UE N° SV1

Organisation et mécanismes moléculaires

des cellules eucaryotes

ECUE 1
Biologie cellulaire

S. Lindenthal
Faculté de Médecine
28 ave de Valombrose
Sabine.Lindenthal@univ-cotedazur.fr
Tel.: 0489153506
 UE N°SV1
Organisation et mécanismes moléculaires des
cellules eucaryotes (OMM) (6 ECTS)

Responsables : Sabine Lindenthal, Pierre Frendo, Delphine Ciais

ECUE 1 (2 ECTS) : Biologie Cellulaire (Coefficient 2)

20h CM, 10h TD
ECUE 2 (2 ECTS) : Biologie Cellulaire Végétale (Coefficient 1)
8h CM, 6h TD
ECUE 3 (2 ECTS) : Biologie Moléculaire (Coefficient 1)
10h CM, 4h TD

Attention : un examen écrit par ECUE

2
Les ouvrages utilisés pour la préparation de ce cours :
Biologie moléculaire de la cellule, B. Alberts, Flammarion
L’essentiel de la biologie cellulaire, B. Alberts, Flammarion
Biologie moléculaire de la cellule, Lodish, DeBoeck
Cours de biologie cellulaire, P. Cau et R. Seïte, Ellipses
Biologie cellulaire, Y Bassaglia, Maloine
Biologie, N. Campbell, J.B. Reece ; Pearson

Le livre « Biologie moléculaire de la cellule », B. Alberts, est disponible

dans son intégralité en version anglaise sur le site :
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ (cliquez sur « books »)

Plan du cours I :
I. Introduction
1.1. « Définition » de la cellule
1.2. Brève comparaison cellule procaryote/eucaryote
1.2.1. La cellule procaryote
1.2.2. La cellule eucaryote
1.3. Formation de la cellule ancestrale
1.4. Evolution de la cellule
1.5. L’origine des cellules eucaryotes
1.5.1. L’hypothèse endosymbiotique
1.5.2. Le rapport surface/volume 3
Plan du cours I (suite):

II. Les membranes biologiques

2.1. Structure et composition de la membrane biologique

A : Les lipides membranaires

2.2. Les phospholipides
2.2.1. Formation de la bicouche lipidique
2.2.1.1. La liaison hydrogène
2.2.1.2. Molécules hydrophobes/molécules hydrophiles
2.2.1.3. Les hydrocarbures dans l’eau
2.2.1.4. Les phospholipides dans l’eau
2.2.1.5. L’autoassemblage et l’autofermeture

4
Moodle : cours, animations et QCM

5
Moodle : les votes électroniques

6
 ECUE 1
Biologie cellulaire

Compétences visées :

- savoir décrire et reconnaître les constituants de la cellule

eucaryote animale
- connaître les fonctions des organites cellulaires et leurs
interactions
- comprendre le concept de la compartimentation dans
l’organisation et le fonctionnement de la cellule eucaryote
- approfondir les connaissances de la division cellulaire
mitotique et méiotique
- comprendre l’importance des mécanismes de la régulation
du cycle cellulaire pour l’organisme pluricellulaire 7
 I. Introduction : La cellule procaryote

ADN
paroi
membrane
plasmique
ribosomes
paroi
cellulaire

mésosome
espace
périplasmique ADN bactérien,
nucléoïde
cytosol

Microscopie électronique d’une coupe

longitudinale d’une bactérie d’E.coli 8
I. Introduction : La cellule eucaryote animale

9
I. Introduction : Formation de la cellule ancestrale
Différents stades suggérés de l’évolution de la cellule

Stade 1 Stade 2

ARN + polypeptides ARN protéines

rudimentaires

Formation des premiers polypeptides L’ARN autoréproductif pouvait agir

et d’ARN capable comme matrice pour la synthèse de
d’autoréplicationdans la soupe pré- protéines.
biotique.
10
I. Introduction : Formation de la cellule ancestrale

Stade 3 Stade 4

ARN protéines ADN ARN protéines

Cette compartimentation permettait Les cellules devenaient plus

la sélection de l’ARN sur sa
capacité de fabriquer une meilleure
protéine.
complexes ; des nouvelles enzymes
créaient l’ADN et devenaient
capables de réaliser des copies
d’ARN de cet ADN.
11
 I. Introduction : Evolution de la cellule
début de l’accumulation rapide de
l’O2 dans l’atmosphère

temps
(milliards
d’années)

0 1 2 3 4

formation cellule cellule à époque

de la terre ancestrale respiration actuelle
anaérobie aérobie organismes
pluricellulaires

cellule à activité de cellule eucaryote à 12

photosynthèse activité de photosynthèse
I. Introduction : l’origine des cellules eucaryotes

L’enveloppe nucléaire et le système

endomembranaire – l’hypothèse de
l’invagination et de la spécialisation
de la membrane plasmique.

Les mitochondries et les plastes -

l’hypothèse d’origine
endosymbiotique

13
I. Introduction : le rapport surface/volume

Fig. 4-2, Purves W.,

Le monde du vivant

un cube de 4 mm huit cubes de 2 mm 64 cubes de 1 mm

Surface (mm2) 96 192 384

Volume (mm3) 64 64 64
Rapport
surface/volume 1,5/1 3/1 6/1

Le faible volume des cellules permet de maintenir un grand rapport

surface/volume.

