EDUCATION-SANTE-AGRICULTURE-INFORMATIQUE

MICROBIOLOGIE
Hôpital de Goundi - TCHAD -1996-2000

DOCUMENTS PEDAGOGIQUES LIBRES

Licence pour Documents Libres, Version 1.1
Copyright (©) 2000 Guilde des Doctorants. Paris
 MICROBIOLOGIE

Un organisme vivant est constitué de cellules.

Le nombre de cellules peut varier de :

• 1 cellule → organismes unicellulaires

Exemples : microbes, protozoaires, parasites

• à des milliards → organismes pluricellulaires

Exemples : animaux, végétaux

La cellule est l’unité élémentaire des organes.

Dans le règne animal, comme dans le règne végétal, les cellules peuvent être différentes
comme structure et comme fonction suivant l’organe qu’elles constituent :

Les cellules épithéliales sont différentes des cellules sanguines.

Les cellules osseuses sont différentes des cellules nerveuses, etc.

La comparaison est facile à mettre en évidence quand on étudie un sédiment urinaire

dans lequel on trouve, différentes par la forme et par la taille :

• des cellules vésicales

• des cellules rénales
• des leucocytes
• des hématies

L’organisme unicellulaire n’est visible qu’au microscope ; on l’appelle micro-organisme.

Il fait l’objet de la microbiologie.

1
 Constitution de la cellule

Toute cellule est constituée de 3 parties essentielles

• la membrane
• le cytoplasme
• le noyau

C’est la constitution de noyau qui permet de diviser les cellules en 2 catégories :

• les cellules eucaryotes ( caryos = noyau ; eu = normal )

• les cellules procaryotes ( caryos = noyau ; pro = substitut de noyau vrai

Cellule eucaryote

Caractéristique du règne animal et végétal, elle est constituée :

a) d’une membrane cytoplasmique avec une paroi pour les cellules végétales mais pas
de paroi pour les cellules animales ;

b) d’un cytoplasme qui contient :

• des ribosomes
• des réticulum
• des vacuoles
• divers organismes : mitochondries, corps de Golgi

c) d’un noyau formé :

• d’une membrane nucléaire

• d’une nucléole
• d’un amas de chromatine

Cellule procaryote

Caractéristique du règne bactérien, elle est constituée :

a) d’une membrane cytoplasmique avec une paroi de composition différente de celle

du règne animal ;

b) d’un cytoplasme qui contient :

• des ribosomes
• des vacuoles

c) d’un noyau rudimentaire : pas de noyau vrai et avec un seul chromosome.

Ces deux types de cellules déterminent la classification des êtres vivants.

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 Principaux Bactéries Algues Levures
Groupes protozoaires Moisissures Animaux Végétaux
Champignons

Type Procaryotes Eucaryotes Eucaryotes Eucaryotes Eucaryotes

Cellulaire

Unicellulaires Unicellulaires
Organisation Unicellulaires ou ou Pluricellulaires
Biologique Pluricellulaires Pluricellulaires
(algues)

Taille Microscopique Microscopique Microscopique Macroscopique Macroscopique

ou ou
Macroscopique Macroscopique

LES BACTERIES
═══════

I - FORMES et GROUPEMENTS

Elles peuvent être observées :

soit à l’état frais, entre lame et lamelle, à partir d’un étalement de liquide biologique
(pus, crachats,…) ou d’une culture en milieu liquide.
soit, après coloration, à partir d’un étalement sur une lame, séché et fixé.

La forme des bactéries permet de les classer en :

cocci ( formes rondes )

bacilles ( formes longues )

1 ) Bactéries sphériques : Cocci

a ) Les cocci peuvent se grouper dans le même plan :

par deux :

pneumocoques : diplocoques

- encapsulés
- en flammes de bougie groupés par l’extrémité de la flamme
- en forme de 8

3
 neisseiria : gonocoques, méningocoques

- non capsulés
- aplatis à un pôle accolés par la partie plate

Méningocoques et gonocoques ont des morphologies très voisines ; le diagnostic, sur un

examen direct, exige qu’on connaisse l’origine du prélèvement :

-LCR }
- frottis de gorge } ——→ méningocoques
- crachats }

- prélèvement urétral }
- prélèvement vaginal } ——→ gonocoques
- liquide de ponction articulaire (très rare) }

Les cocci peuvent se grouper en chaînettes

Streptocoques

- pyogènes
- hémolytiques
- enterocoques ( groupe D) allongés en forme de ballon de rugby

Leuconostoc

b ) Les cocci peuvent se grouper sur des plans différents :

2 plans perpendiculaires → tétrades

3 plans perpendiculaires → sarcines

plusieurs plans en amas irréguliers → par exemple : en forme de

grappes → staphylocoques

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2 ) Bactéries cylindriques : bacilles

3 ) Bactéries de formes variées :

a) hélicoïdales : Spirochétacés : Tréponèmes ( Syphilis) ; Spirochètes (Ictéro –

hémorragiques)
b) filamenteuses : Sphaerotines
c) ramifiées : Actinomycètes

II - STRUCTURE

La structure des bactéries est plus rudimentaire que celle des cellules animales ou
végétales. Elle peut être plus ou moins riche en organismes divers.

