 (38,7) 82 (50) 147 (44,3)
Salmonella Typhimurium 38 (22,6) 59 (36) 97 (29,2)
Salmonella Enteritidis 59 (35,1) 15 (9,2) 74 (22,3)
Salmonella sp* 6 (3,6) 8 (4,8) 14 (4,2)
*Salmonella Paratyphi A (n = 3) ; S. Paratyphi C (n = 2) ; Salmonella Dublin
(n = 6) ; Salmonella Panama (n = 3).
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Tableau 2
Aspects cliniques des infections dues à Salmonella à Lomé entre 1998 et 2004
Table 2
Clinical aspects of infections due to Salmonella in Lomé from 1998 to 2004
Septicémies Entérocolites IUa PIb Ostéomyélites Arthrite Pleurésie
n = 231 (%) n = 53 (%) n = 14 (%) n = 10 (%) n = 10 (%) n = 8c (%) n = 6c (%)
Salmonella Typhi 132 (57,1) 0 (0,0 %) 2 (14,3) 8 (80) 2 (20) 1 2
Salmonella Typhimurium 52 (22,5) 25 (47,1) 7 (50) 1 (10) 6 (60) 2 4
Salmonella Enteritidis 43 (18,6) 26 (49) 0 (0,0) 0 (0,0) 2 (20) 3 0
Salmonella spp* 4 (1,7) 2 (3,8) 5 (35,7) 1 (10) 0 (0,0) 2 0
*Salmonella Paratyphi A (n = 3) ; S. Paratyphi C (n = 2) ; Salmonella Dublin (n = 6) ; Salmonella Panama (n = 3).
a
Infection urinaire.
b
Perforation intestinale.
c
Pourcentage non calculé pour effectif trop faible.

Tableau 3
Comparaison des pourcentages de résistance aux antibiotiques de Salmonella typhi, Salmonella typhimurium et Salmonella enteritidis entre 1998–2000 et 2003–2004
Table 3
Comparison of antibiotic resistance rates for Salmonella typhi, Salmonella typhimurium, and Salmonella enteritidis from 1998 to 2000 and from 2003 to 2004
Antibiotiques Salmonella Typhi Salmonella Typhimurium Salmonella Enteritidis Chi2 (p value)
1998–2002 2003–2004 1998–2002 2003–2004 1998–2002 2003–2004 comparaison des
(n = 65) % (n = 82) % (n = 38) % (n = 59) % (n = 59) % (n = 15) % résistances
globales*
Amoxicilline 34 72 50 96 45 80 39,5 (< 0,0001)
Amoxicilline + acide clavulanique 15 53 33 83 28 72 41,1 (< 0,0001)
Céfalotine 7 13 15 22 18 25 NS1
Céfoxitine 0 9 5 13 5 12 NS
Ceftriaxone 0 0 0 2 0 7 NC2
Doxycycline 40 75 49 77 52 93 28,98 (< 0,0001)
Cotrimoxazole 30 81 58 96 54 93 23,53 (< 0,0001)
Chloramphénicol 15 69 40 96 20 80 37,39 (< 0,0001)
Acide nalidixique 0 4 5 17 10 13 15,19 (< 0,0001)
Ciprofloxacine 0 0 0 8 0 7 NC
Gentamicine 0 5 12 13 8 13 0.5 NS
Nétilmicine 0 0 0 0 0 0 NC
*Comparaison des pourcentages de souches résistantes tous sérotypes confondus entre 1998–2002 et 2003–2004.

Tableau 4 4. Discussion
Profil de multirésistance aux antibiotiques des sérotypes de salmonelles isolés
entre 2003–2004 à Lomé
Table 4 Les infections dues aux salmonelles sont fréquentes aussi
Profile of multiresistance to antibiotics for salmonella serotypes identified bien dans les pays développés que dans les pays en développe-
between 2003 and 2004 in Lomé
ment. Dans les pays développés, ce sont les sérotypes non
Type de résistance* Salmonella Salmonella Salmonella Typhi qui sont en cause. Ils sont responsables de toxi-
Typhi Typhimurium Eenteritidis
infections alimentaires dont les manifestations restent souvent
(n = 82) % (n = 59) % (n = 15) %
AC 69 96 80 localisées au tube digestif [5–7]. Dans les pays en développe-
CCo 69 96 80 ment, le sérotype Typhi était de loin le plus fréquemment isolé
CD 65 65 65 par hémoculture [8–11]. Les sérotypes non Typhi étaient les
ACD 63 65 65 premiers responsables de septicémies chez les patients immu-
ACCo 69 96 80
AAuCCo 56 83 70
nodéprimés. Leur fréquence et leur gravité sont de plus en plus
AAuCCoD 56 75 65 croissantes en Afrique à cause de l’infection à VIH, nécessitant
* Abréviation des antibiotiques : A = amoxicilline ; Au = association amoxicil- une hospitalisation et une antibiothérapie [9,10].
