Fiches de bactériologie spéciale

Pr Elouennas et Pr Chadli
2020/2021 Fait par Hiba Terrafi
Ces fiches ont été faites dans un temps record !
Donc excusez moi si vous trouvez des fautes.
Le but c’est de vous facilitez la tâche et de réduire le
cours au minimum alors si vous trouvez que les
informations ne sont pas suffisantes selon vous
dirigez vous vers le cours complet des professeurs.
 Mycobactéries

Mycobactéries typiques : Pathogène Mycobactéries atypiques :

Hôtes normals
Complexe mycobacterium tuberculosis Mycobactéries leprae
• Infections chroniques +++
• Strictement humain. • Ubiquistes de
M.tuberculosis M.Bovis M.Africanum • Transmission : interhumaine : difficile. l’environemment.
• Strictement • • Variant de • Habitat : tropisme cutané et • Grande résistance aux
Réservoir
humain. animal. M.tuberculosis muqueux. antiseptiques.
• Transmission • Contamination en Afrique. • Diagnostic : directe. (Pas de • PP : Adénites (enfant)
: directe : humaine sérodiagnostic fiable) • Nombreuses résistances
interhumain possible. • Culture : Non cultivable ! naturelles aux antibiotiques.
e par voie • Pas d’antibiogramme. • BCG ne protège pas des
aérienne
• Absence de vaccination. mycobactéries non
• Bacille à gram + tubeculeuse.
• Colorable par Ziehl-Neelsen : BAAR
• Caractères : Aérobie stricte / Catalase + / Immobile
/ Résiste au froid / Sensible à la chaleur
• Aucun plasmide !
• Culture : ne pousse pas sur milieu ordinaire.
• Diagnostic de certitude : culture.
• Tuberculose : immunité cellulaire : Etat de
sensibilisation (primo infection) + Etat de forte
résistance.
 Spirochètes

Leptospires Borrelia Treponema : Pathogène

Pathogène
Leptospira interrogans : Pathogène Treponema pallidum ssp pallidum

• Anthropozoonoses. • Strictement humaine.

• Bactérie spiralée.
• Caractères : Hélicoïdale / Mobile / Non • Bactérie fragile.
• Aérobie stricte.
colorés au gram • Agent de la syphilis vénérienne.
• Visible au microscope à fond noir.
• PP : Maladie de Lyme (borrelia • Mal coloré au gram.
• Habitat : Rongeurs / Homme (accidentellement)
burgdorferi) / Fièvres récurrentes (autre • Transmission : sexuelle /
/ Milieu extérieur aqueux (égouts)
borrelia) maternofeotale / transplantation
• Culture : ne pousse pas sur milieu ordinaire.
• Culture : ne pousse pas sur milieu • PP : lésions neurologiques et
• Absence d’immunité naturelle.
ordinaire. cardiovasculaires. (4 phases)
• L’immunité acquise ne protège pas contre
• Coloration : Giemsa (fièvres récurrentes) • Diagnostic : indirect :
d’autres sérovars.
• Diagnostic : direct : microscope à fond sérologique
• PP : leptospirose ictéro-hémorragique /
noir • Non cultivable !
leptospirose anictérique
• Pas de sérologie (fièvres récurrentes) • Immunité acquise ne protège
pas.
• Hélicoïdales.
• Examen à fond noir.
• Coloration par imprégnation argentique.
• Culture : soit impossible (Treponema) soit longue et difficile (Borellia, Leptospira).
• Diagnostic : Souvent sérologique.
• Spirochètes saprophytes ont comme habitat préf l’oropharynx.
 Bacilles à gram +
BGP

+
Corynebactérium diphteriae Bacillus
Pathogène stricte
• Essentiellement humaine. • Grandes BGP sporulés et
• Agent de la diphtérie. régulières.
• Transmission : aérienne interhumaine. • Aérobie stricte ou aéro-
• Caractères : Aéro-anaérobie / Immobile / anaérobie.
Irrégulière / Non sporulé / Forme de • Habitat : Sol / Environnement.
massue / Catalase + / Nitrate réductase + • Bacillus anthracis seul
• Exigence en culture ! pathogène.
• Produit une exotoxine protéique lorsque la
concentration en fer est faible.
• Toxine : blocage des synthèses protéiques.
• PP : Angine pseudomembraneuse / Signes
d’intoxication
• Diagnostic : direct : recherche du gène tox
par PCR
• Vaccination par l’anatoxine.
 Listeria
Coccobacille à gram +
+
Listeria monocytogenes
Pathogène

