Chapitre III : représentation des molécules

& analyse conformationnelle

I. Introduction :

Nous avons vue au 1er Chap. que certains paramètres fixant la géométrie
d’une molécule :
•Etat d’hybridation
•Nature des liaisons
•Angles de valence

Exemple :

………………………………
……………………………….
………………………………..

II. Modèle moléculaire :

Donne une vue générale de la géométrie

de la molécule à une échelle donnée.

H2O
1
 ………………

Ethane Ethylène Acéthylène

…………………

L’examen des modèles moléculaires permet de voir :

• les formes
•les distances inter-atomiques (liaison hydrogène)
• les encombrements stériques
• les possibilité d’isomérie.

2
III. Représentation des molécules

La formule brute, développée ou semi-développée sont insuffisante pour

décrire la réalité de la géométrie de la molécule.
La stéréochimie est l’étude des molécules organiques dans l’espace.

1) Représentation projective :

La molécule est observé sous

l’angle favorable au dessinateur.

3
2) Représentation perspective :
Très utilisée dans le cas des cycles.

3) Représentation de NEWMAN :
Très utiles pour la représentation des conformations.

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4) Représentation de FISCHER :

• On part de la représentation projective dans laquelle la chaîne principale est

représentée par les liaisons dans le plans.

• On regarde la molécule sous l’angle formé par la liaison en avant et la liaison en

arrière.

• On projette la molécule de façon à avoir la chaîne principale en verticale et

dirigé vers l’arrière du plan, les autres liaisons seront en horizontale
dirigées vers l’avant du plan.

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IV- Analyse conformationnelle :

1) Chaîne ouverte :
a- L’éthane :

Représentation projective :

Du fait de la libre rotation autour de C1-C2, la molécule peut prendre différentes

représentations:
- soit les atomes d’hydrogène sont face à face (I).
- soit ils sont décalés (II).

Entre ces 2 représentations extrêmes il existe plusieurs représentations ; ce sont des

conformations.

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Définition :
On considère une molécule donnée.
Les conformations sont les différentes formes que peut prendre dans
l’espace une molécule (conformères).
On peut déterminer 2 conformations différentes, mais on ne peut les
isoler.
Pour passer d’une conformation à une autre la
B.E ~ 1 à 10 Kcal/mol.

L’analyse conformationnelle à pour but d’examiner les

conformations adoptées par la molécule et de dégager parmi celles-ci
celle qui est plus stable.

Cet analyse est facilité par la projection de NEWMAN.

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 Projection de NEWMAN :

(I) Conformation (II) Conformation

éclipsée décalée (ou gauche)
moins stable plus stable

(I) et (II) sont deux conformères (ou rotamères).

q
fig.III.1. Diagramme énergétique de l’éthane
8
Exemple
2-Chloroéthanol

(I) Conformation (II) Conf. Décalée

Eclipsée totale Gauche (plus stable)

(IV) Conf. Anti (III) Conf. Eclipsée partielle

Exercice :1) Classer les conformations I, II, III et IV

en fonction de leur énergie potentiel croissante.
2) Tracer le diagramme d’énergie potentielle E = f (q).

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 b- Le butane :

(I) (II) (III) (IV)

éclipsée décalé éclipsée décalée anti
totale gauche partielle (+ table)

I I

III III

II II
VI

Fig.III.2. Diagramme d’énergie potentielle

E = f (q) du butane

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 2) Chaîne cyclique :
a - Le cyclohéxane :

Se trouve sous forme de chaise et bateau.

A 21°C, 999/1000 sous forme de chaise.

- Représentation perspective :

6 5 4 120°

1 2 3

Liaison axiale,

X X 6
1 4 5 4
1 5
6
Y Y 6 5
X
1 2 3
3 4
2 2 3 Y
Liaison équatoriale
conformation
bateau (II)
(I) conformation
conformation chaise inversée
chaise

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- Représentation de NEWMAN :

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 (I) Conformation (II) Conformation
chaise Chaise inversée

Fig. III. 3 : Diagramme d’énergie du cyclohéxane E = f (q)

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 b - Cyclohéxanes monosubstitués :

R H 6 5 4
6H 5
1
R
2 3
3 1
2 4

(I) (II)
R en axiale R en équatoriale.
Interactions stériques Interactions stériques
entre R, H3 et H5 Minimisés, plus stable

La barrière énergétique DE augmente avec

l’encombrement de R

Exemple : R = Me-, DE =1.5 Kcal/mol.

R = C6H5-, DE = 2.7 Kcal/mol.
R = ter-butyle-, DE = 5.6 Kcal/mol.

Règle de BARTON :
………………………………………………………………
………………………………………………………………
………………………………………………………………
..
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3) Cas des systèmes conjugués :

système conjugué : alternance de simple et de double liaison.

(I) s-cis (5%) (II) s-trans

95% plus stable

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