Eléments toujours présents

• la paroi : enveloppe rigide entourant le cytoplasme mais indépendant

de celui-ci ;

• la membrane cytoplasmique : plus mince que la paroi ;

• le cytoplasme qui contient :

- les ribosomes
- les granulations de réserve
- les vacuoles

• l’appareil nucléaire : ce n’est pas un noyau vrai.

Il est constitué d’un filament d’ADN 1000 fois plus long que la bactérie.

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Eléments facultatifs

• la capsule : couche visqueuse entourant la bactérie ;

Exemple : pneumocoques ;

• les flagelles qui donnent la mobilité à la bactérie ;

• les pilis :
- filaments qui favorisent l’adhésion des bactéries entre elles : pilis
communs
- d’autres pilis portent les caractères génétiques : pilis sexuels ;

• les spores : forme de résistance de certaines bactéries qui leur permet

de survivre dans des conditions défavorables.

1 ) la paroi

En désintégrant des bactéries par les ultra-sons, on a pu faire l’analyse de la structure et

de la composition chimique de la paroi.

Les différences constatées ont permis d’expliquer la réaction des bactéries vis-à-vis des
colorants.

On a exploité ces différences pour faciliter une première identification des germes par les
colorations : Gram, Ziehl…

a) Constitution

Toutes les parois des bactéries ont un constituant commun : le peptidoglycane : c’est un
molécule constituée de :
Polyoside ( dérivé du sucre )
Polypeptides ( substances protidiques )

Bactéries GRAM +

- La paroi, assez épaisse, est essentiellement constituée de peptidoglycane

- Elle a aussi une couche d’autres polyosides (composés dérivés du sucre) chez les
staphylocoques et les streptocoques.
- Des protéines de surface jouent un rôle important dans le pouvoir pathogène de
certains germes.
Les protéines fixant certains antibiotiques sont fixées à la surface de la membrane
cytoplasmique ; exemple : elles fixent les pénicillines, les céphalosporines, ce qui
entraîne :

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 Une application pratique au labo

Si on veut faire pousser des streptocoques ou autres germes à partir du prélèvement d’un
malade qui a déjà eu un traitement d’antibiotiques, il faut ajouter au milieu de culture une
enzyme : la pénicillinase qui va détruire les molécules d’antibiotiques fixées sur la protéine
de la bactérie ; sinon l’antibiotique empêche le germe de se reproduire et la culture restera
stérile.
D’ou une erreur de diagnostic pour le laboratoire qui ne pourra isoler le germe.

Bactéries GRAM -

Chez ces bactéries, la couche de peptidoglycane, plus mince, est recouverte d’une
membrane externe constituée de :

- phospholipides ( graisses phosphorées )

- protéïnes
- lipopolysacchrides ( lipides + sucres )

Cette différence de constitution explique les résultats obtenus au cours de la coloration de

GRAM+ qui s’effectue, selon le schéma suivant, après avoir fait les étalements, les avoir
fixés et séchés :
Coloration de GRAM

1er
temps L’étalement est recouvert de violet de gentiane :
tous les éléments sont colorés en violet, en profondeur.

2ème
temps L’étalement est recouvert de Lugol qui favorise la fixation du colorant.

3ème
temps L’étalement est recouvert d’éthanol ou d’un mélange d’éthanol-acétone.
Deux résultats différents :

1 2
L’alcool ne pénètre pas la couche de L’alcool pénètre la couche lipidique et la
peptidoglycane qui est épaisse. couche, plus mince de peptidoglycane.
Le violet de gentiane fixé ne sera pas Le violet de gentiane est dissous
dissous
4ème
temps Lavage à l’eau

Les germes restent colorés. Le colorant est évacué, les germes sont
décolorés.

5ème
temps L’étalement est recouvert d’une solution diluée de fuschine de Ziehl ou de safranine.

Les germes restent colorés en violet sur Les germes sont colorés en rose sur fond rose
fond rose. plus pâle.
↓ ↓
Ces germes sont dits : Ces germes sont dits :
GRAM + GRAM –

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Bactéries non colorables par le GRAM

Certaines bactéries ont une paroi riche en lipides, en acides gras à longue chaîne et en
substances cireuses difficiles à pénétrer.

