Entérobactéries BGN (+++) -

E. Choli Salmonella Shigella

Hôte normal du TD Photogène stricte Pathogène stricte

• Mobile (mobilité hésitante). • Mobile • Immobiles.

• Facteurs de P: capsule / protéines/ LPS/
sys de captation du fer/ adhésines/
toxines
• Généralement sensible au ATB.
• Il existe des souches pathogènes d’E.Coli:
Pathovars: peut donner diarrhees +
pathologies
• Habitat: les animaux à sang chaud et froid
• -Faible pouvoir métabolique.
• PP: Fièvre typhoïde • -Strictement humaine.
• Généralement sensibles aux ATB • -Fait pas partie de la flore intestinale
• Prélèvement: Hémoculture + Coproculture commensale.
• Diagnostic: indirect: sérodiagnostic de Félix
• -Sensible aux ATB
• 2 types de vaccins: injectable + vivant • -Responsable de la dysenterie bacillaire.
• -Prélèvement: Coproculture (selles)
• -Absence de vaccin.

✓ Les entérobactéries sont retrouver dans la plupart des prélèvements.

✓ Classées en pathogènes spécifiques (diarrhées) et opportunists/occasionnels
✓ Habitat: TD des hommes et des animaux (Environnement aussi)
✓ Grande résistance naturelle à certaines familles d’ATB hydrophobes.
✓ Caractères: Mobiles ou immobiles / Aéro anaérobies facultatives / Oxydase - / Nitrate + / Fermentent le glucose /
Parfois capsulés
✓ Pousse sur milieu ordinaire
✓ Les colonies sont regroupées en 3 classes: S, M et R
✓ Facteurs de virulence: Reconnaissance de l’hôte / Invasion et destruction tissulaire / Exotoxines / Destruction du sys
immunitaire / Presence de capsule
✓ Transmission: Directe: Manuportée / Indirecte: Eau, aliments, Cathéter, sondes / Porteurs sains
✓ Leur présence dans l’eau est un signe de contamination fécale.
 Cocci à gram + (+++) +
Staphylocoque Streptocoque
Habitat: Muqueuse et peau homme et animaux. Habitat: Commensaux muqueuse et peau homme et animaux.
(Environnement aussi) / Cavité oropharyngée / TD et vagin
Caractères: Anaérobies aérotolérants / Disposés en
diplocoques et en chainettes / Immobiles / Catalase –
Coagulase + Coagulase – - Exigence en culture! (milieux enrichis en sang ± facteurs
S. Aureus S. Non aureus de croissance)
Pathogène spécifiques Pathogène opportunists Classification: Hémolyse / caractères antigéniques et
responsables d’infections nosocomiales biochimiques

• Essentiellement humaine
Streptocoque A Streptocoque pneumoniae
• Habitat: Fosses nasales Pathogène Hôte normal
• Caractères: Aéro-anaérobie / Disposés en amas /
Immobiles / Catalase + / Coagulase +
/ Oxydase-
• Transmission: Directe / Indirecte (matériel
hospitalier) / Alimentaire • Habitat: Arbre respiratoire sup
• Habitat: Cavité oropharyngée.
• PP: Lésions suppuratives et nécrotiques. • Facteurs virulence:
• Strictement humaine. Pneumolysine / Capsule
• Facteurs virulence: Hémolysine / DNAase / • Béta hémolytique. polyosidique / Proteine de
Enterotoxines / Toxine du choc toxique • Transmission: directe: voie aérienne surface / Acides teichoiques
• Pousse sur milieu ordinaire. • PP: Angines érythémateuses. et peptidoglycane
• Diagnostic: direct: recherche d’A nucléiques • Facteurs virulence: Capsule / • PP: Bronchite / Méningite
Enzymes et toxines • Vaccin à base d’ag capsulaires
• Sensible à la meticilline.
 Cocci à gram –
Strictement humaine
(+++) -
Impliquées dans infections graves
Groupés par paires

