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TP de MICROBIOLOGIE DU SOL

Séance N°2:
Exploitation des microorganismes
en agriculture: Bactérisation des
semences

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1. Bactérisation des semences

Les inoculums bactériens ont été introduits dans le sol


afin d'améliorer la croissance et la santé des plantes
tout en réduisant l'utilisation des produits chimiques.

Les groupes de bactéries appelées «Plant Growth


Promoting Rhizobacteria» (PGPR) utilisées
appartiennent notamment aux
genres Bacillus, Pseudomonas et Enterobacter.

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1. Bactérisation des semences

Cet effet bénéfique des bactéries sur la croissance des


plantes est souvent évalué par l'augmentation du poids
des racines et des tiges.

La finalité de la bactérisation est d’augmenter le


rendement des cultures.

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1. Bactérisation des semences

L’augmentation de rendement d’une culture


bactérisée résulte de 2 effets bénéfiques principaux :

La stimulation de croissance des plantes;

La protection des plantes contre les maladies


d’origine tellurique.

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2. Autres effets bénéfiques
2.1. Stimulation de la germination

Une des composantes du rendement agronomique des


cultures est la densité du peuplement végétal.

Or, cette densité est liée à la faculté germinative des


semences.

Certaines souches bactériennes semblent améliorer la


germination des graines lorsque les conditions
d’environnement sont favorables ou défavorables.

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4.2. Stimulation des interactions entre la
microflore symbiotique et la plante hôte

Certaines souches PGPR stimulent la nodulation des


légumineuses.

Il a été démontré qu’une souche de Pseudomonas


putida augmente de façon significative la nodulation
du haricot par Rhizobium.

Ces souches sont appelées «Nodulating Promoting


Rhizobacteria» (NPR).
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4.2. Stimulation des interactions entre la
microflore symbiotique et la plante hôte
Toutes ces souches stimulent la croissance racinaire,
produisent de l’acide indole acétique et sont
pectinolytiques.

Elles provoquent une augmentation de la masse de


nodosités plutôt que de leur nombre.

De même, certaines souches de bactéries influencent


positivement la colonisation racinaire de la plante
hôte par des endomycorhizes ou par des
ectomycorhizes.
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5. Manipulation
5.1. Préparation des graines
Les graines de blé dur sont stérilisées en surface par
trempage dans de :
 L’éthanol 70% pendant 3 min.
 L’eau de javel 5% pendant 5 min.
 Trois lavages à l'eau distillée stérile.
 Les graines sont stockées dans le réfrigérateur à
+ 4 °C jusqu’à utilisation.

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5. Manipulation
2. Préparation de l’inoculum bactérien

La souche Bacillus subtilis a été isolée à partir de la


rhizosphère d’un amandier et identifiée. Elle est
connue sous le code V26.

La souche bactérienne a été mise en culture à 30 °C


pendant 48 h sur un milieu nutritif gélosé.

Ensuite, les bactéries ont été mises en suspension


dans 10 ml d’eau distillée stérile.

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5. Manipulation
2. Préparation de l’inoculum bactérien

La suspension bactérienne est lavée trois fois par


centrifugation et le culot est resuspendu dans une
quantité d’eau distillée stérile.

La densité de l'inoculum est ajustée à 106 CFU/mL en


utilisant une courbe d'étalonnage établie à une
densité optique de 600 nm.

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5. Manipulation
5.3. Bactérisation des graines

 Tremper les graines de tomate stériles dans 50 ml de


la suspension bactérienne (108 CFU/mL) pendant une
durée de 30 min, sous une faible agitation.

 Tremper les graines témoins dans de l’eau distillées


stérile pendant la même durée.

 Déposer du papier filtre stérile dans les boites de


Pétri.

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5. Manipulation
5.3. Bactérisation des graines

 Imbiber le papier filtre stérile avec 10 ml d’eau distillée


stérile.

 Déposer les graines traitées dans les boites de Pétri


contenant du papier filtre stérile imbibé d’eau.

 Placer les boites de Pétri pour germination dans


l’obscurité, à 25°C, pendant 7 jours.

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5. Manipulation
5. 4. Paramètres à mesurer
 Déterminer le pourcentage de germination et
l’indice de germination qui sont calculés comme suit :

Pourcentage de germination (%) = Nombre de graines


germés/Nombre de graines totales

Indice de germination (%) = [(SGe/SGc) × (Rle/RLc)] ×100


Avec : SGe : Nombre de Graines traitées germées.
SGc : Nombre de graines contrôles germées
Rle : Longueur des racines des graines traitées
RLc : Longueur des racines des graines contrôles.

 Interpréter vos résultats. 13

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