Ce sont des mycobactéries, en particulier, le bacille de Koch (tuberculose) et le bacille de

Hansen (lèpre).

On doit leur appliquer une coloration spéciale : la coloration de Ziehl.

Sur la lame d’étalement séchée et fixée :

1er On recouvre l’étalement de fuschine de Ziehl concentrée et on chauffe jusqu’à

temps émission de vapeur.
Tous les éléments sont colorés en rouge.
Laver à l’eau pour éliminer l’excédent de fuschine

2ème Décoloration par un acide fort dilué (sulfurique ou d’acide nitrique)

temps Lavage à l’eau pour éliminer l’acide et le colorant
La décoloration des cellules est partiellement entamée à l’exception des BK

3ème Décoloration par l’alcool

temps Lavage à l’eau
Tous les éléments cellulaires et germes colorables au GRAM sont décolorés
Les bacilles de Koch ou Hansen restent colorés en rose

4ème Pour faciliter la lecture au microscope, on recouvre l’étalement de bleu de

temps méthylène, les bacilles roses se détachant sur fond bleu.

Ces bacilles sont appelés :

Bacilles acido-alcoolo résistants ( BAAR)

NB : A signaler que la couche de cire du B. de la lèpre est plus mince que celle du B. de la
tuberculose.
Il faut donc utiliser un acide à une concentration inférieure sous peine de les décolorer
complètement.

b ) Fonction de la paroi

Elle confère à la bactérie sa forme et sa résistance dans les milieux

extérieurs hyper. ou hypotoniques.

Elle est le support des antigènes.

Elle contient les sites de fixation des virus sur les bactéries.

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2 ) La membrane cytoplasmique

a) Constitution

Elle est constituée du poids de la matière sèche :

Glucides : 10% environ, associés aux protides et aux phospholipides
Protides : 70%
Lipides : 20% sous forme de phospholipides
La membrane cytoplasmique est le réservoir d’énergie de la bactérie.

b ) Rôle

Elle empêche que sortent du cytoplasme les éléments nutritifs qui y sont concentrés :

Acides aminés
Sucre
Sels minéraux
Elle assure la pénétration de ces mêmes éléments :

Les petites molécules pénètrent par diffusion si la concentration du

milieu extérieur est supérieure à celle du cytoplasme.
Dans le cas contraire ; la pénétration se fait grâce à une liaison de ces
molécules avec une protéine ou grâce à une enzyme ( perméase ) qui
favorise le passage à travers la membrane.

C’est au niveau de la membrane que les substances sont oxydées avec production d’ATP
(adénoside tri-phosphate).

3 - Le Cytoplasme

Il est physiquement intermédiaire entre l’état solide et l’état liquide.

Il possède une certaine résistance et de l’élasticité.
Il est fluide et visqueux ; ce qui permet les échanges nécessaires à son existence.
Il est constitué de longues chaînes protéiques qui enserrent glucides et lipides ; le
tout dans un milieu aqueux.

Le constituant principal est l’ARN ( acide ribo-nucléique ). C’est lui qui constitue les
ribosomes. Plus une bactérie contient de ribosomes, plus elle est active.

Le cytoplasme contient d’autres inclusions :

dans les vacuoles : glycogène et lipides

des granulations métachromatiques
des sels minéraux : fer et soufre
des pigments

4 - Le Noyau

Le noyau est constitué d’un filament d’ADN très long ( parfois 1mm ) pelotonné sur lui-
même. Il porte tous les gènes de la bactérie. L’ADN conditionne tous les caractères de la
bactérie :
métabolisme
reproduction
activité enzymatique
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On peut résumer en disant que :

la membrane cytoplasmique fabrique l’énergie ;

les ribosomes sont les centres de production ;
les vacuoles sont les centres de stockage ;
le noyau conditionne la reproduction.

5 - Eléments inconstants des bactéries

a ) La capsule

Elle est constituée de substances visqueuses accumulées sur la paroi des bactéries.
Ces substances sont composées de polyosides (dérivés des sucres à + ou – longues
chaînes).

Les capsules sont visibles après coloration :

De GRAM : la bactérie est entourée d’une zone plus réfringente, pas

toujours facile à distinguer.
A l’encre de Chine : la bactérie est colorée en noir et entourée d’une
zone transparente.

