Année Académique :
2020_2021
Le contrôle de la qualité microbiologique de nos aliments reste indispensable car il
permet d’éviter la commercialisation et la consommation de produits dangereux ou non
conformes. Ceci ce fait par des analyses règlementées et régit par normes (nationales ou
internationales) qui souvent imposent que l’aliment soit exempte de tous germe
pathogène ou de toxine microbienne et que la flore totale soit peu abondante.
La qualité sanitaire du produit fini se base sur la numération des germes totaux (FTAM et
coliformes totaux) , les germes indicateurs d’une contamination fécale qui sont les
coliformes fécaux (souvent associés aux pathogènes tels que : Salmonella et Shigella),
Streptocoques fécaux ( ou Entérocoques), les germes indologènes, les germes indicateurs
d’une contamination tellurique (sol) comme les anaérobies sulfito-réducteurs ainsi que la
recherche des germes ubiquitaires et d’origine humaine ou animales comme
Staphylococcus aureus (qui aussi toxinogène).
Ces analyses passent par plusieurs étapes dans le laboratoire microbiologiques.
1) Matériel :
2) Préparation de dilutions décimales :
Les Coliformes :
Genre Escherichia :
Genre Salmonella :
Genre Staphylococcus :
Les membres de ce genre sont des coques Gram+, souvent en amas. Certaines
espèces contiennent des pigments caroténoïdes orange ou jaune. Non mobiles,
anaérobies facultatifs, chimioorganohétérotrophes. catalase+. Le staphylocoques
sont répartis en souches coagulase+ et souches coagulase- . Ils sont commensaux
et pathogènes chez l'homme et chez d'autres animaux S. aureus coagulase+ est
pathogène, il produit des entérotoxines thermostables Les aliments dangereux
sont nombreux: viandes, plats cuisinés, produits à base de lait ou d'œufs,
pâtisserie, crèmes glacées, etc. Les aliments à haute concentration en sels et en
sucres constituent un bon milieu de croissance pour S. aureus.
Genre Clostridium :
Genre Streptococcus sp :
Les levures :
Les levures sont des champignons pour tout ou partie de leur cycle végétatif.
La température optimale se culture des levures se situe en général entre 25 C° et
30C°mais colle les autres microorganismes mes levures peuvent être classées
en levures psychrophiles mésophile et thermophiles.
Les moisissures :
lait pasteurisés :
Le lait est un aliment hautement nutritif par sa richesse en glucides, protéines, lipides,
vitamines et sels minéraux, mais peut néanmoins présenter un danger pour le
consommateur lorsqu’il renferme des microorganismes pathogènes ou d’altération
capables d’abaisser significativement sa qualité sanitaire et commerciale,
respectivement. La qualité du lait peut être affectée par de nombreux facteurs tels que
les contaminations au cours et après la traite,
la présence d'infections mammaires ainsi que l'adultération. Le contrôle
microbiologique du lait pasteurisé est indispensable, car la plupart s'imaginent, à tort,
que tout lait pasteurisé peut être consommé sans danger. Les contrôles officiels au
niveau des marchés se limitent à la constatation des falsifications ou simplement les
altérations visibles à l'œil nu. Ces contrôles doivent être Suivis par le contrôle
microbiologique au laboratoire. Les germes concernés sont : les microorganismes
aérobies à 30°C (Flore Totale Aérobie Mésophile, FTAM), les coliformes totaux et
fécaux, Staphylococcus aureus .
Dénombrement et identification des microorganismes recherchés pour le
contrôle microbiologique du lait pasteurisé.
Incubation :
Lecture :
Il s’agit de compter toutes les colonies ayant poussé sur les boites en
tenant compte des facteurs suivants :
-ne dénombrer que les boites contenant entre 15et 300 colonies
En milieu solide :
Lecture :
En milieu liquide :
*Test de présomption :
Préparer dans un portoir une série de tubes contenant le milieu sélectif (VBL) à
raison de trois tubes par dilution
Incubation :
Lecture :
Les tubes de VBL trouvés positifs lors du dénombrement des coliformes totaux
feront l’objet d’un repiquage à l’aide d’une ose bouclée dans à la fois :
Lecture :
Mode opératoire :
*résultats et interprétation :
Préparation du milieu :
Laisser solidifier les boites sur paillasse , puis les sécher en les plaçant
retournées couvercle en bas dans une étuve de séchage réglée entre 45 à 55C° .
Ensemencement :
À partir des dilutions décimales 10-4 dans le cas des toxi-infections alimentaires
et à partir de 10-³ des contrôles de routine porter aséptiquement 1 ml de chaque
dilution reparti en surface à raison de trois fraction sensiblement égale dans trois
boites contenant le milieu de Baird Parker puis étaler à l'aide d'un même étaleur ,
en commençant par les boites de plus haute dilution .
préparation du milieu :
Ensemencement :
Incubation :
Lecture : Seront considérés comme positifs , les tubes ayant vires au noir pour
s'assurer qu'il s'agit bien d'un développement de staphylococcus aureus ces tubes
feront l'objet d'un isolement sur gélose Chapman préalablement fondue coulée
en boites de pétri et bien séchées .
