UNIVERSITE D’ABOMEY-CALAVI

***********
ECOLE DOCTORALE SCIENCE DE LA VIE ET DE LA TERRE
***********
UNITE DE RECHERCHE EN MICROBIOLOGIE ET PHARMACOLOGIE DES SUBSTANCES
NATURELLES

***********
MASTER DE MICROBIOLOGIE MOLECULAIRE ET MEDICALE

***********

Génétique Moléculaire

THEME :tTout sur le fondement de la caracterisation du vivant et du non-

vivant

Réalisé par : Sous la supervision de

supervision

AKPO Carnegie Pr AGBANGLA Clément

Année académique : 2023-2024

 PLAN

Introduction
I-Etat de l’art
II- Variabilité liée aux mutations
III- Causes lointaines et récentes de la variabilité génétique

IV- Applications

Conclusion

Références bibliographiques

2
 Introduction

La compréhension approfondie du vivant et des agents pathogènes, tels que les

virus, repose inévitablement sur la caractérisation précise de leur génome. Au
cœur de cette entreprise scientifique, l'analyse de séquence du génome émerge
comme une discipline incontournable, offrant un accès sans précédent à
l'information génétique qui régit la vie. Cette exploration génomique révèle la
complexité insoupçonnée des codes génétiques, mettant en lumière la variabilité
à l'échelle moléculaire. Ainsi, cette présentation vise à examiner le fondement de
la caractérisation biologique, en mettant en évidence la variabilité génétique liée
aux mutations, les causes lointaines et récentes de cette variabilité, tout en
explorant le polymorphisme et la diversité génétique. En se plongeant dans
l'essence même du matériel génétique, cette analyse cherche à éclairer les
mécanismes fondamentaux qui gouvernent la vie et influencent la virulence des
agents pathogènes, établissant ainsi le socle sur lequel repose la compréhension
moderne de la biologie moléculaire.

I- Etat de l’art

Avant le XXe siècle, l'histoire de la caractérisation en génétique remonte au

travail pionnier de Gregor Mendel au XIXe siècle, qui a jeté les bases de la
génétique mendélienne en décrivant les lois de l'hérédité. Cependant, la
compréhension des mécanismes moléculaires était encore loin d'être atteinte.

Dans les années 1940-1950, l'avènement de la biologie moléculaire dans les a

été marqué par la découverte de la structure de l'ADN par James Watson et
Francis Crick en 1953. Cette percée a ouvert la voie à la compréhension de la
transmission de l'information génétique et à la caractérisation des gènes.

En 1960-1970, la découverte du code génétique, déchiffrant la correspondance

entre les nucléotides de l'ARN et les acides aminés dans les protéines, a été un
jalon majeur. Les méthodes de séquençage ont émergé, bien que limitées à
l'époque, permettant de caractériser progressivement les séquences génétiques
de petits gènes.

Ensuite, l'avènement de la biotechnologie a permis des avancées significatives.

La PCR (réaction de polymérisation en chaîne) a été développée par Kary Mullis
en 1983, permettant l'amplification spécifique d'ADN, une étape cruciale pour la

3
caractérisation génétique. La cartographie génétique a été facilitée par
l'utilisation de marqueurs moléculaires.

Le Projet Génome Humain (PGH), achevé en 2003, a marqué une étape majeure
en caractérisant l'ensemble du génome humain. Les technologies de séquençage
à haut débit ont émergé, révolutionnant la vitesse et l'efficacité des analyses
génétiques. L'attention s'est également portée sur les variations génétiques avec
des projets comme le HapMap et le 1000 Genomes Project.

Et l'avènement du séquençage de nouvelle génération (NGS) a permis une

caractérisation plus approfondie, rapide et abordable des génomes. Les études
d'association génomique (GWAS) ont identifié des liens entre des variations
génétiques spécifiques et des traits complexes. La CRISPR-Cas9, une
technologie d'édition génique, a ouvert la voie à la modification précise des
séquences génétiques.

Aujourd'hui, la caractérisation en génétique repose sur une combinaison de

techniques sophistiquées, allant du séquençage de nouvelle génération à la
biologie moléculaire avancée. L'analyse de séquence génomique, l'étude des
régulations géniques et la compréhension des réseaux génétiques sont au cœur
de la caractérisation, offrant des perspectives sans précédent pour la recherche
en génétique, la médecine personnalisée et la compréhension des bases
génétiques des maladies.