Quelques exemples de germes capsulés :

Gram +
Pneumocoques
Bacillus subtilis
Clostridium perfringens
Gram –
Klebsiella
Acinetobacter
Quelques E. coli

Rôle de la capsule :

Elle joue le rôle d’antigène

Elle contribue au pouvoir pathogène du germe en empêchant le germe
d’être phagocyté ; donc l’invasion de l’organisme en est favorisé.
Dans les milieux de culture, la capsule donne un aspect différent aux
colonies : elle facilite donc l’orientation du diagnostic.

b ) les flagelles

Filaments longs de 10 à 20 µ, flexibles et sinueux. Ils s’insèrent dans la

bactérie sous la membrane grâce à un corpuscule basal.
Ils sont difficilement colorables.
Leur situation sur la bactérie peut être :

- sur les extrémités : ciliature polaire :

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 - près des extrémités : ciliature para-polaire :

- répartis sur tout le corps bactérien : ciliature péritriche :

Rôle des flagelles

• Mobilité :

- si les flagelles sont aux extrémités, le germe se déplace en ligne droite ;

- si la bactérie est péritriche, elle se déplace dans tous les sens.

• Support des antigènes H des bacilles Gram –

Exemples :

- Dans le sérodiagnostic des salmonelles des typhoïdes T et paratyphoïdes A

et B, on met en contact le sérum du malade avec des suspensions
d’antigènes O somatiques et d’antigène H flagellaires.
- La présence de ces antigènes se manifeste par une agglutination.
- Les Klebsiella donnent des colonies grasses envahissant les boîtes de Pétri

c ) les pili

Ce sont des éléments filamenteux différents des flagelles.

Ils sont présents sur des bacilles GRAM – .
Plus courts que les flagelles : 1 µ pour les pili communs ; 100 à 200
par bactérie
Longs de 20 µ environ pour les pili sexuels.

Rôle des pili :

Ils ont un rôle antigénique.
Ils favorisent l’adhérence du germe sur différentes surfaces.
Les pilis sexuels jouent un rôle dans la reproduction.

d ) les spores

On les trouve surtout sur les Bacilles GRAM +.

La spore peut se localiser différemment dans le germe :

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Rôle des spores :

La spore est une forme de résistance de la bactérie.

Lorsque les conditions de vie de la bactérie deviennent défavorables (vieillissement,
diminutions des éléments nutritifs), la sporulation commence.
La spore assure la survie de la bactérie en milieu hostile.
Elle résiste à la chaleur.

Exemple : Clostridium tetani n’est détruite qu’après :

10 min. à 120° en chaleur sèche ;

30 min. à 120 ° en chaleur humide ;
1 min. à 180 ° en chaleur humide .

Les spores gardent très longtemps leur capacité de germination ( plusieurs années ).
Les spores sont visibles à l’état frais, pour un œil exercé : elles apparaissent claires,
brillantes, réfringentes.
Elles peuvent être colorées :

au Gram : incolores ou généralement roses dans un bacille

généralement violet ;
au vert malachite + fuschine : vertes sur fond rose ;
à la fuschine, à chaud+ bleu de méthylène : roses sur fond bleu.

III - REPRODUCTION des BACTERIES

Les bactéries se reproduisent par divisions cellulaires.

Une bactérie – mère donne 2 bactéries – filles suivant le mécanisme suivant :

Pendant la division cellulaire, le chromosome est exactement répliqué : le chromosome de

la cellule – fille est le même que celui de la cellule – mère.

IV – CROISSANCE des BACTERIES

Pour grandir et se reproduire, les bactéries ont besoin :

• de matières premières
• de l’énergie nécessaire à l’édification des différents éléments de la cellule.

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1 ) les matières premières

Ce sont les mêmes que pour les cellules du règne animal ou végétal, c’est-à-dire :

des macro-éléments ( éléments existants en quantité notable) :

Carbone ( C ) ; Hydrogène ( H ) ; Oxygène ( O ) ; Azote ( N ) ;
Phosphore ( P ) ; Soufre ( S ) ;
des micro-éléments ( en quantité plus faible ) :
Potassium ( K ) ; Sodium ( Na ) ; Calcium ( Ca ) ; Magnésium ( Mg ) ; Fer ( Fe ) ;
Manganèse ( Mn ) Chlore ( Cl ) ;
des oligo-éléments (existant à l’état de traces ) :
Selenium (Se) ; Cuivre (Cu) ; Cobalt (Co) ; Zinc (Zn) Aluminium (Al) ;
Iode (I) ; Fluor (F).

2 ) l’énergie

L’énergie nécessaire à la synthèse des éléments est fournie :

par la lumière, dans le cas des bactéries dites phototrophes

par l’oxydation : l’oxydation peut se faire à partir de substances extérieures à
la bactérie ou présentes dans cette bactérie.

