Recherche bibliographique en

médecine d'urgence
 Recherche bibliographique
en médecine d'urgence

• Pourquoi ?
• Avec quoi ?
• Pour quels résultats ?
• Comment ?
 Recherche bibliographique
en médecine d'urgence

• Pourquoi ?
• Avec quoi ?
• Pour quels résultats ?
• Comment ?
 Recherche bibliographique
en médecine d'urgence

A partir d'une situation clinique

Formuler la question
Élaborer la stratégie de recherche
( à partir des mots clés)
 Situations cliniques

• Femme de 62 ans cancer ovaire, avec dyspnée et gène

thoracique : scinti V/Q non contributive : le
« scintigraphiste » vous dit :diagnostic d'EP exclu.
• Homme 69 ans, premier épisode de décompensation de
cardiopathie hypertensive il y a 1 mois : la famille vous
demande votre avis sur l'évolution de sa maladie.
 Formulation de la question

• Définition précise de ce qu’est le problème du

malade et information qu’il est nécessaire
d’acquérir pour résoudre le problème
• Patient (problème)
• Intervention (facteur pronostique...)
• Comparaison
• Outcome (issue, conséquence)
 Formuler la question PICO

• Traduire la situation clinique en une

question bien structurée identifiant
les concepts clés, en étant spécifique

Patient ou Intervention Comparaison Outcome

problème
 Patients ou Problèmes

• Définir la situation, la maladie

• Sévérité, degré d’évolution
• Hôpital, communauté, pré-hospitalier
• Age, sexe
• Pathologie associée
 Intervention

• Trt medical, chirurgical

• Pronostic, facteur de risque, test diagnostique
• Pour qui, comment, quand
• Considérer la complexité de l’intervention
 Comparaison

• Aucune
• Placebo
• Traitement de référence
• Test de référence
• Autre intervention
 Outcome

• Guérison
• Mortalité
• Amélioration
• Effets indésirables
• Décision clinique
• .
• Femme de 62 ans cancer ovaire, avec dyspnée et gène
thoracique : scinti V/Q non contributive : le
« scintigraphiste » vous dit :diagnostic d'EP exclu.
• Homme 69 ans, premier épisode de décompensation de
cardiopathie hypertensive il y a 1 mois : la famille vous
demande votre avis sur l'évolution de sa maladie.
• Chez les patients à haut risque (P), une scinti non
contributive (I), permet-elle d'écarter une EP (O)?
Patient Intervention Comparaison Outcome

Haut risque d'EP Scintigraphie non Exclusion diagnostique

contributive
• Femme de 62 ans cancer ovaire, avec dyspnée et gène
thoracique : scinti V/Q non contributive : le
« scintigraphiste » vous dit :diagnostic d'EP exclu.
• Homme 69 ans, premier épisode de décompensation de
cardiopathie hypertensive il y a 1 mois : la famille vous
demande votre avis sur l'évolution de sa maladie.
• Chez les patients à haut risque(P), une scinti non
contributive (I), permet-elle d'écarter une EP (O) ?
• Quelle la médiane de survie(O) des patients avec
cardiopathie (P), et quels sont les facteurs
pronostiques (I) influençant cette survie?
ACP Journal Club: The well-built clinical question: a key to evidence-based decision
Richardson, W. Scott ; Wilson, Mark C.; Nishikawa, Jim ; Hayward, Robert S. A.
Patient Intervention Comparaison Outcome

Haut risque d'EP Scintigraphie non Exclusion diagnostique

contributive

Cardiopathie Facteurs Médiane de survie

chez l'adulte âgé pronostiques
A vous !
Vous examinez aux urgences un jeune homme
de 19 ans, sans aucun antécédent, qui
présente depuis 3jours des céphalées, une
douleur sus-maxillaire gauche, avec une
rhinorhée purulente, et un fébricule à38,2°C.
Le diagnostic de sinusite maxillaire est posé :
vous discutez avec votre collègue la durée du
traitement antibiotique, et l'intéret d'un
traitement de courte durée par rapport au
traitement standard.
Vous recevez aux urgences un homme de 48 ans,
hypertendu, diabétique (type 1) et tabagique, pour
un premier épisode de douleur thoracique, qui a
duré 45 minutes et qui a cédé spontanement au
repos.L'examen clinique est normal. L'ECG montre
une inversion des ondes T en V4, V5, et V6. La
première troponine est normale. Vous lui
administrez de l'aspirine et le gardez en
observation sous scope.Son medecin traitant, que
vous avez contacté, vous demande si vous lui avez
prescrit un béta-bloquant : il pense que le
pronostic à court terme de son patient en sera
amélioré.
 PubMed mode
d'emploi

