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Éléments de biologie

cellulaire

Jean-Christophe Pagès
DATES ET DÉFINITIONS EN BIOLOGIE CELLULAIRE:
1) La biologie cellulaire émerge avec les outils qui permettent de « voir » le vivant :

ü 1665 le terme « Cellule » est proposé par Robert Hooke: loupe.


ü 1674 Van Leeuwenhoek « invente » le microscope.
ü 1800-50 Construction de la théorie cellulaire par l’observation: Berlin.
ü 1855 R Virchow, La cellule comme unité structurelle et fonctionnelle des
organismes ET reproduction et renouvellement des cellules par division.
o Lien histologie, organisation tissulaire et physiopathologie.
ü 1893 O Hertwig :
o Unification de la théorie cellulaire.
o L’œuf : fusion d’un gamète mâle et d’un gamète femelle.

Ø « Conservation » de l’information structurelle & théorie cellulaire sont le socle de la


génétique.
ÉVOLUTION ET ÉMERGENCE CELLULAIRE
2) Qu’est-ce que le vivant ?
Un « objet » biologique est vivant, s’il est :
Un système autoréplicatif et capable d’évolution.

• Conséquences (1) :
• Capacité de réplication/autoréplication :
ü Par auto-assemblage: interactions moléculaires, une des propriétés des
lipides en milieu aqueux.
ü Par copie: enzymes et information génétique à conservation de la forme.
• Unité de reproduction :
ü La cellule pour les organismes unicellulaires et les tissus des pluricellulaires.
ü La fusion des gamètes pour la reproduction sexuée à Le zygote.
ÉVOLUTION ET ÉMERGENCE CELLULAIRE
Conséquences (2) :
• Les capacités évolutives des cellules et par conséquence des organismes sont
consubstantielles (intrinsèques) à leur fonctionnement physico-(bio)chimique.

• Sur le plan biologique :


Ø Les cellules sont des « bioréacteurs » en milieu ouvert :
o Les réactions biochimiques sont des équilibres (!pas en équilibre!).
Ø Il existe des « variations » lors de la copie des génomes :
o Variation dans les séquences : polymorphismes, neutres ou exprimés.
o Variation de nombre de copie de gène : Pression de sélection et
divergence génétique (fonctionnelle).

Ø Toute variation génétique est source d’évolution.


LE TEMPS DE L'ÉVOLUTION
FLASHBACK : BIOLOGIE DE L’ÉVOLUTION DES EUCARYOTES
Les bactéries ont précédé l’émergence des eucaryotes.
Selon les milieux terrestres plusieurs types de bactéries se sont développés :

Cyanobactéries
Photosynthèse Alphaprotéobactéries
Deltaprotéobactéries
Réduction du soufre Asgard Archéabactéries
Bactéries méthanogènes
Production de méthane Autres bactéries

Théorie endosymbiotique :

Alphaprotéobactéries
Deltaprotéobactéries
Asgard Archéabactéries
(Archéabactérie)
FLASHBACK : BIOLOGIE DE L’ÉVOLUTION DES EUCARYOTES
ü Ce sont les conditions métaboliques/énergétiques qui ont favorisé l’émergence des
eucaryotes.
üLes symbioses facultatives et les organismes phototrophiques ont été les
mécanismes et ingrédients.
Symbiose facultative
Alphaprotéobactéries
Deltaprotéobactéries
Asgard Archéabactéries
(Archéabactérie)

Coopération métabolique
Échanges redox à 1
- 3,5 Milliards
FLASHBACK : BIOLOGIE DE L’ÉVOLUTION DES EUCARYOTES
ü Symbioses facultatives:
o Organismes phototrophes.
o Organismes chimiotrophes.

Symbiose facultative Stabilisation de la symbiose 1


Alphaprotéobactéries
Deltaprotéobactéries
Asgard Archéabactéries
(Archéabactérie)

Coopération métabolique 1 + Endomembrane (EM): canaux


Échanges redox à 1 Transfert de gènes: stabilisationà 2
- 3,5 Milliards - 3 Milliards
FLASHBACK : BIOLOGIE DE L’ÉVOLUTION DES EUCARYOTES

Symbiose facultative Symbiose secondaire stable


Développement des endomembranes
Alphaprotéobactéries
Deltaprotéobactéries
Asgard Archéabactéries
(Archéabactérie)

Coopération métabolique 1 + Endomembrane (EM): canaux 2 + Extension des EM


Échanges redox à 1 Transfert de gènes: stabilisationà 2 Synthèse organique endogèneà 3

- 3,5 Milliards - 3 Milliards - 1,9 Milliards


FLASHBACK : BIOLOGIE DE L’ÉVOLUTION DES EUCARYOTES
Les étapes suivantes voient un transfert de gène vers « l’archaébactérie Asgard ».
Les noyaux des cellules se sont enrichies de nouveaux gènes :
o Par duplication mutation et sélection des « nouveaux » gènes.
o Transfert horizontal (d’un organisme à l’autre), parfois grâce aux virus.
Symbiose facultative Stabilisation de la symbiose
Spécialisation des compartiments
Alphaprotéobactéries
Deltaprotéobactéries
Asgard Archéabactéries
(Archéabactérie)

Coopération métabolique 3 + Transfert des ribosomes


Échanges redox à 1 Réorganisation génétique Pore nucléaire
- 3,5 Milliards - 1,5 Milliards
FLASHBACK : BIOLOGIE DE L’ÉVOLUTION DES EUCARYOTES
ü Les plantes résultent d’un événement d’endosymbiose supplémentaire à partir des
cyanobactéries.