Oxydation de substances extérieures :

Par exemple :
Certaines bactéries oxydent l ‘hydrogène sulfureux contenu dans certains
sols ou certaines eaux pour donner de l’acide sulfurique et de l’énergie :

H2 S → H2 S O44 + énergie

De même l’ammoniaque est transformée en nitrites puis en nitrates :

N H4 + → N O2 - ( nitrites) + énergie

N O2 - → N O3 - (nitrates) + énergie

Oxydation des substances présentes dans la bactérie :

Exemple : le glucose C6 H12 O6

L’oxydation peut être complète :
Le glucose est transformé en gaz carbonique, eau et énergie

C6 H12 O6 → 6O2 + 6H2 O + énergie

C’est le cas de la respiration . La présence d’oxygène est obligatoire.

Elle conditionne la vie des bactéries aérobies.

L’oxydation peut être incomplète :

La présence d’oxygène n’est pas obligatoire ; mais la quantité d’énergie
est plus faible. La réaction est une fermentation. Exemple :

C6 H12 O6 → 2CH3 CH2 OH (éthanol) + 2CO2 + énergie

C’est la fermentation alcoolique, base de la fabrication des boissons
alcoolisées
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 Ou bien :
C6 H12 O6 → 2CH3 - CHOH – CH2 OH (acide lactique) + énergie

C’est la fermentation lactique qui est à la base de la fabrication des

fromages : l’acide lactique coagule la caséine du lait.

3 ) Facteur influençant la croissance microbienne

Température

Pour le plus grand nombre de bactéries, la température de croissance optimale se situe

entre 20°C et 37° C, température du corps humain.
En milieu de culture, ces températures peuvent être étendues à une échelle plus large qui
permet de partager les germes suivant leur tolérance à la température :

- Thermophiles : entre 40°C et 60°C ; exemple : thermophilum

- Mésophiles : entre 20°C et 40°C ; exemple : toutes les bactéries pathogènes
- Psychrotrophes : entre 0°C et 20°C ; exemple : listeria yersinia
- Psychrophyles : à 0° ; rares .

Pression osmotique

C’est la force qui s’exerce sur la paroi des cellules, jouant le rôle de membrane entre
l’intérieur de la cellule et le milieu ambiant.
Une pression osmotique élevée dans le milieu ambiant aspire l’eau contenue dans la
cellule bactérienne et l’empêche de se reproduire : les bactéries ont besoin d’eau pour se
multiplier.
Inversement, si la pression osmotique est plus élevée dans la cellule, elle aspire l’eau du
milieu ambiant et la cellule va éclater.

PH

Le pH le plus favorable se situe aux alentours de 7 ; ce qui est le pH de l’organisme.

Au laboratoire, le pH des milieux de culture doit s’adapter aux germes que l’on veut
identifier :
- Salmonelles : 6,5 à 7,2
- Staphylocoques : 6,8 à 7,5
- Bactéries lactiques : 5,5 à 6,5
Abaisser le pH amène à empêcher le développement des bactéries.

4 ) Forme de conservation des bactéries : les spores

Lorsque le milieu où évolue la bactérie s’appauvrit en éléments nutritifs ou s’enrichit en

substances toxiques, perd de l’eau ou atteint une température défavorable, la bactérie
réagit en produisant des spores.
Toutes les bactéries ne sont pas capables de sporuler.

a ) Formation de la spore :

Le chromosome migre à une extrémité de la bactérie ainsi que le cytoplasme. Plusieurs

membranes se forment et les entourent pour protéger la matière vivante.
La spore formée peut :
rester à l’intérieur de la bactérie ; c’est une endospore
être libérée à l’extérieur : la bactérie disparaît.
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 b ) Propriétés :

Lorsque les conditions de vie redeviennent favorables, la spore redonne naissance à

une bactérie.

Les spores sont plus résistantes que les bactéries :

à la chaleur
aux antiseptiques et désinfectants
aux antibiotiques

D’où l’importance de la bonne exécution et du contrôle des différentes opérations de

stérilisation ou de nettoyage comme ; par exemple : respecter les temps et les
températures de stérilisation à l’autoclave ou au Poupinel.

IV – ACTION des BACTERIES

Deux cas peuvent se présenter :

• Les bactéries n’exercent aucune action sur l’organisme qui les héberge :
la bactérie est commensale.

• Les bactéries déclenchent une infection :

la bactérie est pathogène.

Ces deux qualités ne sont pas immuables : un commensale peut devenir pathogène si les
conditions de défense de l’organisme changent.