Neisseria meningitidis Neisseria gonorrhoeae

Pathogène Pathogène

NB: URGENCE ABOSLUE: Diagnostique, Thérapeutique et Prophylactique MADO

• DCGN fragile et exigeant • DCGN fragile et exigent
• Possède une capsule plysaccharidique. • Habitat: Voies génitales
• Habitat: Rhino-pharynx. • Transmission: directe par voie vénérienne /
• Transmission: directe: interhumaine par voie aérienne.
pernatale
• PP: Méningite cérébrospinale (MCS) / Septicémie (purpura fulminans)
• PP: Homme: Urétrite / Femme: Cervicite
• Facteur virulence: Pili / IgA protéase / Endotoxine: ligosaccharide
• Responsable d’IST
(LOS)
•Prélèvements: LCR - Sang - L’écouvillonnage des lésions purpuriques • Prélèvement: sécrétions: Endocervical (F) / Urétral
• Diagnostic: direct: recherche Ag solubles (méningite décapitée) (H) / Oculaire (NN)
• Culture: gelose au sang cuit + polyvitamines • Maladie non immunisante
• Chimio prophylaxie: Ceftriaxone et Ciprofloxacine.
• Vaccin à base de polysaccharides capsulaires purifiés

DCGN: diplocoque gram -

IST: infection à transmission sexuelle
 Pseudomonas (+++) Acinetobacter (+++)

Pseudomonas aeruginosa Bacterie oppurtiniste

Saprophyte opportuniste

• Cocobacille à gram – ubiquitaire multi résistante.

• Bactérie à gram – ubiquitaire • Caractères: Aérobie stricte / Immobiles /polymorphe
• Caractères: Aérobie stricte / Mobile (mobilité polaire) / • Habitat: homme: principal réservoir à l’hôpital / fait
Oxydase + / Peut former des biofilms / Ne partie de la flore commensale cutanée, TD, pharynx
fermente pas le glucose • Transmission: croisée: patient à patient / par aerosols
• Habitat: Environnement naturel et du patient (milieux • PP: Acinetobacter baumanii / infections nosocomiales
humides) • Pousse sur milieu ordinaire.
• Transmission: interhumaine / sources environnementales / • Très résistantes à l'environnement
pression sélection ATB: augmente risque colonisation
• PP: infections nosocomiales et communautaires localisées,
infections urinaires, otitis, méningite
• Pousse sur milieu ordinaire
• Très grande résistance aux ATB
• Peut former des biofilms
• Présente des pigments et pili
• Secrète des enzymes
 Haemophilus BGN (+++) -
Pathogene pour l’homme uniquement

Haemophilus influenzae Haemophilus ducreyi

Pathogène Pathogène stricte

• Petits bacilles ou cocobacilles à gram –

• Petite bacille à gram –
• Caractères: Aérobie et anaérobie facultatif / Immobiles /
• Aspect en chaîne de vélo
Non sporulé / Parfois encapsulée
• Infection a transmission sexuelle
• Habitat: oro-pharynx
• Oxydase + et Catalase -
• Transmission: interhumaine: par voie aérienne
• Exigeant en facteur X
• 6 serotypes dont le type b est le + frequent
• Culture difficile. (germe fragile)
• PP: Infections invasives et ORL / Méningite / Epiglottite NNé
• Prélèvement: Grattage du chancre / ponction
• Culture: gelose en sang cuit, milieu contenant les facteurs V et X
de l’adénopathie avant fistulisation
• Diagnostic: rapide, Mise en évidence exigence en facteurs V et X
• PP: Chancre mou
/ Recherche Ag solubles
• Resistance naturelle et acquise aux ATB
• Vaccin: infection Hib (Polysaccharide type b)
 Brucella BGN (+++) Vibrions BGN (+++) -
Hôte naturel milieu marin