(Taille de cellules procaryotes : 0,25 x 1,2 µm à 1,5 x 4 µm

taille de cellules eucaryotes : 1 à 1000 µm)
14
 I. Introduction : Evolution de la cellule
début de l’accumulation rapide de l’O2
dans l’atmosphère

temps
(milliards
d’années)

0 1 2 3 4

cellule cellule à époque

formation ancestrale à respiration actuelle
de la terre glycolyse en aérobie
Molécules organiques à CO2 + H2O organismes
anaérobie
Molécules organiques à pluricellulaires
lactate, EtOH, etc

cellule à activité de cellule eucaryote à activité

photosynthèse de photosynthèse
15
CO2 + N2 à molécules organiques
 II. Les membranes biologiques :
Structure de la membrane plasmique

La membrane est constituée de molécules lipidiques et de molécules

protéiques.

Elle sert de barrière hydrophobe. 16

 II. Les membranes biologiques :
Clichés de microscopie électronique de la membrane plasmique

d’un globule rouge

d’un lymphocyte

cell-coat ou glycocalix

Fig. 10-40, Alberts B., Biologie Moléculaire de la Cellule

17
 2.2. Les phospholipides :
Structure de la phosphatidylcholine

groupement (+)
polaire de tête (-)
(hydrophile)

groupement double
liaison cis
apolaire
de queue
(hydrophobe)

Fig.10-2, Alberts B., Biologie Moléculaire de la cellule

Il s’agit alors d’une molécule amphiphile

18
(contenant à la fois des parties hydrophiles et hydrophobes).
Les phospholipides membranaires

19
….. sont constitués d’un glycérol,

H2C OH

HC OH

HO CH2

glycérol

20
… de deux acides gras,

O palmitate

H2C O C (CH2)14 CH3

HC O C (CH2)7 C C (CH2)7 CH3

H H
O
HO CH2
oleate

glycérol acides gras

21
…. d’un groupement phosphate

O palmitate

H2C O C (CH2)14 CH3

HC O C (CH2)7 C C (CH2)7 CH3

O H H
O
HO P O CH2
oleate
O-

phosphate glycérol acides gras

22
 …. et d’un groupement de tête (un alcool).

O palmitate

H2C O C (CH2)14 CH3

HC O C (CH2)7 C C (CH2)7 CH3

H3C O H H
O
H3C N+ CH2 CH2 O P O CH2
oleate
H3C O-

groupement de tête phosphate glycérol acides gras

la phosphatidylcholine

23
 Les phospholipides membranaires forment
spontanément….
G ACIDE GRAS
L
Y
C
E
ACIDE GRAS
R
O
groupement de tête PHOSPHATE L

24
 ….des bicouches lipidiques

têtes polaires intérieur hydrophobe têtes polaires

feuillet
liaison double

Épaisseur de la bicouche : 5-7 nm 25

 Deux phospholipides

Phosphatidylcholine Shingomyeline

26
 2.2. Les phospholipides :
Les phospholipides principaux de la membrane plasmique

Fig. 10-10, Alberts B., Biologie

Moléculaire de la Cellule

Phosphatidyl- Phosphatidyl- Phosphatidyl- Sphingomyéline

éthanolamine sérine choline

27
 2.2. Les phospholipides :
Les acides gras insaturés et saturés

double liaison

Acide oléique (insaturé) Acide palmitique (saturé)

28
2.2.1.1. Formation de la membrane :
La liaison hydrogène

-
A - + H
B
+H O O Liaison covalente
La densité d’électrons
H Liaison hydrogène
+ H est plus forte autour de
L’eau a des liaisons + l’atome d’oxygène
covalentes polaires

Fig. 2-9, Purves W., Le monde du vivant

A : La molécule d’eau est formée par des liaisons covalentes polaires

avec des charges électriques partielles aux extrémités.

B : La liaison hydrogène entre deux molécules d’eau

29
 2.2.1.2. Formation des membranes :
Molécules hydrophiles et hydrophobes

acétone 2-methyl-propane

eau acétone dans l’eau eau 2-methyl-propane dans l’eau

Intégration d’une molécule Les molécules non polaires

polaire dans le réseau des interrompent le réseau.
molécules d’eau. 30
 2.2.1.3. Formation des membranes :
Les hydrocarbures dans l’eau

Fig. 2-14, Purves W., Le monde du vivant

Les hydrocarbures augmentent l’ordre dans la solution.

Les molécules d’eau forment une « cage » de liaisons hydrogène qui

entourent les hydrocarbures.
27
 2.2.1.4. Formation des membranes :
Les phospholipides dans l’eau

En solution aqueuse, les queues hydrophobes des

phospholipides se regroupent tandis que leurs
têtes polaires sont exposées à l’eau.

L’eau repousse les molécules hydrophobes qui se

tassent les unes sur les autres.

Elles forment donc spontanément des bicouches

lipidiques

Micrographie électronique et schéma

32
de vésicules phospholipidiques Fig. 10-4, Alberts B., Biologie Moléculaire de la Cellule
 2.2.1.4. Formation des membranes : La
barrière hydrophobe

têtes polaires intérieur hydrophobe têtes polaires

feuillet
liaison double
33
 2.2.1.4. Formation des membranes :
Les forces de Van Der Waals

-- pas de liaisons covalentes entre les molécules de phospholipides

-- la cohésion des molécules est due aux forces de Van Der Waals
entre les chaînes hydrocarbonées.
 2.2.1.5. Formation des membranes :
L’autoassemblage et l’autofermeture

1
Une bicouche lipidique plane se referme
bicouche lipidique plane spontanément pour former une vésicule.

L’entropie (le désordre) du système

compartiment augmente si la bicouche plane se referme.
3 clos

l’entropie du système 3 1
2.2.1.5. Formation des membranes :
L’autoassemblage et l’autofermeture

le liposome