1 - Flore commensale

La peau et les muqueuses présentent de nombreuses espèces microbiennes :

flore permanente qui se rétablit d’elle-même chaque fois qu’elle est perturbée ;

flore transitoire, peu abondante, qui peut devenir abondante si la flore permanente est
perturbée.

a) flore de la peau : presque uniquement des germes Gram +

Microcoques, Staphylocoques, Corynebactéries, Bacillus se

développent grâce aux graisses de la sueur

b) flore du vagin : lactobacillus

Ils se développent grâce à un pH acide des sécrétions vaginales.

Si celui-ci se modifie, les autres germes se développent d’autant plus
facilement que le pH se rapproche de 7.

c) flore de la bouche et du pharynx : Très abondante et très variée.

Bouche : Streptocoques ( salivarius, mitis, sanguis ???)

Pharynx : Neisseriae
Tartre : Anaérobies, Hémophilus, Strepto, lactobacillus
Fosses nasales : Microcoques, Staphylo.

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 d) flore de l’appareil digestif :

Très abondante : 1014 germes /g de selles

Les bactéries sont localisées dans la lumière du tube digestif, dans le mucus qui
tapisse les muqueuses. Très peu sont attachés à la muqueuse.

Les bactéries anaérobies sont prédominantes.

Parmi les aérobies, les principales sont les Entérobactéries (Coli, Serratia, Klebsiella,
Proteus).

Les bactéries intestinales jouent un rôle important dans :

la dégradation de produits de l’alimentation :

- Cellulose
- Acides gras
- Acides aminés

la dégradation des produits de l’activité de l’organisme :

- Urée
- Bilirubine
- Acides biliaires

La limitation de l’invasion de l’organisme par des bactéries d’origine

extérieure en les cantonnant au rôle de bactéries non dominantes.

2 - Flore pathogène

Le pouvoir pathogène des bactéries est conditionné par trois facteurs. Deux facteurs
dépendent de la bactérie :

a) pouvoir invasif ou pouvoir de multiplication ; c’est leur capacité à se multiplier dans

l’organisme ;
b) pouvoir toxique ; c’est leur capacité à sécréter des toxines.

Le troisième facteur dépend de l’organisme contaminé. C’est sa capacité de résistance à

la bactérie ; on dit couramment que la bactérie se développe en fonction du terrain de
l’organisme.

Exemples :

1 - Bactéries ayant un pouvoir invasif important et un pouvoir toxique faible :

Bacille tuberculeux
Brucelle
Staphylo aureus ( Staphylocoque doré)

2 - Bactéries ayant un pouvoir invasif faible et un pouvoir toxique élevé :

Diphtérie (corynebacterium diphteriae)
Tétanos (clostridium tetani)
Botulisme (clostridium botulinum)

3 - Bactéries ayant un pouvoir invasif fort et un pouvoir toxique élevé

Gangrène (clostridium perfringens)
Typhoïde et paratyphoïde (salmonelle typhi et para t.)
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4 - Bactéries ayant un pouvoir invasif faible et un pouvoir toxique faible :

Normalement non pathogènes, elles ne se développent que dans les organismes affaiblis.
Elles déclenchent des maladies dites « opportunistes », en particulier chez les immuno-
déprimés : cancer, sida…
Pseudomonas (B. pyocyanique)
Staphylo blanc
Certaines entérobactéries
Acinetobacter.

Elles sont souvent responsables des infections nosocomiales (contractées dans les
hôpitaux ou centres de soins).

3 - Toxines

a ) Définition

Substance toxique et antigénique élaborée par une bactérie. Les deux actions, toxique et
antigénique, sont nécessaires pour appeler une substance « Toxine ».

Ne sont pas toxines, les substances provoquant des allergies, non toxiques pour
quelqu’un qui n’y est pas sensibilisé, ni certaines substances toxiques provenant du
métabolisme (ex. : l’urée) qui ne provoquent pas d’anticorps.

Certaines enzymes qui entraînent des lésions des tissus sont considérées comme
toxines :
Exemple : streptolysines, collagenases, etc…

b ) Propriétés des toxines

Toxines protéiques :

Elles ont un pouvoir toxique très élevé. Elles sont libérées pendant la croissance :
exotoxines.

Les toxines botuliques et tétaniques sont les poisons les plus actifs connus :

- 1 mg de toxine tue 1000 tonnes de matières vivantes

Chaque toxine a son site d’action privilégié.

- Les toxines neurotropes se fixent sur les récepteurs du système
nerveux.
- La toxine botulique se fixe sur la plaque motrice.
- La toxine cholérique se fixe sur les cellules de la paroi intestinale.
- La streptolysine se fixe sur les membranes cellulaires et lyse (c’est-à-
dire :dissout) les cellules ; etc.
Elles ont un pouvoir antigénique très fort : l’organisme réagit en provoquant
la production d’antigènes : les antitoxines.