Vibrio cholerae
Pathogène spécifique

• Petits coccobacilles, Aérobies strictes

• Agent du cholera: maladie infectieuse diarrhéique
• Culture lente sur milieux enrichis au sang
(sérogroupes O1 et O139) strictement humaine a declaration
• Peut entrainer Brucellose: Zoonose ou Sévère et
obligatoire.
invalidante
• Caractères: Aéro-anaérobie / Très mobile / Incurvés / Non
• Réservoir: mammifères terrestres et marins
sporulé / Oxydase / Fermente le glucose sans production de gaz
• Transmission: Directe; Indirecte (ingestion de lait
• Facteur virulence: exotoxine protéique
contaminé); Interhumaine exceptionnelle (sexuelle)
• Habitat: Homme malade / convalescent / porteur sain
• Contamination digestive +++
• Transmission (grande contagiosité): directe: interhumaine /
• Prélèvement: Hémoculture +++, biopsie, pus, serum
indirecte
- Uréase rapide et intense, catalase + et oxydase +
• Clinique: Diarrhée profuse / Vomissement / T° normale
• Prélèvement: Coproculture / Vomissement / Aliments / Eau
• Diagnostic: direct: rapide et facile (diagnostic présomptif)
• Pousse sur milieu ordinaire mais de préférence enrichis (eau
peptonée saline alcaline).
• Vaccination supprimée du règlement sanitaire.
 Helicobacter pylori BGN (+++)
• Colonise l’estomac de 1/2 de l’humanite
• Caractère: Micro-aérophile / Spiralée ou arquée /
Mobile / Absence de spore et de capsule
• Habitat: principalement l’homme (animaux aussi)
• Transmission: strictement interhumaine précoce dans
l’enfance et interfamiliale par voie : gastro-orale, oro-
orale et feco-orale
• Facteurs virulence: cytokine vacuolisante / uréase très
active+++
• PP: pathologies gastro-intestinales: de la gastrite, ulcère
gastrique jusqu’au cancer gastrique
• Diagnostic: 3 méthodes non invasives: sérologie (ELISA)
/ test respiratoire / recherche d’ag dans les selles.
1 méthode invasive: biopsie au nombre de 3 pour: examen
anatomopathologique / test à l’uréase / culture.
• Culture delicate en microaerophilie
• Resistance aux ATB
Campylobacter BGN (+++) -
• Caractères: Micro-aérophile / Spiralée ou arquée /
Incurvé / Mobiles / Absence de spore et de capsule
• Facteurs virulence: Capacité d’envahir la muqueuse
intestinale / Toxine
• Habitat: bactérie commensale du TD de nombreux oiseaux et
mammifères / survie dans l’environnement en particulier l’eau
et le lait
• Transmission: origine alimentaire (volaille crue)
• PP: Entérite / Bactériémie / Complications non infectieuses
(syndrome de Guillain–Barré)
• Les infectés sont responsables de zoonoses
• Prélèvement: coproculture / écouvillonnage rectal /
hémoculture
• Exigeante en culture +++
 Les anaérobies (++)

• Cocci ou bacilles Gram + ou -

• Urgence du traitement
• Incapables d’utiliser et de se multiplier en présence de 20% d’O²
• Responsables d'une grande variété d'infections localisées ou généralisées
• Difficulté d’isolement et d’identification
• Classification: anaérobies strictes / modérés / tolérants
➢ Flore de Veillon (multiplication, colonisation de cavités normalement stériles)
➢ Flore tellurique (Contamination; multiplication puis élaboration de toxine)
• Clinique: Intoxinations / Toxi-infections / Infections mixtes
• Diagnostic: direct: Macroscopie: Pus abondant / Odeur fétide / Présence de gaz, parfois de granulations sulfureuses.
Microscopie: Flore bactérienne abondante et polymorphe
• Résistantes aux amniosides
• Vaccination pour C. teteni seulement

Anaérobies telluriques Anaérobies non telluriques = Flore de Veillon

BGP sporulés du genre Clostridium (C) Non sporulés.
La spore permet leur survie en milieu hostile, sur le sol Commensales des cavités naturelles de l’homme.
Sont aussi commensaux de l’intestin. N’élaborent pas de toxines.
Leur pouvoir pathogène est dû à la production de toxines. Sont pathogène par leur pouvoir de multiplication