• Agent de la listériose.
• Caractères : Micro-aérophile / Non sporulée /
Mobile à 25°C
• Habitat : Animaux / Alimentation / TD et parfois
rhino-pharynx (homme) / Environnement
• Transmission : indirecte : alimentation / directe :
fœto-maternelle.
• PP : Septicémie origine dig / Infections SNC
• Pousse sur milieu ordinaire.
• Diagnostic : indirecte : sans intérêt si germe isolé.
 Mycoplasmes

• Caractères : Anaérobies / Petite taille / Ne possède pas de paroi ! /

Non colorable au gram / Sensible à l’environnement
• Non observable au microscope optique mais au microscope inversé
ou à la loupe.
• Ce n’est pas une bactérie intracellulaire obligatoire mais elle a besoin
d’une cellule eucaryote pour son développement.
• Habitat : muqueuses respiratoires (M. pneumoniae) / muqueuses
génitales (M. urealyticum)
• Transmission : Interhumaine / lors de l’accouchement
• Culture : longue nécessite milieux complexes.
• PP : Infections respiratoires / génitales
• Diagnostic : microscopique direct : impossible / indirect : essentiel
pour M.pneumoniae et sans intérêt pour mycoplasmes génitaux.
 Entérobactéries BGN

E. Choli
Hôte normal
• Mobile (mobilité hésitante).
• Généralement sensible au ATB.
• Il existe des souches pathogènes
d’E.Coli : Pathovars.
Salmonella Shigella
Photogène stricte Pathogène stricte -
• PP : Fièvre typhoïde. • Immobiles.
• Prélèvement : Hémoculture + • Faible pouvoir métabolique.
Coproculture • Strictement humaine.
• Diagnostic : indirect : sérodiagnostic de • Fait pas partie de la flore intestinale
Félix commensale.
• 2 types de vaccins : injectable + vivant • Responsable de la dysenterie bacillaire.
• Prélèvement : Coproculture.
• Absence de vaccin.

 Les entérobactéries sont retrouver dans la plupart des prélèvements.

 Sont classées en pathogènes spécifiques et pathogènes opportunistes.
 Leur habitat est le tube digestif des hommes et des animaux. (Environnement aussi)
 Caractères : Aéro anaérobies / Oxydase - / Nitrate + / Fermentent le glucose
 Culture : Pousse sur milieu ordinaire.
 Leur présence dans l’eau est un signe de contamination fécale.
 Ils ont une grande résistance naturelle à certaines familles d’ATB hydrophobes.
 Cocci à gram +
+
Staphylocoque Streptocoque
Habitat : Muqueuse et peau homme et animaux. Habitat : Commensaux muqueuse et peau homme et animaux. /
(Environnement aussi) Cavité oropharyngée / TD et vagin (S.B)
Caractères : Anaérobies aérotolérants / Disposés en diplocoques
Coagulase + Coagulase – et en chainettes / Immobiles / Catalase –
S. Aureus : Pathogène S. Non aureus - Exigence en culture !
Classification : Hémolyse / caractères antigéniques et biochimiques
• Essentiellement humaine.
• Habitat préf : Fosses nasales.
• Transmission : matériel hospitalier
Streptocoque A : Pathogène Streptocoque pneumoniae :
• PP : Lésions suppuratives et nécrotiques.
Hôte normal
• Facteurs virulence : Coagulase / Hémolysine
/ Fibrinolysine / Hyaluronidase / DNAase / • Habitat : Cavité oropharyngée. • Habitat : Arbre respiratoire sup
Leucocidine de Paton et Valentine / • Strictement humaine. • Facteurs virulence :
Enterotoxines / Toxine du choc toxique • Béta hémolytique. Pneumolysine / Capsule
• Caractères : Aéro-anaérobie / Disposés en • Transmission : directe : voie polyosidique / Proteine de
amas / Immobiles / Catalase + / Coagulase + aérienne surface / Acides teichoiques et
/ Oxydase- • PP : Angines érythémateuses. peptidoglycane
• Pousse sur milieu ordinaire. • Facteurs virulence : Capsule / • PP : Bronchite / Méningite
• Diagnostic : direct : recherche d’acides Enzymes et toxines • Diagnostic : direct : Ag solubles
nucléiques • Diagnostic : indirect : • Vaccin à base d’ag capsulaires
• Sensible à la meticilline. sérologique
 Cocci à gram –
Strictement humaine
Groupés par paires -
Neisseria meningitidis Neisseria gonorrhoeae
Pathogène Pathogène
• DCGN fragile et exigeant. • DCGN fragile et exigent.
• Possède une capsule plysaccharidique. • Habitat : Voies génitales.
• Habitat : Rhino-pharynx. • Transmission : directe par voie
• Transmission : directe : interhumaine vénérienne / pernatale
par voie aérienne. • PP : Homme : Urétrite / Femme :
• PP : Méningite cérébrospinale / Cervicite
Septicémie (purpura fulminans) • Responsable d’IST.
• Facteur virulence : Pili / IgA protéase / • Prélèvement : sécrétions :
Endotoxine : ligosaccharide (LOS) Endocervical (F) / Urétral (H) / Oculaire
• Diagnostic : direct : recherche ag (NN)
solubles (méningite décapitée) • Maladie non immunisante.
• Culture : Sang + polyvitamines
• Chimio prophylaxie : Ceftriaxone et
Ciprofloxacine.
• Vaccin à base de polysaccharides
capsulaires purifiés.
DCGN : diplocoque gram –
IST : infection à transmission sexuelle
 Haemophilus