LUCA

Émergence de la vie
QU’EST-CE QU’UNE CELLULE EUCARYOTE ANIMALE?
Les cellules possèdent, un Noyau ancré dans un système endomembranaire,
un cytosquelette dynamique
et un système de conversion/production d’énergie chimique.
1 Nucléole & 2 Noyau
3 RER & 5 Lumière du RER & 8 REL et vésicule de transition
1 Nucléole & 2 Noyau
3 RER & 5 Lumière du RER & 8 REL et vésicule de transition
4 Vésicules d’endocytose & 12 Vésicule de sécrétion
6 Appareil de
de Golgi
Golgi
14 Membrane cellulaire & 7 Reliefs membranaires
9 Mitochondrie
10 Peroxysome
11 Hyaloplasme
13 Nucléosome : centre de formation du cytosquelette microtubulaire
1 Nucléole & 2 Noyau
3 RER & 5 Lumière du RER & 8 REL et vésicule de transition
4 Vésicules d’endocytose & 12 Vésicule de sécrétion
6 Appareil de Golgi
14 Membrane cellulaire & 7 Reliefs membranaires
9 Mitochondrie
10 Peroxysome
11 Hyaloplasme
13 Nucléosome : centre de formation du cytosquelette microtubulaire
INTERACTIONS CELLULAIRES
INTERACTIONS CELLULAIRES
o Les cellules sont en interaction au sein des organes : liaisons cellules-cellules.

o Les cellules sont en interaction au sein des organismes par des échanges, des
sécrétions : de molécules (hormones: stéroïdes/peptides/protéines, Cytokines…).

o Les cellules sont en interaction au sein des organismes par des réseaux :
• SystèmeS nerveux (Sensitivo-moteur; Autonome [S, pS et entérique])
• Système immunitaire.
• La mobilisation de cellules de soutien: Cellules stromales Mésenchymateuses.

o Il existe une grande diversité de types cellulaires, résultant du développement et


illustrée par la diversité histologique des organismes (p.e.) :
• Cellules différenciées : cellules exerçant des fonctions spécialisées.
• Cellules souches (voir cours).
INTERACTIONS CELLULAIRES

Jonctions cellule - cellule Jonctions cellule - MATRICE


EXTRA CELLULAIRE

Tight junction
Zonula occludens
Lien à l’actine
Zonula adhaerens Contacts focaux
Filaments intermédiaires
Desmosomes Hémi-desmosomes
Gap junction
Jonctions
Filaments intermédiaires communicantes: canaux
Matrice extra-cellulaire ioniques

Lien à l’actine
INTÉGRATION CELLULAIRE DANS LES ORGANISMES : échanges

IN OUT
Endocytose Exocytose
Phagocytose Excrétion :
Macropinocytose Micro-vésicules
Récepteurs Exosomes
membranaires… Protéines
INTÉGRATION CELLULAIRE DANS LES ORGANISMES : pathogènes
Les pathogènes coexistent et co-évoluent avec les organismes :
- Interactions à toutes les étapes de leur cycle.
- Mécanismes de défenses et mutation puis sélection des pathogènes.
Cycle du SARS-Cov2

Entrée virale par : Libération des particules


endocytose par virales:
récepteur Exocytose
(HO-Chloroquine!) ou
ou Voie des Multi-Vesicular
Fusion directe Bodies (MVB)
INTÉGRATION CELLULAIRE DANS LES ORGANISMES : signalisation

IN OUT
Récepteurs MP : Exocytose
Hormones protéiques et/ou
Excrétion :
Récepteurs Nuc: Micro-vésicules
Hormones stéroïdes Exosomes
INTERNE Protéines
Différence de potentiel Flux ioniques: RE et Ca2+
Canaux ioniques Séquestration cytoplasmique
de récepteurs nucléaires
Contacts cellulaires & Si NFkB est lié à IkB
cytosquelette Passage dans le noyau
Si NFkB est libre
LES GRANDS TYPES CELLULAIRES :

Les organismes sont formés de différents types cellulaires:


Epithéliums Tissus conjonctifs T. nerveux T. musculaires « T. sanguin »

Métabolisme Contacts Mobilité Métabolisme (O2) Immunité


transmission ciruclation
Points a retenir pour la séquence

1) La théorie endosymbiotique
2) La cellule comme système autoréplicatif et évolutif
3) La cellule comme une unité fonctionnelle: théorie cellulaire
4) La structure des cellules eucaryotes animales
5) La cellule comme constituant d’un organisme
6) La cellule comme système d’interaction dans un organisme
7) La cellule dans sa diversité métabolique

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