C. Difficile C. Perfringens C. Tetani C. botulinum

- Toxine A et B - Toxine α et β - Exotoxines - Neurotoxine - Habitat: TD et muqueuses
- Prélèvement de - Présente ds l’intestin de - Clinique: - Présente ds - Facteurs favorisants: Traumatisme, troubles
selles +ieurs animaux et de Tétanos l’intestin de +ieurs nutritionnel…
l’homme animaux et de l’homme - Clinique: Angine fusospirochetienne / Suppurations
- Clinique: Infections - Diagnostic: diverses.
tissulaires des tissus mous recherche de toxine - Culture: gelose de sang desoxygenes en anaérobiose.
- Coloration gram: aspect protéiforme.
- Vaccination
 Mycobactéries BGP +
Mycobactéries typiques Mycobactéries atypiques -
Pathogène Hôtes normal

Complexe mycobacterium (+++) Mycobactéries leprae

• Non tuberculeuses
• Infections chroniques +++
M.tuberculosis M.Bovis M.Africanum • Strictement humain
• Ubiquistes de l’environemment
• Transmission: interhumaine
• Grande résistance aux antiseptiques.
• Strictement • Habitat: tropisme cutané et
• Réservoir • Variant de • PP: Adénites (enfant)
humain. muqueux
animal. M. • Nombreuses résistances naturelles aux
• Trans: • Diagnostic: directe. (Pas de
• Contamination tuberculosis ATB
interhumaine par sérodiagnostic fiable)
humaine en Afrique • Culture lente: + 15j
voie aérienne et par possible • Culture: Non cultivable !
Noire • Vaccination par BCG ne protège pas
aliments animals des mycobactéries non tubeculeuse
• Examen direct+
PCR
• Bacilles acido-alcoolo-resistants
• Colorable par Ziehl-Neelsen: BAAR
• Caractères: Aérobie stricte / Immobile / non sporulés / non capsulés / Résiste
au froid et a la dessication / Sensible à la chaleur / Aucun plasmide
• Culture: lente, ne pousse pas sur milieu ordinaire
• Prelevement: expéctorations +++, urines, LCR
• Les crachats doivent etre répétés si possible 3j de suite +++
• Tuberculose: immunité cellulaire (acquise par vaccination)
• Examen direct peut être quantitative
• Entrainent chez l'homme une hypersensibilité retardée

Corynebactérium diphteriae
Bacille en forme de massue
Pathogène stricte
• Essentiellement humaine.
• Maladie a declaration obligatoire
• Agent de la diphtérie: souches toxigenes
• Urgence Clinique
• Transmission: aérienne interhumaine.
• Caractères: Aéro-anaérobie facultative /
Immobile / Irrégulière / Non sporulé
• Exigence en culture!
• Produit une exotoxine protéique lorsque la
concentration en
fer est faible.
• Toxine: blocage des synthèses protéiques.
• PP: Angine pseudomembraneuse / Signes
d’intoxication
• Diagnostic: direct: recherche du gène tox
par PCR
• Traitement: serotherapie ATB
• Vaccination par l’anatoxine.
Info: les autres corynebacteries ⇒
Infections nisicomiales ou iatrogenes
Bacilles à gram + BGP
Cultivant en atmosphere aerobie
Bacillus
Gros bacille
• Sporulés et régulières
• Aérobie stricte ou aero-anaérobie
• Habitat: Sol / Environnement
• Culture facile
• Bacillus anthracis seul pathogène
+
-
Listeria (+++)
Coccobacille ou petit bacille
Listeria monocytogenes
Pathogène
• Ubiquitaire
• Pathogene pour l’homme et l’animal
• Agent de la listériose.
• Caractères: Micro-aérophile / Non sporulée
/ Mobile à 25°C / Immobile à 37°C
• Transmission: *indirecte: alimentation
*directe: fœto-maternelle
• PP: Septicémie origine dig / Infections SNC
• Pousse sur milieu ordinaire.
• Resistant dans le milieu exterieur
• Resistance naturelle aux chephalosporines de
3 eme generation +++