Haemophilus influenzae Haemophilus ducreyi

Pathogène Pathogène stricte

• Petits bacilles ou cocobacilles à gram – • Petite bacille à gram –

• Caractères : Aérobie et anaérobie / Immobiles • Aspect en chaîne de vélo.
/ Non sporulé / Parfois encapsulée • Exigeant en facteur X
• Strictement humaine. • Culture difficile. (germe fragile)
• Habitat : oro-pharynx • Prélèvement : Grattage du chancre /
• Transmission : interhumaine : par voie ponction de l’adénopathie avant
aérienne. fistulisation.
• Le type b est le plus fréquent. • PP : Chancre mou
• PP : Infections invasives et ORL / Méningites /
Epiglottite NNé : grave.
• Culture : milieu contenant les facteurs V et X.
• Diagnostic : Mise en évidence exigence en
facteurs V et X / Recherche Ag solubles.
• Vaccin : infection Hib (Polysaccharide type b)
 Pseudomonas

Pseudomonas aeruginosa
Saprophyte opportuniste

• Bactérie à gram – ubiquitaire.

• Caractères : Aérobie stricte / Mobile (mobilité polaire) / Oxydase
+ / Peut former des biofilms / Ne fermente pas le glucose
• Habitat : Environnement naturel et du patient (milieux humides)
• Transmission : interhumaine / sources environnementales /
pression sélection ATB : augmente risque colonisation
• Facteurs pathogénicité : liés à l’hôte : immunité affaiblie
liés à la bactérie : pigments diffusibles / pili / enzymes / protéase
• PP : infections nosocomiales et communautaires localisées.
• Pousse sur milieu ordinaire.
• Très grande résistance aux ATB.
 Acinetobacter

• Cocobacille à gram – ubiquitaire multi résistante.

• Caractères : Aérobie stricte / Immobiles
• Habitat : homme : principal réservoir à l’hôpital /
fait partie de la flore commensale cutanée, TD,
pharynx.
• Transmission : croisée : patient à patient / par
aérosols.
• PP : Acinetobacter baumanii peut infecter
n’importe quel organe / infections nosocomiales.
• Pousse sur milieu ordinaire.
 Helicobacter pylori

• Bacille à gram –
• Caractère : Micro-aérophile / Spiralée ou arquée / Mobile (flagelles
polaires) / Absence de spore et de capsule.
• Habitat : principalement l’homme.
• Transmission : strictement interhumaine précoce dans l’enfance et
interfamiliale par voie : gastro-orale, oro-orale et feco-orale.
• Facteurs virulence : cytokine vacuolisante / uréase très active
• PP : responsable de nombreuses pathologies gastro-intestinales : allant de la
gastrite, ulcère gastrique jusqu’au cancer gastrique et le lymphome de Malt.
• Diagnostic : 3 méthodes non invasives : sérologie (ELISA) / test respiratoire /
recherche d’ag dans les selles.
1 méthode invasive : biopsie au nombre de 3 pour : examen
anatomopathologique / test à l’uréase / culture.
• Culture délicate.
 Campylobacter