Mohamed El Khebir, Albert Trinh-Duc, Aline.Santin, Aurore Armand-Perroux

Dr Mohamed El Khebir SAMU 60- SCREF/SFMU
, Christophe Perrier, Maxime Maignant, Didier Honnard

Sous-commission des référentiels SFMU

Juin 2013
 PubMed mode
d'emploi ou comment
optimiser la
recherche
bibliographique
 PubMed
PubMed (Public Medline) est l’interface
permettant d’interroger gratuitement
Medline, la plus grande base de données
bibliographiques au monde, gérée et
maintenue par la National Library of
Medicine (NLM).
Plus de 4500 revues biomédicales
référencées, en majorité en langue anglaise.
Plus de 21 millions de notices
bibliographiques, en augmentation
constante.
Revues publiées au
cours des 2 dernières
années, concernant
le traitement de
l’asthme par les
bronchodilatateurs.
Surabondance
d’informations
Langage
d’interrogation de
PubMed= langage
d’indexation
Bordereau d’indexation
Bordereau d’indexation
Liste de mots clés
ou descripteurs
attribués au
documents et
organisés
hierarchiquement
 MeSH : Medical Subject
Headings
Le MeSH est le thesaurus du
vocabulaire contrôlé de la National
Library of Medicine
26853 descripteurs
Un descripteur = un seul concept
Hiérarchisés sous forme
d’arborescence, du descripteur le plus
générique au descripteur le plus
spécifique
 MeSH:qualificatifs
(subheadings)
En plus des descripteurs, le thesaurus MeSH
contient des qualificatifs (subheadings)
descripteur/qualificatif = spécificité et
précision
83 qualificatifs
Affinités descripteur/qualificatif :
Chaque catégorie de descripteur a ses propres qualificatifs.
Maladies : diagnostic, traitement, complications, épidémiologie…
Médicaments : effets indésirables, pharmacologie, toxicité…
Investigations diagnostiques : normes, méthodes, statistiques…
 MeSH database
L’accès à l’arborescence et à la liste des
qualificatifs attribuables se fait par la
fonction
Mesh database
On peut y accéder de 2 manières: en
cliquant sur le lien MeSH database ou
sur l’onglet déroulant situé à gauche de la
fenêtre d’interrogation
11 descripteurs sont proposés
avec leurs définitions
On choisit le descripteur le plus
adapté à notre requête
 La liste des qualificatifs (subheadings)
pouvant être associés au descripteur « asthma:
il y en a 46 (sur les 83 possibles)
 MeSH:qualificatifs
(subheadings)

Asthma/Drug therapy recherchera les

articles sur le traitement
médicamenteux de l’asthme
Asthma/Diagnosis: articles sur le
diagnostic de l’asthme
Asthma/Epidemiology: articles sur
l’épidémiologie de l’asthme
 MeSH arborescence
Sur la même page du MeSH database, en
déroulant vers le bas, on trouve les
arborescences du MeSH comprenant le
descripteur asthma.
 MeSH : arborescence
Termes
génériques

Termes
specifiques
 MeSH : arborescence

Explosion
 PubMed: exemple
Nous allons associer le descripteur «
asthma » avec le qualificatif « drug
therapy »:
asthma/drug therapy.
Pour cela, nous pouvons soit entrer la
requête directement dans la fenêtre
d’interrogation de PubMed soit utiliser la
fonction « search builder » du MeSH
database
Requête avec la fonction « PubMed
search builder » de la page MeSH
database:
 2-On clique le bouton
Add to search buider

1-On coche la case

« drug therapy »
 la requête apparait dans
la boite »PubMed search builder

On lance la recherche
par le bouton
search PubMed
Restreint la recherche aux seules
notices
dont le sujet majeur est l’asthme

On peut empêcher l’explosion

en cochant cette case
En cliquant sur ces 2 boutons,

on obtient la requête suivante

 On obtient 19554 références
on a gagné en spécificité avec les champs majr et
noexp
 MeSH : champs (fields)
 indiquent la nature ou la localisation des
descripteurs
sont indiqués par leur abréviation mise entre
crochets
Lorsqu’ils ne sont pas précisés, PubMed
recherche de manière automatique dans les
champs principaux: c’est le mapping automatique