Leptospires (+++)
Leptospira interrogans
• Pathogènes pour l’homme et l’animal
• Bactérie spiralée / Aérobie stricte
• Visible au microscope à fond noir
• Transmission: contact direct
• Prlvm: sang, urines, LCR
• Culture: ne pousse pas sur milieu ordinaire
• Absence d’immunité naturelle.
• Vaccin inactive = immunité acquise ne
protège pas contre d’autres sérovars.
• Caracteristiques: flexible à paroi mince / hélicoïdale ou spiralée
• Examen à fond noir.
• Coloration par imprégnation argentique.
• Culture: soit impossible (Treponema) soit longue et difficile (Borellia, Leptospira)
• Spirochètes saprophytes ont comme habitat préf l’oropharynx.
Spirochètes
Borrelia Treponema (+++)
Pathogène Pathogène
Treponema pallidum ssp pallidum
• Anthropozoonoses.
• Caractères: Hélicoïdale / Mobile /
• Responsable d'endémie
Non colorés au gram
• Strictement humaine
• PP: Maladie de Lyme /
• Bacille fragile et très fin spiralé
Fièvres récurrentes
• Visible au microscope à fond noir
• Culture: ne pousse pas sur milieu
• Agent de la syphilis vénérienne.
ordinaire.
• Mal coloré au gram.
• Diagnostic: direct: microscope à
• Transmission: sexuelle / maternofeotale /
fond noir
transplantation
• Structure antigénique: Cardiolipide / protéique
spcf / polyosidique d'enveloppe spcf / du
corps tréponémiques spcf
• PP: lésions cardiovasculaire,cutanées ou
neurologiques
• Diagnostic: indirect: sérologique
• Non cultivable!
• Immunité acquise ne protège pas = pas de
Vaccine
• Peut etre responsable d'une syphillis
congenitale et latente (non contagieuse)
• La syphillis primaire est responsable de chancre
et peut guerir spontanement
• La syphillis secondaire peut etre tres
contagieuse
 Chlamydiae (+++)

• Bactérie intracellulaire obligatoire responsable d’affection polymorphes et non colorables par le Gram
• Principale IST
• Caractères: Gram - / Absence de peptidoglycane! / Membrane externe, avec LPS
• Formes: Corps réticulé (, Intracell, Métaboliquement actifs, Non infectieux) / Corps élémentaire (infectieuse, Extracell)
/ Corps aberrant (persistance)
• Physiopathologie: Le cycle dure 48 à 72 heures
• Résistance naturelle et acquise (exceptionnelle)

Chlamydia trachomatis Chlamydia pneumoniae Chlamydia psittaci

• Réservoir strictement humain • PP: Infections broncho-pulmonaires

• PP: Ornithose-psittacose
• PP: trachome / IST / / Maladie coronarienne / Asthme
Lymphogranulomatose vénérienne • Transmission: par voie aerienne
• Transmission: directe et indirecte
 Mycoplasmes

• Caractères: Anaérobies facultatifs / Petite taille / Sans paroi /

Non colorable au gram / Sensible à l’environnement
• Chez l'homme: commensales ou pathogènes
• Ce n’est pas une bactérie intracell obligatoire mais elle a besoin
d’une C eucaryote pour son développement
• Habitat: muqueuses respiratoires (M. pneumoniae) / muqueuses
génitales (M. urealyticum)
• Transmission: Interhumaine / lors de l’accouchement
• PP: Infections respiratoires / génitales
• Diagnostic: *microscopique direct: impossible
*indirect: essentiel pour M.pneumoniae et sans intérêt
pour mycoplasmes génitaux.

Oumaima Mosaid