II- Variabilité liée aux mutations

La variabilité génétique, un aspect fondamental de la caractérisation
génétique, trouve son origine principale dans les mutations, des altérations
au niveau moléculaire qui modifient la séquence d'ADN. Ces mutations
peuvent prendre différentes formes, notamment des substitutions, des
insertions, et des délétions, chacune ayant des implications spécifiques.
Les substitutions, par exemple, impliquent le remplacement d'un
nucléotide par un autre, pouvant entraîner des changements dans la
séquence des acides aminés et, par conséquent, influencer la fonction de la
protéine codée. Les erreurs de réplication, les agents mutagènes
environnementaux tels que les rayonnements et les mécanismes de
4
réparation de l'ADN sont autant de contributeurs potentiels à la génération
de mutations. Ces altérations moléculaires sont cruciales pour la diversité
génétique au sein d'une population et sont le moteur des processus
évolutifs.
L'impact des mutations va au-delà de la simple variabilité, affectant
directement la caractérisation des traits génétiques, des maladies et des
mécanismes évolutifs. Certaines mutations peuvent être silencieuses,
n'ayant aucun effet observable, tandis que d'autres peuvent avoir des
conséquences profondes sur la fonction des gènes et des protéines. La
compréhension des mécanismes moléculaires sous-jacents aux mutations
est essentielle pour déchiffrer la complexité du génome et pour interpréter
correctement les résultats de la caractérisation génétique. En résumé, ce
chapitre explore le rôle central des mutations dans la génération de la
variabilité génétique, soulignant leur importance dans le contexte de la
caractérisation génétique moderne.
Les mutations génétiques sont souvent les causes sous-jacentes de
nombreuses maladies génétiques. La caractérisation précise de ces
mutations offre des pistes cruciales pour comprendre les mécanismes
pathologiques, aidant ainsi à développer des approches de traitement
ciblées.
La caractérisation des mutations permet d'évaluer la diversité génétique au
sein des populations. Des projets tels que le 1000 Genomes Project ont
utilisé des données de séquençage pour identifier et cartographier les
variations génétiques, facilitant la compréhension de la variabilité
humaine.
Les études d'association génomique (GWAS) analysent les mutations
associées à des traits complexes tels que la susceptibilité aux maladies.
Cette caractérisation permet de prédire le risque individuel de développer
certaines conditions et guide les approches préventives.

5
 La caractérisation des mutations dans des gènes spécifiques est essentielle
pour le développement de thérapies personnalisées. Les mutations peuvent
indiquer des cibles thérapeutiques spécifiques, et la compréhension de la
variabilité génétique guide la conception de traitements plus précis.
Dans le contexte des virus et des bactéries, la surveillance génomique des
mutations peut fournir des informations cruciales sur la propagation,
l'évolution et la virulence des agents pathogènes. Cela est particulièrement
évident dans la surveillance de virus émergents, permettant des réponses
rapides lors de pandémies.

III- Causes lointaines et récentes de la variabilité génétique

La variabilité génétique résulte de forces évolutives agissant sur de vastes
échelles de temps. Les causes lointaines, enracinées dans les mécanismes de
l'évolution, sont principalement façonnées par des processus tels que la sélection
naturelle, la dérive génétique et les migrations. La sélection naturelle, décrite par
Darwin, favorise la transmission d'alleles avantageux qui confèrent un avantage
sélectif dans un environnement donné. La dérive génétique, quant à elle,
entraîne des changements aléatoires dans la fréquence des allèles au fil des
générations, principalement dans les petites populations. Les migrations,
souvent liées à des changements géographiques, peuvent introduire de nouveaux
allèles dans une population, augmentant ainsi sa diversité génétique au fil du
temps. Ces forces lointaines ont sculpté la variabilité génétique observée
aujourd'hui, créant une mosaïque complexe d'informations génétiques héritées
des ancêtres.
Causes Récentes de la Variabilité Génétique :
À côté des forces évolutives lointaines, des causes récentes contribuent
également à la variabilité génétique. Les mutations spontanées, résultant
d'erreurs lors de la réplication de l'ADN ou d'expositions à des agents
mutagènes, sont des déterminants majeurs de la variabilité à court terme.
6
 Les influences anthropiques, telles que l'exposition à des substances
chimiques dans l'environnement et les changements de modes de vie,
peuvent également générer des mutations. Les pressions de sélection
contemporaines, telles que l'utilisation d'antibiotiques ou d'autres
interventions médicales, peuvent influencer la fréquence des allèles dans
des populations spécifiques. La caractérisation de ces causes récentes de
la variabilité génétique est cruciale pour anticiper les changements
évolutifs à venir et pour comprendre comment les populations s'adaptent
aux pressions sélectives modernes. Ainsi, l'analyse de la variabilité
génétique offre une fenêtre temporelle sur les processus évolutifs, allant
des influences historiques profondes aux dynamiques plus récentes et
dynamiques.