Les boites de Chapman ainsi ensemencées seront incubées à leur tour à 37C°
pendant 24 à 48 heures .
Après ce délai repérer les colonies suspectes à savoir les colonies de taille
moyenne lisse brillante pigmentées en jaune et pourvus d'une catalase et d'une
coagulase .
-Si par contre à la dilution 10-¹ le tube a noirci au bout de 24 hrs et a l'isolement
il y'a des colonies caractéristiques , il faut tenir compte de la dilution en question
car le norme réel de staphylococcus aureus correspond à l'inverse de la dilution
Ensemencement :
viande hachée :
Incubation :
Chaque tube et chaque flacon fera l'objet d'un d'isolement sur deux milieux
gélose différents à savoir : - le milieu gélose Hektoen.
Touts les boites ainsi ensemencées seront incubées à 37°c pendant 24h
- Ensemencement d’un tube de TSI qui sera incubé à 37°c pendant 24h
(lactose, saccharose, glucose, gaz et H2S).
- Ensemencement :
✔ Soit d’une galerie biochimique classique (ONPG, oxydase, LDC, ODC,
ADH, témoin, Urée, Indole, TDA, VP, RM…).
● Identification antigénique :
Cette dernier repose sur l’agglutination sur lame de verre, à partir des mêmes
colonies isolées la veille sur gélose nutritive inclinée au tubes, à l’aide des
sérums de groupes d’abord OMA, OMB puis les autres après.
Résultats et interprétation :
-notre viande hachée contient des bactérie mésophiles sur PCA le nombre n’est
pas assez grand risque
-il est conseillé de bien cuire la viande pour éliminer toute source de microbe et
empêche tous les types de microorganismes de poursuivre leur multiplication
-les résultats montre la présence des bactéries pathogènes plus précisément sont
de genre salmonella on doit prendre attention ne pas consommer cette viande
qu’après une suffisante durée de cuisant .
⮚ Test de présomption :
-Préparer dans un portoir une série de tubes contenant le milieu sélectif Roth
S/C à raison de trois tubes par dilution. À partir des dilutions décimales 10-³ à
10-² porter aseptiquement 1ml dans chacun des 3 tubes correspondant à une
dilution donnée.
Incubation :
Se fait à 37°c pendant 24 à 48h.
Lecture :
⮚ Test de confirmation :
Chaque tube de Roth positif fera donc l’objet d’un repiquage à l’aide d’une anse
bouclée sur tube contenant le milieu EVA Lytski. Bien mélanger l’inoculum
dans le ½ .
Incubation :
Lecture :
- Un trouble microbien.
-Le nombre de Streptocoques fécaux est exprimé par le NPP selon la table de
MAC Grady.
Résultats et interprétation :
:
La viande doit être bien conservé à froid mais pendant une durée qui ne dépasse
pas au plus un mois non seulement pour minimiser le risque de contamination
lais aussi pour garder ces différents critères et structure physique (gout, fraicheur
; richesse en eau…..) ;et avant la consommation ;elle doit être cuite à une
chaleur douce et de préférence bouillée dans l’eau quelque minutes et colle ca
on affirme qu’on a détruits toute la flore pathogène ,indésirable et même la flore
pathogène , indésirable et même la flore problématique .
TP n=°03: Analyse microbiologique des
conserves :
Une conserve ne doit pas subir d’altérations d’origine microbienne et si une telle
altération intervient il faudra en déterminer l’agent causal et son origine .une
boite anormale indique généralement un produit anormal.
Au cours des phénomène d’altérations ,la boite peut présenter des anomalies
s’aspect facilement appréciables : « à demi bombée ; bombée déformable
,bombée indéformable .le bombage est soit d’origine microbienne (fermentation
des glucides avec production de gaz surtout du co2ou fermentation des protéines
avec production d’azote ou de NO2soit d’origine chimique avec production
d’hydrogéne par attaque du métal par des acides soit lié à une surchauffe de
stérilisation .le contenu de la boite peut aussi , par suite de la présence de
bactéries ;subir des modifications d’aspect ; texture ou PH
La nature du gaz d’une conserve bombée peut être évalué après récupération du
gaz dans un tubes préalablement rempli d’eau barytée.