Les principaux champs

précisant la nature du mot clé
• Descripteur  [mh]
• Descripteur majeur [majr]
• Auteur  [au] Les champs de localisation
• Langue  [la] • Mot du titre [ti]
• Titre de périodique [ta] • Mot du titre ou du résumé [tiab]
• Type de publication [pt] • Mot du bordereau d’indexation [tw]
• Date de publication [dp]
MeSH : champs
(fields)
(les champs les plus utiles sont entourés)
 MeSH : champs (fields)
french [au] Le mot « french peut renvoyer a un nom
french[la] d’auteur ou permet
à la langue de l’article: le champs
de le préciser

Asthma [mh] Le mot asthma peut être désigné comme

descripteur: mh
Asthma [majr] desripteur majeur:majr
Asthma [majr:noexp] descripteur majeur et non explosé: majr:noexp
mot du titre ou de l’abstract [tiab]
Asthma [tiab]
Review [pt] Lelechamps publication type [pt] permet de préciser
type d’article: ici, une revue de la littérature
Le champs date of publication [dp] permet de
2011:2013 [dp] sélectionner une date de publication: ici, entre 2011 et 2013
Opérateurs booléens
Trois opérateurs booléens
- AND, OR, NOT
AND : croise
- saisis en lettres capitales
Une règle :
Les mots clés encadrant OR
OR : unit sont mis entre parenthèses
AND: augmente la spécificité
(donc moins de références)
NOT : OR : augmente la sensibilité
exclut (donc plus de références)
 Notre exemple
Nous cherchons les plus récentes
publications, sous forme de revue publiées
au cours des 2 dernières années,
concernant le traitement de l’asthme par
les bronchodilatateurs.
Nous allons chercher le descripteur MeSH
correspondant à bronchodilatateur grâce
au Portail électronique de terminologie du
Cismef
On choisit le 1er résultat
qui nous est proposé
 2-On clique sur Add to
search builder

L’opérateur booléen AND

est présent par défaut
dans ce menu déroulant
1-On choisit le qualificatif
le mieux adapté
à notre recherche
 On cherche « review »
dans la fenêtre d’interrogation
On sélectionne là encore le 1er résultat proposé
Aucun qualificatif n’est
associé à ce descripteur
 Voici notre requête
("Asthma/drug therapy"[Majr:noexp] AND
"Bronchodilator Agents/therapeutic
use"[Mesh]) AND "Review"[Publication
Type]
Les champs sont automatiquements
intégrés, la syntaxe est correcte.
Nous avons 718 références (le30/05/13).
Nous n’avons pas introduit la recherche des
articles sur la période qui nous intéresse (de
2011 à 2013).
Nous allons utiliser une fonctionnalité de la
page Pubmed :   »Choose additional filters »
Cette fonctionnalité peut être utilisée pour
choisir le type de revue « reviews » à la
place de sa recherche dans le MesH comme
N’oubliez pas de désactiver le(s) filtre(s) pour ne
pas perturber une autre recherche: »clear all »!
 L'équation de recherche

Descripteur/qualificatif
[champs] AND
descripteur/qualificatif
[champs] AND (desc./qua.
[chps] OR desc./qua. [chps])
 L'équation de
recherche
Avec de l’entraînement, on peut
écrire directement cette
équation dans la fenêtre de
recherche de PubMed, en se
passant de la fonction de
recherche de MeSH database:
Asthma/dt [majr:noexp] AND
bronchodilator agents/tu [mh]
AND review [pt] AND 2010 :
MERCI et bonnes recherches !
 L'équation de
recherche
Si vous souhaitez suivre cette
thématique, vous pouvez
sauvegarder l’équation
MyNCBI :
Session personnalisable et
accessible sur tout ordinateur
Sauvegarde d’équation de
recherche ou de bibliographie
Un fois votre compte créé, cliquez sur
ce bouton pour y accéder
 Ce tutoriel en ligne vous
donnera la marche à suivre
pour créer et gérer
votre compte (gratuit!) MyNCBI
L’objectif est de pouvoir construire, a
partir d’une situation ou d’une question,
une requête spécifique apportant un
nombre de références utilisables et
répondant à la question posée.
La méthode que nous vous avons montré
ici doit vous permettre d’atteindre cet
objectif.
A condition de bien comprendre les
notions de langage « MeSH »…
Bonnes recherches bibliographique.
Pour toute question ayant trait à ce diaporama: m.elkhebir@ch-beauvais.fr