IV- Applications
La caractérisation génétique du vivant, qu'il s'agisse d'organismes
multicellulaires ou de microorganismes, offre une myriade d'applications
cruciales. Dans le domaine de la médecine personnalisée, la caractérisation
génétique individuelle s'est révélée essentielle pour anticiper et traiter des
maladies. En analysant les variations génétiques, notamment les SNP et les
mutations, elle permet une prévention ciblée des affections héréditaires et
facilite la personnalisation des traitements en fonction des profils génétiques
uniques. De plus, dans le contexte de la recherche médicale, la caractérisation
génétique ouvre la voie à des études d'association génomique (GWAS), révélant
des liens entre des variations génétiques spécifiques et des traits complexes,
offrant ainsi des indices précieux pour comprendre les mécanismes sous-jacents
à diverses conditions.
Quant à la caractérisation génétique des virus, elle joue un rôle critique
dans la surveillance, la prévention et la gestion des maladies infectieuses. En
analysant les séquences génétiques des virus, notamment à travers le séquençage
7
du génome viral, les scientifiques peuvent comprendre la diversité génétique au
sein des populations virales, suivre l'évolution des souches, et anticiper
l'émergence de variants potentiellement plus virulents ou résistants aux
traitements. Cette caractérisation est cruciale pour la conception de vaccins
adaptés et le développement de stratégies de lutte contre les épidémies. En outre,
elle facilite la détection précoce des infections, guide la mise en œuvre de
mesures de contrôle, et contribue à une compréhension approfondie des
mécanismes d'infection. Ainsi, la caractérisation génétique des virus est au cœur
des efforts mondiaux visant à comprendre et à lutter contre les maladies
infectieuses, en particulier dans le contexte des défis posés par les virus
émergents.

8
Conclusion
En conclusion, notre exposé exhaustif sur le fondement de la caractérisation du
vivant et des virus à travers l'analyse de séquence du génome a traversé les
époques, dévoilant les progrès notables de la génétique. Nous avons entrepris un
voyage historique, des travaux fondateurs de Gregor Mendel à l'avènement de la
biotechnologie moderne, soulignant l'évolution rapide des technologies de
caractérisation génétique. Au cœur de cette exploration, la variabilité génétique
a été scrutée, révélant les causes lointaines et récentes de cette diversité
complexe, tandis que le polymorphisme génétique a émergé comme une clé
essentielle de compréhension.

La variabilité génétique, résultat de mutations façonnées par des forces

évolutives lointaines comme la sélection naturelle et des pressions
contemporaines, est cruciale pour la survie des espèces et la compréhension des
mécanismes pathologiques. Par ailleurs, le polymorphisme génétique, cette
coexistence d'allèles dans une population, offre des perspectives riches pour la
médecine personnalisée, la recherche en génétique, et la lutte contre les maladies
infectieuses. Cette caractérisation génétique redéfinit nos capacités à
comprendre et à manipuler les informations génétiques, marquant une ère où la
médecine et la biologie tirent profit des avancées spectaculaires de l'analyse de
séquence du génome. Ainsi, cet exposé confirme que la caractérisation
génétique est une clé indispensable pour déverrouiller les mystères du vivant et
des virus, offrant des perspectives passionnantes pour l'avenir de la génétique et
de la médecine.

9
 Références bibliographiques

 Watson, J. D., & Crick, F. H. (1953). Molecular structure of nucleic acids: a structure for
deoxyribose nucleic acid. Nature, 171(4356), 737-738.
 Lander, E. S., et al. (2001). Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature,
409(6822), 860-921.
 Collins, F. S., Green, E. D., Guttmacher, A. E., & Guyer, M. S. (2003). A vision for the future
of genomics research. Nature, 422(6934), 835-847.
 Shendure, J., & Ji, H. (2008). Next-generation DNA sequencing. Nature biotechnology,
26(10), 1135-1145.
 Venter, J. C., et al. (2001). The sequence of the human genome. Science, 291(5507), 1304-
1351.
 Altshuler, D., et al. (2010). Integrating common and rare genetic variation in diverse human
populations. Nature, 467(7311), 52-58.
 Abecasis, G. R., et al. (2010). An integrated map of genetic variation from 1,092 human
genomes. Nature, 491(7422), 56-65.
 Hindorff, L. A., et al. (2009). Potential etiologic and functional implications of genome-wide
association loci for human diseases and traits. Proceedings of the National Academy of
Sciences, 106(23), 9362-9367.
 The 1000 Genomes Project Consortium. (2015). A global reference for human genetic
variation. Nature, 526(7571), 68-74.
 Doudna, J. A., & Charpentier, E. (2014). The new frontier of genome engineering with
CRISPR-Cas9. Science, 346(6213), 1258096.

10