C’est le principe de la fabrication des sérums.

L’injection du sérum permet d’apporter directement à l’organisme malade des antitoxines
qu’il n’a pas encore eu le temps de fabriquer.

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Par traitement par la chaleur, le formol, etc., la toxine est atténuée, c’est-à-dire qu’elle
perd son pouvoir toxique tout en gardant son pouvoir antigénique.
Certains vaccins sont préparés à partir de ce procédé.

Toxines glucido lipido protidiques

Ce sont des constituants de la cellule bactérienne. Elles ne sont libérées qu’à la lyse de la
bactérie ; ce sont les endotoxines.

Le pouvoir antigénique des endotoxines est faible. On ne peut pas fabriquer de sérums à
partir de ces toxines.

VI - MECANISME DE DEFENSE DE L’ORGANISME

Pour faire face aux infections microbiennes, l’organisme a des moyens de défense.
Certains existent avant toute infection microbienne : ce sont les défenses non-spécifiques.
D’autres se mettent en place au contact du microbe : ce sont les défenses spécifiques.

1 - Défenses non-spécifiques :

a ) la peau : 2 moyens de défense

La couche de kératine qui gène la pénétration du germe ;

La sueur, sécrétée par les glandes sudoripares, qui possède un pouvoir
bactéricides.
Ceci explique les précautions rigoureuses d’asepsie à respecter dans les soins
aux brûlés dont la couche superficielle de peau est détruite sur une étendue
plus ou moins grande.

b ) le tissu conjonctif situé sous la couche externe de la peau et des

muqueuses.

Sa consistance est celle d’un gel qui retarde la progression des bactéries.
D’autre part, il est très vascularisé ; ce qui facilite l’arrivée des cellules
phagocytaires en cas d’infection.

c ) les muqueuses

muqueuses respiratoires :

Elles contiennent deux types de cellules importants :

- Les cellules ciliées
- Les cellules à mucus

Le battement des cils étalent le mucus à la surface des cellules. Le mucus fixe les
poussières qui sont chargées de bactéries. Les battements des cils repoussent le mélange
poussières+mucus vers les voies respiratoires supérieures : bronches, trachée, etc…

Arrivées dans la bouche, les poussières sont dégluties dans l’œsophage et l’estomac où
les bactéries seront neutralisées par le suc gastrique dont l’acidité très forte s’oppose à
toute prolifération.

N.B. : à noter que les fumées, qu’elles aient pour origine la pollution ou le tabac, diminuent
l’activité des cellules ciliées et donc aussi la résistance aux infections..
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 muqueuse vaginale :

Le pH du vagin est acide ; ce qui permet seulement la vie du Lactobacillus acidophilus

(gros bacille GRAM+, hôte normal d’un vagin sain, même s’il est en très grande quantité).
Il produit l’acide lactique responsable du pH.

Si le pH s’élève aux environs de 7, les germes pathogènes peuvent y proliférer et

déclencher des infections qui se traduisent par des pertes abondantes et purulentes.
Ce phénomène peut être produit sous l’influence de modifications hormonales.

d ) la flore commensale

La flore commensale empêche la prolifération des germes pathogènes de 2 façons :

elle utilise les éléments nutritifs qui seront donc en moindre quantité pour les
germes pathogènes ;
elle produit des substances inhibitrices

Deux exemples :

Le tube digestif (intestin grêle et colon) contient environ 140 espèces de

germes commensaux : la concurrence est en leur faveur par rapport aux
germes pathogènes.
Les bacilles lactiques produisent l’acide lactique → abaissement du pH.

e ) les sécrétions

Celles qui recouvrent les muqueuses servent de pièges pour les bactéries.
Les autres sécrétions peuvent contenir des enzymes :
salive, lait, larmes contiennent un lysozyme aux propriétés bactéricides.

Le lysozyme est particulièrement actif sur la couche externe de la paroi

des germes Gram+.

Le lait contient aussi une peroxydase qui libère de l’oxygène jouant un rôle
antiseptique.

Le sperme contient une spermine et du zinc jouant un rôle bactéricide.

f ) la phagocytose

Lorsque les germes pénètrent par un point de la peau, on voit apparaître une réaction
inflammatoire au niveau du point de pénétration. Elle se traduit par :

Rougeur
Chaleur
Douleur
Œdème

Ces manifestations se produisent grâce à l’afflux des cellules phagocytaires qui

combattent l’infection.

Les cellules sanguines sont de deux types :

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 Polynucléaires :
- mobiles
- peu résistants : courte durée de vie
- actifs surtout sur staphylo, stepto, pneumo, neisseria ???