• Bacille à gram –
• Caractères : Micro-aérophile / Spiralée ou arquée / Incurvé / Mobiles (flagelles
polaires) / Absence de spore et de capsule / Vol de moucheron
• Facteurs virulence : Capacité d’envahir la muqueuse intestinale / Toxine /
Résistance à la phagocytose / Mimétisme moléculaire
• Habitat : bactérie commensale du TD de nombreux oiseaux et mammifères /
survie dans l’environnement en particulier l’eau et le lait.
• Transmission : origine alimentaire (volaille crue).
• PP : Entérite / Bactériémie / Complications non infectieuses (syndrome de
Guillain–Barré)
• Prélèvement : coproculture / écouvillonnage rectal / hémoculture
• Diagnostic : indirecte : sérologie : d’arthrite réactionnelle ou Syndrome de
Guillain-Barré.
• Exigeante en culture !
 Vibrions
Hôte naturel milieu
marin

Vibrio cholerae
Pathogène spécifique

• Agent du cholera : maladie infectieuse diarrhéique (sérogroupes O1 et

O139).
• Bacille à gram –
• Caractères : Aéro-anaérobie / Très mobile (cil polaire) / Forme bâtonnets
droits et incurvés / Non sporulé / Oxydase / Fermente le glucose sans
production de gaz
• Facteur virulence : exotoxine protéique.
• Habitat : Homme malade / convalescent / porteur sain
• Transmission (grande contagiosité) : directe : interhumaine / indirecte.
• Clinique : Diarrhée profuse / Vomissement / T° normale
• Prélèvement : Coproculture / Vomissement / Aliments / Eau
• Diagnostic : direct : rapide et facile (diagnostic présomptif)
• Pousse sur milieu ordinaire mais de préférence enrichis (eau peptonée
saline alcaline).
• Vaccination supprimée du règlement sanitaire.
 Les anaérobies
• Incapables d’utiliser et de se multiplier en présence de 20% d’O².
• Responsables d'une grande variété d'infections localisées ou
généralisées.
• Difficulté d’isolement et d’identification.
• Urgence du traitement.
• Cocci ou bacilles Gram positif ou négatif.
• Classification : anaérobies : strictes / modérés / tolérants
• Flore de Veillon (multiplication, colonisation de cavités normalement
stériles). Flore C. Difficile C. Perfringens C. Tetani C. Botulinum
Flore tellurique (Contamination; multiplication puis tellurique :
genre
élaboration de toxine). clostridium
• Clinique : Intoxications / Toxi-infections / Infections mixtes. Toxine A et B Alpha et beta Exotoxine Neurotoxine
• Diagnostic : direct : Macroscopie : Pus abondant / Odeur fétide / (tetanolysine)
Présence de gaz, parfois de granulations sulfureuses.
Microscopie : Flore bactérienne abondante et polymorphe.
• Résistantes aux amniosides. C. Difficile C. Perfringens C. Tetani C. Botulinum
 Flore de veillon : - Portage - Bactérie tellurique - Clinique : Tétanos - Bactérie tellurique
- Habitat : TD et muqueuses. asymptomatique de la - Présente aussi dans (Trismus puis - Présente aussi dans l’intestin
- Facteurs favorisants : Traumatisme, bactérie l’intestin de plusieurs contractions de plusieurs animaux et
troubles nutritionnel… - Antibiothérapie au long animaux et généralisées de l’homme
- Clinique : Angine fusospirochetienne / cours et à large spectre de l’homme douloureuses, - Clinique : intoxication / toxi-
Suppurations diverses. responsable de colite - Clinique : Infections permanentes infection
Peudomembraneuse tissulaires des tissus mous avec paroxysmes) - Diagnostic : recherche de
- Culture en anaérobiose.
- Prélèvement de selles - Diagnostic : direct : grands - Diagnostic : Clinique toxine
- Coloration gram : aspect protéiforme. - TTT : Arrêt de bacilles Gram + encapsulés - Pas d’antibiogramme
- Vaccination. l’antibiothérapie / recherche de
l’enterotoxine
 Chlamydiae
Bactérie intracellulaire obligatoire

• Principale IST
• Caractères : Gram - / Absence de peptidoglycane !
• Formes : Corps réticulé (réplicative) / Corps
élémentaire (infectieuse) / Corps aberrant
(persistance)

Chlamydia trachomatis Chlamydia pneumoniae Chlamydia psittaci

• PP : trachome / IST / • PP : Infections broncho- • PP : Ornithose-psittacose

Lymphogranulomatose pulmonaires / Maladie
vénérienne coronarienne / Asthme
• Diagnostic : directe : PCR • Diagnostic : indirecte : sérologie
Te souhaiter une bonne chance c’est te dire avec des mots
sincères que je crois en toi et en tes capacités.
N’oublie pas qu’on est tous dans le même bateau !