line et acide clavulanique ; C = chloramphénicol ; Co = cotrimoxazole ;
Cette étude a été réalisée dans le but de comparer les pro-
D = doxycycline.
portions de souches de salmonelles résistantes aux antibioti-
ligne (amoxicilline, association amoxicilline et acide clavula- ques sur deux périodes, 1998–2002 et 2003–2004. Elle fait
nique, doxycycline, cotrimoxazole et chloramphénicol) étaient suite à des échecs thérapeutiques observés surtout dans le ser-
plus élevées sur la période de 2003–2004 par rapport à la vice de pédiatrie du CHU Tokoin (Lomé) après utilisation des
période de 1998–2002 avec une différence statistiquement antibiotiques de première ligne, chloramphénicol, cotrimoxa-
significative (p < 0,001) (Tableau 3). Les proportions de sou- zole et amoxicilline.
ches résistantes à la fois à cinq antibiotiques étaient respective- La proportion des souches de S. Typhi et S. Enteritidis iso-
ment de 56, 65 et 75 % pour les sérotypes Typhi, Enteritidis et lées en 1998–2002 et 2003–2004 (Tableau 1) témoigne d’une
Typhimurium (Tableau 4). modification de l’écologie microbienne avec une recrudescence
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de cas de S. Typhi, sérotype responsable de la forme la plus
grave des infections dues aux salmonelles.
Même si les aspects cliniques étaient très variés (Tableau 2),
les septicémies étaient de loin les manifestations cliniques les
plus fréquentes. L’antibiothérapie au cours des infections dues
aux salmonelles est obligatoire si la localisation est extradiges-
tive, ce qui correspond à plus de 80 % des manifestations cli-
niques observées dans notre étude.
Concernant la résistance aux antibiotiques, nous avons
observé une émergence des souches résistantes à tous les anti-
biotiques de première ligne (chloramphénicol, cotrimoxazole,
amoxicilline) entre 2003–2004 quel que soit le sérotype.
Cette observation par rapport au nombre de souches étudiées
est une première dans la sous-région Ouest-africaine. En effet,
une étude réalisée au Ghana sur S. Typhi uniquement, rapporte
dix souches sur 50 (20 %) résistantes à la fois aux antibiotiques
de première ligne, chloramphénicol, cotrimoxazole et amoxicil-
line [11]. En revanche, les résultats observés au Sénégal et au
Burkina-Faso, montrent que S. Typhi, S. Enteritidis et Salmo-
nella Typhimurium restent largement sensibles aux antibioti-
ques de première ligne, 70 à 87 % des souches isolées à
Dakar sont sensibles au chloramphénicol ; 100 et 85 % des
souches isolées au Burkina Faso sont sensibles respectivement
au cotrimoxazole et à l’amoxicilline [8–10]. Cependant, des
souches de Salmonelles multirésistantes ont émergé de par le
monde, notamment aux États-Unis, en Europe et en Asie et
concernent tous les sérotypes [12–15]. La caractérisation géné-
tique de ces souches a permis la mise en évidence des plasmi-
des de virulence porteurs des gènes de résistance à plusieurs
antibiotiques [11,15,16].
L’impact de cette multirésistance aux antibiotiques pour les
patients est l’augmentation du coût du traitement des infections
dues aux salmonelles ; au Togo il n’existe pas un système de
sécurité sociale, l’assurance maladie reste encore très limitée et
les dépenses de santé à la charge des malades. Les fluoroqui-
nolones et les céphalosporines de troisième génération sont
devenues aujourd’hui des antibiotiques de première ligne. Il
est indispensable que leur prescription et leur utilisation soient
réglementées pour prévenir une sélection rapide des souches
résistantes à ces antibiotiques comme cela est observé dans
certains pays, notamment pour les fluoroquinolones.
Remerciements
Nous remercions l’université de Lomé pour avoir financé
une partie de cette étude.
Nous remercions MM. Bocovi Aklamanou et Ségla Tigos-
sou pour la collecte des souches.
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