Monocytes : ils se transforment en macrophages

- peu mobiles
- très résistants : durée de vie plus longue
- actifs sur presque tous les germes infectieux.

Les phagocytes remplissent leurs fonctions grâce aux propriétés suivantes :

1) émissions de pseudopodes par déformation du cytoplasme ;

2) sensibilité au chimiotactisme :
- positif, s’ils sont attirés par certaines substances
- négatifs s’ils sont repoussés ;
3) possibilité d’adhésion aux particules étrangères
4) possibilité de les englober

PEAU

SANG

La phagocytose se fait en 4 temps :

1. adhésion des bactéries à la surface des pseudopodes facilitée par

certaines substances : anticorps, compléments, Ca++ ;

2. englobement : les pseudopodes forment une vacuole où sont enfermés

les germes ;

3. digestion des germes par les enzymes.

Les germes intra-cellulaires comme le gonocoque, le méningo, certaines salmonelles,

les toxoplasmes ne sont pas touchés par les phénomènes de phagocytose.

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 g ) le complément

Système constitué de 13 protéines dont les symboles vont de C1 à C13.

Chaque protéine isolée est inactive.

Sous l’influence de différents facteurs (anticorps, par exemple), elles forment une chaîne
et permettent, en particulier, l’adhésion des germes sur les cellules phagocytaires.

Elles ont des propriétés chimiotactiles importantes et attirent les leucocytes.

2 - Défenses spécifiques

Elles sont assurées par les anticorps et par les lymphocytes T.

a ) Définitions :

Antigène : Substance étrangère à l’organisme capable de provoquer la

production de substance réagissant spécifiquement avec lui.
Anticorps : Substance capable de se combiner à l’antigène qui lui est
spécifique.

On les appelle aussi immunoglobulines : Ig G . Ig H . Ig A . Ig D . Ig E. IgM

Ce sont des β ou y. globulines

La surface des bactéries présente de nombreux antigènes différents les uns des autres.

b ) Mécanisme de production des anticorps :

Ils sont produits par les plasmocytes qui viennent de la transformation de certains
lymphocytes (lymphocytes B), transformation par le contact antigène-plasmocytes.

Les leucocytes sont donc indispensables à la fabrication des anticorps.

C’est pourquoi les traitements qui font chuter le taux des leucocytes (ex. :
radiothérapie, chimiothérapie) favorisent le développement de toutes les infections.

La réaction immunitaire doit s’adapter dans le cas d’une infection virale.

Le virus se développe à l’intérieur de la cellule microbienne et reste donc à l’abri des

anticorps.

L’antigène est transmis aux lymphocytes T par le macrophage, cellule cytotoxique,

capable de détruire la cellule porteuse de l’antigène.

VII – MODE DE TRANSMISSION DES MALADIES INFECTIEUSES

Lorsqu’une maladie se propage rapidement dans la population d’une région, on a affaire à

une épidémie.

Lorsqu’un continent est atteint, c’est une pandémie.

Lorsque la maladie n’atteint qu’une faible partie de la population, mais se prolonge dans le
temps, c’est une endémie.
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1 - Contamination directe

a) Par contact direct

Sur une plaie : l’infection peut être grave ; surtout :

si la plaie est profonde
si le malade est immunodéprimé.

b) Par les voies respiratoires

par la parole
par les éternuements
par l’expiration

Nous expulsons des micro-gouttelettes chargées de la flore de la bouche et du

pharynx.

Cette flore est généralement constituée de germes commensaux ; mais il peut s’y
mêler des germes pathogènes :

- Bacilles de Koch
- Bacille de Loeffler ( diphtérie)
- Pneumocoques
- Méningocoques… pour ne citer que les principaux.

Les linges, les aliments, s’ils sont souillés , peuvent être contaminant par simple contact.

c) par piqûre ou morsure

Certaines maladies sont transmises à l’homme par un hôte intermédiaire qui assure le rôle
de réservoir de germes et d’agent transmetteur.

Exemples :
- Moustiques avec le plasmodium
- Glossine avec le trypanosome
- Chien avec le virus de la rage, etc…
- Rat avec les leptospires et les spirochètes.

2 - Contamination indirecte

Transmission par voies digestives

Principalement des infections intestinales.

Les malades évacuent les germes par les selles. La contamination se fait par l’eau et par
les aliments, le linge, les ustensiles de cuisine.

Il faut donc augmenter les précautions d’hygiène :

- Lavage des mains

- Lavage du linge
- Utilisation d’antiseptiques pour éviter la multiplication des germes et la
propagation des épidémies en cas d’infections intestinales.

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