Recherche et dénombrement des germes aérobies mésophiles
totaux (FTAM) :
A partir ses dilution décimale allant de 10-1 a 10-4 , porter aséptiquement 1 ml
dans une boite de pétri vide préparée à cet usage et numérotée . compléter en
suite avec environ 20ml de gélose PCA fondue puis refroidie à 45 +-1°C.faire
ensuite des mouvements circulaire et de va et vient en forme de « 8 »pour
permettre à l’inoculum de se mélanger à la gélose .Laisser solidifier sur
paillasse ; puis ajoutes une deuxième couche d’environ 5ml de la même gélose
ou de gélose blanche .cette double couche a un rôle protecteur contre les
contaminations diverses
Incubation :
Les boites seront incubées couvercle en bas à 30°C pendant 72heurs avec :
_première lecture à24 heures
Lecture :
Dénombrement :
Il s’agit de compter toutes les colonies ayant poussé sur les boites en tenant
compte des facteurs suivants :
-ne dénombrer que les boites contenant entre 15et 300 colonies
- faire ensuite la moyenne arithmétique des colonies entre les différents dilutions
*soit eu milieu liquide par la technique de NPP (nombre le plus probable à l’aide
du bouillon VBL (Bouillon lactosé bilié au vert brillant ) réparti à raison de 10
ml par tubes munis au préalable d’une cloche de Durham .
En milieu solide :
Laisser solidifie les boites sur paillasse puis couler à nouveau environ 5ml de la
même gélose , cette double couche a un rôle protecteur contre les diverses
contaminations
Incubation :
Lecture :
En milieu liquide :
*Test de présomption :
Préparer dans un portoir une série de tubes contenant le milieu sélectif (VBL) à
raison de trois tubes par dilution
Incubation :
Lecture :
Les tubes de VBL trouvés positifs lors du dénombrement des coliformes totaux
feront l’objet d’un repiquage à l’aide d’une ose bouclée dans à la fois :
- Un autre tube de VBL muni d’une cloche de Durham
Incubation :
Lecture :
A- méthode générale :
- préparation du milieu :
Incubation :
- ces tubes seront ainsi incubés à 37c° pendant 16.24 ou plus tard 48heures .
lecture :
- la première lecture doit se faire impérativement à 16 hrs , car, d'une part les
colonies de clostridiums sulfito-reducteurs sont envahissante auquel cas sont on
se trouverait en face d'un tube complètement noir rendant alors l'interprétation
difficile voire impossible et l'analyse est à refaire .
- d'autre part , il faut absolument repérer toute colonie noir ayant poussé en
masse et un diamètre supérieur à 0.5 mm
- il est donc impératif de repérer toute colonie noir , puis procéder à son
identification biochimique , certains auteurs préconisent de casser le tube à l'aide
d'une lime métallique à 1 cm au-dessus de la colonie suspect et de prendre le
centre de la dite colonie , car très souvent il y'a développement de colonies de
staphylocoques et de bacillus de côté qu'on prendrait à Tard pour des colonies de
clostridiums sulfito-reducteurs .
identification biochimique :
- le centre de colonie noir suspecte (qui est en réalité. Blanche mais entourée
d'un auréole noire ) sera alors déposé soigneusement dans un tube contenant
d'un bouillon TGY ou TY préalablement régénéré à 80C° pendant 15 minutes ,
placer en suite ce tube dans un agitateur (vortex) pour bien mélanger la colonie
dans le milieu puis l'incuber dans anaérobiose pendant 24 à 48 hrs . Après la
période d'incubation constater le trouble du milieu puis réaliser les étapes
suivantes :
- s'il s'agit de bacilles gram positifs , faire un isolement sur deux boites de
gélose au sang de mouton frais :
B- la méthode sélective :
- le milieu de culture : il s'agit cette fois ci d'un milieu sélectif TSN ou TSC ces
deux antibiotiques inhiberont toute la flore éventuellement présente hors mis les
spores des clostridium rendant ainsi le milieu sélectif .
Résultats et Interpretaion :
Les clostridiums sulfito-réducteurs apparaissent sous forme de colonies
entourées d’un halo noire .
Préparation du milieu :
Laisser solidifier les boites sur paillasse , puis les sécher en les plaçant
retournées couvercle en bas dans une étuve de séchage réglée entre 45 à 55C° .
Ensemencement :
Lecture :
Pour s'assurer qu'il s'agit bien de colonies staphylococcus aureus effectuer sur 2
à 3 colonies de chaque boite des tests biochimiques rapides à savoir :
préparation du milieu :
Ensemencement :
Incubation :
Lecture : Seront considérés comme positifs , les tubes ayant vires au noir pour
s'assurer qu'il s'agit bien d'un développement de staphylococcus aureus ces tubes
feront l'objet d'un isolement sur gélose Chapman préalablement fondue coulée
en boites de pétri et bien séchées .
Les boites de Chapman ainsi ensemencées seront incubées à leur tour à 37C°
pendant 24 à 48 heures .
Après ce délai repérer les colonies suspectes à savoir les colonies de taille
moyenne lisse brillante pigmentées en jaune et pourvus d'une catalase et d'une
coagulase .
-Si par contre à la dilution 10-¹ le tube a noirci au bout de 24 hrs et a l'isolement
il y'a des colonies caractéristiques , il faut tenir compte de la dilution en question
car le norme réel de staphylococcus aureus correspond à l'inverse de la dilution
Ensemencement :